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Cloning and Sequence Analysis of IGFBP-7 Gene in Sheep
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作者 Mingliang ZHOU Pinggui YANG +1 位作者 Dengjun WU Xiangyu ZHANG 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2015年第6期38-42,共5页
In this study, full-length CDS sequence of IGFBP-7 gene was cloned from Liangshan semi-fine wool sheep with RT-PCR method and analyzed with bioinformatics methods. The results showed that the full-length CDS sequence ... In this study, full-length CDS sequence of IGFBP-7 gene was cloned from Liangshan semi-fine wool sheep with RT-PCR method and analyzed with bioinformatics methods. The results showed that the full-length CDS sequence of IGFBP-7 gene in Liangshan semi-fine wool sheep was 846 bp in length, encoding 282 amino acids. The CDS sequence shared 99%, 95% and 90% homology with bovine, human and rat, respectively; the amino acid sequence shared 98%, 93% and 89%, respectively. The GenBank accession number was FJ589640.1. The amino acid molecular weight of IGFBP-7 was 29.0 kD, and the theoretical isoelec- tric point (pl) was 8.25. The result of phylogenetic analysis showed that IGFBP-7 gone in Liangshan semi-fine wool sheep exhibited close phylogenetic relationships with bovine, goat and other mammals, and distant phylogenetic relationships with Danio rerio and Haliotis diversicolor. IGFBP-7 gene had uniformly distributed hy- drophobic and hydrophilic regions, harboring one signal peptide, two transmembrane regions, 16 phosphorylation sites, four N-glycosylation sites and one O-glyco- sylation site. The result of secondary structure analysis showed that the random coil, or-helix and β-sheet regions accounted for 64.89%, 19.86% and 15.25%, respectively. The result of tertiary structure analysis showed that IGFBP-7 harbors an IGFBP_N domain and an Ig-like domain. This study provided scientific basis for further investigating the function of IGFBP-7 gene in sheep. 展开更多
关键词 SHEEP Insulin-like growth factor-binding protein-7 gene (IGFBP-7 gene cloning sequence analysis
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猪繁殖障碍与呼吸道综合征病毒福州株ORF2-7基因结构分析 被引量:7
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作者 魏宏 林锋强 +2 位作者 周伦江 王隆柏 庄向生 《中国畜牧兽医》 CAS 2007年第1期82-85,共4页
用RT-PCR方法分段扩增出猪繁殖障碍与呼吸道综合征病毒(PRRSV)FZ株的5条cDNA片段,分别克隆到pMD-18T载体并进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到FZ株ORF2-7编码框序列,测序结果表明该序列长度为3272bp,与BJ-4株、VR-2332株、CH-1a株和... 用RT-PCR方法分段扩增出猪繁殖障碍与呼吸道综合征病毒(PRRSV)FZ株的5条cDNA片段,分别克隆到pMD-18T载体并进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到FZ株ORF2-7编码框序列,测序结果表明该序列长度为3272bp,与BJ-4株、VR-2332株、CH-1a株和HB-1株核苷酸同源性分别为99.1%、98.9%、93.2%和93.2%。 展开更多
关键词 PRRSV ORF2—7基因 克隆 序列分析
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绵羊IGFBP-7基因的克隆及序列分析
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作者 周明亮 杨平贵 +1 位作者 吴登俊 张翔宇 《湖北农业科学》 2015年第6期1416-1420,1433,共6页
试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了其IGFBP-7基因的CDS全序列,生物信息学方法深入分析其序列。结果表明,凉山半细毛羊IGFBP-7基因的CDS序列为846 bp,编码282个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为99%、95%、90%,氨... 试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了其IGFBP-7基因的CDS全序列,生物信息学方法深入分析其序列。结果表明,凉山半细毛羊IGFBP-7基因的CDS序列为846 bp,编码282个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为99%、95%、90%,氨基酸序列同源性分别为98%、93%、89%,Gen Bank登录号为FJ589640.1;IGFBP-7基因的氨基酸分子质量为29.0 ku,理论等电点(p I)为8.25;进化分析显示其与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与斑马鱼、鲍等亲缘关系较远;IGFBP-7基因的蛋白质疏水性区域与亲水性区域间隔较为均匀分布,有1个信号肽、2个跨膜区、16个磷酸化位点、4个N-糖基化位点和1个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为64.89%、19.86%、15.25%;三级结构分析显示存在IGFBP_N和Ig-like功能域。该试验为进一步研究绵羊IGFBP-7基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 绵羊 IGFBP-7基因 克隆 序列分析
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蓝舌病病毒Z1株VP7基因的克隆及序列分析 被引量:2
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作者 马洪超 苏艳 +2 位作者 孙淑芳 尹燕博 蒋正军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期34-37,共4页
用RT PCR扩增我国蓝舌病毒Z1株的 VP7基因 ,直接将其克隆至 pGEM T载体中 ,用限制性内切酶EcoRⅠ分析经蓝 /白斑筛选和PCR鉴定的重组质粒 ,用DIG标记克隆片段制成探针与病毒基因组进行Northernblot杂交 ,证明插入片段为BTVVP 7基因特异... 用RT PCR扩增我国蓝舌病毒Z1株的 VP7基因 ,直接将其克隆至 pGEM T载体中 ,用限制性内切酶EcoRⅠ分析经蓝 /白斑筛选和PCR鉴定的重组质粒 ,用DIG标记克隆片段制成探针与病毒基因组进行Northernblot杂交 ,证明插入片段为BTVVP 7基因特异性片段。采用Sanger双脱氧终止法测定cDNA片段的核苷酸序列 ,将这一序列与国外已发表的 9株蓝舌病毒及相关的环状病毒的VP 7基因进行了比较分析 ,结果表明 :国内BTVZ1株的VP 7基因的核苷酸序列与上述 9个毒株的同源性在 71 4%~ 98 7%之间 ,与USABTV 10株的同源性最高 ,与AUSBTV 15株的同源性最低。该研究对于我国蓝舌病基因工程疫苗的研制及对该病分子流行病学的调查有着重要意义。 展开更多
关键词 蓝舌病病毒Z1株 VP7基因 RT-PCR 序列分析
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