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A novel missense mutation of the TYR gene in a pedigree with oculocutaneous albinism type 1 from China 被引量:5
1
作者 LIN Yu-ying WEI Ai-hua +3 位作者 ZHOU Zhi-yong ZHU Wei HE Xin LIAN Shi 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2011年第20期3358-3361,共4页
Background The mutation of the tyrosinase (TYR) gene results in oculocutaneous albinism type 1 (OCA1), an autosomal recessive genetic disorder. OCA1 is the most common type of OCA in the Chinese population. Hence,... Background The mutation of the tyrosinase (TYR) gene results in oculocutaneous albinism type 1 (OCA1), an autosomal recessive genetic disorder. OCA1 is the most common type of OCA in the Chinese population. Hence, the TYR gene was tested in this study. We also delineated the genetic analysis of OCA1 in a Chinese family. Methods Genomic DNA was isolated from the blood leukocytes of a proband and his family. Mutational analysis at the TYR locus by DNA sequencing was used to screen five exons, including the intron/exon junctions. A pedigree chart was drawn and the fundus of the eyes of the proband was also examined. Results A novel missense mutation p.1151S on exon 1, and homozygous TYR mutant alleles were identified in the proband. None of the mutants was identified among the 100 normal control subjects. Genetic analysis of the proband's wife showed normal alleles in the TYR gene. Thus, the fetus was predicated a carrier of OCA1 with a normal appearance. Conclusion This study provided new information about a novel mutation, p.1151S, in the TYR gene in a Chinese family with OCAI. Further investigation of the proband would be helpful to determine the effects of this mutation on TYR activity. 展开更多
关键词 oculocutaneous albinism type 1 MUTATION tyr gene EXON HOMOZYGOUS
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Tyrosinase (Tyr) Gene Mutation in Albino Mongolian Gerbil (Meriones unguiculatus) 被引量:1
2
作者 Takao Ukaji Masahiro A. Iwasa Osamu Kai 《Open Journal of Animal Sciences》 2016年第4期259-268,共10页
Tyrosinase is encoded by the Tyr (c or albino) locus and is the key enzyme in pigment biosynthesis. Loss of function of this enzyme caused by gene mutation results in albinism. Most cases of albinism are caused by mis... Tyrosinase is encoded by the Tyr (c or albino) locus and is the key enzyme in pigment biosynthesis. Loss of function of this enzyme caused by gene mutation results in albinism. Most cases of albinism are caused by missense mutations of tyrosinase. Albino mutations in Tyr have been identified in various animals, including human, mouse, rat, rabbit, cattle, cat, and ferret, but not in gerbil. We created two new gerbil strains: MON/Num/a (inbred agouti phenotype) and MON/Num/c (albino phenotype). Here, we report that four nucleotide substitutions in the Tyr gene caused two missense mutations in amino acids in the albino gerbil: a G-to-A mutation at position 204 in exon 1 caused R77H, and A-to-G at position 1392 and G-to-T at position 1393 in exon 5 caused Q473R. The substitution at position 1408 in exon 5 was silent. These missense mutations are conserved in all albino phenotypes we tested. Therefore, we suggest that these mutations are responsible for albinism in gerbil. 展开更多
关键词 tyrosinase (tyr) gene Mongolian Gerbil (Meriones unguiculatus) ALBINO
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鸡酪氨酸酶(TYR)基因启动子区序列结构特征分析
3
作者 宋兴超 陈敏 +3 位作者 安清明 孟金柱 赵园园 吴震洋 《特产研究》 2024年第6期53-59,64,共8页
为解析鸡酪氨酸酶(Tyrosinase,TYR)基因启动子区序列的结构特征及其转录调控机制,本研究基于NCBI数据库中鸡TYR基因5'侧翼区与外显子1共计2944bp核苷酸序列,利用不同在线软件对其核心启动子区、基本调控元件、转录因子结合位点与Cp... 为解析鸡酪氨酸酶(Tyrosinase,TYR)基因启动子区序列的结构特征及其转录调控机制,本研究基于NCBI数据库中鸡TYR基因5'侧翼区与外显子1共计2944bp核苷酸序列,利用不同在线软件对其核心启动子区、基本调控元件、转录因子结合位点与CpG岛等结构开展生物信息学预测分析,运用DNASTAR.Lasergene 17.3和MEGA 5.0软件对不同物种TYR基因启动子区序列进行相似性分析和系统进化树构建。结果表明,起始密码子上游1500~2 100 bp为鸡TYR基因潜在的候选核心启动子区域;5'侧翼区1604bp存在1个潜在的转录起始位点C;该基因启动子区存在1个CAAT-box、9个TATA-box和15个E-box,不存在CpG岛结构域。综合多种在线软件预测鸡TYR基因启动子区存在C/EBPalp、GATA-1、Oct-1、TBP、Sp1、NF-1、AP1、SRF和NF-κB等转录因子结合位点。鸡TYR基因启动子区序列与环颈雉、火鸡、鹌鹑、绿头野鸭、棕硬尾鸭、凤头潜鸭、猪、普通牛、水牛、杂交牛、山羊、绵羊、赤鹿、白尾鹿、马鹿和林麝相似性在41.2%~89.7%之间。系统进化树表明,鸡与鹌鹑、环颈雉和火鸡亲缘关系较近,与猪亲缘关系较远。本研究结果可为进一步探明鸡色素沉积关联TYR基因的转录调控机制提供理论依据。 展开更多
关键词 酪氨酸酶基因 启动子区 转录因子 调控元件
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不同鸡品种TYR基因遗传变异分析 被引量:11
4
作者 张建勤 陈宏 +3 位作者 孙兆军 刘小林 强巴央宗 顾玉兰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1153-1158,共6页
采用PCR-SSCP方法,对中国宁夏固原鸡、海南文昌鸡、西藏藏鸡和国外引进海赛克斯鸡TYR基因5′侧翼区及外显子13个位点(P1、P2、P3)的遗传变异进行研究。结果表明,P2位点无多态,P1位点在3个中国鸡品种中均出现3种基因型,分别为AA型、BB型... 采用PCR-SSCP方法,对中国宁夏固原鸡、海南文昌鸡、西藏藏鸡和国外引进海赛克斯鸡TYR基因5′侧翼区及外显子13个位点(P1、P2、P3)的遗传变异进行研究。结果表明,P2位点无多态,P1位点在3个中国鸡品种中均出现3种基因型,分别为AA型、BB型和AB型;在引进的海赛克斯鸡中,只检测到BB型和AB型2种类型。4个鸡品种在该位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态;P3位点在中国3个鸡品种中均检测到3种基因型,分别为AA型、BB型和AB型,而海赛克斯鸡中只检测到AA和AB型,固原鸡和文昌鸡在该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,藏鸡和海赛克斯鸡均处于极不平衡状态。进一步说明,中国地方鸡品种的TYR基因蕴藏丰富变异资源。经克隆测序分析,P1位点存在C→T的单碱基替换突变,P3位点存在G→A的单碱基替换突变,但未引起氨基酸突变。独立χ2分析显示,两位点基因型和等位基因分布在不同鸡品种之间存在显著或极显著差异(P<0.05和P<0.01),提示TYR基因的基因型和等位基因分布与鸡品种因素显著相关。本研究为以后对鸡TYR基因5′侧翼区及外显子1的进一步研究提供基础依据。 展开更多
关键词 tyr基因 PCR-SSCP
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武定乌骨鸡TYR基因多态性与黑色素沉积的关联研究 被引量:9
5
作者 徐志强 李丰耘 +5 位作者 赵净颖 豆腾飞 王坤 黄英 葛长荣 贾俊静 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期608-615,共8页
【目的】研究武定乌骨品系鸡与非乌骨品系鸡酪氨酸酶(TYR)基因多态性及TYR表达差异与黑色素沉积的关系,探究武定鸡乌骨品系鸡乌肉性状形成的分子机理。【方法】以武定乌骨品系鸡和非乌骨品系鸡为研究对象,测定两品系300只300日龄鸡血浆... 【目的】研究武定乌骨品系鸡与非乌骨品系鸡酪氨酸酶(TYR)基因多态性及TYR表达差异与黑色素沉积的关系,探究武定鸡乌骨品系鸡乌肉性状形成的分子机理。【方法】以武定乌骨品系鸡和非乌骨品系鸡为研究对象,测定两品系300只300日龄鸡血浆中TYR活力、总黑色素含量以及血浆比色OD值,采用直接测序法分析武定鸡TYR基因外显子的多态位点(SNPs),并检测各组织中TYR基因表达差异。【结果】与武定非乌骨品系鸡相比,武定乌骨品系鸡血浆各指标均较高;在TYR外显子区域共发现2个SNP位点(C2744T和C2866T),符合哈代温伯格平衡,呈中度多态;TYR基因C2744T位点CC基因型的血浆TYR活力以及总黑色素均高于其他基因型,并呈现较低亮度值的差异;在基因表达量方面,武定乌骨品系鸡各组织的TYR基因表达量均极显著高于武定非乌骨品系鸡(P<0.01)。【结论】TYR基因C2744T位点的CC基因型可作为武定乌骨品系鸡选育的遗传标记,其他指标可作为辅助参照。 展开更多
关键词 武定乌骨鸡 血浆 黑色素 tyr基因 SNPS
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TYR基因研究进展 被引量:19
6
作者 徐伟 封竣淇 +2 位作者 黄兰 蔡慧芬 罗卫星 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2017年第4期23-27,共5页
TYR基因是酪氨酸酶相关蛋白家族(Tyrosinase-related Protein)成员之一,酪氨酸酶是黑色素合成过程中的限速酶,TYR表达量及活性的高低直接影响真黑素与褐黑素的表达,进而对动物毛色产生影响。为深入了解TYR基因结构功能、多态性及TYR基... TYR基因是酪氨酸酶相关蛋白家族(Tyrosinase-related Protein)成员之一,酪氨酸酶是黑色素合成过程中的限速酶,TYR表达量及活性的高低直接影响真黑素与褐黑素的表达,进而对动物毛色产生影响。为深入了解TYR基因结构功能、多态性及TYR基因表达量与毛皮动物毛色的相关性,本文在查阅大量文献基础上,对TYR基因结构与功能以及在临床医学、畜牧生产上的应用研究等方面进行综述。通过综述大量文献发现,TYR基因突变不仅与人类皮肤白化病有明显关系,对哺乳动物被毛白化现象也有明显关系,而且在深色被毛哺乳动物中的表达量普遍高于浅色被毛哺乳动物。 展开更多
关键词 tyr基因 酪氨酸酶相关蛋白家族 黑色素 表达量
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水貂TYR基因T138A位点多态性及其与毛色性状的关联分析 被引量:6
7
作者 宋兴超 徐超 +5 位作者 刘宗岳 杨童奥 岳志刚 刘琳玲 丛波 杨福合 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第10期2973-2979,共7页
试验旨在检测水貂酪氨酸酶(tyrosinase,TYR)基因T138A位点的多态性,并分析其与水貂毛色表型的相关性。提取5种被毛色型430只水貂血液基因组DNA,采用PCR-RFLP技术,对TYR基因T138A位点进行多态性检测,统计等位基因频率与基因型频率,通过卡... 试验旨在检测水貂酪氨酸酶(tyrosinase,TYR)基因T138A位点的多态性,并分析其与水貂毛色表型的相关性。提取5种被毛色型430只水貂血液基因组DNA,采用PCR-RFLP技术,对TYR基因T138A位点进行多态性检测,统计等位基因频率与基因型频率,通过卡方(χ2)独立性检验分析该位点多态性与水貂毛色性状的相关性。结果表明,T138A位点存在2个等位基因T和A,形成TT、TA和AA 3种基因型,AA基因型在吉林白水貂群体中为优势基因型(0.9069),而TT基因型为金州黑水貂、珍珠水貂、咖啡水貂和银蓝水貂群体的优势基因型,其中在金州黑水貂群体中基因型频率最高(1.0000)。关联分析表明,TYR基因T138A位点的多态性与毛色性状呈极显著相关(P<0.0001)。表明TYR基因T138A位点可能是影响水貂毛色的主控位点或与调控白色被毛表型主控位点连锁的分子标记。 展开更多
关键词 水貂 tyr基因 T138A位点 PCR-RFLP 毛色
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鸭TYR基因序列的克隆与分析 被引量:3
8
作者 朱志明 郑嫩珠 +3 位作者 缪中纬 郑丽祯 李盛霖 陈晖 《福建农业学报》 CAS 2008年第3期247-250,共4页
根据鸡和鹌鹑的酪氨酸酶基因(TYR)保守序列设计1对引物,以半番鸭基因组为模板进行PCR扩增,将扩增出的序列进行克隆和测序,结果得到长为630 bp的序列。序列分析表明该基因片段包含外显子1部分序列,与鸡、鹌鹑和孔雀的TYR基因分别有93.5%... 根据鸡和鹌鹑的酪氨酸酶基因(TYR)保守序列设计1对引物,以半番鸭基因组为模板进行PCR扩增,将扩增出的序列进行克隆和测序,结果得到长为630 bp的序列。序列分析表明该基因片段包含外显子1部分序列,与鸡、鹌鹑和孔雀的TYR基因分别有93.5%、94.3%和93.4%的同源性,充分显示了TYR基因在进化上的保守性;对扩增序列进一步研究发现第133处存在G/A突变。该基因部分序列的克隆,为进一步开展研究TYR基因多态性与鸭羽色的相关性研究奠定基础。 展开更多
关键词 tyr基因 克隆 序列分析
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眼皮肤白化病Ⅰ型基因突变研究在产前诊断中的应用及一种致病性TYR基因新突变 被引量:3
9
作者 苗春越 闻人庆 +1 位作者 郑辉 李洪义 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期624-628,共5页
目的:对1名生育过眼皮肤白化病(OCA)先证者母亲再次怀孕的家庭进行酪氨酸酶(TYR)基因突变研究和产前基因诊断。方法:应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增TYR基因各外显子、外显子内含子交界区及启动子区,分别以异源双链分析法(HA)、变性高效... 目的:对1名生育过眼皮肤白化病(OCA)先证者母亲再次怀孕的家庭进行酪氨酸酶(TYR)基因突变研究和产前基因诊断。方法:应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增TYR基因各外显子、外显子内含子交界区及启动子区,分别以异源双链分析法(HA)、变性高效液相层析(DHPLC)和DNA序列测定技术分析先证者及其父母的基因突变,明确突变的致病性后,检测胎儿TYR基因相应位点与基因型。结果:先证者的基因型为c.232_233insGGG/c.841G>T,其父母基因型分别为c.232_233insGGG和c.841G>T突变杂合子。E281X具有致病性。胎儿未获得父亲的c.232_233insGGG突变和母亲的c.841G>T突变。HA和DHPLC法所获得结果与测序结果完全一致。结论:确定了先证者基因型,并检测出一种新的致病性突变c.841G>T。胎儿未获得致病性基因突变,具有正常的基因型。 展开更多
关键词 眼皮肤白化病Ⅰ型 tyr基因 基因突变 产前诊断
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略阳乌鸡酪氨酸酶基因(TYR)遗传变异分析 被引量:4
10
作者 路宏朝 张涛 +2 位作者 江海 李丽霞 樊鹏辉 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第5期1123-1127,共5页
试验通过PCR-SSCP技术检测略阳乌鸡酪氨酸酶基因(TYR)部分启动子区、全部外显子和部分内含子的遗传多样性,并对不同基因型进行了测序和比对分析。结果表明,略阳鸡群体在TYR位点具有较为丰富的遗传变异,在所检测的启动子区有2个单核苷酸... 试验通过PCR-SSCP技术检测略阳乌鸡酪氨酸酶基因(TYR)部分启动子区、全部外显子和部分内含子的遗传多样性,并对不同基因型进行了测序和比对分析。结果表明,略阳鸡群体在TYR位点具有较为丰富的遗传变异,在所检测的启动子区有2个单核苷酸多态(SNP)位点;外显子1有2个SNP位点,外显子2、3、4没有检测到变异位点,外显子5存在5个SNP位点;检测的部分内含子2中发现2个SNP位点。mRNA上的7个变异位点有3个发生在编码区,但都是同义突变,没有造成氨基酸变异。表明略阳乌鸡和普通鸡的酪氨酸酶没有氨基酸序列差异,TYR基因在鸡的遗传上是高度保守的。启动子区和内含子区的遗传变异是否与酪氨酸酶的转录剪接和表达量有关,进而影响乌鸡黑色素的沉积还有待进一步研究。 展开更多
关键词 略阳乌鸡 酪氨酸酶基因(tyr) 遗传变异
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不同代次羊驼皮肤黑素细胞TYR基因表达变化的研究 被引量:1
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作者 白瑞 程志学 +4 位作者 于志慧 尹志红 范瑞文 庞全海 董常生 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2016年第3期6-9,共4页
为了探讨TYR基因在体外培养的羊驼皮肤黑素细胞不同代次间表达变化差异,根据Gen Bank中已发现的序列(EU293064)设计引物和探针,以羊驼皮肤黑素细胞的RNA为模板,采用QRT-PCR Taq Man探针法研究羊驼酪氨酸酶基因在不同代次间羊驼皮肤黑素... 为了探讨TYR基因在体外培养的羊驼皮肤黑素细胞不同代次间表达变化差异,根据Gen Bank中已发现的序列(EU293064)设计引物和探针,以羊驼皮肤黑素细胞的RNA为模板,采用QRT-PCR Taq Man探针法研究羊驼酪氨酸酶基因在不同代次间羊驼皮肤黑素细胞中m RNA表达量.结果表明,经过内参基因校正后,第10代羊驼黑素细胞中TYR基因的相对表达量是第3代细胞相对表达量的25倍(P<0.01),第10代细胞与第5代细胞表达差异不明显(P>0.05)。表明TYR基因表达量的差异与羊驼皮肤黑素细胞传代可能存在一定的相关性。 展开更多
关键词 羊驼皮肤黑素细胞 tyr基因 QRT-PCR TAQ Man探针法 基因表达水平
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樱桃谷鸭TYR和VEGFA基因的表达研究 被引量:1
12
作者 李华 谭淑雯 +2 位作者 叶定泽 谭旭茹 谭旭杰 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2015年第23期21-24,共4页
本实验旨在探讨0~28日龄樱桃谷鸭的羽色变化及换羽的分子机制,用荧光定量PCR方法研究了酪氨酸酶基因(TYR)与血管内皮生长因子A基因(VEGFA)的m RNA表达谱。结果表明:0~7日龄绒羽色由黄变浅,21~28日龄绒羽逐渐变白并被幼羽取代;随着... 本实验旨在探讨0~28日龄樱桃谷鸭的羽色变化及换羽的分子机制,用荧光定量PCR方法研究了酪氨酸酶基因(TYR)与血管内皮生长因子A基因(VEGFA)的m RNA表达谱。结果表明:0~7日龄绒羽色由黄变浅,21~28日龄绒羽逐渐变白并被幼羽取代;随着日龄增长,TYR基因在心、肝的表达量被抑制(P〈0.05),而眼、肌肉、脑则大量表达(P〈0.01);皮肤TYR基因呈先升后降的趋势,在肺、肾的表达则是先升后降再升的波动表达。VEGFA基因在0~7日龄樱桃谷鸭的肝、皮肤、肺、肾、眼、肌肉中表达明显增加(P〈0.01),而心、脑降低(P〈0.05);21~28日龄,在心、肝、皮肤、肺、肾VEGFA表达下调(P〈0.01),在眼、肌肉、脑中的表达却上调(P〈0.05)。综上,0~28日龄的樱桃谷鸭羽毛颜色和换羽与TYR基因和VEGFA的抑制表达有关,两者之间有一定协同性。 展开更多
关键词 樱桃谷鸭 tyr基因 VEGFA基因 基因表达
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反义核酸抑制B16黑色素瘤细胞tyr基因的表达
13
作者 吉琼梅 朱振宇 +4 位作者 王晓华 张东方 张海涛 李秀英 马涧泉 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期1321-1325,共5页
目的:用反义核酸技术抑制小鼠B16黑色素瘤细胞酪氨酸酶基因(tyr)的表达。方法:构建tyr反义重组体pcDNA3.1(-)-tyr,用脂质体法导入B16细胞,用酪氨酸酶活性及黑色素含量测定,多巴染色及透射电镜等检测由反义重组体pcDNA3.1(-)-tyr转录产生... 目的:用反义核酸技术抑制小鼠B16黑色素瘤细胞酪氨酸酶基因(tyr)的表达。方法:构建tyr反义重组体pcDNA3.1(-)-tyr,用脂质体法导入B16细胞,用酪氨酸酶活性及黑色素含量测定,多巴染色及透射电镜等检测由反义重组体pcDNA3.1(-)-tyr转录产生的tyr反义核酸对B16细胞tyr表达的抑制情况。结果:成功构建了反义重组体pcDNA3.1(-)-tyr,转染了反义重组体的B16细胞其酪氨酸酶活性为0.0498±0.0036,显著低于对未转染组B16细胞的0.0916±0.0132(P<0.01);转染空质粒pcDNA3.1(-)及真核表达重组体pcDNA3.1(+)-tyr组B16细胞的氨酸酶活性分别为0.1015±0.0166和0.0948±0.0096,两者同对照组相比均无显著差异(P>0.05)。多巴染色及电镜观察结果表明转染了反义重组体的B16细胞其黑色素颗粒的含量明显低于对照组。结论:反义核酸可以显著抑制B16黑色素瘤细胞tyr的表达。 展开更多
关键词 核苷酸 反义 黑色素瘤 一元酚单元酶 基因 tyr
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饲料浮萍水平对大正三色锦鲤TYR及MC1R基因表达的影响 被引量:5
14
作者 张植元 魏东 +4 位作者 乔秀亭 白东清 范泽 李静辉 安贸麟 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期172-177,共6页
为探究饲料中不同浮萍添加水平对大正三色锦鲤酪氨酸酶TYR以及黑素皮质素受体MC1R基因表达的影响,配制浮萍添加水平分别为0%、3%、6%、9%、13%、14%6种等蛋白(38.6%)饲料饲养大正三色锦鲤(42.19±1.32)g 8周,分别记为Diet 1(0/13)、... 为探究饲料中不同浮萍添加水平对大正三色锦鲤酪氨酸酶TYR以及黑素皮质素受体MC1R基因表达的影响,配制浮萍添加水平分别为0%、3%、6%、9%、13%、14%6种等蛋白(38.6%)饲料饲养大正三色锦鲤(42.19±1.32)g 8周,分别记为Diet 1(0/13)、Diet 2(3/10)、Diet 3(6/7)、Diet 4(9/4)、Diet 5(13/1)、Diet 6(14/0)。每种饲料设3个重复,每个重复饲喂10尾鱼。试验结果表明:(1)TYR基因在大正三色锦鲤的心脏、肝脏、眼睛、黑色皮肤、脑中均有表达,并且在脑、皮肤、眼睛中表达量相对较高;(2)各组织中TYR mRNA表达量随浮萍添加水平的升高均有一定波动,在皮肤与眼睛中,以Diet 6(14/0)组显著高于其他各组(P<0.05),在脑中,以Diet 3(6/7)组显著高于除Diet 6的其他各组(P<0.05);(3)皮肤与眼睛中MC1R mRNA表达量以Diet 6(14/0)组显著高于其他各组(P<0.05),而在脑中各组差异均不显著(P>0.05)。综上所述,在本试验条件下,饲料不同浮萍添加水平促进大正三色锦鲤TYR以及MC1R基因表达,有利于鱼体黑色素沉积,因此选择Diet 6(14/0)组饲料投喂大正三色锦鲤最适。 展开更多
关键词 浮萍 大正三色锦鲤 tyr基因 MC1R基因 黑色素
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TYR基因多态性与哈萨克羊毛色相关的研究 被引量:4
15
作者 木合依扎.热很别克 孙军 +5 位作者 何军敏 阿依达尔.霍江台 李新鹏 王东海 雒诚龙 余雄 《新疆农业大学学报》 CAS 北大核心 2016年第4期307-310,共4页
采集新疆伊犁哈萨克自治州特克斯县4种不同被毛颜色2~3周岁的216只哈萨克母羊血样,其中黑色被毛羊51只,棕色被毛羊50只,青灰色59只,白色被毛羊56只。运用PCR-SSCP及测序方法对TYR基因多态性及其对哈萨克羊毛色的影响进行分析。结果表明,... 采集新疆伊犁哈萨克自治州特克斯县4种不同被毛颜色2~3周岁的216只哈萨克母羊血样,其中黑色被毛羊51只,棕色被毛羊50只,青灰色59只,白色被毛羊56只。运用PCR-SSCP及测序方法对TYR基因多态性及其对哈萨克羊毛色的影响进行分析。结果表明,TYR基因存在3种基因型:AA、AB和BC型。在白色和青灰色被毛群体中,AB基因型为优势基因型。在棕色和黑色被毛群体中,AA基因型为优势基因型。在此群体中A等位基因为4种毛色的优势等位基因。经χ2检验,TYR基因的基因型频率在4种毛色羊中的分布差异不显著(P〉0.05)。 展开更多
关键词 哈萨克绵羊 tyr基因 PCR-SSCP 遗传多态性
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黔北麻羊TYR基因多态性及生物信息学分析 被引量:4
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作者 翁吉梅 罗铮 +4 位作者 徐伟 封竣琪 黄兰 蔡惠芬 罗卫星 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2018年第1期60-64,共5页
为研究黔北麻羊毛色形成的遗传机制,本实验对黔北麻羊哺乳动物酪氨酸酶(TYR)基因外显子区域运用混合DNA池结合PCR产物直接测序方法进行多态性分析,在TYR基因外显子区域共筛选出5个SNPs,分别为Exon1-G617A、Exon1-G685T、Exon3-C1236T(As... 为研究黔北麻羊毛色形成的遗传机制,本实验对黔北麻羊哺乳动物酪氨酸酶(TYR)基因外显子区域运用混合DNA池结合PCR产物直接测序方法进行多态性分析,在TYR基因外显子区域共筛选出5个SNPs,分别为Exon1-G617A、Exon1-G685T、Exon3-C1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T(Gly-Glu)、Exon5-T1862C;进而利用生物信息学分析软件对PCR扩增所获序列进行m RNA二级结构及蛋白质二级结构和三级结构分析,发现Exon3-C1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T(Gly-Glu)引起m RNA二级结构的改变,其中Exon1-G685T、Exon3-C1236T(Asn-Lys)、Exon5-T1862C突变导致其m RNA二级结构最小自由能增大,即二级结构稳定性降低,其错义突变位点Exon3-C1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T(Gly-Glu)均引起蛋白质二级结构和三级结构的改变。 展开更多
关键词 黔北麻羊 tyr基因 SNPS 生物信息学
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他留乌骨鸡TYR基因多态性与色素性状相关性分析 被引量:7
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作者 陆晓屏 滕召纯 +4 位作者 李庆华 孙利民 王玉祥 张斌 史宪伟 《中国家禽》 北大核心 2015年第17期17-22,共6页
通过研究鸡酪氨酸酶(TYR)基因多态性与羽色、肤色等色素性状相关性,为他留乌骨鸡色素性状基因纯化及分子标记选择提供科学依据。采用PCR扩增池测序与PCR-RFLP标记技术,研究他留乌骨鸡麻羽、白羽和黑羽3个羽色类群以及乌骨鸡与非乌骨鸡2... 通过研究鸡酪氨酸酶(TYR)基因多态性与羽色、肤色等色素性状相关性,为他留乌骨鸡色素性状基因纯化及分子标记选择提供科学依据。采用PCR扩增池测序与PCR-RFLP标记技术,研究他留乌骨鸡麻羽、白羽和黑羽3个羽色类群以及乌骨鸡与非乌骨鸡2种类群的TYR基因多态性,计算等位基因频率与基因型频率,并与色素性状进行了关联分析。结果显示,在他留乌骨鸡中共检测到20个SNP位点,其中2个SNP引起氨基酸改变。建立了TYR基因HindⅢ和MseⅠ两个PCR-RFLP分子标记,利用这两个标记对所有受试个体进行基因分型,关联分析提示,他留乌骨鸡TYR基因变异与羽色性状显著相关,但与肤色等乌骨性状相关不显著。TYR基因MseⅠPCR-RFLP标记可能是影响羽色性状变异的一个分子标记。 展开更多
关键词 他留乌骨鸡 tyr基因 SNP RFLP 羽色
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獭兔Tyr基因外显子3多态性检测及序列分析 被引量:2
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作者 赵博昊 施丽娟 +5 位作者 闫晓荣 郝晔 朱杰 陈阳 翁巧琴 吴信生 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期1111-1116,共6页
以不同獭兔群体为研究对象,采用PCR-SSCP技术检测了Tyr基因外显子3的多态性,针对獭兔Tyr基因外显子3中的碱基突变,进行了生物信息学预测比较分析,以期为獭兔毛色形成机制提供分子生物学基础。结果表明,外显子3存在2个等位基因、3种基因... 以不同獭兔群体为研究对象,采用PCR-SSCP技术检测了Tyr基因外显子3的多态性,针对獭兔Tyr基因外显子3中的碱基突变,进行了生物信息学预测比较分析,以期为獭兔毛色形成机制提供分子生物学基础。结果表明,外显子3存在2个等位基因、3种基因型,A1118C的突变导致编码的赖氨酸变成了苏氨酸。白色和青紫蓝色獭兔各基因型和基因型频率的卡方适合性检验结果显示,BB基因型频率在青紫蓝色獭兔和白色獭兔中均较高,说明等位基因B是青紫蓝色獭兔群体和白色獭兔中的优势等位基因。Hardy-Weinberg平衡检验结果表明,两个群体均处于平衡状态。青紫蓝色獭兔群体的多态信息含量为中度多态(0.25<PIC<0.50),白色獭兔群体的多态信息含量为低度多态(PIC<0.25)。青紫蓝色獭兔杂合度较高,白色獭兔杂合度较低。生物信息学分析结果表明,外显子3中A1118C的突变未改变TYR蛋白质的理化性质、二硫键、跨膜结构、信号肽、磷酸化位、二级结构和三级结构,但改变了TYR蛋白质的糖基化位点,从而有可能影响到TYR蛋白质的功能。 展开更多
关键词 tyr基因 外显子3 多态性 序列分析
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半滑舌鳎酪氨酸酶基因(TYR)和多巴色素异构酶基因(DCT)的克隆表达与分析 被引量:4
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作者 吴垚磊 李仰真 +3 位作者 王娜 马腾 赵玉柱 陈松林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2021年第6期42-52,共11页
作为我国鲆鳎鱼类中的一种主要养殖品种,半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)有时会发生无眼侧黑化(Melanism)、有眼侧白化(Albinism)的体色异常现象。本研究克隆了半滑舌鳎体色相关的酪氨酸酶基因(TYR)和多巴色素异构酶基因(DCT)的cDNA序... 作为我国鲆鳎鱼类中的一种主要养殖品种,半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)有时会发生无眼侧黑化(Melanism)、有眼侧白化(Albinism)的体色异常现象。本研究克隆了半滑舌鳎体色相关的酪氨酸酶基因(TYR)和多巴色素异构酶基因(DCT)的cDNA序列,并对这2个基因进行系统发育分析和时空表达分析。实验获得了TYR基因编码区cDNA序列长度为1620 bp,编码539个氨基酸;DCT基因编码区cDNA序列长度为1551 bp,编码516个氨基酸。结果显示,TYR和DCT在20日龄前的鱼苗体内表达量较高,尤其是在变态关键时期(15~20日龄)表达量最高,30日龄时的表达量锐减到很低水平;在其他时期的皮肤组织中,这2个基因在有眼侧正常皮肤和无眼侧黑化皮肤的表达量最高,在有眼侧白化皮肤和无眼侧正常皮肤中表达量极低;在其他时期的其他组织中,在眼睛中的表达量最高,其次是肝脏,在脾脏和肌肉中表达量极低。研究表明,TYR和DCT基因是半滑舌鳎无眼侧黑化发生和有眼侧体色维持的关键基因。本研究为查明半滑舌鳎体色异常机制提供了重要依据和参考。 展开更多
关键词 半滑舌鳎 体色 酪氨酸酶基因(tyr) 多巴色素异构酶基因(DCT)
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不同毛色贵州水牛MC1R、TYR基因SNP研究 被引量:7
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作者 敖啟燕 胡玲玲 +3 位作者 罗师红 赵永超 王振 刘若余 《中国牛业科学》 2015年第4期12-17,共6页
[目的]为促进贵州白水牛资源保护与开发的科学性,同时为品种选育提供更加充分的科学依据。[方法]本实验以贵州水牛(灰色)为对照组,以贵州白水牛为实验组分别构建DNA池,对不同毛色贵州水牛的MC1R基因和TYR基因进行PCR扩增并确定SNP位点,... [目的]为促进贵州白水牛资源保护与开发的科学性,同时为品种选育提供更加充分的科学依据。[方法]本实验以贵州水牛(灰色)为对照组,以贵州白水牛为实验组分别构建DNA池,对不同毛色贵州水牛的MC1R基因和TYR基因进行PCR扩增并确定SNP位点,并利用生物信息学软件分析突变位点对RNA的二级结构,蛋白质的二、三级结构的影响。[结果]在贵州水牛(灰色)和贵州白水牛扩增的MC1R基因中共同筛选到错义突变exon1-T843C,导致缬氨酸(Val)变成丙氨酸(Ala),还在贵州水牛(灰色)中筛选到exon1-C1228T(同义)、exon1-G1330A两个突变位点。在两种水牛扩增的TYR基因共同筛选到2个错义突变exon1-G826A、exon5-T70C,分别导精氨酸(Arg)突变为组氨酸(His)、亮氨酸(Leu)突变为异亮氨酸(Ile);1个同义突变exon3-A83G。 展开更多
关键词 贵州水牛 MC1R基因 tyr基因 SNPS
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