茄子SmU2AF^65基因的可变剪接

U2AF(U2 snRNP auxiliary factor)是参与前体mRNA剪接的重要辅助因子,在进化上具有较高保守性。文章根据茄子BAC 77N19(GenBank登录号:EF517791)的基因组序列信息和烟草NpU2AF65a和NpU2AF65b基因的全长cDNA序列,设计特异引物,经cDNA末端快速扩增法(RACE)获得了1986bp的茄子同源基因(SmU2AF65)全长cDNA,GenBank登录号为EU543263。序列分析表明该序列包含1665bp的可阅读框,编码554个氨基酸,在氨基酸序列的C末端有3个保守的RNA识别结构域RRM。RT-PCR分析表明,SmU2AF65基因在不同组织中均有表达,但是该基因通过可变剪接至少能够产生两个转录本,在根中产生与其他组织中不同的剪切子。