基于Ualcan数据库分析WASH2P在结肠癌中的表达及预后

目的通过Ualcan数据库分析WASH2P在结直肠癌中的表达及意义。方法利用UALCAN数据库分析结肠癌中WASH2P的表达水平,并分析其与肿瘤分期、种族、性别、体重、病理亚型之间的关系;对WASH2P进行生存分析,并利用GEPIA数据库进行验证;对结肠癌中WASH2P与MSH5和PMS2的协同表达情况进行分析。结果 WASH2P在结肠癌组织中的表达高于正常组织,WASH2P高表达的结肠癌患者预后差,WASH2P与MSH5、PMS2的表达存在明显的相关性。结论 WASH2P可能是治疗结肠癌的潜在靶点。

基于Ualcan数据库分析caspase-7在结肠癌中的表达和意义

目的通过Ualcan数据库探讨caspase-7(CASP7)在结肠癌中的表达和意义。方法统计Ualcan数据库中CASP7在结肠癌中的表达情况并进行生存分析,通过Oncolnc数据库对得出的结果进行验证。并分析CASP7与KRAS基因和TP53I3基因的协同表达情况。结果在结肠癌中,CASP7的表达较低,且低表达者的预后劣于高表达者。CASP7与KRAS基因和TP53I3基因存在共表达。结论CASP7在结肠癌中存在低表达且与不良预后相关。

基于公共数据库分析MFAP2在食管癌中表达及其预后意义

目的探讨微纤维相关糖蛋白2(MFAP2)基因在食管癌中的表达及预后意义。方法检索Oncomine和GEPIA数据库中有关MFAP2的基因表达信息,利用UALCAN数据库从不同临床信息分析MFAP2在食管癌组织中的基因表达。采用Kaplan-Meier Plotter在线网站进行预后分析。利用STRING构建MFAP2蛋白互作网络。结果Oncomine及GEPIA分析表明MFAP2基因在食管癌组织中表达上调。UALCAN分析表明:与癌旁组织相比,MFAP2基因在21~60岁人群、1级食管癌患者、吸烟的患者中显著上调。Kaplan-Meier Plotter在线网站分析表明当MFAP2基因高表达时,食管腺癌患者的预后较差。探索MFAP2在不同临床信息的食管腺癌患者的生存预后关系,结果显示:在男性、调节性T细胞等免疫细胞浸润的食管腺癌患者中预后较差。蛋白互作网络分析提示MFAP2可能引起染色体异常。结论MFAP2是食管腺癌中潜在的癌基因,可能与染色体异常相关,其中肿瘤微环境中的免疫细胞影响着食管腺癌的预后,其有望成为诊断和治疗食管腺癌的重要生物学指标。

基于数据分析CDKN2A基因在软组织肉瘤中的表达和意义

目的:分析挖掘CDKN2A基因与软组织肉瘤之间的关系。方法:利用GEPIA数据库、UALCAN数据库及String数据库中的数据资料,分析比较CDKN2A基因在软组织肉瘤中的表达及与临床生存期及相关上下游蛋白的关系。结果:CDKN2A基因在软组织肉瘤组织中高度表达,但其表达与临床预后无统计学差异,仅仅表现出相关性趋势。与CDKN2A基因关系紧密的上下游基因蛋白有11个,相互作用关系较为复杂。结论:CDKN2A基因表达与软组织肉瘤高度相关,并且在软组织肉瘤中参与多条细胞信号通路,所起的作用非常复杂,可作为研究软组织肉瘤病因及治疗的切入点。

基于数据库挖掘分析TPX2基因在肺腺癌中的表达及意义

目的探讨TPX2基因在肺腺癌中的表达及临床意义。方法通过检索Oncomine、Ualcan、GEPIA在线数据库中有关TPX2的信息,并对所获取的数据库资料中关于TPX2在肺腺癌中的研究进行荟萃分析。结果Oncomine数据库中肺腺癌和正常组织中TPX2表达有差异的有8项,共有869例样本。荟萃分析8项研究成果,结果显示肺腺癌中TPX2的表达高于正常组织(P<0.05);Ualcan结果表明,男性患者TPX2含量高于女性;肺腺癌患者TPX2表达与肿瘤分期、年龄、种族无关;GEPIA数据库中生存分析曲线结果显示肺腺癌患者TPX2水平越高,生存时间越短,预后更差(P<0.05)。结论TPX2在肺腺癌组织中呈现高表达,TPX2与肺腺癌患者预后密切相关,TPX2为肺腺癌治疗提供新的治疗靶点。

基于数据挖掘分析ABCB5基因在恶性黑色素瘤中的表达和意义

目的:挖掘ABCB5基因与恶性黑色素瘤之间的关系。方法:利用GEPIA数据库、UALCAN数据库及String数据库中的数据资料,分析比较ABCB5基因在恶性黑色素瘤中的表达及与病理分期、临床生存期及相关上下游蛋白的关系。结果:ABCB5基因在恶性黑色素瘤组织中高度表达,但其表达与肿瘤的病理分期、临床预后等方面无统计学差异,仅仅表现出相关性趋势。与ABCB5基因关系紧密的上下游基因蛋白有10个,之间相互作用关系较为复杂,尤其与SLC22C14、KDM5B及CD44三者之间有密切的相互作用。结论:ABCB5基因是恶性黑色素瘤细胞中高度特异性表达的基因之一,在恶性黑色素瘤细胞中参与多条信号通路,所起的作用非常复杂,可作为研究恶性黑色素瘤发生及治疗的切入点。

基于数据库分析KIF4A基因在肾透明细胞癌中临床意义

目的:分析驱动蛋白超家族4A(KIF4A)在肾透明细胞癌中的表达和预后的关系,并探索其潜在机制。方法:从UALCAN数据库中检索KIF4A基因在肾透明细胞癌中信息,包括表达水平、生存分析和正负相关基因数据,可以得到KIF4A在肾透明细胞癌中的表达水平、预后信息以及潜在机制。结果:在肾透明细胞癌中KIF4A高表达,其中男性患者高于女性患者,肿瘤级别越高、N分期越晚,其表达也越高(P<0.05);生存分析表明KIF4A的表达水平和预后呈负相关(P<0.05);细胞周期蛋白B2(CCNB2)、驱动蛋白超家族23(KIF23)、细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)与KIF4A存在着明显正相关,而短链脱氢酶家族12(DHRS12)、细胞极性蛋白3(CRB3)、β-羟丁酸脱氢酶2(BDH2)与KIF4A存在着负相关,它们之间的相互关系可能是其潜在机制。结论:KIF4A在肾透明细胞癌发生发展中扮演重要的角色,可作为潜在的肾透明细胞癌诊断、预后的标志物和治疗靶点,包括儿童。

CEACAM5在肺腺癌中的表达及临床意义

目的通过检测癌胚抗原相关细胞黏附分子5(CEACAM5)在肺腺癌中的表达,探究其临床意义及预后。方法回顾性分析2016年8月-2017年8月在本院确诊为肺腺癌的患者51例,取肺腺癌患者病变肺部组织作为实验组;从中选取42例取癌旁组织作为对照组。采用免疫组化SP法检测肺部肺腺癌组织和癌旁组织CEACAM5的表达,并利用UALCAN数据库(http://ualcan.path.uab.edu/analysis.html)分析肺腺癌中CEACAM5的表达与性别、年龄、分期的关系;采用Kaplan-Meier生存曲线对CEACAM5进行生存分析,COX回归分析影响肺腺癌的因素,并分析肺腺癌中CEACAM5表达与CEACAM6、CEACAM1的相关性。结果 Ualcan数据库显示CEACAM5在肺腺癌组织中的表达高于正常组织(P<0.05);CEACAM5高表达的肺腺癌患者远期生存率与低表达患者相比,差异无统计学意义(P>0.05);肺腺癌中CEACAM5与CEACAM6、CEACAM1存在明显的相关性(r=0.48,0.43,P<0.05)。本实验结果显示,实验组CEACAM5阳性率62.75%高于对照组21.43%(P<0.05),其中CEACAM5阳性组在年龄、临床分期、淋巴结转移、肿瘤分化程度、肿瘤大小与阴性组比较差异有统计学意义(P<0.05);Kaplan-Meier生存曲线显示,CEACAM5阳性表达患者生存率50%,低于阴性表达生存率78.9%,两组比较log-rank值为4.324,P=0.038;COX回归分析显示,CEACAM5及临床分期、淋巴结转移均是影响肺腺癌预后的危险因素。结论肺腺癌患者CEACAM5阳性率高于癌旁组织,与肺腺癌患者预后有关,且CEACAM5及临床分期、淋巴结转移,均是影响肺腺癌预后的危险因素,推测CEACAM5可能是治疗肺腺癌的潜在靶点。

GTSE1基因在乳头状肾细胞癌中的表达及临床意义

目的通过数据库探索G2/S期应答相关蛋白1(GTSE1)在乳头状肾细胞癌中的表达及意义。方法通过UALCAN数据库明确GTSE1在乳头状肾细胞癌中的表达差异并进行生存分析,进一步明确GTSE1相关基因,随后利用Metascape工具对相关基因进行通路富集,最后通过OncoLnc数据库对生存分析结果进行验证。结果与正常组相比,GTSE1在乳头状肾细胞癌中高表达(P<0.001),并且以组织亚型、癌症临床分期以及淋巴结转移等作进一步分析后发现,GTSE1在亚组中依然显著高表达(P<0.05),且GTSE1高表达患者生存率显著降低(P<0.01)。同时,乳头状肾细胞癌中GTSE1启动子区甲基化水平显著降低(P<0.001)。通路富集结果表明,GTSE1相关基因主要富集在细胞周期相关通路。结论GTSE1在乳头状肾细胞癌中显著高表达,且与患者不良预后显著相关,其可能通过调控细胞周期来发挥促癌作用。

CLIC3在胰腺癌中的表达及预后相关性的生物信息学分析

目的:通过GEPIA和Ualcan数据库分析CLIC3在胰腺癌中的表达及意义。方法:分析CLIC3在胰腺癌中的表达水平,同时分析其与肿瘤分期、性别、年龄、病理亚型和甲基化之间的关系;利用GEPIA数据库分析CLIC3在胰腺癌的预后和无病生存期的表达情况,对胰腺癌中CLIC3与MMP28和TRIM29的协同表达情况进行分析。结果:CLIC3在胰腺癌组织中的表达高于正常组织,与肿瘤年龄、性别和病理组织学分级存在部分相关性,CLIC3高表达的胰腺癌患者预后较差,CLIC3与MMP28和TRIM29的表达存在明显的正相关性。结论:CLIC3可能是治疗胰腺癌的潜在靶点。