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定位于染色体9p21-22的一个新基因UBAP1的克隆测序及在鼻咽癌中的表达分析
被引量:
8
1
作者
钱骏
王洁如
+6 位作者
向秋
阳剑波
张小慧
张必成
曹莉
李伟芳
李桂源
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第3期299-305,共7页
在染色体 9p2 1 2 2鼻咽癌杂合性丢失 (lossofheterozygosity,LOH)高频区 ,应用EST介导的定位 侯选克隆策略 ,用RT PCR及Northern杂交检测了 2 2个表达序列标记 (expressedsequencetag ,EST)在鼻咽癌细胞株HNE1和原代培养的正常鼻咽上...
在染色体 9p2 1 2 2鼻咽癌杂合性丢失 (lossofheterozygosity,LOH)高频区 ,应用EST介导的定位 侯选克隆策略 ,用RT PCR及Northern杂交检测了 2 2个表达序列标记 (expressedsequencetag ,EST)在鼻咽癌细胞株HNE1和原代培养的正常鼻咽上皮细胞中的表达差异 ,并对其中一个在鼻咽癌细胞株HNE1中表达下调的EST检测了在鼻咽癌活检组织中的表达 .用生物信息学方法获得其全长cDNA序列 ,GenBank登录号AF2 2 2 0 4 3.该基因cDNA全长 2 70 1bp ,其开放阅读框 (openreadingframe ,ORF)编码一个含 50 2个氨基酸、分子量为 55kD的碱性蛋白质 ,在蛋白羧基端含有 2个连续的重要UBA功能域 (ubiquitinassociateddomain) ,属于遍在蛋白相关蛋白家族的一个新成员 ,经国际人类基因命名委员会同意 ,将其命名为UBAP1 (ubiquitinassociatedprotein 1 ) .Northern表达分析显示UBAP1在所检测的人组织中广泛表达 ,但在人的心脏、骨骼肌及肝脏中的表达较强 .UBAP1基因在63 2 % ( 1 2 1 9)的鼻咽癌活检组织中表达下调 .UBAP1基因作为一个遍在蛋白相关蛋白家族的新成员 ,结合其在 9p的重要定位信息 ,有必要进一步研究其表达下调参与鼻咽癌发生发展的可能机制 .
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关键词
鼻咽癌
染色体9p
基因克隆
表达分析
uba功能域
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题名
定位于染色体9p21-22的一个新基因UBAP1的克隆测序及在鼻咽癌中的表达分析
被引量:
8
1
作者
钱骏
王洁如
向秋
阳剑波
张小慧
张必成
曹莉
李伟芳
李桂源
机构
中南大学湘雅医学院肿瘤研究所
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第3期299-305,共7页
基金
国家 8 63高科技项目 (No .10 2 10 0 1 0 5
Z19 0 1 0 1 0 3 )
+1 种基金
国家重点基础研究发展规划 973项目 (No .G19980 5 10 0 8)
美国
文摘
在染色体 9p2 1 2 2鼻咽癌杂合性丢失 (lossofheterozygosity,LOH)高频区 ,应用EST介导的定位 侯选克隆策略 ,用RT PCR及Northern杂交检测了 2 2个表达序列标记 (expressedsequencetag ,EST)在鼻咽癌细胞株HNE1和原代培养的正常鼻咽上皮细胞中的表达差异 ,并对其中一个在鼻咽癌细胞株HNE1中表达下调的EST检测了在鼻咽癌活检组织中的表达 .用生物信息学方法获得其全长cDNA序列 ,GenBank登录号AF2 2 2 0 4 3.该基因cDNA全长 2 70 1bp ,其开放阅读框 (openreadingframe ,ORF)编码一个含 50 2个氨基酸、分子量为 55kD的碱性蛋白质 ,在蛋白羧基端含有 2个连续的重要UBA功能域 (ubiquitinassociateddomain) ,属于遍在蛋白相关蛋白家族的一个新成员 ,经国际人类基因命名委员会同意 ,将其命名为UBAP1 (ubiquitinassociatedprotein 1 ) .Northern表达分析显示UBAP1在所检测的人组织中广泛表达 ,但在人的心脏、骨骼肌及肝脏中的表达较强 .UBAP1基因在63 2 % ( 1 2 1 9)的鼻咽癌活检组织中表达下调 .UBAP1基因作为一个遍在蛋白相关蛋白家族的新成员 ,结合其在 9p的重要定位信息 ,有必要进一步研究其表达下调参与鼻咽癌发生发展的可能机制 .
关键词
鼻咽癌
染色体9p
基因克隆
表达分析
uba功能域
Keywords
nasopharyngeal neoplasms,chromosome 9p,gene cloning,gene expression,
uba
domain
分类号
R739.63 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
定位于染色体9p21-22的一个新基因UBAP1的克隆测序及在鼻咽癌中的表达分析
钱骏
王洁如
向秋
阳剑波
张小慧
张必成
曹莉
李伟芳
李桂源
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001
8
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