基于细胞焦亡相关基因表达谱的子宫内膜癌预后模型构建

目的:筛选在子宫内膜癌(UCEC)中具有预后价值的细胞焦亡相关基因并构建风险评分模型,进一步构建整合细胞焦亡基因表达谱和临床病理参数的UCEC预后列线图(Nomogram)。方法:基于癌症基因组图谱数据库(TCGA)筛选UCEC细胞焦亡相关差异表达基因。通过最小绝对收缩和选择算子(Lasso)回归获得细胞焦亡相关预后基因并构建风险评分模型。使用受试者工作特征曲线(ROC)评估模型的特异度和敏感度。根据风险值(risk)的中位数将患者划分为高风险组和低风险组,整合临床病理信息(临床分期、病理分级和肿瘤类型),采用Kaplan-Meier法进行生存分析,使用单样本基因集富集分析(ssGSEA)评估28种免疫细胞浸润丰度。比较高风险组和低风险组的临床病理分型、预后特征和免疫细胞浸润程度的差异。结合临床变量(年龄和临床病理分期),通过逐步回归方法获得最优变量组合建立Nomogram,使用ROC和校准曲线对Nomogram进行评估。结果:13种细胞焦亡基因在UCEC组织中的表达高于癌旁组织(P<0.05)。进一步获得由9种有预后价值的细胞焦亡基因组成的表达谱,并据此构建风险评分模型。预后风险模型1年、3年和5年的生存预测性能AUC值分别是0.627、0.722和0.770。百分比柱状图显示,临床分期、病理分级和肿瘤类型在高风险组、低风险组间所占比例存在差异,高风险组表现出更差的临床分期、病理分级和更高的复发风险。生存分析显示,低风险组患者的总生存期(OS)显著高于高风险组(P<0.001)。ssGSEA分析表明,低风险组中20种免疫细胞的浸润程度高于高风险组(P<0.05)。Nomogram的C指数(C-index)为0.681(95%CI为0.618~0.742,P<0.001),预测总生存时间方面表现出良好的准确性。校准曲线分析显示,校准预测曲线与实际观测结果一致性较高。结论:本研究通过9种细胞焦亡相关基因构建UCEC预后模型,该模型具有良好的预测能力和稳定性,可帮助患者生存预后评估及优化治疗策略。

子宫内膜癌合并糖尿病患者PAX8的表达及意义

目的:探讨配对盒基因8(PAX8)在子宫内膜癌(UCEC)中的表达及意义。方法:RT-PCR检测PAX8在癌组织和正常组织中的表达,分析PAX8的表达与UCEC临床病理特征的相关性及影响预后的因素;全自动生化分析仪检测UCEC患者血糖水平。结果:PAX8在癌组织中的表达高于正常组织(P<0.05);PAX8的表达与UCEC临床分期、年龄、病理分型、病理分级、浸润深度及特异性生存(DSS)有相关性(P<0.05)。回归分析显示,PAX8的表达是影响UCEC患者预后的因素(P<0.05),且低表达患者(特别是合并糖尿病的低表达患者)有较长的肿瘤总生存期(OS)(P<0.05)。合并糖尿病的UCEC患者PAX8的表达水平较高(P<0.05),且患者血糖水平较高(P<0.05)。结论:PAX8的高表达可能在UCEC预后特别是合并糖尿病的患者中扮演着重要作用。

miRNA-519a在子宫内膜癌中的诊断及预后价值及机制探寻

目的利用TCGA数据库探寻miRNA-519a在子宫内膜癌中的诊断及预后价值及机制。方法通过对TCGA数据库中UCEC数据进行差异表达和生存分析,挑选出肿瘤组织中显著高表达且高表达提示预后不良的miRNA,并对该miRNA的靶基因进行富集分析,将富集出的关键通路中的mRNA与UCEC组织中低表达的mRNA交集,找出miRNA在UCEC中的靶基因和通路,并进一步利用双荧光素酶报告基因分析检测miRNA与靶基因mRNA的靶向结合进而调控其功能。结果TCGA-UCEC数据库中癌旁组织和癌组织存在不同miRNA差异表达,共148个miRNA上调,75个miRNA下调(|logFC|>2);进一步对差异表达miRNA进行预后分析发现,和正常组织相比,miRNA-519a在UCEC组织中显著高表达,且高表达的患者预后不良;通过mirDB数据库预测miRNA-519a靶基因(共685个),并用DAVID数据库将这些mRNA进行KEGG-PATHWAY富集分析,发现miRNA-519a的靶基因富集于肿瘤相关通路,且该通路相关基因中PDGFRA和TGFBR2在UCEC组织中显著低表达;双荧光素酶报告基因分析证明,miRNA-519a可与PDGFRA和TGFBR2 mRNA的3'-UTR直接结合并抑制两者的表达。结论miRNA-519a能够作为UCEC诊断和预后的生物标志物,miRNA-519a通过调控PDGFRA和TGFBR2的表达进而调控肿瘤的进程。