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延边牛UCP1基因CDS区克隆、生物信息学分析及组织mRNA表达
被引量:
2
1
作者
孙斌
唐琳
+6 位作者
张军芳
孙建富
崔岩
王英
王恩泽
李强
李香子
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021年第6期211-218,共8页
旨在克隆延边牛解偶联蛋白-1(UCP1)CDS区序列,利用RT-PCR技术和基因克隆获得延边牛UCP1基因,与其他物种进行同源性比对及构建系统进化树,利用生物信息学方法预测UCP1编码蛋白质的理化性质、潜在的磷酸化位点等性质,利用实时荧光定量PCR(...
旨在克隆延边牛解偶联蛋白-1(UCP1)CDS区序列,利用RT-PCR技术和基因克隆获得延边牛UCP1基因,与其他物种进行同源性比对及构建系统进化树,利用生物信息学方法预测UCP1编码蛋白质的理化性质、潜在的磷酸化位点等性质,利用实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)方法检测UCP1基因在延边牛不同组织的表达丰度。结果显示,延边牛UCP1基因的CDS区全长749 bp,编码249个氨基酸。同源性比对发现延边牛UCP1基因与印度牛同源性为99.47%,系统进化树表明,延边牛与印度牛的亲缘关系最近,和南美羊驼亲缘关系最远。UCP1蛋白缺乏稳定性,脂溶系数是91.53,网状红细胞于体外的半衰期是30 h,总平均亲水性等于0.212,预测其具备一定亲水性。二级结构由α-螺旋(54.03%)、延伸链(12.90%)、无规卷曲(27.42%)和β-转角(5.65%)构成的混合型蛋白。磷酸化位点和糖基化位点分析结果表明,UCP1共有21个磷酸位点,4个潜在的O-糖基化位点,3个N-糖基化潜在位点。UCP1基因的编码产物无跨膜螺旋(TMHs)结构,跨膜螺旋氨基酸残基数量的预测值为19.00857,蛋白质前60个氨基酸的跨膜螺旋数预测值为10.98009,位于膜细胞质侧的总概率为22.995%且属于非分泌蛋白。经实时荧光定量PCR(RT-PCR)可知,延边牛脂肪与小肠内UCP1基因表达水平相对较高,而在肌肉、心脏中的表达水平较低。该试验结果可为进一步研究该基因的功能提供借鉴。
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关键词
延边牛
ucp1
基因
克隆
生物信息学
组织
mrna
表达
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职称材料
侧脑室注射CRH对急性冷暴露长爪沙鼠BAT产热的影响及产热调节机理
被引量:
2
2
作者
杨明
李庆芬
黄晨西
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期45-51,共7页
长爪沙鼠侧脑室注射促肾上腺皮质激素释放激素 (CRH) 8μg或CRH受体阻断剂 2 5 μg后 ,4± 1℃暴露3h ,对照组注射等体积生理盐水并置于 2 4± 2℃或 4± 1℃下。与常温对照组相比 ,低温对照组褐色脂肪组织 (BAT)重量下降 ...
长爪沙鼠侧脑室注射促肾上腺皮质激素释放激素 (CRH) 8μg或CRH受体阻断剂 2 5 μg后 ,4± 1℃暴露3h ,对照组注射等体积生理盐水并置于 2 4± 2℃或 4± 1℃下。与常温对照组相比 ,低温对照组褐色脂肪组织 (BAT)重量下降 ,BAT中解偶联蛋白 (UCP1)mRNA上调 ;下丘脑促甲状腺激素释放激素 (TRH)含量降低 ,血清T3、T4、T3 T4水平及BAT中T45′脱碘酶活性均增加 ,血清去甲肾上腺素 (NE)含量上升。与低温对照组相比 ,侧脑室注射CRH后再冷暴露 ,BAT重量、蛋白总含量和UCP1mRNA含量趋于减少 ;血清NE含量上升 ,BAT中T45′脱碘酶活性增加 ,但下丘脑TRH含量、血清T3、T4及T3 T4水平均降低。侧脑室注射 2 5 μg的CRH受体阻断剂α -helicalCRH 9- 41,对冷暴露长爪沙鼠甲状腺轴的分泌、BAT重量、血清中NE水平及UCP1mRNA含量没有明显影响。结果表明 ,急性冷暴露激活了长爪沙鼠下丘脑 -垂体 -甲状腺 (HPT)轴和交感神经系统 ,刺激BAT产热和UCP1合成 ;而CRH作用于中枢 ,可能一方面抑制HPT轴的分泌 ,进而抑制UCP1的基因表达 ,另一方面又刺激交感神经 ,增加产热。
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关键词
侧脑室注射
CRH
急性冷暴露
长爪沙鼠
BAT产热
产热调节机理
褐色脂肪组织
下丘脑-垂体-甲状腺轴
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职称材料
题名
延边牛UCP1基因CDS区克隆、生物信息学分析及组织mRNA表达
被引量:
2
1
作者
孙斌
唐琳
张军芳
孙建富
崔岩
王英
王恩泽
李强
李香子
机构
延边大学
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021年第6期211-218,共8页
基金
国家自然科学基金(32060767)
东北寒区肉牛科技创新教育部工程研究中心及高等学校学科创新引智计划(D20034)。
文摘
旨在克隆延边牛解偶联蛋白-1(UCP1)CDS区序列,利用RT-PCR技术和基因克隆获得延边牛UCP1基因,与其他物种进行同源性比对及构建系统进化树,利用生物信息学方法预测UCP1编码蛋白质的理化性质、潜在的磷酸化位点等性质,利用实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)方法检测UCP1基因在延边牛不同组织的表达丰度。结果显示,延边牛UCP1基因的CDS区全长749 bp,编码249个氨基酸。同源性比对发现延边牛UCP1基因与印度牛同源性为99.47%,系统进化树表明,延边牛与印度牛的亲缘关系最近,和南美羊驼亲缘关系最远。UCP1蛋白缺乏稳定性,脂溶系数是91.53,网状红细胞于体外的半衰期是30 h,总平均亲水性等于0.212,预测其具备一定亲水性。二级结构由α-螺旋(54.03%)、延伸链(12.90%)、无规卷曲(27.42%)和β-转角(5.65%)构成的混合型蛋白。磷酸化位点和糖基化位点分析结果表明,UCP1共有21个磷酸位点,4个潜在的O-糖基化位点,3个N-糖基化潜在位点。UCP1基因的编码产物无跨膜螺旋(TMHs)结构,跨膜螺旋氨基酸残基数量的预测值为19.00857,蛋白质前60个氨基酸的跨膜螺旋数预测值为10.98009,位于膜细胞质侧的总概率为22.995%且属于非分泌蛋白。经实时荧光定量PCR(RT-PCR)可知,延边牛脂肪与小肠内UCP1基因表达水平相对较高,而在肌肉、心脏中的表达水平较低。该试验结果可为进一步研究该基因的功能提供借鉴。
关键词
延边牛
ucp1
基因
克隆
生物信息学
组织
mrna
表达
Keywords
Yanbian cattle
ucp1
gene
Cloning
Bioinformatics
Tissue
mrna
expression
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S826 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
侧脑室注射CRH对急性冷暴露长爪沙鼠BAT产热的影响及产热调节机理
被引量:
2
2
作者
杨明
李庆芬
黄晨西
机构
北京师范大学生命科学学院
出处
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期45-51,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目 ( 39970 12 4)
文摘
长爪沙鼠侧脑室注射促肾上腺皮质激素释放激素 (CRH) 8μg或CRH受体阻断剂 2 5 μg后 ,4± 1℃暴露3h ,对照组注射等体积生理盐水并置于 2 4± 2℃或 4± 1℃下。与常温对照组相比 ,低温对照组褐色脂肪组织 (BAT)重量下降 ,BAT中解偶联蛋白 (UCP1)mRNA上调 ;下丘脑促甲状腺激素释放激素 (TRH)含量降低 ,血清T3、T4、T3 T4水平及BAT中T45′脱碘酶活性均增加 ,血清去甲肾上腺素 (NE)含量上升。与低温对照组相比 ,侧脑室注射CRH后再冷暴露 ,BAT重量、蛋白总含量和UCP1mRNA含量趋于减少 ;血清NE含量上升 ,BAT中T45′脱碘酶活性增加 ,但下丘脑TRH含量、血清T3、T4及T3 T4水平均降低。侧脑室注射 2 5 μg的CRH受体阻断剂α -helicalCRH 9- 41,对冷暴露长爪沙鼠甲状腺轴的分泌、BAT重量、血清中NE水平及UCP1mRNA含量没有明显影响。结果表明 ,急性冷暴露激活了长爪沙鼠下丘脑 -垂体 -甲状腺 (HPT)轴和交感神经系统 ,刺激BAT产热和UCP1合成 ;而CRH作用于中枢 ,可能一方面抑制HPT轴的分泌 ,进而抑制UCP1的基因表达 ,另一方面又刺激交感神经 ,增加产热。
关键词
侧脑室注射
CRH
急性冷暴露
长爪沙鼠
BAT产热
产热调节机理
褐色脂肪组织
下丘脑-垂体-甲状腺轴
Keywords
Cold exposure
Brown adipose tissue (BAT)
Hypothalamus-pituitary-thyroid (HPT)
ucp1 mrna
Mongolian gerbils ( Meriones unguiculatus )
分类号
Q959.837 [生物学—动物学]
Q413 [生物学—生理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
延边牛UCP1基因CDS区克隆、生物信息学分析及组织mRNA表达
孙斌
唐琳
张军芳
孙建富
崔岩
王英
王恩泽
李强
李香子
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021
2
下载PDF
职称材料
2
侧脑室注射CRH对急性冷暴露长爪沙鼠BAT产热的影响及产热调节机理
杨明
李庆芬
黄晨西
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003
2
下载PDF
职称材料
已选择
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