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紫化茶树UDP-糖基转移酶启动子的克隆及其生物信息学分析
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作者 唐秀华 陈志丹 +4 位作者 陈祖枝 林子琪 曹士先 孙威江 谢凤 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2019年第3期303-308,共6页
以紫化茶树武夷奇种C18的叶片为材料,采用染色体步移技术获得该材料的UDP-糖基转移酶(UDPG)基因5′端上游启动子序列大小为902 bp,利用软件进行生物信息学分析.结果表明,该调控序列含有启动子核心元件TATA-box、CAAT-motif以及多个光响... 以紫化茶树武夷奇种C18的叶片为材料,采用染色体步移技术获得该材料的UDP-糖基转移酶(UDPG)基因5′端上游启动子序列大小为902 bp,利用软件进行生物信息学分析.结果表明,该调控序列含有启动子核心元件TATA-box、CAAT-motif以及多个光响应元件(GT1-motif、GATA-motif等)、胚乳特异性表达元件(GCN4-motif、Skn-1-motif)、水杨酸响应元件(TCA-element)等特殊顺式作用元件. 展开更多
关键词 紫化茶树 udp糖基转移酶基因 启动子 生物信息学分析
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植物类黄酮生物合成相关UDP–糖基转移酶研究进展 被引量:28
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作者 解林峰 任传宏 +2 位作者 张波 徐昌杰 李鲜 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1655-1669,共15页
类黄酮是人类膳食和观赏园艺植物中重要的多酚类物质,因其广泛的生物活性及重要的生物学功能而倍受关注。植物尿苷二磷酸糖基转移酶(Uridine diphosphateglycosyltransferase,UGT)催化类黄酮生物合成的最后一步从而形成多种多样的糖苷... 类黄酮是人类膳食和观赏园艺植物中重要的多酚类物质,因其广泛的生物活性及重要的生物学功能而倍受关注。植物尿苷二磷酸糖基转移酶(Uridine diphosphateglycosyltransferase,UGT)催化类黄酮生物合成的最后一步从而形成多种多样的糖苷衍生物。近年来,大量UGT基因家族被分析,类黄酮合成相关糖基转移酶也陆续被鉴别报道。本文综述了植物类黄酮生物合成相关UGT的生物化学及分子生物学研究进展,重点对参与不同类黄酮糖基化的UGT体外重组蛋白活性及转基因功能分析等试验证据进行归纳,并介绍了相关的微生物工程,以期为植物类黄酮代谢和其调控原理及生物技术研究提供参考。 展开更多
关键词 类黄酮 生物合成 udp基转移酶 生物学功能
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沙棘UGT基因家族的全基因组鉴定与表达分析 被引量:4
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作者 吕中睿 刘宏 +3 位作者 张国昀 于立洋 罗红梅 何彩云 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2021年第6期9-19,共11页
[目的]本研究通过系统检测沙棘UGT基因家族成员,探讨其结构特征及潜在功能,为解析沙棘类黄酮糖苷生物合成机制及其积累模式奠定基础。[方法]利用BLASTP和hmmsearch搜索沙棘基因组,并通过Pfam、CDD和SMART数据库验证保守结构域。使用Prot... [目的]本研究通过系统检测沙棘UGT基因家族成员,探讨其结构特征及潜在功能,为解析沙棘类黄酮糖苷生物合成机制及其积累模式奠定基础。[方法]利用BLASTP和hmmsearch搜索沙棘基因组,并通过Pfam、CDD和SMART数据库验证保守结构域。使用Prot-Param、MUSCLE、MAGA7.0、MEME、MCScanX等工具分析蛋白理化性质、系统发育、蛋白基序和基因结构及基因复制事件。利用转录组数据和实时荧光定量PCR分析沙棘UGT基因在果实发育过程中的表达模式。[结果]本研究从沙棘基因组中鉴定出89个沙棘UGT基因,全部包含UGT基因家族保守结构域PSPG box。通过分析发现:沙棘UGT蛋白长度为266~533氨基酸,平均分子量50.00 KDa,平均等电点5.89。根据系统发育关系,可将89个沙棘UGT分为16个组,其中,A组包含最多的沙棘UGT基因家族成员。除7号染色体外,UGT基因共分布在11条沙棘染色体上。研究发现,串联重复是导致沙棘UGT基因家族扩张的主要复制事件。转录组分析和实时荧光定量PCR表明,大部分基因具有广泛的果实发育阶段特异性表达。[结论]本研究提供了沙棘UGT基因家族的完整信息,为进一步研究沙棘基因家族成员的生物学功能提供了数据参考和理论依据。 展开更多
关键词 沙棘 udp糖基转移酶 基因表达
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人参属三萜皂苷骨架修饰的研究进展 被引量:4
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作者 陈勤 雷君 +2 位作者 刘迪秋 崔秀明 葛锋 《中药材》 CAS 北大核心 2020年第11期2831-2837,共7页
三萜皂苷是人参属药用植物的主要生物活性成分,具有防治心脑血管疾病、抗疲劳、抗氧化和增强免疫力等多种药理功效。由于人参属药用植物种生长周期长,种植成本高,难以满足日益增长的市场需求。目前,人参属三萜皂苷生物合成途径中的皂苷... 三萜皂苷是人参属药用植物的主要生物活性成分,具有防治心脑血管疾病、抗疲劳、抗氧化和增强免疫力等多种药理功效。由于人参属药用植物种生长周期长,种植成本高,难以满足日益增长的市场需求。目前,人参属三萜皂苷生物合成途径中的皂苷骨架构建过程已基本清楚,但关于三萜皂苷的骨架修饰研究仍需进一步深入。本文综述了用于三萜皂苷骨架修饰的细胞色素P450单加氧酶和UDP⁃糖基转移酶的最新研究进展,为全面解析皂苷骨架修饰过程奠定基础,也为利用合成生物学技术生产人参皂苷提供了思路。 展开更多
关键词 人参属 三萜皂苷 细胞色素P450单加氧酶 udp基转移酶
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Two unrelated patients with rare Crigler-Najjar syndrome type I:two novel mutations and a patient with loss of heterozygosity of UGT1A1 gene 被引量:2
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作者 Yan LI Yu-jin QU +8 位作者 Xue-mei ZHONG Yan-yan CAO Li-min JIN Jin-li BAI Xin MA Yu-wei JIN Hong WANG Yan-ling ZHANG Fang SONG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2014年第5期474-481,共8页
Cdgler-Najjar syndrome type Ⅰ (CN-I) is the most severe type of hereditary unconjugated hyperbilirubinemia. It is caused by homozygous or compound heterozygous mutations of the UDP-glycuronosyltransferase gene (UG... Cdgler-Najjar syndrome type Ⅰ (CN-I) is the most severe type of hereditary unconjugated hyperbilirubinemia. It is caused by homozygous or compound heterozygous mutations of the UDP-glycuronosyltransferase gene (UGT1A1) on chromosome 2q37. Two patients clinically diagnosed with CN-I were examined in this paper. We sequenced five exons and their flanking sequences, specifically the promoter region of UGT1A 1, of the two patients and their parents. Quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) was used to determine the UGT1A1 gene copy number of one patient. In patient A, two mutations, c.239_245delCTGTGCC (p.Pro80HisfsX6; had not been reported previously) and c.1156G〉T (p.Va1386Phe), were identified. In patient B, we found that this patient had lost heterozygosity of the UGTIA1 gene by inheriting a deletion of one allele, and had a novel mutation c.1253delT (p.Met418ArgfsX5) in the other allele. In summary, we detected three UGTIA 1 mutations in two CN-I patients: c.239_ 245delCTGTGCC (p.Pro80HisfsX6), c.1253delT (p.MeH18ArgfsX5), and c.1156G〉T (p.Va1386Phe). The former two mutations are pathogenic; however, the pathogenic mechanism of c.1156G〉T (p.Va1386Phe) is unknown. 展开更多
关键词 Crigler-Najjar syndrome type (CN-I) HYPERBILIRUBINEMIA udp-glycuronosyltransferase gene (UGT1A 1) Mutation Loss of heterozygosity
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