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黄烷酮-7-O-葡萄糖基转移酶(UF7GT)的生物信息学分析
1
作者
肖妃垚
刘娟
+2 位作者
黄旭
田苗苗
单杨
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第16期5221-5234,共14页
黄烷酮-7-O-葡萄糖基转移酶(UDP-glucose:flavanone 7-O-glucosyltransferase,UF7GT)是柑橘类植物中黄烷酮-7-O-葡萄糖苷类化合物生物合成途径的关键酶之一。本研究利用生物信息学相关分析工具对不同植物来源的43个UF7GT的一级结构、二...
黄烷酮-7-O-葡萄糖基转移酶(UDP-glucose:flavanone 7-O-glucosyltransferase,UF7GT)是柑橘类植物中黄烷酮-7-O-葡萄糖苷类化合物生物合成途径的关键酶之一。本研究利用生物信息学相关分析工具对不同植物来源的43个UF7GT的一级结构、二级结构及三级结构等进行分析与预测,并构建了该家族系统进化树。结果表明,UF7GT基因开放阅读框架(open reading frame,ORF)为1326~1926 bp,编码440~500个氨基酸,理论等电点均低于7,大部分是亲水蛋白,不含信号肽和导肽,部分稳定;除葛麻姆来源的UF7GT蛋白含两个跨膜螺旋结构,其他均无跨膜结构;亚细胞定位预测结果表明,UF7GT最大可能定位在质膜或细胞质上;二级结构组成比例相似,α-螺旋和无规则卷曲是主要的结构元件,属于GT-B超家族成员,多数蛋白在进化上高度保守。分析结果为植物UF7GT的功能研究及黄烷酮糖苷的生物合成提供理论依据。
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关键词
黄烷酮-7-O-葡萄糖苷类化合物
黄烷酮-7-O-葡萄糖基转移酶
生物信息学
原文传递
题名
黄烷酮-7-O-葡萄糖基转移酶(UF7GT)的生物信息学分析
1
作者
肖妃垚
刘娟
黄旭
田苗苗
单杨
机构
湖南大学隆平分院
湖南省农业科学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第16期5221-5234,共14页
基金
湖南省科技厅重点领域研发技术项目(2019NK2041)
湖南省农业科技创新资金重点项目(2020CX47)
国家科技支撑计划项目(2012BAD31B02)共同资助。
文摘
黄烷酮-7-O-葡萄糖基转移酶(UDP-glucose:flavanone 7-O-glucosyltransferase,UF7GT)是柑橘类植物中黄烷酮-7-O-葡萄糖苷类化合物生物合成途径的关键酶之一。本研究利用生物信息学相关分析工具对不同植物来源的43个UF7GT的一级结构、二级结构及三级结构等进行分析与预测,并构建了该家族系统进化树。结果表明,UF7GT基因开放阅读框架(open reading frame,ORF)为1326~1926 bp,编码440~500个氨基酸,理论等电点均低于7,大部分是亲水蛋白,不含信号肽和导肽,部分稳定;除葛麻姆来源的UF7GT蛋白含两个跨膜螺旋结构,其他均无跨膜结构;亚细胞定位预测结果表明,UF7GT最大可能定位在质膜或细胞质上;二级结构组成比例相似,α-螺旋和无规则卷曲是主要的结构元件,属于GT-B超家族成员,多数蛋白在进化上高度保守。分析结果为植物UF7GT的功能研究及黄烷酮糖苷的生物合成提供理论依据。
关键词
黄烷酮-7-O-葡萄糖苷类化合物
黄烷酮-7-O-葡萄糖基转移酶
生物信息学
Keywords
Flavanone-7-O-glucoside
uf7gt
Bioinformatics
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
S66 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄烷酮-7-O-葡萄糖基转移酶(UF7GT)的生物信息学分析
肖妃垚
刘娟
黄旭
田苗苗
单杨
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024
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