人巨细胞病毒UL148A、UL148B、UL148C、UL148D基因在临床株中的多态性研究

目的研究人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)UL148A、UL148B、UL148C和UL148D基因序列在临床低传代分离株中的多态性。方法对22株经荧光定量PCR方法(Q-PCR)检测HCMV-DNA为阳性的临床株进行HCMV UL148A、UL148B、UL148C和UL148D基因全序列PCR扩增,并对PCR扩增产物进行序列测定及分析。结果22株临床株序列与Merlin株相比.临床分离株UL148A基因的核苷酸变异率为0.5%～8.3%,氨基酸变异率为1.3%～6.3%;UL148B基因核苷酸变异率为0.5%～4.6%,氨基酸变异率为1.3%～5.0%;UL148C基因核苷酸变异率为0.5%～3.0%,氨基酸变异率为1.3%～3.9%;UL148D基因核苷酸变异率为0.6%～8.5%,氨基酸变异率为1.7%～8.1%。22株HCMV UL148A和UL148D序列均分为3个型。与Merlin株比较,除U96株外,来自未经传代的尿标本中的UL148A、UL148B、UL148C和UL148D基因编码产物含有的翻译后修饰位点均保守。结论UL148C基因无论在核苷酸序列还是在蛋白的氨基酸结构上均较为保守。统计学分析显示HCMV UL148A和UL148D基因呈现一定的相关性。

人巨细胞病毒UL148基因在临床低传代分离株中的多态性研究

目的 研究人巨细胞病毒 (HCMV)UL14 8序列在临床低传代分离株中的多态性。方法 对 38株经荧光定量PCR方法 (Q PCR)检测HCMV DNA为阳性的临床低传代分离株的细胞培养上清液进行HCMVUL14 8全序列PCR扩增 ,并对PCR扩增产物进行序列测定及分析。结果 38株临床低传代分离株有 17株PCR扩增阳性 ,与HCMVToledo株进行序列比较分析 ,17株临床分离株UL14 8开放阅读框架 (ORF)长度均与Toledo株相同。其编码蛋白的氨基酸变异率为 0 3%～ 2 3%。所有分离株均有蛋白翻译后修饰位点的新增或缺失。与Toledo株相比 17株临床分离株UL14 8蛋白质二级结构预测结果均为第 15～ 18位之间由α 螺旋变为 β 折叠。 结论 17株HCMV临床低传代分离株UL14 8基因及其编码产物的氨基酸序列比较保守 ,但仍存在一定程度的多态性。