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16种平菇遗传关系的SRAP分析
被引量:
4
1
作者
常艳
金青
+3 位作者
凌磊
蔡永萍
聂凡
林毅
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期834-838,共5页
为了确定不同来源的平菇遗传差异,利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记技术,对安徽地区的16个平菇品种的遗传多样性进行了分析。筛选出24对随机引物组合,获得了627条清晰条带,平均每对引物产...
为了确定不同来源的平菇遗传差异,利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记技术,对安徽地区的16个平菇品种的遗传多样性进行了分析。筛选出24对随机引物组合,获得了627条清晰条带,平均每对引物产生26.1条。多态性条带共189条,占总条带数的30.1%,平均每对引物组合得到7.88条多态性条带。依据SRAP标记聚类,在遗传相似系数0.65的水平上,供试的16个平菇品种分为2个大类:Ⅰ和Ⅱ。Ⅰ类分为2个亚类:A类和B类,Ⅱ类也分为2个亚类:C类和D类。其中A类和D类各包括4个品种,B类中有3个品种,C类中有5个品种,从而在DNA水平上证明了所研究的平菇种质资源的遗传多样性。
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关键词
平菇
遗传关系
SRAP
聚类分析
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职称材料
外来入侵种空心莲子草的RAPD遗传多样性分析
被引量:
8
2
作者
项卫东
张亚梅
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第6期35-38,共4页
基于随机扩增多态DNA(RAPD)方法,对8个居群空心莲子草Agasicleshygrophila的遗传多样性及分化程度进行分析。10条随机引物扩增出99个可分析位点,多态位点百分比为36.3%。POPOGENE分析发现,空心莲子草居群平均水平的多态位点百分比为26.2...
基于随机扩增多态DNA(RAPD)方法,对8个居群空心莲子草Agasicleshygrophila的遗传多样性及分化程度进行分析。10条随机引物扩增出99个可分析位点,多态位点百分比为36.3%。POPOGENE分析发现,空心莲子草居群平均水平的多态位点百分比为26.2%,Nei's基因多样度为0.0906,Shannon信息指数为0.1609,具有较高的遗传多样性;居群间遗传分化比例为30.88%,居群内遗传分化占69.12%;居群间基因流为1.1189。结合居群遗传多样性及UPGMA聚类分析表明,镇江及南京地区是空心莲子草遗传变异程度最高的中心区,应该作为外来种空心莲子草防治及根除的重点地带,防治的最有效措施是加强对其无性繁殖体临近传播、蔓延和扩散途径的阻断。
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关键词
入侵种
空心莲子草
RAPD
遗传多样性
遗传结构
upgma
聚类分析
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职称材料
Rh系统单倍型在中国人群中的分布
被引量:
3
3
作者
贾旭明
王沥
+1 位作者
郝露萍
金锋
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001年第5期385-397,共13页
对中国已发表的125个人群Rh血型系统表型分布频率数据进行了收集和整理。用累积计算法(Counting method)重新计算单倍型频率,通过各单倍型的分布差异分析中国不同地区不同民族、人群的遗传差异。分组比较了不同...
对中国已发表的125个人群Rh血型系统表型分布频率数据进行了收集和整理。用累积计算法(Counting method)重新计算单倍型频率,通过各单倍型的分布差异分析中国不同地区不同民族、人群的遗传差异。分组比较了不同地区汉族和少数民族人群的基因多样度和基因分化度,结果表明南方少数民族和北方少数民族民族亚群体基因多样度有明显差异。用不同方法计算各小组遗传距离并进行聚类分析。最后,计算了除维吾尔族和哈萨克族外的68个人群间的遗传距离并聚类比较,结果表明Rh基因单倍型的分布与地理分布基本相符。
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关键词
Rh单倍型
累积计算法
基因多样度
遗传距离
中国人
血型
群体数据
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职称材料
题名
16种平菇遗传关系的SRAP分析
被引量:
4
1
作者
常艳
金青
凌磊
蔡永萍
聂凡
林毅
机构
安徽农业大学生命科学学院
安徽省农业科学院园艺所
出处
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期834-838,共5页
基金
安徽省科技计划项目(1101c0603062)资助
文摘
为了确定不同来源的平菇遗传差异,利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记技术,对安徽地区的16个平菇品种的遗传多样性进行了分析。筛选出24对随机引物组合,获得了627条清晰条带,平均每对引物产生26.1条。多态性条带共189条,占总条带数的30.1%,平均每对引物组合得到7.88条多态性条带。依据SRAP标记聚类,在遗传相似系数0.65的水平上,供试的16个平菇品种分为2个大类:Ⅰ和Ⅱ。Ⅰ类分为2个亚类:A类和B类,Ⅱ类也分为2个亚类:C类和D类。其中A类和D类各包括4个品种,B类中有3个品种,C类中有5个品种,从而在DNA水平上证明了所研究的平菇种质资源的遗传多样性。
关键词
平菇
遗传关系
SRAP
聚类分析
Keywords
Pleurotus ostreatus
genetic relationship
SRAP
upgma dendrogram
分类号
S646.14 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
外来入侵种空心莲子草的RAPD遗传多样性分析
被引量:
8
2
作者
项卫东
张亚梅
机构
南京林业大学资源与环境学院
出处
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第6期35-38,共4页
基金
南京市环保局"南京市生态环境现状调查"课题资助
文摘
基于随机扩增多态DNA(RAPD)方法,对8个居群空心莲子草Agasicleshygrophila的遗传多样性及分化程度进行分析。10条随机引物扩增出99个可分析位点,多态位点百分比为36.3%。POPOGENE分析发现,空心莲子草居群平均水平的多态位点百分比为26.2%,Nei's基因多样度为0.0906,Shannon信息指数为0.1609,具有较高的遗传多样性;居群间遗传分化比例为30.88%,居群内遗传分化占69.12%;居群间基因流为1.1189。结合居群遗传多样性及UPGMA聚类分析表明,镇江及南京地区是空心莲子草遗传变异程度最高的中心区,应该作为外来种空心莲子草防治及根除的重点地带,防治的最有效措施是加强对其无性繁殖体临近传播、蔓延和扩散途径的阻断。
关键词
入侵种
空心莲子草
RAPD
遗传多样性
遗传结构
upgma
聚类分析
Keywords
Invasive species
Agasicles hygrophila
RAPD
Genetic diversity
Genetic structure
upgma dendrogram
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
Rh系统单倍型在中国人群中的分布
被引量:
3
3
作者
贾旭明
王沥
郝露萍
金锋
机构
中国科学院遗传研究所
出处
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001年第5期385-397,共13页
基金
中国科学院生物科学与生物技术特别支持项目
文摘
对中国已发表的125个人群Rh血型系统表型分布频率数据进行了收集和整理。用累积计算法(Counting method)重新计算单倍型频率,通过各单倍型的分布差异分析中国不同地区不同民族、人群的遗传差异。分组比较了不同地区汉族和少数民族人群的基因多样度和基因分化度,结果表明南方少数民族和北方少数民族民族亚群体基因多样度有明显差异。用不同方法计算各小组遗传距离并进行聚类分析。最后,计算了除维吾尔族和哈萨克族外的68个人群间的遗传距离并聚类比较,结果表明Rh基因单倍型的分布与地理分布基本相符。
关键词
Rh单倍型
累积计算法
基因多样度
遗传距离
中国人
血型
群体数据
Keywords
Rh haplotypes
counting method
gene diversity
genetic distance
upgma
phylogenetic
dendrogram
s
分类号
Q987 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
16种平菇遗传关系的SRAP分析
常艳
金青
凌磊
蔡永萍
聂凡
林毅
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
下载PDF
职称材料
2
外来入侵种空心莲子草的RAPD遗传多样性分析
项卫东
张亚梅
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2004
8
下载PDF
职称材料
3
Rh系统单倍型在中国人群中的分布
贾旭明
王沥
郝露萍
金锋
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001
3
下载PDF
职称材料
已选择
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