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题名基于rbcL序列探讨荨麻科植物的系统发育关系
被引量:3
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作者
康冬丽
潘其辉
易自力
蒋建雄
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机构
湖南农业大学生物科学技术学院
江西省苎麻生物技术重点实验室
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出处
《分子细胞生物学报》
CSCD
北大核心
2008年第4期255-264,共10页
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文摘
对苎麻属4个种的rbcL序列进行了PCR扩增和T/A克隆产物的序列测定,扩增出长度为1370bp的rbcL序列。从GenBank中选取荨麻科8个属的rbcL序列,将所有物种的rbcL序列排序后,总长度约为1428bp。其中保守位点1263个,变异位点165个,信息位点71个。利用MEGA3.1软件构建荨麻科植物的MP和NJ系统树,并根据rbcL区碱基序列的差异计算种间的遗传距离,从而进一步探讨荨麻科植物之间的亲缘关系。其中,赤车属、锥头麻属、藤麻属、楼梯草属和冷水花属聚为一支,具有较近的亲缘关系;墙草属、单蕊麻属和苎麻属聚为另一组;而荨麻属植物在一级分支中就与荨麻科其他属植物分开,说明该属与其他属的亲缘关系较远。
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关键词
荨麻科
rbcl序列
信息位点
距离依靠法
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Keywords
urticaceae. rbcl sequence. information sites. distance based methods
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分类号
S563
[农业科学—作物学]
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