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白癜风相关基因-1的确认及其序列分析 被引量:7
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作者 李永伟 张迪敏 +2 位作者 尉晓冬 章一近 许爱娥 《中华皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期190-192,共3页
目的探讨白癜风患者黑素细胞VIT-1基因转录水平的表达情况,分析该基因序列的差异性。方法用半定量RT-PCR法检测黑素细胞VIT-1基因表达水平,克隆VIT-1 ORF cDNA全长并测序, 序列差异由CLUSTAL W(1.83)软件分析。结果黑素细胞的VIT-1基因... 目的探讨白癜风患者黑素细胞VIT-1基因转录水平的表达情况,分析该基因序列的差异性。方法用半定量RT-PCR法检测黑素细胞VIT-1基因表达水平,克隆VIT-1 ORF cDNA全长并测序, 序列差异由CLUSTAL W(1.83)软件分析。结果黑素细胞的VIT-1基因ORF含有81 bp的内含子,为 FBXO11的3’端的部分序列,白癜风患者黑素细胞VIT-1基因表达量下降。结论 VIT-1不是一个新基因,而是FBXO11,属于F-box蛋白家族成员。 展开更多
关键词 白癜风 黑素细胞 F框蛋白质类 FBXO11 白癜风相关基因-1
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苹果液泡铁离子转运蛋白基因家族的鉴定与表达分析 被引量:1
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作者 杨亚明 丁毓端 +6 位作者 陈丽娟 田雪婷 殷伟杰 彭红慧 杜薇 梁丽平 任小林 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期205-218,共14页
液泡铁离子转运蛋白(vacuolar iron transporter,VIT)参与铁的储存和运输,对植物光合作用、固氮、呼吸、DNA和激素合成有重要作用。本研究中鉴定了苹果全基因组的9个VIT基因,通过系统发育分析其进化关系,表明苹果VIT蛋白与拟南芥进化关... 液泡铁离子转运蛋白(vacuolar iron transporter,VIT)参与铁的储存和运输,对植物光合作用、固氮、呼吸、DNA和激素合成有重要作用。本研究中鉴定了苹果全基因组的9个VIT基因,通过系统发育分析其进化关系,表明苹果VIT蛋白与拟南芥进化关系较近。染色体定位显示9个VIT基因分布在7条染色体上,VIT基因的启动子区域富含光反应、植物激素调控和启动子相关顺式作用元件。表达谱分析显示VIT基因在花和果实中的表达量相对较高。此外,对MdVIT家族进行蛋白理化性质、String互作网络和基因结构等分析,表明苹果VIT家族扩增的主要因素是串联重复和片段复制,与苹果VIT蛋白互作的主要蛋白是阳离子共转运蛋白(XP_008372221.1和XP_008383418.1)。qRT-PCR分析结果表明:在2000μmol·L^(-1)FeSO_(4)·7H_(2)O(高铁)处理的‘M26’苹果砧木苗中,苹果VIT家族基因在不同组织的表达中存在差异,6 h后,MdVIT4在茎中的相对表达量最高,是对照的237倍。24 h后,MdVIT1和MdVIT2在叶片中的相对表达量与对照相比呈现上调表达,分别是对照的6.6倍和12.0倍。综上,基因MdVIT1、MdVIT2和MdVIT4可能与植物耐铁胁迫有密切关系,为苹果逆境胁迫机制研究提供参考。 展开更多
关键词 苹果 全基因组 液泡铁离子转运蛋白 vit基因 基因表达
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猪流感病毒H1N1亚型济南株HA、NA、NP基因的克隆与序列分析
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作者 朱晓林 凌宗帅 +4 位作者 祝素珍 谢之景 赵宏坤 姜世金 张兴晓 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期49-54,共6页
根据GenBank中流感病毒H1N1亚型HA、NA、NP基因序列,分别设计扩增HA、NA、NP基因的特异性引物,用RT-PCR方法扩增猪流感病毒(SIV)H1N1济南株(SW/SD/JT/07)HA、NA、NP基因,分别将RT-PCR产物克隆入pMD18-T载体,进行测序分析。结果显示,SW/S... 根据GenBank中流感病毒H1N1亚型HA、NA、NP基因序列,分别设计扩增HA、NA、NP基因的特异性引物,用RT-PCR方法扩增猪流感病毒(SIV)H1N1济南株(SW/SD/JT/07)HA、NA、NP基因,分别将RT-PCR产物克隆入pMD18-T载体,进行测序分析。结果显示,SW/SD/JT/07(H1N1)HA基因长为1 701bp,编码566个氨基酸;HA蛋白切割位点为IPSIQSR↓G,属于非高致病性毒株;HA蛋白有8个糖基化位点,其中有6个在HA1蛋白上,有2个在HA2蛋白上,与个别参考毒株糖基化位点个数不同;HA蛋白上的受体结合位点与多数参考毒株一致。SW/SD/JT/07(H1N1)NA基因长为1 410bp,编码469个氨基酸;NA基因颈部未发现氨基酸缺失现象;NA蛋白的头部有5个可能的抗原位点Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ分别由5个区段组成,在340、346、366位分别为P、I、N,其余参考毒株在相应位置的氨基酸分别为S、V、S;NA蛋白共有8个糖基化位点,与个别参考毒株的糖基化个数不同。SW/SD/JT/07(H1N1)NP基因长为1 565bp,编码498个氨基酸,根据HA、NA、NP基因系统发生树分析,说明SW/SD/JT/07(H1N1)与2009年全球范围内暴发的H1N1甲型流感病毒的几个参考毒株亲缘关系较远,不属于同一分支;根据NA、NP基因系统发生分析表明,SW/SD/JT/07(H1N1)与H1N1亚型禽流感病毒亲缘关系最近。 展开更多
关键词 猪流感病毒 HA基因 NA基因 NP基因 克隆 序列分析
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