VITEK■ 2 Compact全自动微生物鉴定药敏分析仪虚拟仿真教学软件的开发与应用

文章主要介绍了VITEK■2 Compact全自动微生物鉴定药敏分析仪虚拟仿真教学软件的设计与开发,以及虚拟仿真融合线上线下混合教学模式在医学微生物检验实验教学中的应用。结果表明,该仿真教学软件的实际应用既有利于培养学生的实践操作能力及思维方式,又能弥补学校实训环境与临床实际不符的缺陷,为微生物检验实验教学质量的提升开辟新的思路。

基于VITEK MS及VITEK2 Compact的更年宁微生物污染调查

目的研究更年宁微生物负载状况。方法建立微生物限度检查方法并对全部样品进行微生物限度检查,分离培养检查中出现的污染菌,使用VITEK MS飞行时间质谱及VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对分离菌株进行鉴定。结果样品需氧菌总数存在不同程度的微生物污染问题,霉菌、酵母菌总数及控制菌各项指标良好。需氧菌污染菌株以芽孢杆菌属为主,其他种类需氧菌较少被检出,2种方法对菌种的鉴定结果存在差异。结论更年宁需氧菌总数微生物污染问题不容忽视,但未发现有严重致病性微生物。VITEK MS及VITEK2 Compact联用时结果展现更丰富、直观、高效,可为调查污染来源提供重要参考。

用VITEK 2 Compact系统鉴定准确率低的临床少见病原菌评价焦磷酸测序技术鉴定能力

目的用焦磷酸测序技术鉴定经VITEK 2 Compact系统鉴定准确率低或无法鉴定的46株细菌,对两种方法在少见菌的鉴定能力进行评价。方法选择经VITEK 2 Compact系统鉴定准确率低或无法鉴定的46株细菌(包含革兰阳性球菌、革兰阳性杆菌、革兰阴性球菌及革兰阴性杆菌),提取DNA模板,做焦磷酸测序技术分析;同步进行Sanger法测序并以其结果作为准确鉴定的"金标准"。结果焦磷酸测序技术在4 h内完成46株细菌的鉴定。焦磷酸测序技术鉴定正确率为71.74%(33/46),VITEK 2 Compact系统鉴定正确率为43.48%(20/46)。46株菌中,两种方法鉴定均鉴定正确的菌株19株;焦磷酸测序技术鉴定正确、VITEK 2 Compact系统鉴定准确率低、未鉴定或鉴定错误的菌株14株;VITEK2 Compact系统鉴定正确、焦磷酸测序技术鉴定错误的菌株1株;两种方法均鉴定错误的菌株12株。结论对于微生物实验室利用传统方法无法准确鉴定的细菌,利用焦磷酸测序技术鉴定具有准确、快速及简便的特点,可适用于临床少见病原菌的鉴定。

VITEK2 Compact与VITEK MS系统对细菌鉴定结果的比较研究

目的比较VITEK 2 compact和ⅥTEK MS两套系统对细菌鉴定的符合率。方法 分别应用VTEK 2 compact和VITEK MS对289株临床分离菌株、室间质评菌株和标准菌株同时进行鉴定,采用测序技术对两者鉴定结果不一致的菌株进行确认。结果 VITEK 2 compact对细菌"种"和"属"鉴定符合率分别为88.58%(256/289)和100%(289/289),VITEKMS对细菌"种"和"属"鉴定符合率分别为88.93%(257/289)和100%(289/289)。结论 VITEK MS对细菌"种"鉴定符合率高于VITEK 2 compact,且具有操作简便和检测快速等优势,使细菌鉴定更准确、快速和高效,可用于临床微生物实验室的细菌常规快速鉴定。

Vitek 2 Compact系统鉴定临床少见疑难细菌的应用及评价

目的回顾分析室间质评1304号菌株的鉴定过程,评价Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统(简称Vitek 2 Compact系统)在临床少见疑难细菌鉴定中的应用。方法采用传统的细菌形态学检查、手工生化反应及Vitek 2 Compact系统等多种手段对1304号菌株进行鉴定分析,同时用基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)仪对最终鉴定结果进行佐证。结果 1304号菌株为革兰阴性小杆菌,氧化酶试验阳性,初次上机鉴定结果为支气管炎鲍特菌,鉴定率99%,转种分纯后2次上机鉴定结果为低分辨,粪产碱杆菌占51%,类产碱假单胞菌占49%,补充硝酸盐还原试验,结果为阴性,报告最终鉴定结果为粪产碱杆菌,质谱鉴定得分值为2.158,与最终结果相符。结论 Vitek 2 Compact系统鉴定临床少见疑难细菌有一定局限性,遇到少见疑难细菌应该用多种方法加以确定,综合分析以免造成错误鉴定。

VITEK2.Compact对奶牛乳源金黄色葡萄球菌的条件摸索及MRSA检测结果准确性的评价

为探究金黄色葡萄球菌全自动微生物检测平台(VITEK2 Compact)检测条件,及该方法在金黄色葡萄球菌耐药性筛查的准确性及其兽医临床应用价值,以金黄色葡萄球菌ATCC 29213为质控菌株,选取ASTGP79药敏板,参考美国临床实验室标准研究所(CLSI/NCCLS)的《抗生素敏感试验操作标准》(S100-17和M31-A2)中兽医临床抗生素敏感性试验选药原则,通过摸索不同稀释浓度菌液,对照药敏标准,摸索全自动微生物生长分析仪的高通量筛选平台的适用检测条件。将该耐药性筛查方法应用于在奶牛乳汁中分离获得的39株金黄色葡萄球菌,与经典K-B法的耐药性进行比较,以此验证VITEK2 Compact检测金黄色葡萄球菌药敏结果准确性。结果显示,综合考虑检测结果、透光度、重复性等因素,确定了质控菌株的菌液比例为1×10^(8)CFU/mL,且证实了VITEK2 Compact药敏检测方法的结果符合临床折点的判断标准;对39株乳源金黄色葡萄球菌的耐药性检测与K-B法比较,标准符合率(CA):β-内酰胺类为92.30%、氨基糖苷类为93.32%、四环素类为92.30%、磺胺类为94.87%、喹诺酮类为92.30%、大环内酯类为90.59%、林可酰胺类为92.30%、氯霉素类为94.87%;两种检测方法对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(meticillin-resistant Staphylociccus aureus,MRSA)的检出阳性率无统计学差异(P>0.05)。表明了本研究探讨的金黄色葡萄球菌全自动微生物检测平台的药敏检测方法的准确性与可靠性,为该方法应用于金黄色葡萄球菌引起的奶牛乳房炎防治提供了理论依据。

VITEK 2 Compact联合MALDI-TOF MS、16S rDNA基因测序对1株类志贺邻单胞菌的对比鉴定报告

类志贺邻单胞菌属于肠杆菌科的邻单胞菌属,是革兰阴性杆菌,为人类条件致病菌,该菌首先发现于胃肠道,但无明确证据证实其具有肠致病性,仅个别例证报道其可引起败血症和肠胃炎。霍乱弧菌属于弧菌属,革兰阴性杆菌,血清型O1群和O139群是甲类传染病霍乱的病原菌,通过侵袭力和霍乱肠毒素致病,可引起严重的呕吐和腹泻;而血清型非O1/O139群血流感染在国内偶见报道。本文报告1例在湘潭市中心医院就诊的慢性肝病患者无明显诱因出现腹痛、腹泻伴呕吐,且畏寒、寒战,血培养检出1株革兰阴性杆菌,初期经VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析系统鉴定为霍乱弧菌;但后经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)和16S rDNA基因测序,均确认为类志贺邻单胞菌。根据药敏试验结果,予哌拉西林/他唑巴坦抗感染,输血、护肝等对症治疗后好转出院,随访无复发。本报告结果提示,当Vitek-2 Compact将待检样本鉴定为霍乱弧菌等临床少见菌时,仍须结合细菌菌落形态、辅助生化试验以及患者的临床情况进行综合判断,必要时可采用质谱、基因测序等其他检测手段进行复核。

VITEK 2 Compact检测耐亚胺培南鲍曼不动杆菌在庆大霉素不同药敏表型时阿米卡星的敏感性

目的探讨VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统(VITEK 2 Compact)检测亚胺培南耐药的鲍曼不动杆菌在庆大霉素不同药敏表型情况下阿米卡星敏感性试验的准确性。方法收集使用VITEK 2 Compact检测对庆大霉素不同药敏表型、阿米卡星敏感的耐亚胺培南鲍曼不动杆菌80株,以E-test法为参考方法,同时用纸片扩散(K-B)法进行复核。结果在80株耐亚胺培南的鲍曼不动杆菌中,有22株VITEK 2 Compact检测为庆大霉素、阿米卡星敏感,经E-test法和K-B法检测为庆大霉素、阿米卡星敏感,其余58株VITEK 2Compact检测为庆大霉素耐药、阿米卡星敏感,经E-test法和K-B法检测其中4株为庆大霉素耐药、阿米卡星均敏感,54株为庆大霉素、阿米卡星均耐药。本实验中E-test法和K-B法的结果均一致,标准符合率(CA)100%,VITEK 2 Compact与E-test法CA为32.5%,极严重错误率达67.5%。结论 VITEK 2 Compact检测亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌在庆大霉素为敏感、阿米卡星为敏感时结果与E-test法及K-B法相符;当庆大霉素药敏为耐药、阿米卡星为敏感时,可能会产生结果误差,在临床可用E-test法或K-B法进行验证。

VITEK 2 Compact及其在食品微生物检测中的应用研究

食品检验是确保食品安全的重要手段,而食品微生物检验又是食品检验的重要组成部分。VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定系统具有准确、快速、可重复、安全和自动化程度高的特点,被广泛用于微生物检验。在检验过程中,微生物的纯度、浓度、传代次数及培养时间和培养基类型等因素对检验结果影响较大。该系统对常见的食源性致病菌检验效果较好,在食品安全检测领域具有重要的应用价值。

梅里埃血培养仪联合Vitek2 compact在血标本中菌株分离鉴定及耐药检测分析

目的:分析Vitek2 compact和梅里埃血培养仪在血标本菌株分离鉴定和耐药分析的应用。方法:选择临床送检血液样本1 350份,进行菌种鉴定和耐药性分析。结果:在1 350份血液样本中分离出病原菌152株,革兰阴性菌78株(51.31%),革兰阳性菌66株(43.42%),真菌8株(5.27%);革兰阳性菌对苯唑西林与苄青霉素的耐药率分别为62.12%和77.27%,革兰阴性菌对头孢素类和青霉素类的耐药率均较高。结论:Vitek2 compact和梅里埃血培养仪能准确分离出血标本中菌株,在血流感染疾病的快速诊疗领域中具有较好的应用前景。

VITEK 2 Compact与Phoenix-100对革兰阴性杆菌药物敏感试验结果对比分析

目的对比VITEK 2 Compact与Phoenix-100两台微生物鉴定药敏分析系统对革兰阴性杆菌药物敏感试验(简称药敏试验)结果准确性的差异。方法收集温州市中心医院2019年临床分离率最高的4种革兰阴性杆菌,共20株,大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌各5株。分别在VITEK 2 Compact和Phoenix-100分析系统上机,进行药敏试验;同时对两台仪器共有的抗生素用手工纸片扩散(K-B)法进行复核,对比分析试验结果。结果在185株革兰阴性杆菌-抗生素组合,与K-B法相比较,VITEK 2的总分类一致性为92.4%,Phoenix-100为94.6%。两台仪器的药敏试验结果符合率为91.4%,除阿米卡星与复方新诺明两台仪器结果全部符合外,其他药物均存在一定的差异,尤其头孢吡肟、左氧氟沙星与哌拉西林/他唑巴坦均出现相反结果。结论两台仪器对革兰阴性杆菌体外药敏试验均较可靠,但使用VITEK 2测定哌拉西林/他唑巴坦与头孢吡肟时,注意可能出现“假敏感”现象,采用Phoenix-100或K-B法检测更准确。

溶藻弧菌相关分离株的分子及VITEK鉴定

哈维群弧菌是弧菌属的核心菌群,包括溶藻弧菌在内的6个种在表型和遗传型上均十分相似,要准确鉴定各种有一定难度。看家基因的研究及生化鉴定系统的出现为弧菌鉴定提供了多种方法,本文比较了16S rRNA基因、toxR基因和pyrH基因以及VITEK 2 COMPACT GN鉴定卡对溶藻弧菌相关分离株的分辨力。哈维群弧菌基因组内16S rRNA基因是多拷贝的,且拷贝间序列差异大于种间差异,不适用于种的鉴定。单拷贝基因toxR和pyrH序列种内差异均小于种间差异。基于toxR基因相似性比较可清楚地将18个疑似溶藻弧菌分离株和5个参比株归并到4个种;toxR基因系统发育学分析也显示,哈维群弧菌各种独立地聚类分支,且溶藻弧菌种内存在两个明显的聚类分支,说明两个分支的溶藻弧菌具有独立的进化方向。pyrH基因的相似性比较和发育学分析也得到类似的结果,但pyrH基因具有较强的保守性,因而分辨力稍低于toxR基因。VITEK 2 COMPACT GN鉴定卡在鉴定溶藻弧菌时也有一定的错误率,且鉴定谱较窄。因此,建议在实际应用中采用toxR基因比对作为溶藻弧菌快速鉴定的主要手段,可再选用pyrH基因对鉴定结果进行验证。

HX-21细菌鉴定药敏分析仪对临床常见菌鉴定能力的评价

目的评价HX-21细菌鉴定药敏分析仪对临床常见细菌的鉴定能力。方法对39株常见菌按操作规程进行分离与培养，用HX-21细菌鉴定药敏分析仪和VITEJ（2COMPACT进行鉴定并对结果进行比较。结果两种微生物鉴定仪的菌种鉴鉴符合率为94．87％，菌属鉴定符合率为99．99％。结论HX-21细茼鉴定药敏分析仪能够满足中小型医院临床常见菌的鉴定。

VITEK-2Compact高级专家系统检测肠杆菌科碳青霉烯酶的性能评价

目的评价VITEK-2Compact仪器高级专家系统(Advanced expert system,AES)检测肠杆菌科碳青霉烯酶的性能,探讨AES在早期诊断产碳青霉烯酶肠杆菌科细菌中的应用价值。方法以VITEK-2Compact全自动细菌鉴定和药敏系统进行细菌鉴定和药敏试验,筛选2010-2012年非重复临床分离的碳青霉烯类药物敏感性降低的肠杆菌科细菌,PCR检测碳青霉烯酶blaKPC、blaIMP、blaVIM、blaOXA-48及blaNDM-1基因型,阳性结果进行测序并Blast比对确定基因型,以基因测序结果为金标准,分析统计VITEK-2Compact仪器AES检测肠杆菌科碳青霉烯酶的各项性能指标。结果试验共收集62株碳青霉烯类敏感性降低的肠杆菌科细菌,包括肺炎克雷伯菌、阴沟肠杆菌、大肠埃希菌、产酸克雷伯菌,分别占67.74%、19.36%、8.06%、4.84%;AES检测碳青霉烯酶阳性共58株,其中肺炎克雷伯菌、阴沟肠杆菌、大肠埃希菌、产酸克雷伯菌,分别占68.97%、18.97%、6.89%、5.17%;经PCR扩增并测序证实27株为产IMP-4型基因菌株,包括肺炎克雷伯菌21株、阴沟肠杆菌4株、产酸克雷伯菌2株、20株为产IMP-8型基因菌株,包括肺炎克雷伯菌10株、阴沟肠杆菌6株、大肠埃希菌3株、产酸克雷伯菌1株,其他15株为碳青霉烯酶阴性菌株;AES检测肠杆菌科碳青霉烯酶的灵敏度为100.00%、特异性为26.67%,阳性预测值为81.03%、阴性预测值为100.00%,检验效能为82.26%。结论 VITEK-2Compact仪器AES检测肠杆菌科碳青霉烯酶具有良好的灵敏度,临床微生物实验室应将检测信息第一时间提供给临床科室,以便及时采取隔离防护措施。

奶牛源表皮葡萄球菌的分离鉴定

为了探讨生牛乳中表皮葡萄球菌的分离鉴定方法,对某奶牛场的生鲜乳进行细菌分离培养和生化试验鉴定。结果显示:使用氯化钠肉汤(氯化钠质量分数为7.5%)增菌,使用Baird-Parker琼脂培养基选择培养,使用营养琼脂培养基纯化培养,可获得表皮葡萄球菌分离株;使用vitek2compact全自动微生物分析系统鉴定表皮葡萄球菌分离株,可信水平为良好;本实验获得的表皮葡萄球菌分离株与经典表皮葡萄球菌模式菌株符合率为93%。

如何快速高效分离李斯特菌属

为了有效区分鉴别李斯特菌属,选择几种李斯特菌属的标准菌株,包括英诺克李斯特氏菌、斯氏李斯特氏菌、伊氏李斯特氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌,按照相同的方法进行检测。过程中对其菌落形态、生理生化特性、溶血现象进行分析,区分不同菌株的特性,从而有效、快速地鉴别目标菌。染色镜检、动力试验、过氧化氢酶试验不能有效地区分李斯特菌属,生化鉴定及溶血试验可以有效区分。不同标准菌株之间的对比试验可有效鉴别目标菌。

对饮用水中疑似铜绿假单胞菌的复核鉴定

铜绿假单胞菌是一种不允许在饮用水中检出的条件致病菌,本文对10株分离自饮用水样品的菌株进行了菌落形态观察及生化反应确证,并使用HK-MID细菌鉴定系统、VITEK 2全自动微生物鉴定系统和16S rRNA基因测序等多种手段进行进一步鉴定。鉴定结果表明,部分菌株并非铜绿假单胞菌,但均为条件致病菌,从食品安全的角度考虑,不应出现在饮用水、矿泉水中。本文除了探讨以往的研究普遍关注的检验方法的准确性与时效性,还对这些菌株进行了分析,为相关管理部门进行质量监督、制定标准提供了研究依据和借鉴。

VITEK 2 Compact系统的应用及鉴定结果分析

目的探讨VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统对本实验室鉴定的包括食源性、肠道致病性及其他来源微生物如肠球菌属、葡萄球菌属、链球菌属、李斯特菌属、埃希菌属、志贺菌属、沙门菌属、变形杆菌属、耶尔森菌属、枸橼酸杆菌属、肠杆菌属、弧菌属、气单胞菌属、弯曲菌属、假单胞菌属、需氧芽胞杆菌属、酵母菌属在内的17菌属87株菌的准确性。方法按照VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统仪器说明书中的标准操作流程进行。选择国家标准常规方法作为参照,以验证VITEK 2 Compact全自动微生物分析检测方法的符合性。结果从本试验结果来看VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统仪对本实验室87株微生物的鉴定结果的总体符合率为97.0%(98/101)。结论 VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统仪对实验室常见87株微生物鉴定结果较好,但对弧菌的鉴定还应结合生物学特性进行综合评定。

Vitek 2 Compact全自动微生物分析仪对肠杆菌科细菌药敏及ESBLs测定能力的评价

目的探讨Vitek2 Compact全自动微生物分析仪对肠杆菌科细菌药敏及ESBLs测定能力。方法选取本院2016年10月至2018年3月从腹腔感染患者中分离得到的50株肠杆菌细菌,分别采用Vitek 2 Compact法和微量肉汤稀释法测定其对左氧氟沙星、环丙沙星、阿米卡星、亚胺培南、头孢吡肟、头孢曲松、头孢他啶、厄他培南、氨苄西林-舒巴坦及哌拉西林-他唑巴坦的体外敏感性。利用PCR和测序法,在奇异变形杆菌、产酸克雷伯菌、肺炎克雷伯菌基大肠埃希菌中筛选超光谱β-内酰胺酶(ESBLs)耐药基因,评估Vitek 2 Compact表型确证ESBLs的阴性预测值、阳性预测值、特异性以及敏感性。结果使用Vitek 2 Compact测定头孢吡肟、头孢他啶、厄他培南及氨苄西林-舒巴坦时会出现一定比例的极大错误(VME)和大错误(ME)。Vitek 2 Compact对产ESBLs菌株测定的阴性预测值、阳性预测值、特异性和敏感性分别为90.91%、100.00%、100.00%及93.33%,与微量肉汤稀释法比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论 Vitek 2 Compact对肠杆菌细胞体外药敏和ESBLs测定的可靠性较高,但使用Vitek 2 Compact测定头孢吡肟、头孢他啶、厄他培南及氨苄西林-舒巴坦时应预防出现ME和VME。

5种鲜切藕片胀袋微生物的分离与鉴定

为解决真空包装鲜切藕片的胀袋问题,本实验对鲜切藕片胀袋主要微生物的种类进行研究,分离出5种优势微生物,并利用VITEK 2 Compact全自动快速微生物鉴定智能分析系统进行鉴定。得到2株细菌,分别为阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)、蜡样芽孢杆菌(Bacilllus cereus Frankland&Frankland);3株酵母菌,分别为季也蒙假丝酵母(Candida guilliermondii)、无名假丝酵母(Candida famate)和葡萄牙假丝酵母(Candida iusitaniae)。