奶牛源表皮葡萄球菌的分离鉴定

为了探讨生牛乳中表皮葡萄球菌的分离鉴定方法,对某奶牛场的生鲜乳进行细菌分离培养和生化试验鉴定。结果显示:使用氯化钠肉汤(氯化钠质量分数为7.5%)增菌,使用Baird-Parker琼脂培养基选择培养,使用营养琼脂培养基纯化培养,可获得表皮葡萄球菌分离株;使用vitek2compact全自动微生物分析系统鉴定表皮葡萄球菌分离株,可信水平为良好;本实验获得的表皮葡萄球菌分离株与经典表皮葡萄球菌模式菌株符合率为93%。

VITEK■ 2 Compact全自动微生物鉴定药敏分析仪虚拟仿真教学软件的开发与应用

文章主要介绍了VITEK■2 Compact全自动微生物鉴定药敏分析仪虚拟仿真教学软件的设计与开发,以及虚拟仿真融合线上线下混合教学模式在医学微生物检验实验教学中的应用。结果表明,该仿真教学软件的实际应用既有利于培养学生的实践操作能力及思维方式,又能弥补学校实训环境与临床实际不符的缺陷,为微生物检验实验教学质量的提升开辟新的思路。

如何快速高效分离李斯特菌属

为了有效区分鉴别李斯特菌属,选择几种李斯特菌属的标准菌株,包括英诺克李斯特氏菌、斯氏李斯特氏菌、伊氏李斯特氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌,按照相同的方法进行检测。过程中对其菌落形态、生理生化特性、溶血现象进行分析,区分不同菌株的特性,从而有效、快速地鉴别目标菌。染色镜检、动力试验、过氧化氢酶试验不能有效地区分李斯特菌属,生化鉴定及溶血试验可以有效区分。不同标准菌株之间的对比试验可有效鉴别目标菌。

高原地区两种微生物鉴定系统对临床常见病原菌鉴定的一致性分析

目的比较MicroTyper MS微生物快速鉴定基质辅助激光解析飞行时间质谱和VITEK 2Compact全自动微生物分析系统对细菌的鉴定能力。方法950株临床分离的菌株,均采用MicroTyper MS和VITEK 2 Compact同时进行鉴定,以VITEK 2 Compact的结果为准,分析MicroTyper MS与VITEK 2Compact结果的一致性。结果同时鉴定950株细菌,与VITEK 2 Compact鉴定结果相比,MicroTyper MS可将841株(88.5%)鉴定至种,可将899株(94.6%)鉴定至属。鉴定不一致51株(5.4%)。MicroTyper MS与VITEK 2 Compact相比,鉴定至种的一致率为88.5%,鉴定至属的一致率为94.6%。695株革兰阴性细菌中,MicroTyper MS可将611株(87.9%)鉴定至种,可将649株(93.4%)鉴定至属。鉴定不一致46株(6.6%)。247株革兰阳性球菌中,MicroTyper MS可将222株(89.9%)鉴定至种,可将242株(98.0%)鉴定至属。鉴定不一致5株(2.0%)。8株酵母菌中,MicroTyper MS可将8株(100.0%)鉴定至种,鉴定不一致0株。结论MicroTyper MS与VITEK 2 Compact对临床常见细菌的鉴定结果具有较高的一致性,但MicroTyper MS相对VITEK 2 Compact来说具有耗时短、成本低等优点,提高了鉴定效率,为临床诊疗带来了便利。

VITEK2.Compact对奶牛乳源金黄色葡萄球菌的条件摸索及MRSA检测结果准确性的评价

为探究金黄色葡萄球菌全自动微生物检测平台(VITEK2 Compact)检测条件,及该方法在金黄色葡萄球菌耐药性筛查的准确性及其兽医临床应用价值,以金黄色葡萄球菌ATCC 29213为质控菌株,选取ASTGP79药敏板,参考美国临床实验室标准研究所(CLSI/NCCLS)的《抗生素敏感试验操作标准》(S100-17和M31-A2)中兽医临床抗生素敏感性试验选药原则,通过摸索不同稀释浓度菌液,对照药敏标准,摸索全自动微生物生长分析仪的高通量筛选平台的适用检测条件。将该耐药性筛查方法应用于在奶牛乳汁中分离获得的39株金黄色葡萄球菌,与经典K-B法的耐药性进行比较,以此验证VITEK2 Compact检测金黄色葡萄球菌药敏结果准确性。结果显示,综合考虑检测结果、透光度、重复性等因素,确定了质控菌株的菌液比例为1×10^(8)CFU/mL,且证实了VITEK2 Compact药敏检测方法的结果符合临床折点的判断标准;对39株乳源金黄色葡萄球菌的耐药性检测与K-B法比较,标准符合率(CA):β-内酰胺类为92.30%、氨基糖苷类为93.32%、四环素类为92.30%、磺胺类为94.87%、喹诺酮类为92.30%、大环内酯类为90.59%、林可酰胺类为92.30%、氯霉素类为94.87%;两种检测方法对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(meticillin-resistant Staphylociccus aureus,MRSA)的检出阳性率无统计学差异(P>0.05)。表明了本研究探讨的金黄色葡萄球菌全自动微生物检测平台的药敏检测方法的准确性与可靠性,为该方法应用于金黄色葡萄球菌引起的奶牛乳房炎防治提供了理论依据。

一株产5’-肌苷酸菌株的分离鉴定及其发酵条件优化

5’-肌苷酸具有独特鲜味,在调味品行业有重要的应用价值。为了缩短5’-肌苷酸的生产周期,进一步降低成本,对可直接生产5’-肌苷酸的菌株进行筛选,但直接发酵法生产5’-肌苷酸的菌株资源匮乏,为了找到适合直接发酵法生产的菌株,本文在豆瓣酱分离出的菌株中利用常压室温等离子体(ARTP)诱变育种仪诱变,再用影印法进行初筛,最后以5’-肌苷酸产量为响应值进行复筛,得到适合的菌株LK-6。筛选出菌株后,再利用形态学分析、Vitek 2 Compact生理生化实验和16S rDNA测序分析对LK-6菌株进行鉴定,确定该菌为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。最后用Plackett-Burman(PB)实验进行初步的发酵优化,结果表明酵母粉、KH2PO4和温度是5’-肌苷酸发酵中的主要影响因子。在PB设计的基础上,获得了初步优化的培养条件,优化后5’-肌苷酸的产量从10 mg/L增长到407.21 mg/L。本文为工业化直接发酵法生产5’-肌苷酸生产菌的筛选方法提供了思路。

溶藻弧菌相关分离株的分子及VITEK鉴定

哈维群弧菌是弧菌属的核心菌群,包括溶藻弧菌在内的6个种在表型和遗传型上均十分相似,要准确鉴定各种有一定难度。看家基因的研究及生化鉴定系统的出现为弧菌鉴定提供了多种方法,本文比较了16S rRNA基因、toxR基因和pyrH基因以及VITEK 2 COMPACT GN鉴定卡对溶藻弧菌相关分离株的分辨力。哈维群弧菌基因组内16S rRNA基因是多拷贝的,且拷贝间序列差异大于种间差异,不适用于种的鉴定。单拷贝基因toxR和pyrH序列种内差异均小于种间差异。基于toxR基因相似性比较可清楚地将18个疑似溶藻弧菌分离株和5个参比株归并到4个种;toxR基因系统发育学分析也显示,哈维群弧菌各种独立地聚类分支,且溶藻弧菌种内存在两个明显的聚类分支,说明两个分支的溶藻弧菌具有独立的进化方向。pyrH基因的相似性比较和发育学分析也得到类似的结果,但pyrH基因具有较强的保守性,因而分辨力稍低于toxR基因。VITEK 2 COMPACT GN鉴定卡在鉴定溶藻弧菌时也有一定的错误率,且鉴定谱较窄。因此,建议在实际应用中采用toxR基因比对作为溶藻弧菌快速鉴定的主要手段,可再选用pyrH基因对鉴定结果进行验证。

分析巴中地区696例阴道分泌物的细菌分离鉴定及耐药性

目的了解不同地区不同人群阴道感染病原菌的分布及耐药情况,为临床对阴道炎治疗过程中合理选用抗生素提供科学的实验室依据。方法对巴中地区2013年7月至2015年6月期间的696例阴道分泌物样本进行培养,在VITEK2-compact全自动微生物分析仪对分离的菌株进行分离鉴定和药敏试验分析。结果 696例样本中457例中培养出病原菌238株,阳性检出率为52.08%。细菌检出种类较多,革兰氏阳性球菌104株,革兰氏阴性杆菌63株,假丝酵母菌67株,其他细菌4株,阳性检出率分别为43.70%、26.47%和1.68%。葡萄球菌、粪肠球菌和B群无乳链球菌对万古霉素和利奈唑胺抗生素敏感率均为100.0%,粪肠球菌和B群无乳链球菌对氨苄西林和万古霉素的耐药率为0.00%。大肠埃希氏菌和肺炎克雷伯菌对阿米卡星、美洛培南和亚胺培南抗生素敏感率均在97.00%以上,两种假丝酵母菌对氟康唑和伊曲康唑的耐药率均在34.00%以上。结论定期总结分析所在地区的阴道分泌物中病原菌分布及细菌总体耐药概率,对临床合理选择抗生素、提高疗效和降低耐药菌株的产生有着重要的临床意义。

HX-21细菌鉴定药敏分析仪对临床常见菌鉴定能力的评价

目的评价HX-21细菌鉴定药敏分析仪对临床常见细菌的鉴定能力。方法对39株常见菌按操作规程进行分离与培养，用HX-21细菌鉴定药敏分析仪和VITEJ（2COMPACT进行鉴定并对结果进行比较。结果两种微生物鉴定仪的菌种鉴鉴符合率为94．87％，菌属鉴定符合率为99．99％。结论HX-21细茼鉴定药敏分析仪能够满足中小型医院临床常见菌的鉴定。

一种国产全自动微生物质谱检测系统性能评价

目的对国产全自动微生物质谱检测系统的临床常见病原菌鉴定能力进行评价。方法收集该院2021年3-5月来自临床非重复菌株302株。采用CMI-3800全自动微生物质谱检测系统(CMI-3800 MS)和VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪(VITEK 2 Compact)对病原菌进行鉴定,结果不一致的菌株采用16SrDNA基因测序予以确认。结果CMI-3800 MS鉴定到属水平有297株(98.34%),鉴定到种水平有288株(95.36%);VITEK 2 Compact鉴定到属水平有296株(98.01%),鉴定到种水平有277株(91.72%)。两种检测方法鉴定属一致的为296株(98.01%),种一致的为277株(91.72%);在种不一致的25株中取18株采用16SrDNA测序鉴定。结果显示,CMI-3800 MS有12株标本在种水平鉴定与16SrDNA基因测序结果完全一致,4株标本属水平一致,其余2株种属均不一致;VITEK 2 Compact有13株标本在属水平鉴定与16SrDNA基因测序的结果一致,4株种属均不一致,有1株未能鉴定出来。结论CMI-3800 MS与VITEK 2 Compact对临床常见病原菌的鉴定结果较一致,但前者通量大、重复性好、操作简便,且在时间和经济成本上明显优于后者,符合对临床微生物鉴定的要求。

VITEK 2 Compact检测耐亚胺培南鲍曼不动杆菌在庆大霉素不同药敏表型时阿米卡星的敏感性

目的探讨VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统(VITEK 2 Compact)检测亚胺培南耐药的鲍曼不动杆菌在庆大霉素不同药敏表型情况下阿米卡星敏感性试验的准确性。方法收集使用VITEK 2 Compact检测对庆大霉素不同药敏表型、阿米卡星敏感的耐亚胺培南鲍曼不动杆菌80株,以E-test法为参考方法,同时用纸片扩散(K-B)法进行复核。结果在80株耐亚胺培南的鲍曼不动杆菌中,有22株VITEK 2 Compact检测为庆大霉素、阿米卡星敏感,经E-test法和K-B法检测为庆大霉素、阿米卡星敏感,其余58株VITEK 2Compact检测为庆大霉素耐药、阿米卡星敏感,经E-test法和K-B法检测其中4株为庆大霉素耐药、阿米卡星均敏感,54株为庆大霉素、阿米卡星均耐药。本实验中E-test法和K-B法的结果均一致,标准符合率(CA)100%,VITEK 2 Compact与E-test法CA为32.5%,极严重错误率达67.5%。结论 VITEK 2 Compact检测亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌在庆大霉素为敏感、阿米卡星为敏感时结果与E-test法及K-B法相符;当庆大霉素药敏为耐药、阿米卡星为敏感时,可能会产生结果误差,在临床可用E-test法或K-B法进行验证。

梅里埃血培养仪联合Vitek2 compact在血标本中菌株分离鉴定及耐药检测分析

目的:分析Vitek2 compact和梅里埃血培养仪在血标本菌株分离鉴定和耐药分析的应用。方法:选择临床送检血液样本1 350份,进行菌种鉴定和耐药性分析。结果:在1 350份血液样本中分离出病原菌152株,革兰阴性菌78株(51.31%),革兰阳性菌66株(43.42%),真菌8株(5.27%);革兰阳性菌对苯唑西林与苄青霉素的耐药率分别为62.12%和77.27%,革兰阴性菌对头孢素类和青霉素类的耐药率均较高。结论:Vitek2 compact和梅里埃血培养仪能准确分离出血标本中菌株,在血流感染疾病的快速诊疗领域中具有较好的应用前景。

金黄色葡萄球菌鉴定方法研究

目的筛选出能够快速准确鉴定金黄色葡萄球菌的方法。方法利用国家标准法、VITEK 2 Compact生化鉴定、16S rDNA序列分析和PCR鉴定等4种方法对酱卤肉制品中分离出的典型菌落进行鉴定。结果国家标准法检测结果显示菌株为革兰氏阳性菌,血平板上有明显的透明溶血圈且血浆凝固酶试验结果为阳性,符合金黄色葡萄球菌判定标准。VITEK 2 Compact生化鉴定结果中不吻合的典型生化谱仅有1项(dMAL),判定菌株为金黄色葡萄球菌(98%概率),为极好的鉴定。16SrDNA序列比对分析及以邻接法构建的进化树均显示典型菌落为金黄色葡萄球菌。以耐热核酸酶基因(nuc)设计的引物能扩增出单一的清晰条带,能快速准确的识别出金黄色葡萄球菌。结论 4种方法均能准确鉴定出金黄色葡萄球菌,但耗时都比较长,通过改进实验方法,缩短DNA提取时间, PCR鉴定将表现出较大优势。

饮用天然矿泉水中疑似粪链球菌的鉴定与分析

目的检测某品牌饮用天然矿泉水样品中是否含有粪链球菌,并对出现的疑似菌落进行分析。方法按照GB 8538.56-2016《食品安全国家标准饮用天然矿泉水检验方法》中粪链球菌的检测方法对样品进行检测,对疑似菌落进行确证性实验,并通过VITEK2COMPACT全自动微生物鉴定系统对疑似菌进行鉴定。结果滤膜上出现典型红色菌落,经确证性实验确认为非粪链球菌;经VITEK2COMPACT鉴定,该菌为粘质沙雷氏菌。结论样品中的疑似菌落非粪链球菌而是粘质沙雷菌。

食品中沙门氏菌快速检测技术方法对比结果分析

目的比较VITEK2COMPACT、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(matrixassistedlaser desorption ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)、实时荧光PCR法(real-time PCR)、环介导等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)4类方法,分析其对沙门氏菌的快速检测效果。方法挑取12株阳性野生菌株复苏,配以1株标准菌株作为对照,分别用VIKEK2COMPACT、MALDI-TOF-MS、Real-timePCR、LAMP四类方法对其进行检测,并比较4类方法的结果差异。结果 Real-time PCR与LAMP单对通用引物能鉴定到属水平,此外, LAMP测定沙门氏菌时会有假阴性的情况出现;VITEK2生化鉴定能将少数沙门菌株鉴定到种的水平;质谱方法能鉴定到亚种水平,同时会出现鉴定不准确的情况。结论基于沙门氏菌属水平上, 4类方法都能快速准确鉴定沙门氏菌,但在使用快速检测技术时均应考量该方法的优点对实际工作的帮助以及缺点对检验结果的影响,才能提高检测效率。

VITEK 2 Compact联合MALDI-TOF MS、16S rDNA基因测序对1株类志贺邻单胞菌的对比鉴定报告

类志贺邻单胞菌属于肠杆菌科的邻单胞菌属,是革兰阴性杆菌,为人类条件致病菌,该菌首先发现于胃肠道,但无明确证据证实其具有肠致病性,仅个别例证报道其可引起败血症和肠胃炎。霍乱弧菌属于弧菌属,革兰阴性杆菌,血清型O1群和O139群是甲类传染病霍乱的病原菌,通过侵袭力和霍乱肠毒素致病,可引起严重的呕吐和腹泻;而血清型非O1/O139群血流感染在国内偶见报道。本文报告1例在湘潭市中心医院就诊的慢性肝病患者无明显诱因出现腹痛、腹泻伴呕吐,且畏寒、寒战,血培养检出1株革兰阴性杆菌,初期经VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析系统鉴定为霍乱弧菌;但后经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)和16S rDNA基因测序,均确认为类志贺邻单胞菌。根据药敏试验结果,予哌拉西林/他唑巴坦抗感染,输血、护肝等对症治疗后好转出院,随访无复发。本报告结果提示,当Vitek-2 Compact将待检样本鉴定为霍乱弧菌等临床少见菌时,仍须结合细菌菌落形态、辅助生化试验以及患者的临床情况进行综合判断,必要时可采用质谱、基因测序等其他检测手段进行复核。

微生物洁净室环境菌库建立方法探讨

目的:本研究通过对洁净实验室环境菌的收集及鉴定,为超标结果调查分析、药品检出菌溯源分析及洁净环境菌数据库的建立与分析提供数据支持。方法:在洁净实验室、操作人员等监控点采集沉降菌、浮游菌及表面微生物,采用VITEK2 compact鉴定系统进行鉴定分型。结果:经过对不同洁净级别和微生物种类的分析,共收集获得环境菌53株,其中芽孢杆菌属、库克氏菌属和葡萄球菌属细菌分别占全部分离株的17.0%、15.1%和13.2%。结论:基本了解洁净室环境微生物构成,初步建立洁净室环境微生物数据库。建议洁净实验室规范人员更衣进场程序和洁净区行为,制定有效的清洁消毒程序,加强环境监控,定期分析监控数据,研究数据变化趋势,出现异常数据,应及时采取措施,使洁净区处于良好的受控状态。

VITEK 2 Compact及其在食品微生物检测中的应用研究

食品检验是确保食品安全的重要手段,而食品微生物检验又是食品检验的重要组成部分。VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定系统具有准确、快速、可重复、安全和自动化程度高的特点,被广泛用于微生物检验。在检验过程中,微生物的纯度、浓度、传代次数及培养时间和培养基类型等因素对检验结果影响较大。该系统对常见的食源性致病菌检验效果较好,在食品安全检测领域具有重要的应用价值。

3种方法在化妆品铜绿假单胞菌鉴定中的应用

为对3种鉴定方法进行比较分析,以建立适合于化妆品中铜绿假单胞菌的检验方法,本文同时采用MALDI-TOF-MS方法、基于16s rRNA基因的系统发育分析方法、VITEK2 COMPACT微生物鉴定仪对化妆品中10株分离菌株进行鉴定。结果显示,上述3种方法对10株可疑菌株鉴定结果一致,均为铜绿假单胞菌。由此可见,3种方法可相互结合,用于化妆品中铜绿假单胞菌的鉴定及其他菌株的鉴定。

VITEK 2 Compact与Phoenix-100对革兰阴性杆菌药物敏感试验结果对比分析

目的对比VITEK 2 Compact与Phoenix-100两台微生物鉴定药敏分析系统对革兰阴性杆菌药物敏感试验(简称药敏试验)结果准确性的差异。方法收集温州市中心医院2019年临床分离率最高的4种革兰阴性杆菌,共20株,大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌各5株。分别在VITEK 2 Compact和Phoenix-100分析系统上机,进行药敏试验;同时对两台仪器共有的抗生素用手工纸片扩散(K-B)法进行复核,对比分析试验结果。结果在185株革兰阴性杆菌-抗生素组合,与K-B法相比较,VITEK 2的总分类一致性为92.4%,Phoenix-100为94.6%。两台仪器的药敏试验结果符合率为91.4%,除阿米卡星与复方新诺明两台仪器结果全部符合外,其他药物均存在一定的差异,尤其头孢吡肟、左氧氟沙星与哌拉西林/他唑巴坦均出现相反结果。结论两台仪器对革兰阴性杆菌体外药敏试验均较可靠,但使用VITEK 2测定哌拉西林/他唑巴坦与头孢吡肟时,注意可能出现“假敏感”现象,采用Phoenix-100或K-B法检测更准确。