目的:分析总结2021年河南省新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV-2)Delta变异株肺炎流行病学及分子特征,为疫情防控提供依据。方法:依据中国疾病预防控制中心(Chinese Centre for Disease Control and...目的:分析总结2021年河南省新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV-2)Delta变异株肺炎流行病学及分子特征,为疫情防控提供依据。方法:依据中国疾病预防控制中心(Chinese Centre for Disease Control and Prevention,CDC)反馈测序结果,挑选2021年河南入境和本土病例为SARS-CoV-2 Delta变异株肺炎患者111例,从大疫情网上获得患者基本信息,对年龄、性别、是否接种疫苗、接种剂次、RT-qPCR检测ORF1 ab基因和N基因Ct值在不同性别及不同症状病例间有无差异、患者临床分型等进行统计学分析,对测序结果核苷酸及刺突蛋白(spike protein,S)突变位点进行分析,总结规律。结果:111个病例在不同年龄组间的性别分布差异无统计学意义(χ^(2)=2.217,P=0.529)。不同疫苗接种史人群中的病例类型差异无统计学意义(χ^(2)=12.074,P=0.209)。SARS-CoV-2核酸阳性标本中,大部分标本Ct值分布在较低区间,病毒载量较高。ORF1 ab基因Ct值在不同性别间的差异无统计学意义(χ^(2)=1.646,P=0.439),在无症状感染者、轻型、普通、重型之间差异具有统计学意义(χ^(2)=13.257,P=0.039)。N基因Ct值在不同性别及不同症状病例间差异均无统计学意义(P均>0.05)。本研究的111例患者主要通过密接筛查和全员核酸筛查发现,两者共占总体的62.2%(69例)。测序长度覆盖度基本都大于99%(占90.1%,100/111),核苷酸突变位点总数多为46~50个(86.4%,89/103),S蛋白突变位点总数多为12个(82.5%,85/103)。103株Delta变异株均含有T19R、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、D950N、E156del、F157del这9个突变位点,突变率为100%。结论:2021年河南省SARS-CoV-2 Delta变异株对人群普遍易感;病毒载量高,ORF1 ab基因载量增高会加重临床症状。展开更多
文摘目的:分析总结2021年河南省新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV-2)Delta变异株肺炎流行病学及分子特征,为疫情防控提供依据。方法:依据中国疾病预防控制中心(Chinese Centre for Disease Control and Prevention,CDC)反馈测序结果,挑选2021年河南入境和本土病例为SARS-CoV-2 Delta变异株肺炎患者111例,从大疫情网上获得患者基本信息,对年龄、性别、是否接种疫苗、接种剂次、RT-qPCR检测ORF1 ab基因和N基因Ct值在不同性别及不同症状病例间有无差异、患者临床分型等进行统计学分析,对测序结果核苷酸及刺突蛋白(spike protein,S)突变位点进行分析,总结规律。结果:111个病例在不同年龄组间的性别分布差异无统计学意义(χ^(2)=2.217,P=0.529)。不同疫苗接种史人群中的病例类型差异无统计学意义(χ^(2)=12.074,P=0.209)。SARS-CoV-2核酸阳性标本中,大部分标本Ct值分布在较低区间,病毒载量较高。ORF1 ab基因Ct值在不同性别间的差异无统计学意义(χ^(2)=1.646,P=0.439),在无症状感染者、轻型、普通、重型之间差异具有统计学意义(χ^(2)=13.257,P=0.039)。N基因Ct值在不同性别及不同症状病例间差异均无统计学意义(P均>0.05)。本研究的111例患者主要通过密接筛查和全员核酸筛查发现,两者共占总体的62.2%(69例)。测序长度覆盖度基本都大于99%(占90.1%,100/111),核苷酸突变位点总数多为46~50个(86.4%,89/103),S蛋白突变位点总数多为12个(82.5%,85/103)。103株Delta变异株均含有T19R、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、D950N、E156del、F157del这9个突变位点,突变率为100%。结论:2021年河南省SARS-CoV-2 Delta变异株对人群普遍易感;病毒载量高,ORF1 ab基因载量增高会加重临床症状。
