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2009—2018年辽宁省急性弛缓性麻痹监测中肠道病毒A组71型VP1区基因特征分析
被引量:
2
1
作者
任丽萍
邵玉平
+4 位作者
陈涛
王艳
方兴
韩悦
姚文清
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期181-185,共5页
目的分析辽宁省2009—2018年急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中人肠道病毒A组71型(EV-A71)VP1区的基因特征。方法对辽宁省2009—2018年AFP病例的粪便标本进行病毒分离,将分离到的非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enter...
目的分析辽宁省2009—2018年急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中人肠道病毒A组71型(EV-A71)VP1区的基因特征。方法对辽宁省2009—2018年AFP病例的粪便标本进行病毒分离,将分离到的非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus,NPEV)进行RT-PCR,将阳性产物进行VP1区序列测定。用BioEdit软件对分离株VP1区序列与EV-A71 C4亚型的C4a分支及EV-A71原型株进行同源性比对;根据EV-A71 VP1编码区全长,采用Neighbor-Joining方法构建所获分离株及从GenBank下载的EV-A71各基因型及亚型代表株的进化树,并用Mega4.0软件分析。结果共检测1 044例AFP粪便标本,99例标本分离到NPEV,其中11例标本的分离株为EV-A71;此11株分离株VP1区核苷酸及氨基酸与C4亚型的C4a分支同源性分别为96.5%~98.3%和98.6%~99.3%;与EV-A71原型株同源性分别为81.1%~82.2%和93.6%~94.7%;11株EV-A71之间核苷酸及氨基酸同源性为95.5%~100%和98.6%~100%。进化树分析表明,辽宁省EV-A71分离株与C4亚型的C4a分支处于同一支。结论辽宁省11株EV-A71分离株为密切相关的一簇,来源于同一传播链,为C4亚型中的C4a进化分支。本文为辽宁省AFP监测提供了病原学依据。
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关键词
肠道病毒A组71型
急性弛缓性麻痹
非脊髓灰质炎肠道病毒
vp1
区
基因特征
原文传递
题名
2009—2018年辽宁省急性弛缓性麻痹监测中肠道病毒A组71型VP1区基因特征分析
被引量:
2
1
作者
任丽萍
邵玉平
陈涛
王艳
方兴
韩悦
姚文清
机构
辽宁省疾病预防控制中心
出处
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期181-185,共5页
基金
国家科技重大专项(2017ZX10103007-001)
辽宁省2018年重点研发计划(2018225043)。
文摘
目的分析辽宁省2009—2018年急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中人肠道病毒A组71型(EV-A71)VP1区的基因特征。方法对辽宁省2009—2018年AFP病例的粪便标本进行病毒分离,将分离到的非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus,NPEV)进行RT-PCR,将阳性产物进行VP1区序列测定。用BioEdit软件对分离株VP1区序列与EV-A71 C4亚型的C4a分支及EV-A71原型株进行同源性比对;根据EV-A71 VP1编码区全长,采用Neighbor-Joining方法构建所获分离株及从GenBank下载的EV-A71各基因型及亚型代表株的进化树,并用Mega4.0软件分析。结果共检测1 044例AFP粪便标本,99例标本分离到NPEV,其中11例标本的分离株为EV-A71;此11株分离株VP1区核苷酸及氨基酸与C4亚型的C4a分支同源性分别为96.5%~98.3%和98.6%~99.3%;与EV-A71原型株同源性分别为81.1%~82.2%和93.6%~94.7%;11株EV-A71之间核苷酸及氨基酸同源性为95.5%~100%和98.6%~100%。进化树分析表明,辽宁省EV-A71分离株与C4亚型的C4a分支处于同一支。结论辽宁省11株EV-A71分离株为密切相关的一簇,来源于同一传播链,为C4亚型中的C4a进化分支。本文为辽宁省AFP监测提供了病原学依据。
关键词
肠道病毒A组71型
急性弛缓性麻痹
非脊髓灰质炎肠道病毒
vp1
区
基因特征
Keywords
Enterovirus group A type 71(EV-A71)
Acute flaccid paralysis(AFP)
Non-polio enterovirus(NPEV)
vp1 rogion
Genetic characteristics
分类号
R512.5 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2009—2018年辽宁省急性弛缓性麻痹监测中肠道病毒A组71型VP1区基因特征分析
任丽萍
邵玉平
陈涛
王艳
方兴
韩悦
姚文清
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
原文传递
已选择
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