鹅细小病毒不同毒株VP13基因的克隆与序列分析

分别将鹅细小病毒(GPV)的5个分离株通过PCR技术,从病毒基因组DNA中扩增出病毒蛋白VP1和VP3非重叠区的基因片段(VP13基因),并与pMD18-T质粒载体连接,转化到感受态大肠埃希菌Top10中,经PCR鉴定后,对插入片段进行序列测定及分析。结果表明,5株GPV VP13基因全长均为594 bp,编码198个氨基酸。不同毒株主要结构蛋白VP13基因与国外已发表的鹅细小病毒B株核苷酸序列相似性较高(93.4%～98.7%),但毒株间也存在一定差异。

VPS13A基因双位点纯合突变致舞蹈病-棘红细胞增多症1例并文献复习

舞蹈病-棘红细胞增多症(chorea-acanthocytosis,ChAc)是一种罕见的常染色体隐性遗传病,其临床特征较为复杂,可累及运动、神经、精神及内分泌等多个系统,常伴有头颈部不自主运动、进行性舞蹈样运动障碍、认知能力下降等临床表现,极易与麦克劳德综合征、类亨廷顿病2型、泛酸激酶相关的神经退行性等疾病相混淆[1];液泡蛋白分类同源物13A(vacuolar protein sorting homolog 13A,VPS13A)基因编码蛋白chorein对于维持细胞膜正常结构及神经元细胞功能具有重要作用,其突变与CHAc发病相关。现将南昌大学第一附属医院诊治的1例VPS13A基因双位点纯合突变致ChAc患者报告如下。

山羊VPS13C和EIF4G1基因多态性及其与产奶性状关联性分析

为了探究VPS13C和EIF4G1基因与奶山羊产奶性状的关系,以吐根堡和崂山奶山羊为试验组,辽宁绒山羊、日土白绒山羊、班戈白绒山羊和南疆绒山羊为对照组,采用PCR产物直接测序方法,检测VPS13C基因外显子10、33和内含子10以及EIF4G1基因外显子18和24上的单核苷酸多态性在不同山羊品种中的分布。结果表明,在VPS13C基因外显子10、33和内含子10上分别检测到1、1和3个多态位点。其中,g.22885C>A、g.72809G>A位点均导致氨基酸变化。在该基因中发现2个在奶用和非奶用山羊群体中共有的单体型,分别为ACAG(奶山羊中63.7%;非奶用山羊中21.2%)和CTGT(奶山羊中36.3%;非奶用山羊中78.1%),说明单体型ACAG可能与山羊的产奶性状相关。在EIF4G1基因外显子18和24上各发现1个多态位点,其中g.12301A>G位点导致氨基酸变化,g.9003G>A位点不改变氨基酸。g.9003G>A位点在崂山奶山羊上存在AA和AG两种基因型,与日均产奶量关联分析显示,AA基因型个体的日均产奶量显著高于AG基因型个体(P=0.021)。研究结果提示:VPS13C和EIF4G1基因均可能是与山羊产奶性状有一定的相关性,EIF4G1基因中g.9003G>A位点与奶山羊高产奶量之间存在显著相关性。

VPS13A基因突变致舞蹈病-棘红细胞增多症的诊断及家系研究

目的:探讨舞蹈病-棘红细胞增多症(Ch Ac)的诊断方法及家系特点,为Ch Ac的精准诊断提供可行合理的策略。方法:选取1例临床疑似Ch Ac患者(先证者)作为研究对象,收集其临床资料和家系资料并绘制遗传家系图;采用扫描电镜检测棘红细胞,利用全外显子目标序列捕获2代测序技术筛查Ch Ac易患性基因及其突变类型。结果:先证者主要临床表现为不自主伸舌、磨牙、扮鬼脸、头部及四肢舞蹈动作及口唇自噬动作,外周血肌酶和转氨酶均增高,头颅MRI可见尾状核轻度萎缩;其兄生前具有与先证者同样的临床表现,其父母及姐姐均体健;先证者外周血检测到典型棘红细胞,检测出液泡蛋白分类同源物13A(VPS13A)基因,且VPS13A基因存在c. 9403C> T纯合突变,引起氨基酸改变p. R3135X,为无义突变;先证者的父亲和母亲均为c. 9403C> T杂合突变。结论:结合临床表现及扫描电镜检查可以高度怀疑Ch Ac,但全外显子目标序列捕获2代测序技术可准确检测VPS13A基因突变,并可结合遗传家系特点,作为Ch Ac首选确诊手段。

VPS13B基因复合杂合变异致Cohen综合征1例报告并文献复习

目的探讨Cohen综合征临床及基因变异特点。方法回顾分析1例Cohen综合征患儿的临床资料及分子遗传学检测结果,并复习相关文献。结果患儿,男,1岁3个月,因智力运动发育迟缓就诊。患儿毛发浓密,眼距宽,眼裂下斜,短人中,上唇短,多线及通贯掌纹,关节过伸,肌张力低。中性粒细胞减少。头颅磁共振成像示双侧脑室扩大,脑外间隙增宽。基因检测显示患儿VPS13B基因存在复合杂合变异c.3863 delC(p.T 1288 fs)及c.5082 delT(p.S 1694 fs),分别来自表型正常的父母。两个变异位点均未见报道,相关软件预测为致病变异。结论患儿确诊为Cohen综合征,此研究扩展了Cohen综合征患者VPS13B基因变异谱。

VPS13C基因作为黑色素瘤患者预后预测指标及免疫细胞浸润相关研究

目的探讨VPS13C基因表达水平对黑色素瘤患者预后的影响及其潜在机制。方法采用GEPIA数据库分析VPS13C基因在肿瘤和正常组织中的表达差异;通过Prognoscan数据库分析VPS13C基因表达与黑色素瘤患者预后的关系;通过TIMER及GEPIA数据库分析VPS13C基因低表达与免疫细胞浸润的相关性。结果相较于正常组织,VPS13C基因在黑色素瘤中低表达,且具有统计学差异(P<0.05);Prognoscan数据库及TCGA数据库分析结果显示VPS13C基因低表达时黑色素瘤患者预后更差。VPS13C高表达的黑色素瘤患者预后更好,生存时间更长;TIMER数据库分析结果显示,在黑色素瘤患者中,多种免疫细胞浸润与VPS13C基因表达水平呈正相关,包括CD8^(+)T细胞,CD4^(+)T细胞等;VPS13C基因表达水平与耗竭前体CD8^(+)T细胞相关基因,Th1细胞相关基因,cDC1相关基因,M1型巨噬细胞相关基因表达水平呈正相关。结论VPS13C基因低表达与黑色素瘤患者不良预后明显相关,可能与耗竭前体CD8^(+)T细胞、Th1细胞、cDC1、M1巨噬细胞高浸润有关。

VPS13B基因突变致科恩综合征患儿2例并文献复习

报道2例VPS13B基因突变致科恩综合征患儿,并进行文献复习。

VPS13B基因复合杂合变异致Cohen综合征一个家系的遗传学分析

目的分析1个Cohen综合征家系的临床表型与遗传学特征,并为产前诊断提供实验依据。方法选取2021年6月2日因"智力障碍及发育迟缓"就诊于郑州人民医院的Cohen综合征女性先证者、先证者妹妹及其家系成员(3代共11人)作为研究对象,收集先证者及先证者妹妹的临床资料。提取该家系成员外周血样品及胎儿胎盘绒毛样品基因组DNA,利用染色体微阵列技术(CMA)检测先证者染色体异常情况。利用全外显子组测序(WES)及Sanger测序,寻找先证者候选变异位点,并进行家系验证。提取家系成员外周血RNA,进行体内剪接变异体检测,应用RT-PCR分析VPS13B基因的mRNA表达水平,并对胎龄12周的胎儿的进行产前诊断。结果先证者为10岁女性,临床表现为发育迟缓、躯体肥胖、高度近视、特殊面容。先证者妹妹为3岁女性,具有与先证者相同表型。CMA结果提示先证者染色体未见异常。WES结果发现先证者及其妹妹VPS13B基因存在2个杂合变异,分别为c.1007610077delCA(p.T3359fs*29)缺失移码变异及c.6940+1G>T剪接位点变异,均已有报道。母亲为c.1007610077delCA(p.T3359fs*29)变异携带者,遗传自先证者外祖父。父亲为c.6940+1G>T变异携带者,遗传自先证者祖母。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,c.1007610077delCA评级为致病性变异(PVS1+PS4+PM4+PP1),c.6940+1G>T评级为致病性变异(PVS1+PM2Supporting+PM3+PP1)。c.6940+1G>T剪接位点变异导致VPS13B基因第38外显子发生跳跃,产生1个缺失69个氨基酸的转录本。与对照组相比,先证者父母在外周血中mRNA表达水平降低至65%~70%(P<0.01)、先证者及其妹妹降低至40%(P<0.001)。对胎龄12周的胎儿的产前诊断发现胎儿存在c.1007610077delCA杂合变异。结论VPS13B基因的c.1007610077delCA(p.T3359fs*29)缺失移码变异及c.6940+1G>T剪接位点变异考虑为该家系先证者及其妹妹患Cohen综合征的致病原因。基因检测技术可以辅助临床医师诊断Cohen综合征。

严重先天性中性粒细胞减少症2例报告及文献复习

目的探讨罕见的严重先天性中性粒细胞减少症的临床及基因突变特点。方法回顾分析2例经基因检测确诊为严重先天性中性粒细胞减少患儿的临床资料,并复习相关文献。结果男女各1例,均有反复感染病史。男孩,1岁9个月,中性粒细胞绝对计数(ANC)最低0.17×10^9/L,伴有发育异常,全外显子基因检测示VPS13B基因杂合突变,Exon47,c.8531 delG(p.Ser 2844 fs)移码突变,来自父亲;Intron 38(c.6940+1G>T)内含子突变,来自母亲,结合临床确诊Cohen综合征。女孩,2岁,ANC长期波动在0.4×10^9/L左右,全外显子基因检测示CSF3R基因杂合突变,Intron3,c.64+5G>A内含子突变,来自父亲;Exon 7,c.690 delC(p.Met 231Cysfs*32)移码突变,来自母亲,结合临床考虑为严重先天性粒细胞减少症7型(SCN7)。女性患儿对粒细胞集落刺激因子(G-GSF)治疗无效,改用粒细胞巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)有效。结论严重先天性中性粒细胞减少可导致严重或反复感染,为某类综合征的特征表现,部分可向骨髓增生异常综合征或急性髓细胞性白血病转变,需长期随访及治疗,基因检测有助诊断。

以精神行为症状为主要临床相的神经性棘红细胞增多症1例

神经性棘红细胞增多症是一种罕见、严重、预后不良的遗传性神经退行性疾病。本例患者29岁,女性,以逐渐加重的行为异常伴口齿不清作为主要症状就诊,基因测序提示VPS13A基因突变,诊断为神经性棘红细胞增多症。本文通过报道此例患者,希望提高精神科医生对于运动障碍和行为障碍的鉴别意识,并结合文献回顾神经性棘红细胞增多症的临床表现、鉴别诊断和基因检测手段,帮助精神科医生对神经性棘红细胞增多症进行早期识别和准确诊断。

首诊于眼科的Cohen综合征1例

患儿男,6岁。因双眼畏光2年于2021年3月12日到陕西省眼科医院就诊。患儿为第一胎第一产,足月孕39周+5顺产。1岁时外院儿科诊断为“先天发育迟缓”,运动较同龄人差(约2岁时能说完整的词语,3岁时可行走)。否认夜盲及色盲,否认癫痫病史。父母非近亲结婚,无家族遗传病史。体格检查:体重24 kg,身高120 cm,头围48 cm;神志清晰,反应迟钝;面容特殊(头围小,头发浓密、发际线低,睑裂下斜,人中短,上嘴唇凸出)(图1A);通贯掌纹,手指脚趾较为纤细(图1B,1C);骨骼发育、心脏彩色超声及心电图检查无异常。

幼儿精神运动发育落后伴中性粒细胞减少1年余

患儿,男,1岁5个月。婴儿期出现精神运动发育落后及外周血中性粒细胞减少,体格检查发现小头畸形、特殊面容、皮纹异常(右手通贯掌)、四肢肌张力低以及双侧肩、髋关节过度伸展。基因检测发现患儿VPS13B基因存在c.8868-1G>A(splicing)与c.11624_11625del(p.V3875Afs*10)复合杂合突变,具致病性,确诊为Cohen综合征。Cohen综合征是由VPS13B基因突变所致的罕见常染色体隐性遗传病,临床表现复杂多样,小头畸形、特殊面容、中性粒细胞减少、关节过度伸展等表现具有特征性,行VPS13B基因检测有助于确诊。

Cohen综合征并文献复习

目的探讨VPS13B基因突变所致Cohen综合征患儿的临床特征及诊断特点,并进行相关文献复习,为Cohen综合征遗传咨询和诊断提供参考。方法选择2019年1月,于中山大学孙逸仙纪念医院儿科确诊为Cohen综合征的2例患儿(患儿1、2)为研究对象。采用回顾性分析方法,收集2例患儿的临床病例资料,并对其病史采集、相关检查结果进行分析。以“Cohen综合征”“Cohen syndrome”为关键词,检索在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、PubMed数据库、中国生物医学文献服务系统(SinoMed)、中国知网(CNKI)、万方数据知识服务平台、维普中文科技期刊数据库中Cohen综合征相关文献,检索时间设定为1973年1月1日至2019年1月1日。本研究符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求,并且征得受试儿家属(父亲、母亲及表叔)知情同意。结果①患儿1病史采集:男性,4岁3个月,主要临床表现为精神运动发育落后、小头畸形和身材矮小。相关检查结果:血常规检查结果提示中性粒细胞计数减少;听性脑干反应(ABR)检查提示左侧听觉传导通路损伤,双侧听觉反应阈值可疑范围;双眼视觉诱发电位(VEP)检查未见异常;脑电图正常;头颅MRI平扫提示双侧额部脑外间隙稍增宽;全脊柱正侧位X射线摄片提示右侧轻度髋发育不良伴右髋关节半脱位可能;腰椎轻度左侧弯,疑为双髋关节不对称所致;心电图、心脏彩色多普勒超声检查和染色体核型分析均未见异常。②患儿2病史采集结果:患儿1胞弟,男性,1岁4个月,亦表现为精神运动发育落后,小头畸形和身材矮小。相关检查结果:双耳ABR正常;VEP检查提示右眼F-VEP P2波潜伏期稍延迟,振幅正常;脑电图正常;头颅MRI平扫未见异常;全脊柱正侧位X射线摄片、心电图、心脏彩色多普勒超声检查和染色体核型分析均未见异常。③患儿1、2遗传性疾病大家系全外显子组检测提示,2例患儿均携带VPS13B基因2个杂合病理性突变,即VPS13B[8q22 NM_017890.4 Intron50 c.9259-1G>C][8q22 NM_017890.4 Exon57 c.11104_11105de1]基因突变,这2个基因突变位点目前均尚未见文献报道。结论Cohen综合征为一种罕见常染色体隐性遗传性疾病。临床上对于特殊面容、生长发育落后、高度近视、弱视和色素性视网膜病变伴中性粒细胞减少症的患儿,应考虑到Cohen综合征的可能性,并进行基因检测,以及时确诊Cohen综合征。

新生儿Cohen综合征1例回顾性研究

目的:探讨Cohen综合征在新生儿期的发病特点、临床表现及早期干预管理。方法:回顾性研究本科室收治的一例新生儿期确诊的Cohen综合征患儿的临床资料,分析该病在不同时期的临床特征、基因变异及早期干预,以期能够在早期发现并确诊。结果:Cohen综合征是一种常染色体隐性遗传病[1],系VPS13B基因突变所致,可致多系统损害,随着年龄的增加,临床症状逐渐表现,在新生儿期的喂养困难、肌张力低下及中性粒细胞减少常常是其早期表现。结论:cohen综合症早期临床诊断比较困难,应尽早进行基因检测,确诊后积极给予早期干预。