不同甲型肝炎病毒株间部分编码VP_1N端的核苷酸序列比较

为估计从毛蚶中提取的甲肝病毒的VP_(1)N端核苷酸和氨基酸的变异,本实验用DNA多聚酶链反应特异性地扩增该区域基因,并将其次级克隆到M13载体作双脱氧核苷酸序列分析。与发表的HM-175、CR326和HAS-15株相应区域比较,除HAS-15株从第76位至93位存在18个核苷酸缺失外,测得的204个核苷酸序列中分别存在15、12和4个碱基替换。其中大多数碱基替换发生在不引起氨基酸改变的第三密码子上,仅第86、91和176位核苷酸改变在第一或第二密码子上。据此推导出不同地区甲肝病毒株的VP_(1)N端前68个氨基酸,除HAS-15株有6个氨基酸缺失外,只存在1至2个氨基酸区别。考虑到病毒是否经传代培养,无明显证据表明绒猴传代与这一区域核苷酸变异有关。