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河北地区鸡IBDV分离株VP2高变区的序列分析 被引量:3
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作者 张艳英 孙继国 +2 位作者 张文香 郑世学 张曼夫 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期24-27,共4页
以河北地区不同鸡IBDV基因组RNA为模板,采用RT-PCR/Nested-PCR的方法,得到其VP2高变区的cDNA片段后进行测序,并将其序列与本实验室已测定的周边省市及文献已报道的IBDV毒株相应区域进行了比较。结果表明,河北地区与周边省市间的IBDV毒... 以河北地区不同鸡IBDV基因组RNA为模板,采用RT-PCR/Nested-PCR的方法,得到其VP2高变区的cDNA片段后进行测序,并将其序列与本实验室已测定的周边省市及文献已报道的IBDV毒株相应区域进行了比较。结果表明,河北地区与周边省市间的IBDV毒株同源性极高,与欧洲细胞毒株Cu1和P2间具有很高的同源性,而与美国变异株VariantE的亲缘关系相距较远。 展开更多
关键词 IBDV vp2高变区 序列分析
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1株鸡传染性法氏囊病毒VP2基因的克隆及其分子流行病学分析 被引量:2
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作者 冯金芳 何海汛 +1 位作者 孙国鹏 王选年 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第1期109-113,133,共6页
为了解河南地区鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)的流行特征,研究了分离于河南新乡地区某发病鸡场的1株IBDV(XX511毒株)VP2基因的分子流行病学特征。根据Gen Bank公布的IBDV基因组序列信息,设计合成特异性引物,应用RT-PCR方法对分离于新乡某发... 为了解河南地区鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)的流行特征,研究了分离于河南新乡地区某发病鸡场的1株IBDV(XX511毒株)VP2基因的分子流行病学特征。根据Gen Bank公布的IBDV基因组序列信息,设计合成特异性引物,应用RT-PCR方法对分离于新乡某发病鸡场的IBDV野毒株XX511的VP2高变区进行克隆及分析,并将XX511毒株的VP2高变区中与毒力相关的2个亲水区及七肽区与国内外其他参考毒株进行序列比对,绘制进化树。结果显示,XX511毒株与超强毒株D49706、AJ878898的VP2基因高变区氨基酸序列的同源性均为96.8%,与广东地区JQ911703毒株具有100%的同源性。与参照的经典毒株相比,XX511毒株在第一亲水区发生了1个氨基酸位点的突变。通过与国内外(包括河南地区)其他流行毒株的比对及进化分析发现,XX511毒株与2012年广东流行JQ911703毒株处于同一分支。 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病毒 遗传进化 vp2高变区 七肽区 分子流行病学
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一株水貂阿留申病毒VP2基因的高变区测序分析 被引量:2
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作者 张蕾 胡博 +7 位作者 白雪 张海玲 赵建军 王振军 马凡舒 闫喜军 吴威 徐淑娟 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期226-230,共5页
为分析我国水貂阿留申病(Aleutian disease,AD)跨宿主传播的分子机制,扩增获得一株吉林地区水貂阿留申病毒(Aleutian disease virus,ADV)VP2基因高变区片段。序列分析表明,第235位存在与参考毒株不同的氨基酸位点,进化树分析结果表明,... 为分析我国水貂阿留申病(Aleutian disease,AD)跨宿主传播的分子机制,扩增获得一株吉林地区水貂阿留申病毒(Aleutian disease virus,ADV)VP2基因高变区片段。序列分析表明,第235位存在与参考毒株不同的氨基酸位点,进化树分析结果表明,该毒株与丹麦高致病毒株ADV-K亲缘关系较近。ADV第235位氨基酸位点可能与病毒的感染能力相关。 展开更多
关键词 水貂阿留申病毒 vp2高变区 跨宿主传播
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鸡传染性法氏囊病病毒秦皇岛株的分离鉴定
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作者 鲁改儒 张艳英 孟立根 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第6期62-65,共4页
将秦皇岛某养鸡场疑似为传染性法氏囊病的病死鸡进行剖检,为了对该疑似病例进行确诊,并进行流行病学研究,经对流免疫电泳,对采集的病料进行病毒的分离,阳性法氏囊病料进行病毒RNA的提取,采用套式RT-PCR对病毒的VP2高变区进行扩增,分析... 将秦皇岛某养鸡场疑似为传染性法氏囊病的病死鸡进行剖检,为了对该疑似病例进行确诊,并进行流行病学研究,经对流免疫电泳,对采集的病料进行病毒的分离,阳性法氏囊病料进行病毒RNA的提取,采用套式RT-PCR对病毒的VP2高变区进行扩增,分析氨基酸序列。结果表明,该分离株为传染性法氏囊病病毒(IBDV),被检毒株与GenBank报道的标准超强毒株OKYM、UK661、DV86同源性高达100%,与V3、V2亲缘关系较近。动物回归试验可使健康鸡100%发病,病死率80%。表该分离株为鸡传染性法氏囊病病毒超强毒株。 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病病毒 对流免疫电泳 vp2高变区 套式RT-PCR
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鸡传染性法氏囊病分子流行病学研究
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作者 白文霞 鲍恩东 +1 位作者 侯继波 何孔旺 《动物科学与动物医学》 2004年第8期51-53,共3页
15个江苏省IBDV分离株,对其VP2高变区进行RT-PCR扩增、测序,得到约560bp长的片段。分析比较15个IBDV分离株与参考毒株的VP2高变区(AccI-SpeI)推断的氨基酸序列,构建进化树。氨基酸序列分析以及进化树分析表明,15个IBDV分离株是超强毒株... 15个江苏省IBDV分离株,对其VP2高变区进行RT-PCR扩增、测序,得到约560bp长的片段。分析比较15个IBDV分离株与参考毒株的VP2高变区(AccI-SpeI)推断的氨基酸序列,构建进化树。氨基酸序列分析以及进化树分析表明,15个IBDV分离株是超强毒株。而且目前vvIBDVs在亚洲各个国家流行,且与欧洲国家的vvIBDVs的进化关系很近。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病毒 vp2高变区 超强毒株 变异毒株 古典毒株 致弱毒株
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传染性法氏囊病病毒广西流行毒株的分离鉴定及其遗传进化分析
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《今日畜牧兽医》 2009年第10期67-67,共1页
为了解传染性法氏囊病病毒(IBDV)广西流行株的遗传变异规律,本研究通过鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种的方法对2006年-2007年间采集自广西各鸡场的疑似传染性法氏囊病(IBD)的病料进行病毒分离,设计针对VP2高变区(vVP2)g/引物对分... 为了解传染性法氏囊病病毒(IBDV)广西流行株的遗传变异规律,本研究通过鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种的方法对2006年-2007年间采集自广西各鸡场的疑似传染性法氏囊病(IBD)的病料进行病毒分离,设计针对VP2高变区(vVP2)g/引物对分离物通过RT—PCR进行鉴定及序列分析。共分离出9个IBDV毒株,其ELD50在105/0.2毫升~106.5/0.2毫升之间。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 分离鉴定 流行毒株 遗传进化 广西 鸡胚绒毛尿囊膜 遗传变异规律 vp2高变区
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