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一种新的氨基酸描述子及其在肽QSAR中的应用
被引量:
25
1
作者
梅虎
周原
+1 位作者
孙立力
李志良
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004年第8期821-825,共5页
从天然氨基酸的25个结构与拓扑变量中经主成分分析得到一种新的氨基酸描述子———VSTV(principalcomponentscoresvectorofstructuralandtopologicalvariables).应用该描述子对以下3个体系,即血管紧张素转化酶抑制剂(2肽)、抗菌18肽和...
从天然氨基酸的25个结构与拓扑变量中经主成分分析得到一种新的氨基酸描述子———VSTV(principalcomponentscoresvectorofstructuralandtopologicalvariables).应用该描述子对以下3个体系,即血管紧张素转化酶抑制剂(2肽)、抗菌18肽和促凝血酶原激酶抑制剂(6~12肽)进行分子结构参数化表达,并在此基础上通过偏最小二乘回归(PLSR)建立定量构效关系(QSAR)模型,取得了优于文献的结果.模型的复相关系数(R2)和交互检验复相关系数(Q2)分别为0.789,0.767;0.996,0.879;0.981,0.480.
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关键词
氨基酸
多肽
拓扑
vstv
定量构效关系
偏最小二乘回归
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职称材料
题名
一种新的氨基酸描述子及其在肽QSAR中的应用
被引量:
25
1
作者
梅虎
周原
孙立力
李志良
机构
重庆大学化学化工学院
生物医学工程教育部与重庆市重点实验室
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004年第8期821-825,共5页
基金
重庆市应用基础基金(2001-155403-6)
霍英东基金(98-05-26)
重庆大学创新基地科技攻关实践项目(2003-03)资助~~
文摘
从天然氨基酸的25个结构与拓扑变量中经主成分分析得到一种新的氨基酸描述子———VSTV(principalcomponentscoresvectorofstructuralandtopologicalvariables).应用该描述子对以下3个体系,即血管紧张素转化酶抑制剂(2肽)、抗菌18肽和促凝血酶原激酶抑制剂(6~12肽)进行分子结构参数化表达,并在此基础上通过偏最小二乘回归(PLSR)建立定量构效关系(QSAR)模型,取得了优于文献的结果.模型的复相关系数(R2)和交互检验复相关系数(Q2)分别为0.789,0.767;0.996,0.879;0.981,0.480.
关键词
氨基酸
多肽
拓扑
vstv
定量构效关系
偏最小二乘回归
Keywords
amino acids
peptide
topology
principal component scores vector of structural and
topological variables (
vstv
)
quantitative structure activity relationship
partial least squares regression
分类号
O621 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种新的氨基酸描述子及其在肽QSAR中的应用
梅虎
周原
孙立力
李志良
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004
25
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职称材料
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参考文献
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