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草菇低温胁迫初期应答关键通路的探究
被引量:
3
1
作者
吕贝贝
吴潇
+9 位作者
莫芹
孙宇
蒋玮
黄艳娜
武国干
宋丽莉
王金斌
李鹏
刘刚
唐雪明
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1074-1086,共13页
本研究利用表达谱芯片技术解析了低温胁迫初期(0–120min)不同低温处理时间草菇转录组水平的变化。芯片结果分析发现在低温诱导过程中,低温处理20min内变化基因的功能为单加氧酶、氧化还原酶和细胞内的氧化还原。低温处理40min时表达差...
本研究利用表达谱芯片技术解析了低温胁迫初期(0–120min)不同低温处理时间草菇转录组水平的变化。芯片结果分析发现在低温诱导过程中,低温处理20min内变化基因的功能为单加氧酶、氧化还原酶和细胞内的氧化还原。低温处理40min时表达差异基因具有结合RNA的功能。80min的时间段内,基因的功能比较集中于核酸物质和能量的代谢。CYP450的代谢途径在20–40min、60–80min和100–120min低温处理的菌丝体中均有显著性变化,表明这一通路在草菇低温处理过程中表现活跃。基因表达趋势分析发现34个表达差异基因富集到显著表达趋势模型,基因共表达网络分析发现VVO04066位于网络的核心地位,推测VVO04066通过提高磷酸肌醇特异性磷脂酶C(PI-PLC)的胞内水平,促进糖蛋白和几丁质的合成,从而完成草菇细胞的低温胁迫应答。
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关键词
草菇
表达谱芯片
耐低温
CYP450
vvo_04066
原文传递
题名
草菇低温胁迫初期应答关键通路的探究
被引量:
3
1
作者
吕贝贝
吴潇
莫芹
孙宇
蒋玮
黄艳娜
武国干
宋丽莉
王金斌
李鹏
刘刚
唐雪明
机构
上海市农业科学院生物技术研究所
上海市农业遗传育种重点实验室
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1074-1086,共13页
基金
上海市科委一带一路项目(20310750500)
上海市科委社会发展科技领域重点项目(19DZ1203802)
+2 种基金
国家自然科学基金(31801511)
上海市农业科学院科技支撑项目(KJZC202008)
上海市农业科学院卓越团队(2017 B-07)。
文摘
本研究利用表达谱芯片技术解析了低温胁迫初期(0–120min)不同低温处理时间草菇转录组水平的变化。芯片结果分析发现在低温诱导过程中,低温处理20min内变化基因的功能为单加氧酶、氧化还原酶和细胞内的氧化还原。低温处理40min时表达差异基因具有结合RNA的功能。80min的时间段内,基因的功能比较集中于核酸物质和能量的代谢。CYP450的代谢途径在20–40min、60–80min和100–120min低温处理的菌丝体中均有显著性变化,表明这一通路在草菇低温处理过程中表现活跃。基因表达趋势分析发现34个表达差异基因富集到显著表达趋势模型,基因共表达网络分析发现VVO04066位于网络的核心地位,推测VVO04066通过提高磷酸肌醇特异性磷脂酶C(PI-PLC)的胞内水平,促进糖蛋白和几丁质的合成,从而完成草菇细胞的低温胁迫应答。
关键词
草菇
表达谱芯片
耐低温
CYP450
vvo_04066
Keywords
Volvariella volvacea
cDNA microarray
low temperature resistance
CYP450
VVO04066
分类号
S646.13 [农业科学—蔬菜学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草菇低温胁迫初期应答关键通路的探究
吕贝贝
吴潇
莫芹
孙宇
蒋玮
黄艳娜
武国干
宋丽莉
王金斌
李鹏
刘刚
唐雪明
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
原文传递
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参考文献
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