基于生物信息学分析VAMP8在乳腺癌中的表达情况及调控机制

目的基于生物信息学分析囊泡相关膜蛋白8(VAMP8)在乳腺癌中的表达情况及调控机制,并分析VAMP8高表达与患者预后的关系。方法用Oncomine数据库获取VAMP8在癌症组织及正常组织中的差异表达,用HPA数据库分析乳腺癌中VAMP8的阳性表达情况。用cBioPortal数据库获取VAMP8的共表达基因,随后用String数据库构建VAMP8共表达基因的蛋白质互作网络,最后用David数据库分析其GO生物学功能及KEGG信号通路富集。结果Oncomine数据库显示,VAMP8在癌症组织及正常组织中有317个数据集,在癌症组织中有36个高表达数据集、23个低表达数据集,其中乳腺癌组织中有12个高表达数据集,中位等级为191.5,P=4.89e-38。HPA数据库显示,VAMP8在乳腺癌组织中呈中、高度阳性表达,阳性蛋白主要集中在细胞质或细胞膜内。String数据库显示,有47种蛋白质与VAMP8有着直接或间接的联系。David数据库显示了VAMP8共表达基因在乳腺癌中的具体调控机制。乳腺癌患者的无病生存期(DFS)缩短与VAMP8的高表达有关(P=0.0183)。结论VAMP8在乳腺癌组织中呈中、高度阳性表达,其可作为评估患者预后的分子标志物及基因治疗靶点。

囊泡相关膜蛋白8基因多态性与动脉粥样硬化性脑梗死相关性研究

目的探讨囊泡相关膜蛋白8(VAMP8)基因rs13426038和rs10666612多态性与动脉粥样硬化性脑梗死(ACI)的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术,对动脉粥样硬化性脑梗死组和正常对照组VAMP8基因rs13426038和rs10666612位点进行基因分型。结果两位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡检验。VAMP8基因rs13426038位点CC/GG基因型频率在ACI组和对照组分别为20.5%/35.9%和15.0%/36.0%,C/G等位基因频率为42.3%/57.7%和39.5%/60.5%;两组间基因型及等位基因频率差异比较无统计学意义(P=0.08,P=0.25)。VAMP8基因rs10166612位点AA/GG基因型频率在ACI组和对照组分别为92.7%/0.5%和91.8%/0%,A/G等位基因频率为96.1%/3.9%和95.9%/4.1%;两组间基因型及等位基因频率分布比较亦无统计学差异(P=0.16,P=0.46)。结论 VAMP8基因rs13426038 C/G和rs10166612 A/G多态性可能与ACI发生无关。

DNA甲基化在脑胶质瘤中调控囊泡相关膜蛋白8基因的表达

目的探讨囊泡相关膜蛋白8(VAMP8)基因在脑胶质瘤中的表达及DNA甲基化对其的影响。方法通过荧光定量PCR分析VAMP8基因在脑胶质瘤中的表达水平;使用亚硫酸氢盐测序PCR检测VAMP8基因启动子甲基化程度;通过DNA甲基转移酶抑制剂处理脑胶质瘤细胞,检测DNA甲基化程度对VAMP8基因表达的影响;通过双荧光素酶报告基因实验验证DNA甲基化程度对VAMP8基因启动子活性的影响。结果与正常脑组织相比,VAMP8基因在脑胶质瘤组织中高表达(P=0.002),其表达水平与DNA甲基化程度相关(相关系数r=-0.533,P=5.8×10-5);脑胶质瘤组织中VAMP8基因转录起始区上游6个Cp G位点甲基化程度低(P<0.05)。VAMP8基因在脑胶质瘤细胞中的表达量受DNA甲基化水平的调控,处于高甲基化状态的VAMP8基因启动子活性较低(P=0.028)。结论脑胶质瘤组织DNA甲基化程度较低是VAMP8基因高表达的原因之一。

大鼠耳蜗中三磷酸腺苷表达及来源的初步研究

目的研究大鼠耳蜗中三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)的表达部位、来源及其可能的存在形式。方法运用喹丫因染色技术,观察培养的大鼠耳蜗血管纹缘细胞、全膜迷路铺片和新鲜分离的单离外毛细胞;用免疫组化荧光染色法,观察突触素(synaptophysin,SYN)和小泡相关膜蛋白-2(vesicle-associated mem-brane protein-2/synaptobrevin,VAMP-2)在大鼠耳蜗中的表达。结果培养的缘细胞胞浆中存在星点状喹丫因染色,全膜迷路铺片血管纹以外的区域和单离毛细胞中均未发现喹丫因的特异性染色。SYN和VAMP-2在大鼠耳蜗的内螺旋束、外螺旋束、Deiters细胞内侧缘和螺旋神经元(spiral ganglion neurons,SGNs)有共同表达。结论大鼠耳蜗缘细胞胞浆中存在大量囊泡状的ATP,而毛细胞、支持细胞中的ATP可能以非囊泡的形式储存。内螺旋束、外螺旋束和SGNs中有可能存在SYN染色的ATP囊泡。

花生VAMP基因家族全基因组鉴定及表达分析

植物囊泡结合膜蛋白(VAMP)是定位在囊泡上的运输蛋白,在植物发育以及响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用。本研究对花生VAMP基因进行了全基因组鉴定与分析,并对它们在22个组织中的表达模式进行了分析。结果表明,二倍体野生种花生Arachis duranensis基因组有18个VAMP基因,Arachisi paensis基因组有21个,栽培种有41个,剔除假基因后花生VAMP基因家族有62个成员;表达模式分析表明AdVAMP17与AiVAMP1在大部分组织中均有表达,AdVAMP18与AiVAMP21在雌蕊中表达量最高,可能有特异性表达。本研究为进一步分析VAMP家族成员,并深入探讨其在花生中的生物学功能和进化模式奠定了基础。

囊泡相关膜蛋白8的研究进展

膜融合对真核生物的诸多生命活动至关重要,需要不同的囊泡转运蛋白互相配合,从而特异性协调并辅助不同生物膜的融合,这些囊泡转运蛋白高度保守。囊泡相关膜蛋白8(vesicle associated membrane protein 8,VAMP8)主要定位于囊泡膜和溶酶体膜,其在多种不同生物膜的融合中发挥重要作用。本文就VAMP8的分子结构、转录调控和翻译后修饰、生物学功能及其与人类疾病相关性的研究进展作一综述,以期为治疗相关疾病和开发有效的VAMP8靶点药物提供新思路。

囊泡相关膜蛋白8基因多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病的相关性研究

目的 研究囊泡相关膜蛋白8（synaptobrevins/vesicle-associated membrane proteins 8,VAMP8）基因rs1010多态性在中国汉族人群中的分布及与冠状动脉粥样硬化性心脏病（简称冠心病）的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术,对汉族185例冠心病患者及149名正常人VAMP8 rs1010基因多态性,基因型及等位基因频率分布进行研究.结果 研究人群中存在VAMP8 rs1010基因多态性,基因型符合Hardy-Weinberg平衡,冠心病患者A等位基因频率显著高于对照组（67.3%VS 53.0%,P〈0.05）.Logistic回归分析得出：VAMP8基因（AA＋AG）基因型是冠心病的独立危险因素,（AA＋AG）基因型比GG基因型的比数比为1.969,95%可信区间为1.032～3.755.结论 VAMP8 rs1010基因多态性与冠心病有关,A等位基因可能是汉族人群冠心病的遗传危险因素.

肺炎支原体脂质相关膜蛋白激活THP-1单核细胞系产生醌氧化还原酶1抑制IL-8的分泌

目的探讨肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,Mp)脂质相关膜蛋白(lipid-associated membrane proteins,LAMPs)刺激人单核细胞系THP-1细胞表达醌氧化还原酶1(quinine oxidoreductase 1,NQO-1)的作用及NQO-1对LAMPs诱导IL-8分泌的影响,初步了解机体对Mp感染所致炎症反应的调节及机制。方法大量培养Mp,提取LAMPs,CCK8试验检测LAMPs的细胞毒性。用不同浓度LAMPs分别作用THP-1细胞不同时间,Western blot检测NQO-1蛋白水平。用特异性siRNA沉默THP-1细胞NF-E2相关因子2(nuclear factor erythroid 2-related factor 2,Nrf2)后,Western blot分析LAMPs对NQO-1蛋白表达的影响。用NQO-1抑制剂Diminutol(Dim)预处理THP-1细胞后,ELISA检测LAMPs刺激后IL-8的分泌水平。结果提取的LAMPs对THP-1细胞无毒性;NQO-1蛋白表达水平与LAMPs刺激呈剂量依赖性和时间依赖性,5.0μg/ml和7.5μg/ml LAMPs刺激12 h后THP-1细胞产生的NQO-1蛋白浓度最高。沉默Nrf2表达后,LAMPs诱导THP-1细胞产生的NQO-1蛋白显著减少。Dim抑制NQO-1后,LAMPs刺激细胞分泌的IL-8增多。结论Mp LAMPs经Nrf2诱导单核细胞表达的NQO-1可抑制IL-8的分泌。

囊泡相关膜蛋白8在结肠癌中的表达及临床意义

目的:探讨囊泡相关膜蛋白8(VAMP8)在结肠癌组织中的表达及其临床意义。方法:收集42例结肠癌患者癌组织及癌旁正常组织标本,用免疫组化法检测VAMP8蛋白的阳性表达率,分析其表达与结肠癌临床病理特征之间的关系;并选择其中12对标本,用q RT-PCR与Western blot法检测VAMP8 m RNA与蛋白的表达量。结果:q RT-PCR及Western blot检测显示,9对标本的结肠癌组织VAMP8 m RNA与蛋白表达量明显高于其对应的癌旁组织(均P<0.05);免疫组化结果显示,VAMP8在结肠癌组织中的阳性率明显高于癌旁组织(73.8%vs.42.9%;χ2=8.28,P<0.01),且VAMP8的表达与肿瘤的分化程度、Dukes分期及淋巴结转移情况有关(均P<0.05)。结论:VAMP8在结肠癌组织中表达上调,提示VAMP8可能通过调节自噬/溶酶体途径促进结肠癌的恶性进展与转移。