目的分析2021年5月济宁市一起学校聚集感染乙型流感病毒(Influenza B virus,FluB)Victoria系(BV系)聚集疫情的流行病学特点和全基因组特征,为疫情防控提供参考依据。方法对病例进行现场流行病学调查,采集咽拭子样本进行病毒核酸检测和...目的分析2021年5月济宁市一起学校聚集感染乙型流感病毒(Influenza B virus,FluB)Victoria系(BV系)聚集疫情的流行病学特点和全基因组特征,为疫情防控提供参考依据。方法对病例进行现场流行病学调查,采集咽拭子样本进行病毒核酸检测和细胞培养,对培养毒株进行全基因组测序,利用生物信息学软件分析进化变异特征。结果本次学校流感聚集疫情报告病例29例,班级罹患率为69.05%(29/42);核酸检测BV系阳性率为77.78%(14/18),培养毒株9株。同疫苗株B/Washington/02/2019相比,9株毒株8个节段核苷酸相似性为98.33%~99.74%。9株毒株HA基因序列在进化树上属于1A分支。血凝素抗原决定簇3个氨基酸发生置换,神经氨酸酶抑制剂耐药位点和酸性聚合酶抑制剂耐药位点均未发生变异。HA丢失位于抗原决定簇的N197糖基化位点,NS1丢失N107糖基化位点。多个蛋白的磷酸化位点发生改变。结论引起本次学校聚集疫情的病原体是BV系,应加强对学校流感样病例聚集疫情监测。展开更多
本研究分析了嘉兴市2021-2022年乙型流感病毒基因进化特征。首先采集2021-2022年嘉兴市流感样病例咽拭子标本进行流感病毒核酸检测、病毒分离。然后从嘉兴市2021-2022年流感分离株中共选取27株乙型流感病毒代表毒株进行全基因组高通量...本研究分析了嘉兴市2021-2022年乙型流感病毒基因进化特征。首先采集2021-2022年嘉兴市流感样病例咽拭子标本进行流感病毒核酸检测、病毒分离。然后从嘉兴市2021-2022年流感分离株中共选取27株乙型流感病毒代表毒株进行全基因组高通量测序。最后利用生物信息学软件从核苷酸、氨基酸及分子层面对流感毒株进行分子特征分析。2021年嘉兴市共检测1362例流感样病例标本,阳性标本数98例,阳性率为7.20%,均为乙型流感病毒Victoria系(Influenza B virus Lineage Victoria,BV)。2022年嘉兴市共检测1318例流感样病例标本,阳性标本数335例,其中BV系89例,阳性率为6.75%,H3N2亚型246例,阳性率为18.66%。与疫苗株相比,2021年血凝素(haemagglutinin,HA)核苷酸与氨基酸序列相似性为98.92%±0.24%、98.55%±0.21%,神经氨酸酶(neuraminidase,NA)核苷酸与氨基酸序列相似性为99.25%±0.13%、99.37%±0.22%;2022年HA核苷酸与氨基酸序列相似性为99.12%±0.08%、99.64%±0.16%,NA核苷酸与氨基酸序列相似性为98.16±0.25%、98.1±0.19%。2021年嘉兴市分离的BV系流感病毒归属于V1A.3a.1和V1A.3a.2分支,2022年分离的BV系病毒归属于V1A.3a.2分支,V1A.3a.2为2021-2022年嘉兴市优势毒株。在2021年流感毒株中发现一株HA/NA系内重组株B/Zhejiang-Nanhu/1921/2021。与流感疫苗株相比,嘉兴市分离株在HA蛋白的120环、150环、160环及190螺旋等关键的抗原决定簇部位发生H137N、H137Q、A137T、R148G、P159L、N165K、A172T、G196E、R133K、H137K、R156G等多个氨基酸位点改变,而在NA蛋白上未发现神经氨酸酶抑制剂耐药位点的变异。2021-2022年嘉兴市分离的BV系流感毒株与疫苗株同源性较高,但HA蛋白关键抗原存在数个位点变异,可能导致流感病毒发生抗原漂移等改变,因此应加强对病毒变异的持续监测,为疫苗株更新、流感防控及临床诊疗措施的制定提供参考。展开更多
文摘目的分析2021年5月济宁市一起学校聚集感染乙型流感病毒(Influenza B virus,FluB)Victoria系(BV系)聚集疫情的流行病学特点和全基因组特征,为疫情防控提供参考依据。方法对病例进行现场流行病学调查,采集咽拭子样本进行病毒核酸检测和细胞培养,对培养毒株进行全基因组测序,利用生物信息学软件分析进化变异特征。结果本次学校流感聚集疫情报告病例29例,班级罹患率为69.05%(29/42);核酸检测BV系阳性率为77.78%(14/18),培养毒株9株。同疫苗株B/Washington/02/2019相比,9株毒株8个节段核苷酸相似性为98.33%~99.74%。9株毒株HA基因序列在进化树上属于1A分支。血凝素抗原决定簇3个氨基酸发生置换,神经氨酸酶抑制剂耐药位点和酸性聚合酶抑制剂耐药位点均未发生变异。HA丢失位于抗原决定簇的N197糖基化位点,NS1丢失N107糖基化位点。多个蛋白的磷酸化位点发生改变。结论引起本次学校聚集疫情的病原体是BV系,应加强对学校流感样病例聚集疫情监测。
文摘本研究分析了嘉兴市2021-2022年乙型流感病毒基因进化特征。首先采集2021-2022年嘉兴市流感样病例咽拭子标本进行流感病毒核酸检测、病毒分离。然后从嘉兴市2021-2022年流感分离株中共选取27株乙型流感病毒代表毒株进行全基因组高通量测序。最后利用生物信息学软件从核苷酸、氨基酸及分子层面对流感毒株进行分子特征分析。2021年嘉兴市共检测1362例流感样病例标本,阳性标本数98例,阳性率为7.20%,均为乙型流感病毒Victoria系(Influenza B virus Lineage Victoria,BV)。2022年嘉兴市共检测1318例流感样病例标本,阳性标本数335例,其中BV系89例,阳性率为6.75%,H3N2亚型246例,阳性率为18.66%。与疫苗株相比,2021年血凝素(haemagglutinin,HA)核苷酸与氨基酸序列相似性为98.92%±0.24%、98.55%±0.21%,神经氨酸酶(neuraminidase,NA)核苷酸与氨基酸序列相似性为99.25%±0.13%、99.37%±0.22%;2022年HA核苷酸与氨基酸序列相似性为99.12%±0.08%、99.64%±0.16%,NA核苷酸与氨基酸序列相似性为98.16±0.25%、98.1±0.19%。2021年嘉兴市分离的BV系流感病毒归属于V1A.3a.1和V1A.3a.2分支,2022年分离的BV系病毒归属于V1A.3a.2分支,V1A.3a.2为2021-2022年嘉兴市优势毒株。在2021年流感毒株中发现一株HA/NA系内重组株B/Zhejiang-Nanhu/1921/2021。与流感疫苗株相比,嘉兴市分离株在HA蛋白的120环、150环、160环及190螺旋等关键的抗原决定簇部位发生H137N、H137Q、A137T、R148G、P159L、N165K、A172T、G196E、R133K、H137K、R156G等多个氨基酸位点改变,而在NA蛋白上未发现神经氨酸酶抑制剂耐药位点的变异。2021-2022年嘉兴市分离的BV系流感毒株与疫苗株同源性较高,但HA蛋白关键抗原存在数个位点变异,可能导致流感病毒发生抗原漂移等改变,因此应加强对病毒变异的持续监测,为疫苗株更新、流感防控及临床诊疗措施的制定提供参考。
