2006～2007年深圳市Victoria系B型流感病毒HA1基因特性的分析

目的：了解2006-2007年深圳市Victoria系B型流感病毒流行情况及HA1基因特性。方法：用狗肾传代细胞（MDCK）和鸡胚进行流感病毒分离,将分离到的Victoria系B型流感毒株进行血凝素HA片段核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,用SIMMONIC软件和Mega软件对其进行分析。结果：2006-2007年深圳分离培养到的Victoria系流感毒株与同时段的疫苗株B/Malaysia/2506/04、国内代表株B/Shenzhen/155/05的核苷酸同源性极高,没有发生较大的变异;2006-2007年深圳所有的Victoria系株均在134号位点上发生了Ser到Pro的替换。除此之外,还存在个别的氨基酸点变异,部分的变异位点处在HA1区的抗原表位,会导致病毒的抗原性改变。结论：本研究未发现2007年深圳流行的Vic-toria系B型流感毒株与2006年的流行株在HA1片段有明显的氨基酸变异。

2019—2022年铜陵市B型Victoria系流感病毒HA和NA基因进化特征分析

目的分析2019—2022监测年度铜陵市B型Victoria系流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)的遗传进化特征。方法选取2019—2022年度本实验室分离的22株B型Victoria系流感病毒进行全基因组测序,利用生物信息分析软件进行序列对比和系统进化分析。结果2019—2022年铜陵市季节性流感主要以B型Victoria系流感为主,归属于V1A.3分支,其中2021—2022年分离的14株归属V1A.3a.2分支。与疫苗株相比,22株B型Victoria系流感的HA与NA蛋白均出现多个氨基酸变异位点,HA蛋白的四个主要抗原表位(120环、150环、160和190螺旋)均有变异,NA蛋白耐药位点未检测出变异,HA蛋白197 NETQ糖基化位点也发生改变。结论2019—2022年铜陵市B型Victoria系流感病毒的HA蛋白的氨基酸位点部分发生了变异现象,这可能导致抗原表位的漂移变化,因此需要进一步加强流感病毒变异监测。

2021-2022年浙江省衢州市B/Victoria系流行性感冒病毒抗原性及基因特性分析

目的了解浙江省衢州市2021—2022年B/Victoria系流行性感冒(流感)病毒抗原性及基因进化特征,为流感防控提供科学依据。方法选取衢州市2021—2022年分离到的14株B/Victoria系流感毒株进行全基因组测序,利用生物信息学软件对其血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因进行分子进化特征分析。采用红细胞凝集抑制实验进行抗原性分析。结果10株分离株为同期疫苗株B/Washington/02/2019的类似株,后期分离的4株毒株为疫苗株B/Washington/02/2019的低反应株。同源性分析显示,分离株与下一年度(2022—2023年)疫苗株B/Austria/1359417/2021的匹配性总体高于同期疫苗株B/Washington/02/2019。基因进化分析发现,14株分离株从V1A.3a.1逐渐进化为V1A.3a.2分支,与同期疫苗株B/Washington/02/2019的遗传距离随时间逐渐加大,而与下一年度疫苗株B/Austria/1359417/2021关系渐近且最终聚集在V1A.3a.2分支上。相较于同期疫苗株B/Washington/02/2019,HA氨基酸序列共有14个变异位点,涉及3个抗原表位和1个糖基化位点(197NET);NA蛋白发生了多个氨基酸位点改变,但未发现相关耐药位点变异。结论2021—2022年衢州市B/Victoria系流感病毒处在持续进化之中,与同期疫苗株B/Washington/02/2019的匹配性降低,应继续加强对B/Victoria系流感病毒的监测研究,及时为流感疫苗株的筛选提供科学依据。

江苏省2019—2022年乙型流感病毒Victoria系HA基因特征分析

目的分析江苏省2019—2022年乙型流感病毒Victoria系流行特征,了解其基因变异情况,监测江苏省流感活动水平和流行趋势。方法通过"中国流感监测信息系统"收集的江苏省2019—2022年流感样病例监测数据,选取16株乙型流感病毒Victoria系毒株进行全基因组测序,利用MEGA 7软件构建进化树并进行HA基因序列特征分析。结果江苏省2019—2022年监测到的流感病毒中乙型流感病毒Victoria系占绝对优势。16株标本株中2019—2020年度的毒株在V1A.3早期分支,而2021—2022年度的毒株则聚类在3a.2亚型分支。与疫苗株相比,2019—2020及2020—2021年度的毒株发生了1个氨基酸位点的改变并增加了1个糖基化位点,而2021—2022年度的毒株则存在多个位点变异,其中H122Q、A127T、R133G、P144L、N150K、S194D及K200R位于抗原决定簇上。结论江苏省乙型流感病毒Victoria系在多处基因位点发生了变异,提示对该亚型变异的持续监测至关重要,可为疫苗的更新提供重要依据。

新疆兵团2021-2022年度B型Victoria系流感病毒基因组特征分析

目的检测和分析新疆兵团2021-2022监测年度B/Victoria系流感病毒基因组特征及进化情况,为流感的防控提供科学依据。方法随机选取8株B/Victoria系荧光PCR检测核酸阳性标本,使用MDCK进行病毒的分离培养并提取RNA,通过全基因组深度测序获得B/Victoria系流感病毒8个基因序列,与世界卫生组织推荐的疫苗株等进行同源性分析;构建进化树,分析病毒进化情况。结果新疆兵团2021-2022监测年度B/Victoria系流感流行株之间血凝素HA基因的核苷酸同源性99.4%~99.9%,氨基酸同源性99.8%~99.9%。神经氨酸酶NA基因与疫苗株的核苷酸同源性99.6%~99.9%,氨基酸同源性99.8%~99.9%。其余6个内源基因的核苷酸及氨基酸同源性分别在99.0%~99.9%和99.7%~99.9%之间;HA、PB2、PB1、NP、MP基因进化分析显示,8株B/Victoria系流行株与疫苗株B/Austria/1359417/2021亲缘关系较近;NA、NS、PA基因进化树分析显示,8株B/Victoria系流行株与疫苗株B/Washington/02/2019亲缘关系较近。结论新疆兵团2021-2022监测年度B/Victoria系流感流行株属于V1A.3分支,与2022-2023年WHO推荐疫苗株B/Austria/1359417/2021亲缘关系较近,但仍然存在关键抗原表位漂变情况,而NA的氨基酸突变并未影响毒株的耐药性。

2021年—2022年宁夏Victoria系乙型流感病毒基因特性分析

目的了解2021年—2022年宁夏Victoria系乙型流感病毒基因变异情况,为宁夏流感防控提供参考依据。方法采集流感样病例标本进行核酸检测和病毒分离,对30株Victoria系乙型流感毒株的HA和NA片段进行基因测序,利用生物信息学软件分析进化变异特征。结果30株宁夏Victoria系乙型流感毒株HA和NA基因在进化上与疫苗株B/Washington/02/2019(2020—2022)亲缘关系较近,属于V1A.3分支。HA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.5%~99.0%和98.0%~98.6%;NA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.0%~99.4%和98.9%~99.6%。与疫苗株B/Washington/02/2019相比,多数毒株在HA区有H122Q、A127T、R133G、G141R、P144L、N150K、G184E、N197D、K203R和R279K突变,涉及3个抗原表位,并在受体结合位点140-loop、190-helix及240-loop处存在突变位点。所有毒株均未发生耐药位点变异。结论2021年—2022年宁夏Victoria系乙型流感病毒与本年度疫苗株亲缘关系较近,但其HA蛋白的重要氨基酸位点发生多处变异,可能导致流感病毒发生抗原性漂移,减弱疫苗的保护作用。

2021-2022监测年度枣庄市乙型流感病毒Victoria系全基因组测序分析

为了解山东省枣庄市2021-2022监测年度乙型流感病毒Victoria系的流行情况,分析病毒全基因组遗传特征,了解病毒进化变异特点,分析与疫苗株的相似程度,为流感的防控提供参考依据。从枣庄市流感监测网络实验室分离的流感毒株中随机选取10株B/Victoria系毒株,以WHO推荐的B/Victoria流感疫苗株B/Washington/02/2019(2020-2022北半球疫苗代表株)为参考进行全基因序列测定,利用生物信息学软件构建进化树,并分析分子进化特征。2021年4月-2022年3月,枣庄市流感病毒监测阳性率为17.03%(202/1186),均为B/Victoria系流感。将枣庄市分离的10株B/Victoria系毒株序列与北半球疫苗代表株B/Washington/02/2019相比血凝素(Hemagglutinin,HA)基因核苷酸同源性为99.5%~100%,HA基因氨基酸同源性为99.7%~100%;HA进化树分析中,该10株B/Victoria系毒株与疫苗代表株B/Washington/02/2019同属于1A分支;但发现已有5处抗原表位突变,均发生在120-loop区122位、133位,150-loop区144位、150位,190-loop区197位;神经氨酸酶(NA)未发现关键氨基酸位点变异。NA抑制剂耐药位点均未发生变异,奥司他韦等药物治疗流感敏感。枣庄市2021-2022监测年度流行的流感病毒均为乙型Victoria系,与疫苗推荐株相比HA发生了抗原漂移,提示B/Victoria系疫苗株与本地区流行株的匹配度有所降低。枣庄地区流行的乙型流感病毒对药物奥司他韦和扎那米韦依然敏感。今后继续开展流感病毒分子进化特征监测是重要的,有利于了解乙型流感流行风险,以及对流感疫苗和治疗药物效果的影响。

2018-2019年河北省流感流行特征及乙型流感病毒Victoria系血凝素基因特征分析

目的了解2018-2019年河北省流感流行特征,分析乙型流感病毒Victoria(BV)系毒株血凝素(HA)基因特征和变异情况。方法于2018年4月至2019年3月,在河北省28所国家级哨点医院采集发热3 d内的流感样病例(ILI)咽拭子标本,同时通过"中国流感监测信息系统"收集2018-2019年河北省ILI的监测数据。对ILI的咽拭子标本进行核酸检测、病毒分离,并选取不同地区的14株BV毒株进行HA基因测序,利用DNASTAR 7.0和Mega-X软件分析HA基因序列特征并构建进化树。结果 2018-2019年,河北省28所国家级流感监测哨点医院共监测门、急诊病例总数为4 689 103例,ILI例数为 99 266例(2.12%);共检测ILI样本18 730份,流感病毒核酸阳性2 752份(14.69%),检出高峰在2019年第3周(44.92%),流行前期以甲型H1N1为主,流行后期以BV为主。HA基因序列分析显示14株BV病毒均属于162-164位氨基酸缺失株,氨基酸同源性为97.16%~100%,与疫苗株B/Colorado/06/2017相比氨基酸同源性为97.16%~98.95%,涉及11个氨基酸位点突变。结论 2018-2019年河北省流感冬、春季流行,BV流行毒株有多个抗原位点发生了变异,可能是引起暴发疫情的原因。

2020-2021年广西Victoria系乙型流感病毒的抗原性及基因特性分析

目的 了解广西壮族自治区(广西)2020—2021年度B/Victoria(Bv)系流感病毒的抗原性及基因特征。方法 选取广西2020—2021年分离的36株Bv系流感毒株进行全基因组测序,并对血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进行序列拼接和基因特性分析。同时采用血凝抑制实验进行抗原性分析。结果 2020—2021年广西分离的Bv系流感病毒与WHO推荐的疫苗株B/Washington/02/2019相比,HA和NA基因的核苷酸同源性分别为99.1%~100.0%和99.1%~99.9%。系统进化树分析发现这36株Bv系流感毒株均属于1A(?3)B分支,与疫苗株属于同一分支,但广西毒株又进一步分为两个小分支。抗原性分析显示这两个小分支没有明显差异,均为疫苗株的类似株。氨基酸变异位点分析发现,HA蛋白携带R133G、N150K、N197D的氨基酸突变,变异涉及3个抗原决定簇。NA蛋白的酶活位点和神经氨酸酶抑制剂耐药位点均未发生突变。结论 2020—2021年度广西流行的Bv系流感病毒与WHO推荐的北半球疫苗株的组分匹配但存在持续变异,需要密切监测流行株的变异情况。

Victoria系乙型流感病毒HA1基因变异特征分析

目的阐明2012年邯郸市分离的Victoria系乙型流感毒株HA1抗原性和基因变异特征。方法对2012-2013年分离的流感病毒采用RT-PCR方法特异性扩增HA1基因,扩增产物进行核苷酸序列测定,用DNAStar中Megalign软件进行比对分析,构建系统进化树。结果邯郸市2012年分离的Victoria系乙型流感病毒与WHO推荐的2009-2012年北半球代表株相比,核苷酸同源性为98.1%-99.2%,氨基酸同源性为98.2%-99.4%。HA1区未发生氨基酸丢失和插入,与B/Brisbane/60/2008相比2个位点氨基酸替换具有共性（146I〉V和197D〉N）,而这2个位点与2006-2008年疫苗株B/Malaysia/2506/04相同。与B/Brisbane/60/2008相比7个毒株中有2个毒株发生了另外4个位点（58L〉P、129N〉S、171N〉D和174G〉E）的替换。结论 2012年邯郸市分离的Victoria系乙型流感病毒血凝素蛋白未发生明显的抗原性改变,与WHO推荐的2011-2012年的流感疫苗株B/Brisbane/60/2008匹配,不属于Victoria系乙型流感病毒新变种。

北京市门头沟区2015—2016年Victoria系乙型流感病毒HA1基因特征分析

目的 了解北京市门头沟区2015—2016年分离的Victoria系乙型流感病毒血凝素HA1基因变异特征,分析流行株与我国疫苗株的匹配情况,为乙型流感防控提供依据.方法 对狗肾传代细胞（MDCK）培养分离得到的14株Victoria系乙型流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,采用邻接法进行遗传进化树分析.结果 2015—2016年北京市门头沟区流行的乙型流感病毒以Victoria系为主.分离并测序的14株Victoria系乙型流感病毒HA1基因与WHO推荐的2016—2017年流感疫苗株B/Brisbane/60/2008（FJ766842）和国内代表株B/JilinNanguan/1223/2016（EPI768805）亲缘性更近.与B/Brisbane/60/2008和B/JilinNanguan/1223/2016（EPI768805）的HA1区的氨基酸相比,所有毒株都在2个位点发生氨基酸替换,个别毒株也会在其他个别位点发生点突变,变异涉及1个抗原决定簇.而与WHO推荐的2015—2016年Yamagata系疫苗株B/Phuket/3073/2013（EPI608074）亲缘关系稍远一些.结论 在2015—2016年流感监测季中,北京市门头沟区乙型流感病毒以Victoria系为优势流行株.而WHO推荐的乙型流感疫苗株为Yamagata系,可见疫苗株与本区流行株匹配性不佳.

2018-2020年上海市B/Victoria系流感病毒的流行特征及基因特性分析

目的分析2018—2020年上海市分离的B/Victoria系流感毒株与疫苗株的匹配性及基因变异情况。方法利用血凝抑制实验,对142株B/Victoria系流感毒株进行了抗原性分析,并选取了63株开展了血凝素(HA)及神经氨酸酶(NA)基因序列分析。结果2018—2020年上海市流行的B/Victoria系流感毒株主要属于V1A.3分支,少数属于V1A.1分支及未缺失的V1A分支;抗原性分析显示,26.76%的流行株是疫苗株B/Colorado/06/2017鸡胚株的低反应株,与疫苗株相比,V1A.3分支流行株在HA蛋白的120环、150环、160环及190螺旋等关键的抗原决定簇及受体结合关键部位发生了5个氨基酸位点改变。结论2018—2020监测年度B/Victoria系流行株与世界卫生组织推荐的疫苗株组分B/Colorado/06/2017匹配性不佳,仍需密切监测流行株的谱系及变异情况,为疫苗株的筛选提供可靠的数据。

陕西省2016-2021监测年度B/Victoria系流感病毒流行和进化分析

本文通过分析陕西省2016-2021监测年度B/Victoria系流感病毒的流行趋势及进化特征,为流感防控工作提供数据支撑。随机选取25株2016-2021监测年度分离出的B/Victoria系病毒株,通过全基因组深度测序方法获得血凝素(Hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)基因序列,与世界卫生组织(WHO)推荐的同期北半球疫苗株进行同源性分析,构建系统进化树,分析病毒变异情况。陕西省2016-2021监测年度B/Victoria系流感呈季节性持续传播,流行高峰集中在冬春季。同源性分析表明2016-2018监测年度流行株与同期疫苗株匹配性总体较好(HA基因氨基酸同源性99.3%~99.6%),2018-2021监测年度流行株与同期疫苗株匹配性降低(HA基因氨基酸同源性98.5%~98.8%)。进化特征表现为单一谱系内的抗原漂移,不同监测年度流行株均属于V1A大分支,亲缘关系随时间的推移逐渐变远,在V1A大分支内依次进化为V1A.1、V1A.2和V1A.3三个分支,毒株的变异位点逐渐增多,在HA抗原表位120-loop、150-loop、160-loop、190-helix和受体结合位点240-loop处均存在突变位点,抗原出现漂移现象,其中120-loop上的突变位点尤为突出。NA氨基酸突变位点较少,流行株仍对神经氨酸酶抑制剂敏感。今后的防控工作应继续加强陕西省B/Victoria系流感监测,密切关注病毒的变异情况,及时发现新的变异株,为疫情防控提供科学依据。

2019-2020年海南省乙型流感病毒Victoria系血凝素抗原性及其基因特性分析

目的了解海南省2019-2020监测年度乙型流感病毒Victoria系(BV)血凝素(hemagglutinin,HA)抗原性及其基因特征。方法按照时间不同从海南省5家流感监测网络实验室分离的流感毒株中选取14株BV系毒株,以WHO推荐的BV流感疫苗株B/Colorado/06/2017(2018-2020)为参考进行抗原性分析;对所有分离株进行一代全基因序列测定,应用生物信息学软件分析HA基因系统进化特征。结果与疫苗株相比,57.14%(8/14)的流感病毒分离株为类似株,42.86%(6/14)为低反应株;14株乙型流感病毒BV系分离株HA基因在进化上与疫苗株B/Colorado/06/2017亲缘关系较近,共同归属于1A分支,其中12株分离株聚为一支,以162-164位三缺失为分支特征。核苷酸和氨基酸同源性范围分别是98.6%~98.9%和98.3%~98.8%;14株BV流感分离株HA共有9个位点发生氨基酸变异:G129D、G133R、K136E、N197S、T199I、A202V以及162-164位缺失,涉及3个抗原表位。结论2019-2020监测年度海南省流行的乙型流感病毒分离株HA基因与疫苗株亲缘关系较近,但因HA氨基酸位点发生多处变异可能导致疫苗保护效果不佳。因此,需继续加强对流感流行情况和毒株型别及突变的监测。

济宁市一起学校聚集感染乙型流感病毒Victoria系全基因组测序分析

目的分析2021年5月济宁市一起学校聚集感染乙型流感病毒(Influenza B virus,FluB)Victoria系(BV系)聚集疫情的流行病学特点和全基因组特征,为疫情防控提供参考依据。方法对病例进行现场流行病学调查,采集咽拭子样本进行病毒核酸检测和细胞培养,对培养毒株进行全基因组测序,利用生物信息学软件分析进化变异特征。结果本次学校流感聚集疫情报告病例29例,班级罹患率为69.05%(29/42);核酸检测BV系阳性率为77.78%(14/18),培养毒株9株。同疫苗株B/Washington/02/2019相比,9株毒株8个节段核苷酸相似性为98.33%~99.74%。9株毒株HA基因序列在进化树上属于1A分支。血凝素抗原决定簇3个氨基酸发生置换,神经氨酸酶抑制剂耐药位点和酸性聚合酶抑制剂耐药位点均未发生变异。HA丢失位于抗原决定簇的N197糖基化位点,NS1丢失N107糖基化位点。多个蛋白的磷酸化位点发生改变。结论引起本次学校聚集疫情的病原体是BV系,应加强对学校流感样病例聚集疫情监测。

2016-2021年湖北省乙型Victoria系流感病毒流行病学特征及基因进化分析

目的分析湖北省2016—2021年度乙型流感流行状况及病毒基因进化特征。方法根据湖北省2016—2021年度的流感样病例报告数据和病原学监测数据进行流行病学分析并选取2016—2021年度主要流行的乙型流感毒株69株进行全基因组测序,利用生物信息学软件分析进化变异特征。结果2016—2021年湖北省乙型Victoria系流感毒株小部分分布在Victoria1A分支,而大部分毒株主要集中分布在以162~164氨基酸位点缺失为特征的Victoria 1A.3分支上。与参考株相比,流行株在HA蛋白的120环、150环、160环及190螺旋等关键的抗原决定簇部位发生了多个氨基酸位点改变,而在NA蛋白上未发现神经氨酸酶抑制剂耐药位点的变异。本次研究仅发现1株系内重配株。结论2016—2021年中湖北省乙型流感多为季节性流行,Victoria系流行毒株在多个抗原位点上发生变异,但未检测到耐药位点突变,因此需要进一步密切加强流感流行活动的监测。

珠海市2007-2008年乙型流感病毒基因特性分析

目的了解珠海市近两年乙型流感病毒的基因变异情况。方法采集珠海市流感样病例样本进行流感病毒的分离和鉴定,并对分离到的乙型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定,用Mega、DNA Star、GeneDoc软件对测序结果进行分析处理,并与WHO推荐的疫苗株基因序列进行比对。结果 2007-2008年分离的乙型流感毒株分属于Yamagata系和Victoria系两个谱系,谱系内毒株间距离很近。Yamagata系毒株与B/Brisbane/3/2007的核苷酸同源性极高,在99.4%~99.7%之间;Victoria系乙型流感病毒株与B/Malasia/2506/2004的核苷酸同源性亦很高,在98.6%~99.1%之间。与疫苗株和其它流行株相比,本次分离的两个谱系毒株均未发现核苷酸的丢失和插入,但均增加一个潜在的糖基化位点。结论珠海市人群交替流行着Yamagata系和Victoria系两个抗原性不同的进化系的乙型流感病毒,病毒的基因发生了变异。2007-2008两年WHO推荐的乙型流感疫苗株与我地区当年流行株为不同谱系毒株,预防保护效果不好。

浙江省乙型流感病毒HA_1基因分析

目的：了解浙江省近几年乙型流感病毒的基因变异情况和WHO推荐流感疫苗株对浙江省人体的保护情况。方法：采集浙江省类流感样本进行流感病毒的分离和鉴定，并对分离到的乙型流感病毒进行核酸的提取，采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定，用DNAMAN和BioEdit生物软件对测序结果进行分析处理，并与WHO推荐疫苗株基因进行比对。结果：分离到Yamagata系和Victoria系两个进化系的乙型流感病毒，两系毒株均未发现核苷酸的丢失和插入，糖基化位点没有太大改变。毒株之间核苷酸的同源性为95.25%，氨基酸的同源性为95.28%。Yamagata系毒株HA1区域核苷酸序列长度为1038 bp，推导的氨基酸序列长度为346个，氨基酸变异替换数在6-8之间；Victoria系毒株HA1区域的核苷酸序列长度为1041 bp，推导的氨基酸序列长度为347个，氨基酸变异替换数在2-8之间，相比Yamagata系毒株在163位上都多1个天冬酰胺（N）。基因进化树上可见明显的Yamagata系和Victoria系两个分支。结论：浙江省人群交替流行着Yamagata系和Victoria系两个抗原性不同的进化系的乙型流感病毒，病毒的基因发生了变异，抗原已发生漂移。2001、2006两年WHO推荐乙型流感疫苗株与我省当年流行株为不同谱系毒株，预防保护效果不够理想，其余年份为同一谱系毒株，预防保护效果较好。

2021-2022年嘉兴市乙型流感病毒序列进化分析

本研究分析了嘉兴市2021-2022年乙型流感病毒基因进化特征。首先采集2021-2022年嘉兴市流感样病例咽拭子标本进行流感病毒核酸检测、病毒分离。然后从嘉兴市2021-2022年流感分离株中共选取27株乙型流感病毒代表毒株进行全基因组高通量测序。最后利用生物信息学软件从核苷酸、氨基酸及分子层面对流感毒株进行分子特征分析。2021年嘉兴市共检测1362例流感样病例标本,阳性标本数98例,阳性率为7.20%,均为乙型流感病毒Victoria系(Influenza B virus Lineage Victoria,BV)。2022年嘉兴市共检测1318例流感样病例标本,阳性标本数335例,其中BV系89例,阳性率为6.75%,H3N2亚型246例,阳性率为18.66%。与疫苗株相比,2021年血凝素(haemagglutinin,HA)核苷酸与氨基酸序列相似性为98.92%±0.24%、98.55%±0.21%,神经氨酸酶(neuraminidase,NA)核苷酸与氨基酸序列相似性为99.25%±0.13%、99.37%±0.22%;2022年HA核苷酸与氨基酸序列相似性为99.12%±0.08%、99.64%±0.16%,NA核苷酸与氨基酸序列相似性为98.16±0.25%、98.1±0.19%。2021年嘉兴市分离的BV系流感病毒归属于V1A.3a.1和V1A.3a.2分支,2022年分离的BV系病毒归属于V1A.3a.2分支,V1A.3a.2为2021-2022年嘉兴市优势毒株。在2021年流感毒株中发现一株HA/NA系内重组株B/Zhejiang-Nanhu/1921/2021。与流感疫苗株相比,嘉兴市分离株在HA蛋白的120环、150环、160环及190螺旋等关键的抗原决定簇部位发生H137N、H137Q、A137T、R148G、P159L、N165K、A172T、G196E、R133K、H137K、R156G等多个氨基酸位点改变,而在NA蛋白上未发现神经氨酸酶抑制剂耐药位点的变异。2021-2022年嘉兴市分离的BV系流感毒株与疫苗株同源性较高,但HA蛋白关键抗原存在数个位点变异,可能导致流感病毒发生抗原漂移等改变,因此应加强对病毒变异的持续监测,为疫苗株更新、流感防控及临床诊疗措施的制定提供参考。

2015-2017年盐城市乙型流感病毒HA1、NA基因分子特征

目的对盐城市2015-2017年流行的乙型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因进行分子进化特征研究。方法将盐城市2015-2017年流感监测哨点医院以及流感暴发点采集的流感样病例咽拭子标本进行核酸、病毒分离检测定型,对选取的18株乙型流感病毒分离株采用一步法RT-PCR方法扩增其HA1基因和NA基因,扩增产物经纯化测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸以及分子进化层面对毒株进行分子特征分析。结果盐城市2015-2017年分离的乙型流感病毒HA1基因和NA基因聚类的分支关系基本一致,2015年Yamagata系毒株位于Yamagata Clade 3分支,属Phuket/3073类毒株;2016-2017年Victoria系毒株分布于Victoria Clade 1A分支,属Brisbane/60类毒株。Yamagata系所有毒株在190-helix抗原表位均发生了D196N位点的变异;Victoria系毒株共涉及2个抗原表位,120-loop抗原表位的117、129位点,190-helix抗原表位的197、199位点。盐城株未发生系内、系间重配。18株分离株未发生NA蛋白酶活性位点以及耐药位点的变化。结论 2015年Yamagata系毒株与疫苗株B/Phuket/3073/2013匹配性较好。2016-2017年Victoria系毒株HA1和NA抗原基因变异位点在积累,这些变异位点的积累很可能会导致流感病毒发生实质性的抗原性的漂移,降低与流感疫苗株的匹配度,减弱流感疫苗的保护作用。