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绿豆bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析
被引量:
15
1
作者
陈红霖
胡亮亮
+2 位作者
王丽侠
王素华
程须珍
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1159-1167,共9页
bHLH是真核生物中重要的一类转录因子,其主要由碱性氨基酸区和螺旋-环-螺旋区组成。本研究利用生物信息学的方法鉴定到122个绿豆bHLH转录因子,并对其理化性质、保守结构域、基因结构、在染色体上的分布、系统进化以及部分典型基因的组...
bHLH是真核生物中重要的一类转录因子,其主要由碱性氨基酸区和螺旋-环-螺旋区组成。本研究利用生物信息学的方法鉴定到122个绿豆bHLH转录因子,并对其理化性质、保守结构域、基因结构、在染色体上的分布、系统进化以及部分典型基因的组织表达差异等进行分析。结果表明,bHLH转录因子理化性质差异较大;含有2个保守结构域,分别位于N端的碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区,碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件;bHLH基因在11条染色体上分布不均匀,5号、7号和8号染色体上分布较多,1号、4号和10号染色体上分布较少,大部分基因含有1~9个不等的内含子,在染色体上成簇状分布;122个bHLH转录因子可分为11个亚家族。多数bHLH基因在绿豆根、茎、叶、花和种子等组织中均有表达,但具有组织表达特异性,且不同基因表达量差异较大。本研究为进一步研究绿豆bHLH转录因子家族的生物学功能奠定基础。
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关键词
绿豆
BH
l
H
转录因子
生物信息学分析
下载PDF
职称材料
基于GGE双标图的绿豆品种郑绿20号的丰产稳定性分析
2
作者
王保勤
李君霞
+1 位作者
周秋峰
黄长志
《湖北农业科学》
2024年第7期6-12,共7页
郑绿20号在2019年河南省绿豆[Vigna radiate(L.)R. Wilczek]新品种鉴定试验中,田间性状表现优良、抗性好、产量高,4个参试点均比对照郑绿8号增产。为了进一步考察郑绿20号的丰产稳产性,采用GGE双标图分析2019年河南省绿豆新品种鉴定试...
郑绿20号在2019年河南省绿豆[Vigna radiate(L.)R. Wilczek]新品种鉴定试验中,田间性状表现优良、抗性好、产量高,4个参试点均比对照郑绿8号增产。为了进一步考察郑绿20号的丰产稳产性,采用GGE双标图分析2019年河南省绿豆新品种鉴定试验参试品种的农艺及产量性状,并对绿豆品种9个性状进行变异性和相关性分析。结果表明,郑绿20号的主茎分枝数、单株荚数、株高、主茎节数变异系数在试验点中变异程度较大;主茎节数与生育期呈显著正相关,与产量呈显著负相关,与株高呈正相关;产量与主茎分枝数、单株荚数、荚长、荚粒数呈正相关。丰产稳定性分析结果表明,郑绿20号为适宜推广的兼具丰产性和稳定性的绿豆新品种。
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关键词
绿豆[
vigna
radiate
(
l
.)
r.wilczek
]
郑绿20号
相关性
GGE双标图
丰产性
稳产性
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职称材料
绿豆种质资源苗期耐盐性鉴定及耐盐种质筛选
被引量:
31
3
作者
胡亮亮
王素华
+2 位作者
王丽侠
程须珍
陈红霖
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期367-379,共13页
土壤盐渍化已成为影响中国农业生产的重要问题,筛选耐盐绿豆种质资源对于盐渍化土地利用具有重要意义。本研究对346份国内外绿豆种质苗期用150 mmol L–1 NaCl进行胁迫处理,测定了株高、地上部鲜重、根鲜重、地上部干重、根干重、根长...
土壤盐渍化已成为影响中国农业生产的重要问题,筛选耐盐绿豆种质资源对于盐渍化土地利用具有重要意义。本研究对346份国内外绿豆种质苗期用150 mmol L–1 NaCl进行胁迫处理,测定了株高、地上部鲜重、根鲜重、地上部干重、根干重、根长、根体积等12个指标,采用主成分分析和隶属函数分析、耐盐性综合评价分析及聚类分析对各样本的耐盐性进行了综合评价和归类,并采用逐步回归分析建立了耐盐性预测回归方程。结果表明,处理组与对照组各性状评价指标存在极显著差异,且12个指标的耐盐系数间均存在着不同程度的相关性。结合盐害症状等级划分与耐盐性综合评价结果,筛选到苗期高耐盐(1级)绿豆26份,耐盐(3级)绿豆65份,对盐分敏感(7级)绿豆74份,对盐分极敏感(9级)绿豆18份。其中来自江西的C04125、菲律宾的C06310等10份耐盐能力最强,可作为绿豆耐盐育种的优异种质资源。地上部鲜重、根鲜重、根干重、根长、根体积和根分枝数可以作为绿豆苗期耐盐性评价指标。
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关键词
绿豆
种质资源
苗期
耐盐性
综合评价
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职称材料
题名
绿豆bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析
被引量:
15
1
作者
陈红霖
胡亮亮
王丽侠
王素华
程须珍
机构
中国农业科学院作物科学研究所
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1159-1167,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31401442)
中国农业科学院科技创新工程"杂粮特色育种材料创制和新品种培育"
国家食用豆产业技术体系建设项目(CARS-08)
文摘
bHLH是真核生物中重要的一类转录因子,其主要由碱性氨基酸区和螺旋-环-螺旋区组成。本研究利用生物信息学的方法鉴定到122个绿豆bHLH转录因子,并对其理化性质、保守结构域、基因结构、在染色体上的分布、系统进化以及部分典型基因的组织表达差异等进行分析。结果表明,bHLH转录因子理化性质差异较大;含有2个保守结构域,分别位于N端的碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区,碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件;bHLH基因在11条染色体上分布不均匀,5号、7号和8号染色体上分布较多,1号、4号和10号染色体上分布较少,大部分基因含有1~9个不等的内含子,在染色体上成簇状分布;122个bHLH转录因子可分为11个亚家族。多数bHLH基因在绿豆根、茎、叶、花和种子等组织中均有表达,但具有组织表达特异性,且不同基因表达量差异较大。本研究为进一步研究绿豆bHLH转录因子家族的生物学功能奠定基础。
关键词
绿豆
BH
l
H
转录因子
生物信息学分析
Keywords
Mung bean (
vigna
radiata (
l
. ) R. Wi
l
czek)
basic he
l
ix-
l
oop-he
l
ix
transcription factor
bioinfor- matics ana
l
ysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S522 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
基于GGE双标图的绿豆品种郑绿20号的丰产稳定性分析
2
作者
王保勤
李君霞
周秋峰
黄长志
机构
郑州市农林科学研究所
河南省农业科学院粮食作物研究所
出处
《湖北农业科学》
2024年第7期6-12,共7页
基金
河南省中央引导地方科技发展资金项目(Z20221341070)
河南省农业良种攻关项目(2022010401)
+1 种基金
河南省农业科学院科技创新团队项目(2023TD036)
河南省农业科学院优质秋粮及特色作物绿色高效发展专项(2023FZ05)。
文摘
郑绿20号在2019年河南省绿豆[Vigna radiate(L.)R. Wilczek]新品种鉴定试验中,田间性状表现优良、抗性好、产量高,4个参试点均比对照郑绿8号增产。为了进一步考察郑绿20号的丰产稳产性,采用GGE双标图分析2019年河南省绿豆新品种鉴定试验参试品种的农艺及产量性状,并对绿豆品种9个性状进行变异性和相关性分析。结果表明,郑绿20号的主茎分枝数、单株荚数、株高、主茎节数变异系数在试验点中变异程度较大;主茎节数与生育期呈显著正相关,与产量呈显著负相关,与株高呈正相关;产量与主茎分枝数、单株荚数、荚长、荚粒数呈正相关。丰产稳定性分析结果表明,郑绿20号为适宜推广的兼具丰产性和稳定性的绿豆新品种。
关键词
绿豆[
vigna
radiate
(
l
.)
r.wilczek
]
郑绿20号
相关性
GGE双标图
丰产性
稳产性
Keywords
mung bean[
vigna
radiate
(
l
.)
r.wilczek
]
Zheng
l
v No.20
corre
l
ation
GGE bip
l
ot
good productivity
stabi
l
ity
分类号
S522 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
绿豆种质资源苗期耐盐性鉴定及耐盐种质筛选
被引量:
31
3
作者
胡亮亮
王素华
王丽侠
程须珍
陈红霖
机构
中国农业科学院作物科学研究所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期367-379,共13页
基金
国家重点研发计划项目(2019YFD1000702,2019YFD1000700)
中国农业科学院科技创新工程项目,农作物种质资源保护与利用专项(2019NWB036-07)
+1 种基金
国家农作物种质资源共享服务平台(NICGR2019)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-08)资助。
文摘
土壤盐渍化已成为影响中国农业生产的重要问题,筛选耐盐绿豆种质资源对于盐渍化土地利用具有重要意义。本研究对346份国内外绿豆种质苗期用150 mmol L–1 NaCl进行胁迫处理,测定了株高、地上部鲜重、根鲜重、地上部干重、根干重、根长、根体积等12个指标,采用主成分分析和隶属函数分析、耐盐性综合评价分析及聚类分析对各样本的耐盐性进行了综合评价和归类,并采用逐步回归分析建立了耐盐性预测回归方程。结果表明,处理组与对照组各性状评价指标存在极显著差异,且12个指标的耐盐系数间均存在着不同程度的相关性。结合盐害症状等级划分与耐盐性综合评价结果,筛选到苗期高耐盐(1级)绿豆26份,耐盐(3级)绿豆65份,对盐分敏感(7级)绿豆74份,对盐分极敏感(9级)绿豆18份。其中来自江西的C04125、菲律宾的C06310等10份耐盐能力最强,可作为绿豆耐盐育种的优异种质资源。地上部鲜重、根鲜重、根干重、根长、根体积和根分枝数可以作为绿豆苗期耐盐性评价指标。
关键词
绿豆
种质资源
苗期
耐盐性
综合评价
Keywords
mungbean[
vigna
radiate
(
l
.)Wi
l
czek]
germp
l
asm resources
seeding stage
sa
l
t to
l
erance
comprehensive eva
l
uation
分类号
S522 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
绿豆bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析
陈红霖
胡亮亮
王丽侠
王素华
程须珍
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
15
下载PDF
职称材料
2
基于GGE双标图的绿豆品种郑绿20号的丰产稳定性分析
王保勤
李君霞
周秋峰
黄长志
《湖北农业科学》
2024
0
下载PDF
职称材料
3
绿豆种质资源苗期耐盐性鉴定及耐盐种质筛选
胡亮亮
王素华
王丽侠
程须珍
陈红霖
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
31
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职称材料
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