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乌菜BcVIL2基因克隆及春化响应表达分析 被引量:1
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作者 桂尚枝 刘雪晴 +7 位作者 王英 唐小燕 赵龙龙 李广 吴思文 温宏伟 汪承刚 陈国户 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第9期1843-1851,共9页
【目的】从乌菜(Brassica campestris L.)中克隆VIN3⁃LIKE 2(VIL2)基因并进行生物信息学与表达分析,为进一步研究BcVIL2基因功能奠定基础。【方法】以‘徽乌19’为试验材料,利用同源克隆等技术获得BcVIL2基因,对其序列进行蛋白分子量(MW... 【目的】从乌菜(Brassica campestris L.)中克隆VIN3⁃LIKE 2(VIL2)基因并进行生物信息学与表达分析,为进一步研究BcVIL2基因功能奠定基础。【方法】以‘徽乌19’为试验材料,利用同源克隆等技术获得BcVIL2基因,对其序列进行蛋白分子量(MW)、糖基化位点、二级结构等生物信息学分析;利用荧光定量PCR等技术分析其应答春化表达模式。【结果】BcVIL2基因ORF(Open reading fragment)全长为1296 bp,共编码431个氨基酸,属于亲水性蛋白,预测含有1个潜在的糖基化位点和59个潜在的磷酸化位点,蛋白分子量为47.91 kDa,理论等电点(pI)为8.27;其二级结构主要由α⁃螺旋与无规则卷曲组成;亚细胞定位预测其可能在细胞核中发挥作用;同源序列比对分析显示该基因与芸薹属植物VIL2基因同源性较高;亲缘进化树分析也显示该基因与白菜(B.rapa,syn.B.campestris)和芥菜(B.juncea)VIL2基因亲缘关系很近;荧光定量PCR结果表明,盛花期时BcVIL2基因在根中表达量最低,在荚中表达量最高,而叶中表达量显著低于茎和花中表达量;一月苗龄植株春化后BcVIL2基因的表达量显著低于未春化时的表达量。【结论】乌菜VIL2基因响应春化负表达,与春化反应相关基因BraA01g032910.3C、BraA05g026410.3C与BraA10g016160.3C密切相关,可能存在互作关系,本研究结果为深入分析BcVIL2基因的功能提供了良好基础。 展开更多
关键词 乌菜 vil2 春化 基因克隆 表达分析
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VIL和VIL密度在冰雹云判据中的应用 被引量:78
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作者 刁秀广 朱君鉴 +3 位作者 黄秀韶 杨传凤 刘志红 耿力 《高原气象》 CSCD 北大核心 2008年第5期1131-1139,共9页
利用2002--2005年济南CINRAD/SA雷达资料,统计分析了基于网格的对流云的垂直累积液态含水量(VIL)分布特征,同时对VIL密度(VILD)及0℃层以上的VIL值(VILH)也进行了分析,结果表明,冰雹云和非降雹对流云的VIL、VILD和VILH值有... 利用2002--2005年济南CINRAD/SA雷达资料,统计分析了基于网格的对流云的垂直累积液态含水量(VIL)分布特征,同时对VIL密度(VILD)及0℃层以上的VIL值(VILH)也进行了分析,结果表明,冰雹云和非降雹对流云的VIL、VILD和VILH值有明显差异。降雹单体特别是强降雹单体在成熟前期有明显的VIL跃增现象,强降雹单体的VIL跃增量达15.4kg·m^-2。冰雹云的最大VIL、VILD和VILH平均值比非降雹对流云的最大平均值分别高出20kg·m^-2、1.7g·m^-3。和16kg·m^-2。不同月份的VIL、VILD、VILH阈值对冰雹特别是大冰雹的识别具有很好的指示意义。基本上是在VIL达到最大值后开始降雹,5~7月3个月降雹单体的降雹时间分别滞后于VIL跃增后的体扫时间约4.8、11.4和12.3min。 展开更多
关键词 垂直累积液态水含量(vil) vil分布特点 跃增
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VIL产品在广西冰雹云识别和人工防雹中的应用 被引量:22
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作者 张正国 汤达章 +1 位作者 邹光源 刘丽君 《热带地理》 北大核心 2012年第1期50-53,93,共5页
利用广西2009―2010年3―5月降雹样本资料和新一代天气雷达垂直累积液态含水量(VIL)产品,统计分析广西冰雹云VIL变化特征,结果显示:广西冰雹云的VIL整体呈现明显的阶段性变化特征,识别指标为VIL≥43kg/m2,降雹前VIL出现明显的跃增,一个... 利用广西2009―2010年3―5月降雹样本资料和新一代天气雷达垂直累积液态含水量(VIL)产品,统计分析广西冰雹云VIL变化特征,结果显示:广西冰雹云的VIL整体呈现明显的阶段性变化特征,识别指标为VIL≥43kg/m2,降雹前VIL出现明显的跃增,一个体扫时间VIL跃增值≥5kg/m2。冰雹云VIL值越大则产生的降雹直径也可能越大,VIL产品在人工防雹作业冰雹云识别、作业时机、作业用弹量等方面均有较好的指导作用。 展开更多
关键词 垂直累计液态含水量(vil) 冰雹云 vil变化特征 人工防雹 广西
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使用VIL选择人工增雨作业区域 被引量:17
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作者 李薇 李永振 汤达章 《气象科学》 CSCD 北大核心 2006年第4期432-435,共4页
本文利用长春多普勒雷达资料,分析了层状云降水整体VIL及0℃层上、下VIL的分布特点,指出VIL较雷达强度回波更适用于人工增雨作业区域的选择,0℃层上部VIL对北方人工增雨作业区域的选择更具指导意义。
关键词 多普勒雷达物理量产品vil 层状云降水vil分布特点 人工增雨
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冰雹云和雷雨云单体VIL演变特征对比分析 被引量:44
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作者 刘治国 陶健红 +2 位作者 杨建才 傅朝 梁海河 《高原气象》 CSCD 北大核心 2008年第6期1363-1374,共12页
以3D—Barnes方案插值的兰州站新一代天气雷达反射率因子等高平面资料,用垂直累积液态含水量(Vertically Integrated Liquid Water Content,简称:VIL)的理论模式计算单体VIL、用MAX函数逐次提取最大VIL(简称:VILmax),采用统计... 以3D—Barnes方案插值的兰州站新一代天气雷达反射率因子等高平面资料,用垂直累积液态含水量(Vertically Integrated Liquid Water Content,简称:VIL)的理论模式计算单体VIL、用MAX函数逐次提取最大VIL(简称:VILmax),采用统计和分段函数处理技术,对20042005年5~8月青藏高原东北侧的32个强对流云单体VILmax的演变特征及其在冰雹云识别中的应用进行了分析。结果表明:(1)强对流云单体VILmax在演变过程中均是先增加,后减少,在时间序列曲线中表现为单峰型特征,其中冰雹云单体VILmax存在“爆发式增长及突然降低”现象,这是区别雷雨云单体的一个重要特征;(2)冰雹云单体首次降雹前4个资料时间间隔内VILmax将出现两次“爆发式增长”现象,第一次爆发式增长时不会降雹,维持1~2个资料时间间隔后第二次出现时开始降雹;同一单体再次降雹前没有第一次“爆发式增长”现象,出现“突然降低”现象时降雹均停止;(3)VILmax变化率(简称:GVILmax)的“正(负)峰”现象与冰雹云单体VILmax的“爆发式增长及突然降低”现象对应的时间完全吻合,利用GVILmax建立的冰雹云识别流程在实际业务中具有较高的使用价值。 展开更多
关键词 强对流云单体 vil变化特征 冰雹云识别
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VIL中心区自动识别、跟踪和临近预报 被引量:19
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作者 梁明珠 胡志群 +2 位作者 夏文梅 汤达章 马玉岩 《南京气象学院学报》 CSCD 北大核心 2005年第2期205-212,共8页
利用多普勒天气雷达体扫数据资料计算垂直累积液态含水量(VIL),用逐步增大初始阈值法识别VIL中心区;利用动态预测面积比法、分类跟踪法以及中心区面积守恒原则相结合的方法对中心区进行跟踪;运用线性最小二乘法、线性集成法和线性外推... 利用多普勒天气雷达体扫数据资料计算垂直累积液态含水量(VIL),用逐步增大初始阈值法识别VIL中心区;利用动态预测面积比法、分类跟踪法以及中心区面积守恒原则相结合的方法对中心区进行跟踪;运用线性最小二乘法、线性集成法和线性外推法对中心区的重心位置进行临近预报。实例结果表明:所使用的方法能很好地识别、跟踪和预报VIL中心区。 展开更多
关键词 vil中心区 识别 跟踪 临近预报
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陇东南地区强降水过程与雷达VIL产品的定量关系研究 被引量:10
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作者 赵文 张强 赵建华 《高原气象》 CSCD 北大核心 2016年第2期528-537,共10页
利用天水市新一代天气雷达资料和天水、平凉地区的小时降水资料,探讨VIL(垂直累积液态含水量)滑动平均值以及VIL的移动与陇东南地区不同类型强降水之间的定量关系。结果表明:(1)1 h降水量对VIL有一定的滞后相关(滞后响应):非对... 利用天水市新一代天气雷达资料和天水、平凉地区的小时降水资料,探讨VIL(垂直累积液态含水量)滑动平均值以及VIL的移动与陇东南地区不同类型强降水之间的定量关系。结果表明:(1)1 h降水量对VIL有一定的滞后相关(滞后响应):非对流性降水中,降水与VIL基本同步,对流性降水中降水滞后VIL15~25 min,混合性降水中降水滞后VIL15~20 min。(2)连续非零VIL序列靠近某地可以作为预报指标,对非对流性降水和混合性降水,连续非零VIL序列靠近与产生1~2 mm以上小时降水密切相关;对流性降水中,连续非零VIL序列靠近意味着将产生降水。(3)VIL作为预报指标时,只有连续非零VIL序列才具有预报价值,VIL时间序列中一旦出现零值,即使只出现一次,也应当将零值前后两段序列区分开。 展开更多
关键词 短时强降水 vil 相关性 超前相关 滞后相关
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雷达VIL在局地强对流天气应用中应注意的几个问题 被引量:18
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作者 刘治国 王锡稳 +2 位作者 冀兰芝 王勇 张旭东 《干旱气象》 2006年第4期40-44,共5页
结合兰州新一代天气雷达的使用情况,介绍了其物理量产品中垂直积分液态含水量(Verti-cally Integrated L iqu id W ater Content,)的理论计算模式,从雷达观测距离对VIL计算的影响、VIL理论模式中的反射率强度和探测高度对VIL计算的影响... 结合兰州新一代天气雷达的使用情况,介绍了其物理量产品中垂直积分液态含水量(Verti-cally Integrated L iqu id W ater Content,)的理论计算模式,从雷达观测距离对VIL计算的影响、VIL理论模式中的反射率强度和探测高度对VIL计算的影响及VIL在强对流天气识别中受季节变化的影响3方面提出了思考,以期为今后应用VIL识别强对流天气提供参考。 展开更多
关键词 vil 理论模式 观测距离 误差讨论
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含KSHV vIL-6基因重组分泌型表达载体的构建及其分泌蛋白对内皮细胞增殖和血管生成能力影响的初探 被引量:5
9
作者 朱小飞 秦娣 卢春 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期283-288,共6页
目的:构建含卡波济肉瘤相关疱疹病毒(Kaposi’s sarcoma-assoliated herpesvirus,KSHV)致瘤基因vIL-6的重组分泌型质粒,将其导入内皮细胞系EA.hy926中进行表达,并检测vIL-6对内皮细胞增殖和血管生成作用的影响。方法:根据本实验室先前... 目的:构建含卡波济肉瘤相关疱疹病毒(Kaposi’s sarcoma-assoliated herpesvirus,KSHV)致瘤基因vIL-6的重组分泌型质粒,将其导入内皮细胞系EA.hy926中进行表达,并检测vIL-6对内皮细胞增殖和血管生成作用的影响。方法:根据本实验室先前构建的pvIL-6 F表达载体中的核酸序列设计PCR引物,在其5′端及3′端分别引入HindⅢ和XhoⅠ酶切位点,PCR扩增vIL-6基因,经双酶切纯化后将其克隆入分泌型真核表达载体pSecTag2B中。重组质粒经核酸测序鉴定后转染EA.hy926细胞,以Western blot检测vIL-6基因的表达情况;另外收集重组分泌型质粒转染293T细胞后的上清,通过细胞增殖实验和微管形成实验分别检测vIL-6通过自分泌或旁分泌方式对内皮细胞增殖和血管生成作用的影响。结果:限制性内切酶鉴定和基因测序证实成功构建了含KSHV vIL-6基因的重组分泌型质粒pSecTag2B-vIL-6,此质粒转染EA.hy926细胞后,Western blot能够在相应位置检测到目的蛋白vIL-6的条带。通过将pSecTag2B-vIL-6瞬时转染EA.hy926细胞或者收集pSecTag2B-vIL-6转染293T细胞后的上清作用于EA.hy926细胞,均观察到细胞增殖和血管生成能力的明显增强。结论:成功构建了重组分泌型质粒pSecTag2B-vIL-6;目的蛋白可在EA.hy926细胞中表达,且vIL-6能够通过自分泌和旁分泌方式促进内皮细胞的增殖和血管生成。 展开更多
关键词 KSHV vil.6 分泌型 细胞增殖 血管生成
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新一代天气雷达VIL产品修正方法初探 被引量:9
10
作者 张维全 李闻生 李洋 《气象与环境学报》 2006年第2期11-17,共7页
基于对VIL物理量产品的生成原理和特点的分析后认为:由于产品生成过程中只使用固定的Z-M关系,而实际的Z-M关系因季节和地域的不同变化很大,故VIL物理量产品数据很难与实际情况很好地符合,不宜在人工增雨作业指挥中作为定量数据指标来直... 基于对VIL物理量产品的生成原理和特点的分析后认为:由于产品生成过程中只使用固定的Z-M关系,而实际的Z-M关系因季节和地域的不同变化很大,故VIL物理量产品数据很难与实际情况很好地符合,不宜在人工增雨作业指挥中作为定量数据指标来直接应用。据此,从理论上对如何修正天气雷达提供的VIL产品数据进行了探讨:通过引入“VIL修正函数”,可从理论上解决在考虑了某个具体的Z-M关系的条件下对VIL产品数据进行修正的问题;提出了对VIL物理量产品数据进行修正的修正表格法与修正曲线法,并以沈阳为例,对修正表格和修正曲线的制作及使用方法作了必要的解释。 展开更多
关键词 天气雷达 vil产品 修正函数 修正方法
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马立克氏病病毒类白细胞介素8(vIL-8)的生物趋化作用 被引量:3
11
作者 高巍 秦爱建 +2 位作者 张鑫宇 金文杰 邵红霞 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期623-626,共4页
利用杆状病毒表达系统,将病毒源性趋化因子病毒类白细胞介素8(vIL-8)基因克隆入转移载体pFastBacI,然后转化到DH10Bac感受态细胞中与Bacmid杆状病毒穿梭载体进行转座重组,通过重组子转染Sf9细胞得到含vIL-8的重组病毒rBacvIL-8。间接免... 利用杆状病毒表达系统,将病毒源性趋化因子病毒类白细胞介素8(vIL-8)基因克隆入转移载体pFastBacI,然后转化到DH10Bac感受态细胞中与Bacmid杆状病毒穿梭载体进行转座重组,通过重组子转染Sf9细胞得到含vIL-8的重组病毒rBacvIL-8。间接免疫荧光试验和雏鸡T、B淋巴细胞生物趋化分析结果表明,vIL-8在昆虫细胞中得到了表达,重组vIL-8在一定浓度范围内,可使鸡T、B细胞发生趋化作用,最高趋化指数分别为3.31±0.50和4.02±0.48,且是典型剂量依赖的钟形趋化性反应曲线;进一步分析发现vIL-8对B细胞趋化活性较对T细胞强?P<0.05),提示vIL-8对靶细胞的趋化性与病毒感染过程相关,在早期溶B细胞感染中有重要作用。 展开更多
关键词 马立克氏病病毒 vil-8 杆状病毒 趋化活性
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基于Wigne-Ville分布和短时傅立叶变换时频分布计算地震波衰减梯度 被引量:2
12
作者 付勋勋 秦启荣 +2 位作者 徐峰 李力民 姚泳汐 《新疆石油地质》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期353-356,共4页
地震波在储集层中传播时,伴有能量的剧烈衰减,且频率越高能量衰减越快,因此,通过地震波高频端能量衰减梯度能够灵敏地检测地层中是否有烃类流体存在。短时傅里叶变换的时频分辨率不及Wigne-Ville分布,而Wigne-Ville分布虽有高的时频分... 地震波在储集层中传播时,伴有能量的剧烈衰减,且频率越高能量衰减越快,因此,通过地震波高频端能量衰减梯度能够灵敏地检测地层中是否有烃类流体存在。短时傅里叶变换的时频分辨率不及Wigne-Ville分布,而Wigne-Ville分布虽有高的时频分辨率但存在交叉项的干扰。应用Wigne-Ville分布和短时傅里叶变换相结合的方法来计算地震信号的时频分布,然后利用高频成分能量分布与对应频率的拟线性关系估算出地震波能量衰减梯度。实际资料表明,基于短时傅立叶变换联合Wigner-Ville分布的能量衰减梯度在储集层预测中有较高的应用价值。 展开更多
关键词 瞬时能量衰减梯度 短时傅立叶变换 WIGNER-vilLE分布 储集层预测
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VIL产品在人工防雹中的应用 被引量:18
13
作者 李秀琳 贾金海 《陕西气象》 2008年第3期13-16,共4页
利用西安多普勒雷达垂直累积液态含水量(VIL)产品及地面实况资料,分析2005—2006年渭南19个典型雹日的VIL回波特征。得出指标:VIL值的变化可以应用于预测降雹;降雹时VIL值在50 kg/m2以上;一般在降雹前VIL值有明显的"跃增";VI... 利用西安多普勒雷达垂直累积液态含水量(VIL)产品及地面实况资料,分析2005—2006年渭南19个典型雹日的VIL回波特征。得出指标:VIL值的变化可以应用于预测降雹;降雹时VIL值在50 kg/m2以上;一般在降雹前VIL值有明显的"跃增";VIL值的迅速减小会给本地和下游地区造成雷雨大风冰雹天气;在距离雷达较远的合阳、韩城VIL值可信度较低。这些指标的应用对强对流天气的临近预报和有效开展人工防雹作业具有指导意义。 展开更多
关键词 垂直累积液态含水量(vil) 人工防雹 应用
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黔西南地区冰雹云VIL演变特征分析 被引量:1
14
作者 王芬 李腹广 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第15期9047-9050,9080,共5页
用兴义新一代多普勒天气雷达CINRAD/CD复合体扫基数据作为原始资料,经WSR-88D提供的气象算法生成气象产品——垂直累积液态含水量(VIL),统计分析了基于网络的对流云的VIL特征,用理论模式计算雹云单体在演变过程中的VIL,用MAX函数逐个提... 用兴义新一代多普勒天气雷达CINRAD/CD复合体扫基数据作为原始资料,经WSR-88D提供的气象算法生成气象产品——垂直累积液态含水量(VIL),统计分析了基于网络的对流云的VIL特征,用理论模式计算雹云单体在演变过程中的VIL,用MAX函数逐个提取最大VIL,引入VIL密度VILD及零度层高度以上到18 dBz高度的VIL积分VILH的概念,对2007~2008年黔西南地区12个雹云单体的VIL、VILmax、VILD和VILH的演变特征及其在冰雹云识别中的应用进行了分析。结果表明:冰雹降落时间基本是在VIL值达到最大时开始,降雹结束后,VIL值迅速下降;雹云单体VILmax在演变过程中存在暴发式增长和暴发式降低现象,在时间序列曲线中表现为峰型特征;雹云单体在首次降雹前3~4个资料时间间隔内其VILmax将出现2次暴发式增长现象,出现第1次暴发式增长现象时一般不会降雹,维持1~2个体扫时间间隔后出现第2次暴发式增长现象,此时才开始降雹,同一单体再次降雹前其VILmax并没有第1次暴发式增长现象,出现暴发式降低现象时降雹均停止;从季节上整体来分析,3~4月的平均VIL、VILmax、VILH和VILD数值最大,5~6月次之,8月最小。 展开更多
关键词 冰雹云 vil演变特征 黔西南地区
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马立克氏病病毒编码的vIL8与鸡IL8(cIL8)的抗原相关性初步研究
15
作者 高巍 秦爱建 +1 位作者 金文杰 邵红霞 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1563-1567,共5页
vIL8是马立克氏病病毒(Marek’s disease virus,MDV)编码的一种病毒源性趋化因子;cIL8(鸡IL8)是鸡重要的抗病毒趋化因子。为研究vIL8与cIL8的相互关系,进而深入探索vIL8在MDV致病中的作用,本研究首先用生物信息学方法对vIL8与cIL8的氨... vIL8是马立克氏病病毒(Marek’s disease virus,MDV)编码的一种病毒源性趋化因子;cIL8(鸡IL8)是鸡重要的抗病毒趋化因子。为研究vIL8与cIL8的相互关系,进而深入探索vIL8在MDV致病中的作用,本研究首先用生物信息学方法对vIL8与cIL8的氨基酸序列进行对比和分析;然后原核表达cIL8,利用SDS电泳分离原核表达的cIL8融合蛋白,并切取目的条带免疫小鼠制备抗cIL8血清,将昆虫细胞表达的vIL8与该抗血清进行免疫荧光反应。结果显示,vIL8与cIL8在结构上均为典型的CXC趋化因子,有类似的受体结合关键氨基酸;荧光试验初步证明,vIL8与cIL8有交叉反应性,两者有共同的抗原表位。结果提示,vIL8与cIL8有相似的抗原性,可能有相同的受体。vIL8的这一特点对于病毒的免疫逃避意义重大。 展开更多
关键词 马立克氏病病毒 vil8 cIL8 抗原相关性
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不同毒力马立克氏病病毒毒株的vIL8表达水平分析
16
作者 高巍 秦爱建 +1 位作者 金文杰 邵红霞 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期972-974,共3页
为研究马立克氏病毒(MDV)编码的vIL8与病毒毒力的相关性,本研究用等剂量的3个不同毒力的MDV毒株(CVI988/Rispens株、GA株和RB1B株)对1日龄SPF雏鸡进行接种,接种后第4 d、7 d和10 d分别采集雏鸡的脾脏组织,提取总RNA。以鸡β-actin作为... 为研究马立克氏病毒(MDV)编码的vIL8与病毒毒力的相关性,本研究用等剂量的3个不同毒力的MDV毒株(CVI988/Rispens株、GA株和RB1B株)对1日龄SPF雏鸡进行接种,接种后第4 d、7 d和10 d分别采集雏鸡的脾脏组织,提取总RNA。以鸡β-actin作为内参基因,用半定量RT-PCR法测定MDV vIL8和MDV gB基因在接种后不同时间的表达情况,进而分析vIL8的表达量与病毒毒力的关系。结果显示:不同病毒株感染后检测的不同时间均有vIL8和gB的表达,vIL8的相对表达量大于0.25,gB大于0.17;vIL8表达量与病毒毒力呈正相关,毒力越强,vIL8表达量越高,这种现象在病毒接种后的4 d和10 d较为明显;在各个不同时期,vIL8的mRNA表达量均要比gB表达量高。结果表明,vIL8与MDV毒力有一定相关性,参与MDV-1的致病过程。 展开更多
关键词 马立克氏病病毒 vil8 半定量RT-PCR 毒力
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新结构积层板-ALIVH+VIL 被引量:1
17
作者 蔡积庆 《印制电路信息》 2003年第3期24-28,共5页
概述松下电子部品和目本一共同开发的ALIVH+vIL的新构造积层板,其特征是以ALIVH为基板(芯板), 以细线化的VIL为表面层,适用于21世纪的高密度安装。
关键词 ALIVH+vil 积层板 基板 表面层 高密度安装 印制电路板
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羊口疮病毒凤翔株ORFV121和vIL-10基因的生物信息学分析 被引量:4
18
作者 刘方 赵玄多 +5 位作者 安贝 刘慧 高洋 张立强 贾芸晓 陈德坤 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2014年第7期52-58,共7页
为分析羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因在凤翔(FX0910)强毒株(vORFV)和弱毒株(lvORFV)之间的差异,应用PCR方法扩增羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因的全长序列并测序,应用生物信息学软件分析基因的核酸、氨基酸相似性,蛋白的亲水性、二级... 为分析羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因在凤翔(FX0910)强毒株(vORFV)和弱毒株(lvORFV)之间的差异,应用PCR方法扩增羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因的全长序列并测序,应用生物信息学软件分析基因的核酸、氨基酸相似性,蛋白的亲水性、二级结构以及抗原性。结果显示,lvORFV的ORFV121基因118位的谷氨酸缺失,说明该处发生的碱基突变为有意突变,该突变导致弱毒株相应蛋白的亲水性、二级结构发生变化,蛋白的抗原性在很多区域发生本质改变;vIL-10在蛋白质水平出现了5个氨基酸位点突变(14:V→W,49:A→P,57:T→M,72:R→C,102:I→V)和79位插入1个色氨酸。这些位点差异导致蛋白的亲水性、二级结构和抗原性发生了变化。ORFV121基因和vIL-10基因在vORFV和lvORFV之间存在差异,这些基因差异导致蛋白的亲水性、二级结构和抗原性发生改变。 展开更多
关键词 羊口疮病毒凤翔株 ORFV121 vil-10 基因差异
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Value Analysis and Protective Planning of Famous Historical and Cultural Villages: A Case Study of Ancient Sangyuan Village in Jishui County, Jiangxi Province
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作者 LUO Yi 《Journal of Landscape Research》 2016年第5期123-126,共4页
Through analyzing historical value of patriarchal society, village layout, and characteristic folk dwel ings in Ancient Sangyuan Village, Jishui County, Jiangxi Province, this paper proposed the protective planning ba... Through analyzing historical value of patriarchal society, village layout, and characteristic folk dwel ings in Ancient Sangyuan Village, Jishui County, Jiangxi Province, this paper proposed the protective planning based on the gist of protecting villagers' benefits, applied classified protection of buildings, enhanced water protection and landscape design, and tried to carry out its intangible cultures via folk custom activities, in order to further develop the value of its historical and cultural resources. 展开更多
关键词 Famous historical and cultural village Value analysis Protective planning Ancient Sangyuan vil age
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羊口疮病毒疫苗株与野毒株VIL-10基因的比较分析 被引量:3
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作者 冯倩 吴锦艳 +4 位作者 陈妍 刘永杰 张克山 尚佑军 刘湘涛 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第9期2368-2376,共9页
试验旨在比较分析羊口疮病毒(orf virus,ORFV)VIL-10基因在疫苗株和野毒株之间的差异特征。参照GenBank中公布的ORFV NZ2株的VIL-10基因序列设计并合成1对特异性引物,分别以疫苗株和野毒株提取的基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增ORFV的V... 试验旨在比较分析羊口疮病毒(orf virus,ORFV)VIL-10基因在疫苗株和野毒株之间的差异特征。参照GenBank中公布的ORFV NZ2株的VIL-10基因序列设计并合成1对特异性引物,分别以疫苗株和野毒株提取的基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增ORFV的VIL-10基因全序列并进行测序,应用生物信息学相关软件分析基因的核苷酸、氨基酸变异情况及蛋白结构。结果显示,本试验测定的疫苗株和野毒株VIL-10基因核苷酸序列同源性为94.4%,差异主要是单个碱基的突变,其中疫苗株在132~134bp核苷酸序列出现缺失;氨基酸序列同源性为92.5%,出现了15个氨基酸位点的突变,其中疫苗株第42位氨基酸天冬酰胺出现缺失;蛋白质在一级结构及理化性质、二级结构、三级结构、抗原表位参数及有无信号肽之间均存在一定程度的差异,而疫苗株和野毒株编码的蛋白质均无跨膜结构域。系统进化树分析结果表明,本试验测定的野毒株与疫苗株属于不同分支,遗传关系较远。研究结果提示,野毒株与疫苗株的VIL-10基因发生较明显的变异,这些变异可能与ORFV疫苗株的毒力致弱有关。 展开更多
关键词 羊口疮病毒(ORFV) 疫苗株 野毒株 vil-10基因 比较分析
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