基于VITEK MS及VITEK2 Compact的更年宁微生物污染调查

目的研究更年宁微生物负载状况。方法建立微生物限度检查方法并对全部样品进行微生物限度检查,分离培养检查中出现的污染菌,使用VITEK MS飞行时间质谱及VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对分离菌株进行鉴定。结果样品需氧菌总数存在不同程度的微生物污染问题,霉菌、酵母菌总数及控制菌各项指标良好。需氧菌污染菌株以芽孢杆菌属为主,其他种类需氧菌较少被检出,2种方法对菌种的鉴定结果存在差异。结论更年宁需氧菌总数微生物污染问题不容忽视,但未发现有严重致病性微生物。VITEK MS及VITEK2 Compact联用时结果展现更丰富、直观、高效,可为调查污染来源提供重要参考。

VITEK MS快速鉴定副溶血性弧菌的效果分析

目的评价VITEK MS对副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VP)的识别能力。方法培养平板选用弧菌显色平板和血平板,处理方法选用甲酸辅助裂解法(方法1)和直接涂板法(方法2)。每个菌株的不同培养平板与处理方法的组合分别用RUO软件和IVD软件进行鉴定,鉴定结果用配对卡方检验分析培养平板和处理方法对鉴定结果的影响。用RUO软件对图谱做相似性分析。结果IVD软件可以对139株VP的不同培养平板和方法组合100%鉴定到种的水平,RUO软件对方法1和方法2处理的属水平鉴定率分别不超过60%和45%,种水平的鉴定率分别不超过17%和9%,2种处理方法结果差异具有统计学意义(P<0.05)。同一种处理方法2种平板的结果差异无统计学意义(P>0.05)。VP图谱之间的相似性为45%~90%,其和溶藻弧菌图谱之间的相似性为54%~78%。结论IVD软件对VP有较好的鉴定效果,RUO软件对其鉴定效果不理想,甲酸辅助裂解法可以稍微提高鉴定率。VP图谱和溶藻弧菌图谱有交叉聚类的现象。

VITEK2 Compact与VITEK MS系统对细菌鉴定结果的比较研究

目的比较VITEK 2 compact和ⅥTEK MS两套系统对细菌鉴定的符合率。方法 分别应用VTEK 2 compact和VITEK MS对289株临床分离菌株、室间质评菌株和标准菌株同时进行鉴定,采用测序技术对两者鉴定结果不一致的菌株进行确认。结果 VITEK 2 compact对细菌"种"和"属"鉴定符合率分别为88.58%(256/289)和100%(289/289),VITEKMS对细菌"种"和"属"鉴定符合率分别为88.93%(257/289)和100%(289/289)。结论 VITEK MS对细菌"种"鉴定符合率高于VITEK 2 compact,且具有操作简便和检测快速等优势,使细菌鉴定更准确、快速和高效,可用于临床微生物实验室的细菌常规快速鉴定。

分离胶辅助VITEK-MS质谱仪快速鉴定血培养阳性菌的方法学研究

目的探讨用分离胶采血管联合基质辅助激光解析电离飞行时间质谱系统（VITEK-MS）快速鉴定血培养阳性菌的方法。方法收集2015年3~10月广州医科大学附属第一医院BacT/ALERT3D血培养仪报阳性,且直接涂片染色为革兰阴性菌的血培养标本50例,通过分离胶采血管直接从血培养瓶中提取细菌,采用VITEK-MS对细菌进行快速鉴定;同时用常规方法对细菌进行转种培养及鉴定,比较该方法的鉴定符合率。结果 50例血培养阳性的革兰阴性菌中,21例鉴定不出细菌名,29例鉴定出细菌名,阳性率58.0%,与常规鉴定方法阳性正确率为96.6%;分离胶联合VITEK-MS较常规法提前近24h。结论采用分离胶集菌联合VITKE-MS鉴定细菌的方法,对血培养阳性革兰阴性菌的鉴定符合率高,可以大大缩短鉴定的时间,方法快速、简便。

VITEK 2 Compact鉴定仪和VITEK MS质谱仪直接对血培养阳性标本细菌进行鉴定的探讨

目的探讨用VITEK 2 Compact鉴定仪和VITEK MS质谱仪直接对血培养阳性标本进行细菌鉴定的可行性。方法对临床血培养阳性标本分离的259株细菌进行试验,用VITEK 2 Compact鉴定仪和VITEK MS质谱仪进行直接鉴定,同时用API板条传统法鉴定的结果作为标准结果,将两直接鉴定结果与标准结果进行比对。结果革兰阴性杆菌和革兰阳性球菌用VITEK 2 Compact鉴定仪直接鉴定符合率分别为94.4%(134/142)、89.7%(105/117),鉴定仪直接鉴定总符合率为92.3%(239/259);用VITEK MS质谱仪直接鉴定符合率分别为80.3%(114/142)、70.9%(83/117),质谱仪直接鉴定总符合率为76.1%(197/259)。结论对血培养阳性标本进行离心处理,用VITEK MS质谱仪进行鉴定作为临床初级报告,用VITEK 2 Compact鉴定仪进行直接鉴定和药敏作为正式报告,2种方法互为补充、相互促进,为临床及时、合理和有效的抗菌素治疗提供可靠依据。

VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪与VITEK MS质谱仪在摩根摩根菌鉴定中的应用及评价

目的分析研究VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪与VITEK MS质谱仪在摩根摩根菌鉴定中的应用及对其鉴定结果的准确性做出评价,为临床精准治疗提供科学依据。方法收集2017年1月至2020年5月云南省第三人民医院送检的不同类型标本中分离出的50株摩根摩根菌;常规方法进行菌株培养;采用VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪,手工生化补充试验和VITEK MS质谱仪对菌株进行菌种鉴定,鉴定结果不一致的菌株采用16S rDNA测序验证。结果共分离出5株β溶血表型和45株非β溶血表型摩根摩根菌;VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪对非β溶血摩根摩根菌鉴定结果均符合,对β溶血摩根摩根菌鉴定结果均不符合,且均鉴定为奇异变形杆菌,鉴定符合率为90%;手工生化补充试验结果也符合奇异变形杆菌;VITEK MS质谱仪对非β溶血和β溶血摩根摩根菌的鉴定结果均符合,鉴定符合率为100%;16S rDNA测序对鉴定结果不一致的5株β溶血菌的测序结果均为摩根摩根菌。结论 VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪对非β溶血摩根摩根菌的鉴定结果准确可信;对β溶血摩根摩根菌鉴定结果均不准确,且鉴定为奇异变形杆菌的概率很高;VITEK MS质谱仪对摩根摩根菌的鉴定结果均准确快速且不受细菌β溶血与否影响。

VITEK-MS系统直接鉴定体液培养阳性标本的研究

目的利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱系统(VITEK-MS)对体液培养阳性瓶进行直接鉴定,探索快速诊断临床致病菌的新策略。方法收集体液培养阳性瓶,不经琼脂平板培养,直接利用VITEK-MS进行鉴定,并与传统生化鉴定的方法进行比较分析。结果 50例体液培养阳性瓶中,传统细菌鉴定法检出47株阳性菌,3例阴性;而VITEK-MS直接鉴定法检出31株阳性菌,同样3例阴性。VITEK-MS直接鉴定法灵敏度达65.96%,特异度为100%,临床符合率为68%。鉴定时间从24小时缩短到2小时。结论利用VITEK-MS质谱系统直接鉴定体液培养阳性标本中的病原菌,能有效缩短细菌鉴定时间,准确快速地诊断临床致病菌。

MALDI-TOFMS和VITEK 2鉴定临床常见酵母菌的性能比较

目的本研究从准确性、时间和成本3方面评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与VITEK 2全自动细菌鉴定及药敏分析仪鉴定临床常见酵母菌的性能。方法采用MALDI-TOF MS和Vitek2鉴定144株酵母菌,鉴定结果不一致时进行16S rRNA基因测序分析,同时计算鉴定每株菌所消耗的试剂成本及检测时间。结果 144株酵母菌,包括7个属和7个种,MALDI-TOF MS将142(98.6%)株菌鉴定到属水平,142(98.6%)株菌鉴定到种水平。VITEK 2将139(96.5%)株菌鉴定到属水平,135(93.8%)株菌鉴定到种水平。130(90.3%)株菌经2种方法鉴定,结果完全一致。两种方法鉴定不一致的菌株有14株,MALDI-TOF MS和VITEK 2鉴定错误率分别1.4%、6.3%。2种方法鉴定酵母菌到属水平的准确率,差异无统计学意义(P>0.05),但鉴定到种水平的准确率和鉴定错误率差异有统计学意义(P<0.05)。MALDITOF MS上机操作时间(1.2±0.2)min,鉴定时间(1.3±0.1)min;VITEK 2上机操作时间(3.5±0.3)min,鉴定时间(1098.3±13.1)min;MALDI-TOF MS鉴定每株菌的试剂成本为(12.5±0.2)元,VITEK 2为(68.4±0.5)元,2种方法鉴定酵母菌的时间和试剂成本,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 MALDI-TOF MS具有操作简便、快速、成本低、错误鉴定率低的优点,在鉴定临床常见酵母菌上性能优于VITEK 2,该技术有可能在鉴定临床常见酵母菌上取代传统的生化鉴定方法。

VITEK MS质谱仪对尿路感染的鉴定价值

目的:分析VITEK MS质谱仪对尿路感染的鉴定价值。方法:选取尿路感染尿液标本240份,采用VITEK MS质谱仪直接鉴定,以尿液细菌培养法作为金标准,分析其鉴定价值:准确性、灵敏度及特异度,统计标本病原菌错误或未检出率。结果:尿液细菌培养法作为金标准,VITEK MS质谱仪直接鉴定的准确性在99.58%、灵敏度在75.0%、特异度在98.33%;对尿液标本阳性检出准确率在97.50%,对革兰阴性菌、革兰阳性菌错误或未检出率分别在1.33%、3.95%。VITEK MS质谱仪直接鉴定法鉴定时间短于尿液细菌培养法(P<0.05)。结论:VITEK MS质谱仪对尿路感染尿液标本有较高的鉴定价值,可作为临床实验室对标本微生物的常规鉴定方法。

基于16S rDNA序列、MALDI-TOF-MS和VITEK的沙门氏菌和金黄色葡萄球菌的鉴定

沙门氏菌和金黄色葡萄球菌广泛存在于食品及环境中,对食品安全造成一定的威胁。在食源性致病菌检测过程中,选择合适的方法不仅可以缩短时间,节省人力物力,还能更好地溯源。选取210株沙门氏菌和18株金黄色葡萄球菌,使用16S rDNA序列测定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和VITEK全自动细菌鉴定系统对其鉴定,使用R软件包(v3.6.1)对鉴定结果进行统计和相关性分析,比较3种方法的鉴定水平和效率。结果表明:3种方法均可将210株沙门氏菌(100.0%)鉴定到属水平;16S rDNA序列测定方法可将18株(100.0%)金黄色葡萄球菌鉴定到属水平,可将其中15株(83.3%)菌鉴定到种水平;MALDI-TOF-MS和VITEK可将18株金黄色葡萄球菌(100.0%)鉴定到种水平。除16S rDNA序列测定方法外,其余2种方法对金黄色葡萄球菌和沙门氏菌的鉴定水平相同,而MALDI-TOF-MS鉴定所需时间最短、效率最高。

Vitek-2 Compact和MALDI TOF MS对棒状杆菌属细菌鉴定能力评估

目的：评估 VITEK-2 compact微生物鉴定系统、法国生物梅里埃公司及德国 Bruker公司的 MALDI TOF MS对棒状杆菌的鉴定能力。方法学评价研究选择来自法国生物梅里埃公司的棒状杆菌40株，以16S rDNA测序为金标准，分别使用 VITEK-2 compact，VITEK MS及 Bruker MS进行鉴定，对其鉴定率、检测时间及耗材成本作描述性分析。结果 VITEK-2 compact，VITEK MS及Bruker MS正确鉴定至种水平的鉴定率分别为95.0％，88.9％和97.5％，平均检测时间分别为5～6 h，2～3 min和2～3 min，检测耗材成本约为50～70元、15～25元和10～20元。结论三种方法均具有较高的正确鉴定率，能够满足临床的鉴定需要，但 VITEK MS对无植酸棒状杆菌鉴定能力需要进一步提高。

VITEK■ 2 Compact全自动微生物鉴定药敏分析仪虚拟仿真教学软件的开发与应用

文章主要介绍了VITEK■2 Compact全自动微生物鉴定药敏分析仪虚拟仿真教学软件的设计与开发,以及虚拟仿真融合线上线下混合教学模式在医学微生物检验实验教学中的应用。结果表明,该仿真教学软件的实际应用既有利于培养学生的实践操作能力及思维方式,又能弥补学校实训环境与临床实际不符的缺陷,为微生物检验实验教学质量的提升开辟新的思路。

梅里埃MALDI-TOF-MS系统与VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪对临床常见病原菌鉴定的一致性分析

目的分析梅里埃基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time offlight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)系统与VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪对临床常见病原菌鉴定的一致性。方法收集福建医科大学孟超肝胆医院2018年6月~2019年3月来自临床不同标本分离的非重复菌株300株,分别采用梅里埃MALDI-TOF-MS系统和VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪对病原菌进行鉴定,结果不一致菌株采用16SrDNA基因测序予以确认,比较两种鉴定方法的准确性与一致性,评估两种方法在鉴定16株大肠埃希菌的时间和经济成本。结果 300株临床分离菌中,鉴定到种水平的菌株MALDI-TOF-MS有268株(89.33%),VITEK 2 Compact有266株(88.67%);鉴定到属水平的菌株MALDI-TOF-MS有297株(99.00%),VITEK 2 Compact有297株(99.00%);两种方法在种属鉴定的一致性分别为82.67%与98.33%,MALDI-TOF-MS的准确性略高于VITEK 2 Compact。两种方法鉴定不一致菌株有39株(13.00%),与16SrDNA测序鉴定结果相比,MALDI-TOF MS的准确率(79.49%)高于VITEK 2Compact(58.97%)。对16株大肠埃希菌的鉴定,MALDI-TOF-MS耗时较VITEK 2 Compact少3.5h,且成本仅为VITEK2 Compact的2/5。结论 MALDI-TOF MS与VITEK 2 Compact对于临床常见病原菌的鉴定结果较为一致,但MALDITOF MS准确率更高,且更快速与经济。

Vitek MS在丝状真菌临床分离株鉴定中的应用评估

目的评估Vitek MS对丝状真菌临床分离株的鉴定性能，为丝状真菌的准确菌种鉴定提供新思路。方法对接种在不同培养条件下的25株菌种信息明确的丝状真菌进行Vitek MS鉴定，评估培养条件对Vitek MS丝状真菌鉴定能力的影响。收集207株丝状真菌临床分离株对其进行Vitek MS鉴定．并将Vitek MS鉴定结果与形态学及基因测序鉴定结果进行比较，进一步评估Vitek MS对病原性丝状真菌的鉴定能力。结果不同培养条件对Vitek MS丝状真菌鉴定能力几乎无影响。Vitek MS可将87．9％（182／207）受试丝状真菌鉴定成功；余下未能鉴定菌株多因Vitek MS数据库中缺乏对应菌种的参考质谱峰图。Vitek MS对受试菌株特别是非曲霉丝状真菌的种水平鉴定率优于形态学方法。结论Vitek MS可用于丝状真菌临床分离株的准确鉴定；数据库中参考菌种的持续扩充对于提升Vitek MS丝状真菌鉴定能力至关重要。

VITEK 2 Compact联合MALDI-TOF MS、16S rDNA基因测序对1株类志贺邻单胞菌的对比鉴定报告

类志贺邻单胞菌属于肠杆菌科的邻单胞菌属,是革兰阴性杆菌,为人类条件致病菌,该菌首先发现于胃肠道,但无明确证据证实其具有肠致病性,仅个别例证报道其可引起败血症和肠胃炎。霍乱弧菌属于弧菌属,革兰阴性杆菌,血清型O1群和O139群是甲类传染病霍乱的病原菌,通过侵袭力和霍乱肠毒素致病,可引起严重的呕吐和腹泻;而血清型非O1/O139群血流感染在国内偶见报道。本文报告1例在湘潭市中心医院就诊的慢性肝病患者无明显诱因出现腹痛、腹泻伴呕吐,且畏寒、寒战,血培养检出1株革兰阴性杆菌,初期经VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析系统鉴定为霍乱弧菌;但后经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)和16S rDNA基因测序,均确认为类志贺邻单胞菌。根据药敏试验结果,予哌拉西林/他唑巴坦抗感染,输血、护肝等对症治疗后好转出院,随访无复发。本报告结果提示,当Vitek-2 Compact将待检样本鉴定为霍乱弧菌等临床少见菌时,仍须结合细菌菌落形态、辅助生化试验以及患者的临床情况进行综合判断,必要时可采用质谱、基因测序等其他检测手段进行复核。

食品检验中VITEK SYSTEMS快速检测法与国家标准方法对比试验

VITEK 公司生产的“VITEK SYS-TEMS”是一种微生物快速检测系统,具有检测速度快、录敏度高的特点。为了比较VITEK 法与国标方法有无差别,我们对上千件食品用两种方法进行对比.并采用其中90件食品进行了统计学分析。用两种方法测熟肉、牛奶、饮料的数据经统计学处理 P】0.05.无显著性差异,符合率分别为86.7%、96.7%、100%。

基因测序与Vitek MS对鸟结合分支杆菌复合体分型的比较及评价

本研究评价了Vitek MS对临床肺标本鸟分枝杆菌复合体中分离菌株正确分类的能力 方法:回顾从2016年1月至2017年12月的潍坊市第二人民医院经确诊为鸟分枝杆菌复合体的并已将菌种进行基因测序与Vitek MS鉴定60例患者资料 结果:Vitek MS能够准确地鉴别出鸟分支杆菌,但该系统无法区分胞内和嵌合体杆菌之间的区别。

K-B法和VITEK2法检测108株大肠埃希氏菌18种抗生素耐药表型的一致性研究

目的运用K-B法和VITEK2法检测大肠埃希氏菌对氨苄西林等18种抗生素的药敏情况,对比研究二者结果的一致性。方法收集食源性大肠埃希氏菌108株(32株产β-内酰胺酶的大肠埃希氏菌Escherichia coli producingβ-lactamase,ESBLs+E.coli;76株不产β-内酰胺酶的大肠埃希氏菌Escherichia coli non-producingβ-lactamase,ESBLs-E.coli),通过K-B法和VITEK2法检测大肠埃希氏菌对18种抗生素的敏感性。结果除了复方新诺明,两种方法检测其他17种抗生素的敏感率、中介率和耐药率均无统计学上的差异;18种抗生素的一致率(catagorical agreement,CA)在85.18%~100.00%之间,非常重大误差(very major error,VME)在0%~26.41%之间,重大误差(major error,ME)在0%~1.78%之间,次要误差(minor error,MIE)在0%~12.04%之间。其中氨苄西林/舒巴坦的CA(87.96%)、复方新诺明的CA(85.18%)、氨曲南的VME(7.14%)、复方新诺明的VME(26.41%)和氨苄西林/舒巴坦的MIE(12.04%)不符合标准要求。结论K-B法与VITEK2法在耐药表型测定方面不具有完全等同性,K-B法对异质性耐药菌识别能力优于VITEK2法,但是在检测复方新诺明耐药表型时,可采用其他方法进行验证,综合判断后确定结果。

MADLI-TOF MS自建库在马尔尼菲篮状菌快速鉴定中的应用

目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MADLI-TOF MS)自建库对临床分离马尔尼菲篮状菌快速鉴定的能力。方法收集广州、玉林、防城港3个地区临床分离的马尔尼菲篮状菌,通过ITS区扩增测序进行菌种准确鉴定。菌株通过微型玻璃珠研磨结合甲酸/乙腈提取法预处理。通过采集建库菌株不同时间点、不同平板上菌丝相和酵母相菌落的质谱数据,建立包含马尔尼菲篮状菌超级图谱的自建库;并用非建库的马尔尼菲篮状菌及临床常见的真菌评估建立的自建库。结果建立了包含具有39个特征峰的马尔尼菲篮状菌超级图谱的自建库;用于评估的菌株均被鉴定到种,准确率为100%。结论MADLI-TOF MS建立的马尔尼菲篮状菌自建库能够对于临床马尔尼菲篮状菌进行快速、准确的鉴定。