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哈尔滨市41例HIV-1感染者Vpu基因特征分析
1
作者
李航
李文静
+3 位作者
林元龙
黄超群
王滨有
王福祥
《中国病毒病杂志》
CAS
2013年第2期136-141,共6页
目的了解哈尔滨市未经抗病毒治疗HIV-1感染者人群中部分感染者HIV-1 Vpu基因亚型和变异特征。方法采集哈尔滨市50例未经抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者的抗凝全血,分离外周血单核细胞(PBMC)提取前病毒基因组DNA,用巢氏聚合酶链反应(Nest...
目的了解哈尔滨市未经抗病毒治疗HIV-1感染者人群中部分感染者HIV-1 Vpu基因亚型和变异特征。方法采集哈尔滨市50例未经抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者的抗凝全血,分离外周血单核细胞(PBMC)提取前病毒基因组DNA,用巢氏聚合酶链反应(Nested-PCR)对HIV-1 Vpu基因进行扩增,并使用产物直接测序。应用Sequencher 4.9进行序列清理,Bioedit和MEGA5.05软件进行序列比对及系统发生分析。结果 50例HIV-1感染者的抗凝全血样本中最终有41例(82.0%)成功扩增并完成测序分型。系统进化树显示该41例中34例感染者体内HIV的Vpu基因区与云南瑞丽株RL42(泰国B亚型)聚集在一起,属于B′亚型,7例属于欧美B亚型。各病毒株Vpu区组内离散率为(9.5±1.1)%,与国际标准毒株(HXB2)线性分析可发现某些区域的氨基酸变异,变异主要集中在10~47、70~104、115~147、174~205四个区域。结论哈尔滨市未经抗病毒治疗HIV-1感染者人群中存在属B′亚型和欧美B亚型病毒流行株,其中属B′亚型的流行株最有可能起源于云南吸毒人群流行株。Vpu在组内有一定的保守性,其结构性区域和基序可能为日后抑制HIV-1病毒的复制和释放提供理论指导。
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关键词
人类免疫缺陷病毒I型(HIV一1)
vpu基因
变异
原文传递
HIV-1始祖病毒Vpu和Vif拮抗宿主限制因子的能力
2
作者
黄宇明
赵建元
+1 位作者
岑山
魏涛
《中国医药生物技术》
2017年第4期303-309,共7页
目的研究始祖病毒的生物学和早期进化特征,有助于阐明HIV-1建立感染的关键因素。方法以过表达的方法比较了始祖病毒和同一亚型的慢性感染病毒Vpu蛋白降解宿主限制因子BST-2的能力,利用流式细胞术检测两者对内源性BST-2细胞表面水平的影...
目的研究始祖病毒的生物学和早期进化特征,有助于阐明HIV-1建立感染的关键因素。方法以过表达的方法比较了始祖病毒和同一亚型的慢性感染病毒Vpu蛋白降解宿主限制因子BST-2的能力,利用流式细胞术检测两者对内源性BST-2细胞表面水平的影响。利用已构建的含荧光素酶报告基因的单循环感染始祖病毒表达质粒,比较了始祖病毒与同一亚型的慢性感染株下调BST-2的能力。用过表达的方法检测了Vif蛋白拮抗宿主限制因子h A3G的能力。结果对过表达以及细胞表面内源性BST-2,始祖病毒Vpu蛋白降解宿主限制因子BST-2的能力均显著高于同一亚型的慢性感染病毒。但在始祖病毒拮抗BST-2抗病毒活性的能力分析中,尽管始祖病毒Vpu表现出较强的下调BST-2的能力,仍然不足以拮抗外源过量表达的BST-2的抗病毒活性。在Vif降解hA 3G的实验中,始祖病毒Vif降解h A3G的能力弱于慢性感染病毒p MJ4或与之类似。结论始祖病毒具有更高的拮抗宿主天然免疫的能力,有助于其建立早期感染。
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关键词
vpu基因
产物
人免疫缺陷病毒
vif
基因
产物
人免疫缺陷病毒
HIV-1始祖病毒
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职称材料
题名
哈尔滨市41例HIV-1感染者Vpu基因特征分析
1
作者
李航
李文静
林元龙
黄超群
王滨有
王福祥
机构
哈尔滨医科大学附属第四医院感染科
哈尔滨医科大学流行病学教研室
出处
《中国病毒病杂志》
CAS
2013年第2期136-141,共6页
基金
黑龙江省教育厅科学技术研究(面上)项目(12521227)
文摘
目的了解哈尔滨市未经抗病毒治疗HIV-1感染者人群中部分感染者HIV-1 Vpu基因亚型和变异特征。方法采集哈尔滨市50例未经抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者的抗凝全血,分离外周血单核细胞(PBMC)提取前病毒基因组DNA,用巢氏聚合酶链反应(Nested-PCR)对HIV-1 Vpu基因进行扩增,并使用产物直接测序。应用Sequencher 4.9进行序列清理,Bioedit和MEGA5.05软件进行序列比对及系统发生分析。结果 50例HIV-1感染者的抗凝全血样本中最终有41例(82.0%)成功扩增并完成测序分型。系统进化树显示该41例中34例感染者体内HIV的Vpu基因区与云南瑞丽株RL42(泰国B亚型)聚集在一起,属于B′亚型,7例属于欧美B亚型。各病毒株Vpu区组内离散率为(9.5±1.1)%,与国际标准毒株(HXB2)线性分析可发现某些区域的氨基酸变异,变异主要集中在10~47、70~104、115~147、174~205四个区域。结论哈尔滨市未经抗病毒治疗HIV-1感染者人群中存在属B′亚型和欧美B亚型病毒流行株,其中属B′亚型的流行株最有可能起源于云南吸毒人群流行株。Vpu在组内有一定的保守性,其结构性区域和基序可能为日后抑制HIV-1病毒的复制和释放提供理论指导。
关键词
人类免疫缺陷病毒I型(HIV一1)
vpu基因
变异
Keywords
HIV-1
vpu
Variation
分类号
R512.91 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
HIV-1始祖病毒Vpu和Vif拮抗宿主限制因子的能力
2
作者
黄宇明
赵建元
岑山
魏涛
机构
首都医科大学附属北京地坛医院
中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所
北京联合大学生物化学工程学院
出处
《中国医药生物技术》
2017年第4期303-309,共7页
基金
国家自然科学基金(31470076
31470272)
国家重大科学研究计划(2012CB911102)
文摘
目的研究始祖病毒的生物学和早期进化特征,有助于阐明HIV-1建立感染的关键因素。方法以过表达的方法比较了始祖病毒和同一亚型的慢性感染病毒Vpu蛋白降解宿主限制因子BST-2的能力,利用流式细胞术检测两者对内源性BST-2细胞表面水平的影响。利用已构建的含荧光素酶报告基因的单循环感染始祖病毒表达质粒,比较了始祖病毒与同一亚型的慢性感染株下调BST-2的能力。用过表达的方法检测了Vif蛋白拮抗宿主限制因子h A3G的能力。结果对过表达以及细胞表面内源性BST-2,始祖病毒Vpu蛋白降解宿主限制因子BST-2的能力均显著高于同一亚型的慢性感染病毒。但在始祖病毒拮抗BST-2抗病毒活性的能力分析中,尽管始祖病毒Vpu表现出较强的下调BST-2的能力,仍然不足以拮抗外源过量表达的BST-2的抗病毒活性。在Vif降解hA 3G的实验中,始祖病毒Vif降解h A3G的能力弱于慢性感染病毒p MJ4或与之类似。结论始祖病毒具有更高的拮抗宿主天然免疫的能力,有助于其建立早期感染。
关键词
vpu基因
产物
人免疫缺陷病毒
vif
基因
产物
人免疫缺陷病毒
HIV-1始祖病毒
Keywords
vpu
gene products, human immunodeficiency virus
vifgene products, human immunodeficiency virus
HIV-1 founder virus
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
哈尔滨市41例HIV-1感染者Vpu基因特征分析
李航
李文静
林元龙
黄超群
王滨有
王福祥
《中国病毒病杂志》
CAS
2013
0
原文传递
2
HIV-1始祖病毒Vpu和Vif拮抗宿主限制因子的能力
黄宇明
赵建元
岑山
魏涛
《中国医药生物技术》
2017
0
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职称材料
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