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HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究
被引量:
4
1
作者
张玉新
张少龙
张庆刚
《山东科学》
CAS
2010年第1期1-5,共5页
对HIV-1蛋白酶与抑制剂2AH和4AH结合的两个复合物体系进行了水溶液环境下量子力学分子力学混合方法(hybrid QM/MM)的1ns分子动力学模拟,用MM-GBSA方法得到桥接水分子W301与HIV-1蛋白酶和抑制剂结合体的结合自由能分别为-24.93 kJ/mol和-...
对HIV-1蛋白酶与抑制剂2AH和4AH结合的两个复合物体系进行了水溶液环境下量子力学分子力学混合方法(hybrid QM/MM)的1ns分子动力学模拟,用MM-GBSA方法得到桥接水分子W301与HIV-1蛋白酶和抑制剂结合体的结合自由能分别为-24.93 kJ/mol和-20.29 kJ/mol,表明W301在抑制剂和HIV-1蛋白酶结合的过程中起到了不能被忽略的作用。
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关键词
HYBRID
QM/MM方法
AM1方法
w301水分子
结合自由能
MM-GBSA
下载PDF
职称材料
题名
HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究
被引量:
4
1
作者
张玉新
张少龙
张庆刚
机构
山东师范大学物理与电子科学学院
出处
《山东科学》
CAS
2010年第1期1-5,共5页
基金
国家自然科学基金(10874104)
山东省自然科学家基金(Z2007A05)
文摘
对HIV-1蛋白酶与抑制剂2AH和4AH结合的两个复合物体系进行了水溶液环境下量子力学分子力学混合方法(hybrid QM/MM)的1ns分子动力学模拟,用MM-GBSA方法得到桥接水分子W301与HIV-1蛋白酶和抑制剂结合体的结合自由能分别为-24.93 kJ/mol和-20.29 kJ/mol,表明W301在抑制剂和HIV-1蛋白酶结合的过程中起到了不能被忽略的作用。
关键词
HYBRID
QM/MM方法
AM1方法
w301水分子
结合自由能
MM-GBSA
Keywords
hybrid QM/MM
AM1
w
301
binding free energy
MM-GBSA
分类号
O641.12 [理学—物理化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究
张玉新
张少龙
张庆刚
《山东科学》
CAS
2010
4
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