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WDR45L大鼠同源基因编码区cDNA的克隆及生物信息学分析
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作者 王海涛 畅继武 郭志 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 2007年第14期1050-1053,共4页
目的:克隆肿瘤相关基因WDR45L的大鼠同源基因,并进行初步的生物信息学分析。方法:以人WDR45L同源氨基酸序列(CAJ57996.1)作为查询序列,利用TBLASTN和BLASTN软件搜索数据库中与大鼠WDR45L基因同源的cDNA和EST序列。把检出序列组装为连续... 目的:克隆肿瘤相关基因WDR45L的大鼠同源基因,并进行初步的生物信息学分析。方法:以人WDR45L同源氨基酸序列(CAJ57996.1)作为查询序列,利用TBLASTN和BLASTN软件搜索数据库中与大鼠WDR45L基因同源的cDNA和EST序列。把检出序列组装为连续体(Contig),在UCSC程序上进行EST连续体序列的拼接和基因组序列与EST序列的双重校对。克隆基因采用RT-PCR测序证实,并进行核酸与蛋白质特性的生物信息学分析。结果:综合利用基因组和EST序列信息成功克隆了大鼠WDR45L基因(GenBank登记号:AM182327和NM_001039587.1)。RT-PCR测序结果与计算机克隆结果完全一致。生物信息学分析显示:WDR45L基因定位于染色体10q32.3区,含11个外显子和10个内含子,ORF为1035bp,编码344个氨基酸;在种属中高度保守;WDR45L基因在胃癌、结肠癌、乳腺癌、卵巢癌、肾癌和胰腺癌等恶性肿瘤中表达上调。结论:综合利用基因组和EST序列信息是更为科学的计算机克隆方法,进一步深入研究WDR45L基因的功能具有重要生物学意义。 展开更多
关键词 生物信息学 计算机克隆 种属同源基因 wdr45L
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A Novel WDR45 Mutation in a 9-Month-Old Male Infant with Epileptic Spasms
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作者 Wan-Ting Liu Qian Chen +3 位作者 Zhi-Jie Gao Xin-Na Ji Ke-Ming Xu Yan-Yan Cao 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2018年第24期2991-2992,共2页
To the Editor:Neurodegeneration with brain iron accumulation (NBIA)comprises a group of disorders that manifest as early-or late-onset parkinsonism,dystonia,spasticity,and cognitive impairment, One subtype of NBIA,β-... To the Editor:Neurodegeneration with brain iron accumulation (NBIA)comprises a group of disorders that manifest as early-or late-onset parkinsonism,dystonia,spasticity,and cognitive impairment, One subtype of NBIA,β-propeller protein-associated neurodegeneration (BPAN),is caused by mutation of the WDR45 gene.To date,59 novel WDR45 mutations have been reported.The literature indicates that it is difficult to detect the disorder in early childhood because no specific clinical or imaging features exist. In this report,we describe the case of a 9-month-old male Chinese infant with a novel mutation (c.977-1 C >T)in the WDR45 gene. 展开更多
关键词 wdr45 MUTATION MALE INFANT Epileptic SPASMS
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2例神经退行性变伴脑铁沉积症5型患儿临床及遗传学分析 被引量:1
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作者 赵敏 冯英 +4 位作者 陈玉霞 刘玲 黄琴蓉 肖农 江伟 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期820-823,830,共5页
目的探讨神经退行性变伴脑铁沉积症5型(NBIA5)患儿的临床及遗传学特征。方法分析2例NBIA5患儿临床表现及影像学结果,并用全外显子检测技术对患儿及家系进行WDR45基因测序。结果患儿分别为10个月男性和3岁10个月女性,均有全面性发育迟缓... 目的探讨神经退行性变伴脑铁沉积症5型(NBIA5)患儿的临床及遗传学特征。方法分析2例NBIA5患儿临床表现及影像学结果,并用全外显子检测技术对患儿及家系进行WDR45基因测序。结果患儿分别为10个月男性和3岁10个月女性,均有全面性发育迟缓。1例有疑似癫痫发作史,MRI提示脑实质进行性萎缩;另1例有癫痫病史,MRI提示双侧苍白球T2WI及T2Flair上信号稍高。基因测序显示均存在WDR45基因突变,1例为未见报道的第6外显子c.276-c 277 insC移码突变,另1例为已有报道的第3外显子c. 19 C>T提前终止;2例患儿父母均为WDR45野生型。结论 WDR45全外显子基因测序结合病史及MRI可诊断NBIA5。 展开更多
关键词 神经退行性变伴脑铁沉积症5型 wdr45基因 基因突变 全外显子测序 X连锁显性遗传
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儿童β螺旋蛋白相关性神经变性的基因型和表型特点 被引量:1
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作者 李文辉 陈倩 +12 位作者 王华 张元凤 杨莹 刘爱杰 刘婉婷 姬辛娜 滕紫藤 陈育才 吴冰冰 杨皓玮 王艺 张月华 周水珍 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期830-836,共7页
目的总结β螺旋蛋白相关性神经变性(BPAN)患儿的临床表型及基因型特点。方法回顾性收集2016年6月至2018年12月复旦大学附属儿科医院、北京大学第一医院、首都儿科研究所、中国医科大学附属盛京医院及上海市儿童医院确诊为WDR45基因变异... 目的总结β螺旋蛋白相关性神经变性(BPAN)患儿的临床表型及基因型特点。方法回顾性收集2016年6月至2018年12月复旦大学附属儿科医院、北京大学第一医院、首都儿科研究所、中国医科大学附属盛京医院及上海市儿童医院确诊为WDR45基因变异的17例BPAN患儿病例资料,总结其临床表现、头颅影像表现、脑电图以及基因型特点。结果17例BPAN患儿中女13例、男4例,年龄1.1~8.8岁,17例患儿中16例合并癫痫。首次癫痫发病年龄为3~24月龄,发病年龄中位数为14.5月龄。痉挛发作6例,复杂部分性发作5例。8例患儿仅具有单一发作类型,8例患儿具有超过2种发作类型。9例患儿完全缓解。16例合并癫痫的患儿发作前均已表现出发育迟缓,13例为中、重度发育迟缓。13例患儿头颅磁共振成像(MRI)异常,9例患儿胼胝体薄,10例患儿脑发育不良或者脑萎缩;2例患儿在学龄期前进行头颅磁敏感加权成像(SWI),结果表现为双侧苍白球和脑干腹侧低信号。5例患儿同步脑电监测到痉挛、部分性、全面性强直阵挛、失神和肌阵挛发作。男性发病年龄分别为3、4、5、18月龄,女性患儿发病年龄为17(6~24)月龄。WDR45基因的变异包括3例错义变异,6例无义变异,4例移码变异,4例剪接变异;其中13例女性患儿为杂合变异,3例男性患儿为半合变异,1例男性患儿为嵌合变异,16个不同变异均为De novo,其中5个变异(c.977-1C>T、c.976+1G>C、c.10C>T、c.806del和c.110T>C)未见报道。结论BPAN患儿具有明显的发育迟缓,合并癫痫概率高,女性患儿为主,男性患儿癫痫发病早且发育迟缓程度更重。早期进行头颅SWI检查有助于提供诊断线索。 展开更多
关键词 癫痫 神经变性疾病 基因 wdr45 神经影像
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