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人和大鼠自噬相关新基因WIPI-3的电子克隆和序列分析 被引量:7
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作者 王海涛 畅继武 +4 位作者 马小兵 张一兵 韩瑞发 马富玲 张淑敏 《现代生物医学进展》 CAS 2006年第4期16-21,共6页
目的:人和大鼠WIPI-3基因的电子克隆和序列分析。方法:综合运用基因电子拼接和比较基因组分析等生物信息学手段进行新基因的电子克隆和注释。通过拼接CR593190、NM_019613和BC000974 cDNA序列获得人WIPI-3 cDNA全长序列,通过拼接EST序列... 目的:人和大鼠WIPI-3基因的电子克隆和序列分析。方法:综合运用基因电子拼接和比较基因组分析等生物信息学手段进行新基因的电子克隆和注释。通过拼接CR593190、NM_019613和BC000974 cDNA序列获得人WIPI-3 cDNA全长序列,通过拼接EST序列CB727439、CB737031、BF557312、BG663387和预测的CDS获得大鼠WIPI3基因的cDNA序列。结果:成功克隆了人和大鼠自噬相关新基因WIPI-3的cDNA,上述两个新基因序列均得到了人类基因组序列和EST序列的双重支持,另外经RT-PCR验证电子克隆的基因序列也是正确的,而且序列均已被GenBank收录,其编号分别为:AM182326和NM_001039587。其中,人WIPI-3基因修正了目前基因库中注释的WIPI-3序列,而大鼠基因则是国际上首次克隆,并被确定为参考序列。结论:基因电子拼接结合种属同源基因比较分析,可大大提高电子克隆的精确性,这种方法可有效用于新基因的克隆和注释。 展开更多
关键词 wipi-3 电子克隆 自噬 生物信息学 比较基因组
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基于WIPI1蛋白自噬检测方法及其在PCV2感染细胞自噬研究中的应用
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作者 谷元兴 周莹珊 +3 位作者 齐宝珠 蒋小武 李肖梁 方维焕 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期537-541,566,共6页
多种病毒感染能够诱导细胞自噬,WIPI1蛋白是一种新发现的细胞自噬标记分子。为在PK-15细胞中建立基于红色荧光蛋白(Ds Red)与WIPI1融合表达蛋白的自噬检测方法,本研究以猪圆环病毒2型(PCV2)感染为模式病毒,以药物处理作为阳性对照验证... 多种病毒感染能够诱导细胞自噬,WIPI1蛋白是一种新发现的细胞自噬标记分子。为在PK-15细胞中建立基于红色荧光蛋白(Ds Red)与WIPI1融合表达蛋白的自噬检测方法,本研究以猪圆环病毒2型(PCV2)感染为模式病毒,以药物处理作为阳性对照验证该方法的适用性。采用亚克隆策略构建了表达猪源WIPI1与Ds Red融合蛋白的真核重组表达质粒p Red-WIPI1,western blot检测显示Ds Red-WIPI1融合蛋白能够在PK-15细胞内表达,但不激活自噬标志分子LC3-II形成。然而,激光共聚焦分析显示,PCV2感染或自噬诱导剂Thapsigargin(Tg)及饥饿处理均能够显著促进WIPI1在细胞内形成点状聚集,并且促进Ds Red-WIPI1与EGFP-LC3的共定位。此外,荧光定量PCR结果显示,PCV2感染或Tg处理均能够显著上调wipi1的m RNA水平。本研究在稳定表达EGFP-LC3的PK-15细胞中建立了基于WIPI1蛋白的细胞自噬检测方法,该方法可以用于深入探索相关病毒感染诱导细胞自噬及其机制。 展开更多
关键词 wipi1 自噬标记 猪圆环病毒2型
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自噬相关WIPI1基因在结肠癌细胞中的表达及功能
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作者 鱼军 马苏 +6 位作者 何仲瑾 孙为 曹华梁 范亚莉 李娜苗 张莹莹 黎一鸣 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第12期2055-2060,共6页
目的:探讨细胞自噬相关WIPI1基因在结肠癌组织中的表达及其与结肠癌细胞功能之间的关系。方法:RT-PCR技术检测WIPI1基因在HCT116、SW60、RKO细胞中的表达。利用针对WIPI1基因的shRNA慢病毒感染人低分化结肠癌RKO细胞株,应用Celigo法检测... 目的:探讨细胞自噬相关WIPI1基因在结肠癌组织中的表达及其与结肠癌细胞功能之间的关系。方法:RT-PCR技术检测WIPI1基因在HCT116、SW60、RKO细胞中的表达。利用针对WIPI1基因的shRNA慢病毒感染人低分化结肠癌RKO细胞株,应用Celigo法检测WIPI1敲减对细胞增殖能力的影响;FACS检测WIPI1敲减对细胞周期阻滞能力的影响;Casepase3/7检测WIPI1基因敲减对细胞凋亡的影响;抗体芯片技术检测其可能影响的信号通路。结果:RT-PCR结果证实WIPI1基因在三株结肠癌细胞中表达丰度均为高表达。在基因沉默后,与对照组相比较,RKO细胞增殖受到显著抑制(P<0.05),且凋亡细胞数显著增加(P<0.05),细胞周期阻滞于S期;抗体芯片技术显示:细胞内信号通路中Stat3,Akt(Ser473),mTOR,p38,GSK-3β等相关分子显著下调。结论:沉默细胞自噬相关WIPI1基因对结肠癌细胞起到一定的抑制作用。 展开更多
关键词 wipi1基因 结肠癌 细胞自噬
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自噬基因WIPI2在人肝细胞癌索拉非尼耐药细胞株Huh7-SR中的表达及意义 被引量:1
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作者 陈灿金 叶在秉 +3 位作者 阮煜 童洪飞 倪仲琳 赵亚新 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2020年第3期164-168,174,共6页
目的探讨自噬基因WIPI2在人肝细胞癌索拉非尼耐药细胞株Huh7-SR中的表达及意义。方法以人肝细胞癌Huh7细胞为亲本细胞,采用药物浓度梯度法建立人肝细胞癌索拉非尼耐药细胞株Huh7-SR;用蛋白质印迹法(Western blotting)检测WIPI2蛋白在Huh... 目的探讨自噬基因WIPI2在人肝细胞癌索拉非尼耐药细胞株Huh7-SR中的表达及意义。方法以人肝细胞癌Huh7细胞为亲本细胞,采用药物浓度梯度法建立人肝细胞癌索拉非尼耐药细胞株Huh7-SR;用蛋白质印迹法(Western blotting)检测WIPI2蛋白在Huh7细胞与Huh7-SR细胞中的表达情况;用siRNA转染法敲低Huh7-SR细胞中的WIPI2基因表达,用平板克隆实验检测Huh7-SR细胞对索拉非尼的敏感性改变。结果 WIPI2蛋白在耐药株Huh7-SR细胞中为高表达[蛋白相对表达值为(2.18±0.23)],明显高于其在Huh7细胞中的表达水平(1.02±0.07),二者差异具有统计学意义(P<0.05);在si-WIPI2转染后的Huh7-SR细胞中WIPI2蛋白表达水平降低(0.44±0.03),而si-NC转染后的Huh7-SR细胞中WIPI2蛋白仍为高表达(1.21±0.08);在索拉非尼的作用下,Huh7-SR的si-WIPI2转染组的细胞克隆数为(60±4)个,较si-NC转染组的细胞克隆数[(102±3)个]明显减少(P<0.05)。结论自噬基因WIPI2在人肝细胞癌耐药株Huh7-SR中的高表达对其耐药形成具有重要作用,敲低自噬基因WIPI2可恢复Huh7-SR细胞对索拉非尼的敏感性,这表明WIPI2有望成为肝细胞癌治疗的新的分子靶点。 展开更多
关键词 肝肿瘤 索拉非尼耐药性 wipi2基因 自噬
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WIPI2在经典自噬和非经典自噬中的作用 被引量:1
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作者 许银丰 万伟 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第27期3698-3706,共9页
细胞自噬是真核生物特有的依赖溶酶体的细胞内降解途径,通过清除蛋白聚集体、受损细胞器和入侵病原体等细胞内容物,维持细胞内环境稳定.WIPI蛋白是在哺乳动物细胞中鉴定的与细胞自噬密切相关的一类蛋白家族.其中,WIPI2主要调控自噬前体... 细胞自噬是真核生物特有的依赖溶酶体的细胞内降解途径,通过清除蛋白聚集体、受损细胞器和入侵病原体等细胞内容物,维持细胞内环境稳定.WIPI蛋白是在哺乳动物细胞中鉴定的与细胞自噬密切相关的一类蛋白家族.其中,WIPI2主要调控自噬前体的延伸过程,是直接参与自噬小体形成的少数必需蛋白之一.WIPI2可通过多种不同的作用方式行使功能.近年来的研究发现,除了营养剥夺诱导的经典自噬,WIPI2对于病毒感染诱导的非经典自噬同样必不可少.而且,在不同类型的自噬途径中,不同的细胞内外刺激信号可通过调控WIPI2的蛋白稳定性或者WIPI2与自噬前体的亲和力,影响细胞内的自噬水平,帮助细胞更好地应对内外环境的改变.值得一提的是,WIPI2的功能缺失突变与一类引起发育障碍的人类遗传病相关.本文主要围绕WIPI2在经典自噬和非经典自噬中的作用方式与调控机制,综述近年来的研究进展. 展开更多
关键词 wipi2 经典自噬 非经典自噬 自噬小体 自噬前体
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苦参碱诱导肝癌HepG2细胞自噬的作用与机制 被引量:10
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作者 何星星 余伟 +1 位作者 姚树坤 谢步善 《南昌大学学报(医学版)》 CAS 2018年第2期1-4,36,共5页
目的探讨苦参碱对肝癌HepG2细胞自噬的作用,进一步研究苦参碱诱导HepG2细胞自噬的机制。方法将0.0(对照组)、0.4、0.8、1.6g·L^(-1)苦参碱及0.4g·L~(^(-1))苦参碱+10mmol·L^(-1)自噬特异抑制剂(3-MA)分别作用于肝癌HepG... 目的探讨苦参碱对肝癌HepG2细胞自噬的作用,进一步研究苦参碱诱导HepG2细胞自噬的机制。方法将0.0(对照组)、0.4、0.8、1.6g·L^(-1)苦参碱及0.4g·L~(^(-1))苦参碱+10mmol·L^(-1)自噬特异抑制剂(3-MA)分别作用于肝癌HepG2细胞,构建体外模型。采用免疫印迹法(Western blotting)检测自噬基因LC3-Ⅱ的表达,实时荧光定量PCR(Realtime-PCR)检测自噬基因WIPI1的表达,Annexin V FITC-PI流式细胞术检测HepG2细胞凋亡率,电镜观察HepG2细胞自噬体变化与凋亡情况。结果 0.4、0.8、1.6g·L^(-1)苦参碱作用的HepG2细胞LC3-Ⅱ表达相比对照组均显著增加(P<0.05),其中0.4g·L^(-1)苦参碱作用的HepG2细胞LC3-Ⅱ表达水平最高;0.4g·L^(-1)苦参碱作用的HepG2细胞自噬体、WIPI1mRNA表达水平较对照组明显增加(P<0.05)。0.4g·L^(-1)苦参碱联合3-MA作用的HepG2细胞凋亡率较单纯0.4g·L^(-1)苦参碱作用的凋亡率显著增加(P<0.05)。结论苦参碱诱导HepG2自噬且减少细胞凋亡,与WIPI1的表达相关。自噬抑制剂可抑制苦参碱诱导的自噬,促进肝癌细胞凋亡,二者联合可成为临床治疗肝癌的新措施。 展开更多
关键词 苦参碱 肝癌HEPG2细胞 自噬基因 wipi1 LC3-Ⅱ 凋亡
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潮流先驱 三星SPH-X9600
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《数字通信》 2004年第17期21-21,共1页
关键词 三星公司 SPH-X9600 手机 技术规格 3D游戏 wipi标准 镜面功能 自拍状态
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Inducible expression pattern of rice Bowman-Birk inhibitorgene OsWIP1-2 and its protease inhibitory activity 被引量:7
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作者 CHENJun LIUJing GUOLei QULijia CHENZhangliang GUHongya 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2004年第9期895-899,共5页
The WIP1-2 gene was cloned from rice. It be-longs to the Bowman-Birk inhibitor gene family. Northern blot showed that expression of this gene was induced by wounding and jasmonic acid (JA). It indicates that the OsWIP... The WIP1-2 gene was cloned from rice. It be-longs to the Bowman-Birk inhibitor gene family. Northern blot showed that expression of this gene was induced by wounding and jasmonic acid (JA). It indicates that the OsWIP1 gene plays an important role in the rice defense sys-tem. The OsWIP1-2 was cloned into pET28a and expressed in E. coli. Its expressed product was purified in the form of fusion protein and tested for the inhibitory activities against trypsin and chymotrypsin. It was found that the fusion pro-tein could inhibit chymotrypsin, but not trypsin. It was also found that the His tag at its C-terminal affected its inhibitory activity significantly. The fusion protein with a natural C-terminal had the inhibitory activity, while no inhibitory activity was detected in the fusion protein with a (His)6-tag at its C-terminal. This implies that extra amino acid residues at the C-terminal of OsWIP1-2 may interfere with its correct folding. The inhibitory assay indicated that the members of rice Bowman-Birk inhibitor gene family probably differenti-ated both in their structure and function. 展开更多
关键词 诱导表达 水稻 创伤诱导 蛋白酶抑制剂 wipi 茉莉酸
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