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泡桐WPR基因家族鉴定及其对丛枝植原体的响应
1
作者
常梦悦
曹喜兵
+1 位作者
赵振利
范国强
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2022年第3期312-319,共8页
为研究WPR基因家族在泡桐丛枝病叶片黄化中的作用,在泡桐全基因组水平上,采用生物信息学方法对WPR基因家族成员进行鉴定、进化分析、染色体定位、共线性、基因结构、蛋白性质、顺式作用元件和表达量的研究。结果表明,白花泡桐基因组中...
为研究WPR基因家族在泡桐丛枝病叶片黄化中的作用,在泡桐全基因组水平上,采用生物信息学方法对WPR基因家族成员进行鉴定、进化分析、染色体定位、共线性、基因结构、蛋白性质、顺式作用元件和表达量的研究。结果表明,白花泡桐基因组中共存在16个WPR基因,分布在9条染色体上,其中,12个基因具有种内共线性,9个基因与拟南芥具有共线性;所有WPR家族成员均含光响应、防御响应及激素响应元件。通过对植原体侵染后的转录组和互作蛋白分析,发现PfWEB3、PfWPRb2、PfWPRb3和PfPMI2可能与丛枝植原体侵染后泡桐叶片黄化有关。
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关键词
白花泡桐
wpr基因
家族进化
植原体
全
基因
组
染色体定位
生物信息学
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题名
泡桐WPR基因家族鉴定及其对丛枝植原体的响应
1
作者
常梦悦
曹喜兵
赵振利
范国强
机构
河南农业大学泡桐研究所
出处
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2022年第3期312-319,共8页
基金
中原学者科学家工作室建设专项(豫科[2018]185)。
文摘
为研究WPR基因家族在泡桐丛枝病叶片黄化中的作用,在泡桐全基因组水平上,采用生物信息学方法对WPR基因家族成员进行鉴定、进化分析、染色体定位、共线性、基因结构、蛋白性质、顺式作用元件和表达量的研究。结果表明,白花泡桐基因组中共存在16个WPR基因,分布在9条染色体上,其中,12个基因具有种内共线性,9个基因与拟南芥具有共线性;所有WPR家族成员均含光响应、防御响应及激素响应元件。通过对植原体侵染后的转录组和互作蛋白分析,发现PfWEB3、PfWPRb2、PfWPRb3和PfPMI2可能与丛枝植原体侵染后泡桐叶片黄化有关。
关键词
白花泡桐
wpr基因
家族进化
植原体
全
基因
组
染色体定位
生物信息学
Keywords
Paulownia fortunei
wpr
gene
family evolution
phytoplasma
genome-wide
chromosome localization
bioinformatics
分类号
S763 [农业科学—森林保护学]
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作者
出处
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1
泡桐WPR基因家族鉴定及其对丛枝植原体的响应
常梦悦
曹喜兵
赵振利
范国强
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2022
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