平邑甜茶MhWRKY15基因cDNA克隆及其生物信息学分析

以平邑甜茶为材料,通过RT-PCR和RACE技术,获得平邑甜茶WRKY15基因的全长cDNA,命名为Mh-WRKY15(GenBank登陆号:GU576874)。生物信息学分析表明,该基因全长1 091 bp,包含810 bp的完整开放读码框,编码269个氨基酸,属于WRKY类转录因子的第II组,为WRKY15家族成员;其编码蛋白为可溶性蛋白,分子式为C1263H1941N365O425S12,相对分子量为29 423.2 ku,理论等电点为5.30;含有一个WRKY保守结构域,定位于细胞核,存在磷酸化、N糖基化和O糖基化位点,其二级结构主要以无规则卷曲为主。

中间锦鸡儿WRKY15基因克隆及其生物信息学分析

WRKY家族是高等植物中最大的转录因子家族之一,参与多种生物与非生物胁迫过程的调节。本研究采用PCR技术从中间锦鸡儿(Caragana intermedia)中克隆了CiWRKY15基因。结合生物信息学方法对CiWRKY15基因编码的蛋白质进行理化性质、亚细胞定位、蛋白结构以及系统进化等进行预测分析。结果显示:CiWRKY15基因序列包含1005bp开放阅读框,编码335个氨基酸,含有一个典型的WRKY结构域,属于Group IId亚族。预测蛋白分子量为47.39KD,等电点为8.59,它的亚细胞定位于细胞核内。该研究结果为进一步挖掘与非生物胁迫相关的WRKY15转录因子的功能,以及为改进植物抗生物和非生物逆境的特性提供了理论依据。