猪WTAP基因的生物信息学分析

本试验通过生物信息学方法对猪WTAP基因进行分析,分析的内容包括开放阅读框、理化性质、亲水性/疏水性、蛋白质二级结构、磷酸化位点和N-糖基化位点等内容。结果表明,猪WTAP基因编码178个氨基酸,等电点5.54,不稳定指数59.85,为不稳定蛋白;亲疏水平均值-1.207,属于亲水蛋白;二级结构以无规则卷曲为主,含有25个α螺旋、28个延伸链、125个无规则卷曲,49个潜在的磷酸化位点,2个N-糖基化位点。

WTAP基因DNA甲基化与广西汉族儿童乙肝疫苗低/无应答水平的关联性

目的探讨WTAP基因DNA甲基化与广西汉族儿童乙肝疫苗(HepB)应答水平的关联性,以期了解其他可能影响乙肝疫苗应答水平的遗传因素,为新型HepB的研发提供新的科学依据。方法选取在2016年1月至12月间至广西3家医院就诊的8~9月龄且全程接种HepB的263名汉族儿童作为研究对象。对研究对象进行乙肝两对半检测,根据排除和纳入标准筛选符合要求的研究对象纳入本次研究。根据乙肝表面抗体浓度(抗-HBs)将研究对象分成无应答(<10 mIU/mL)、低应答(10 mIU/mL≤抗-HBs<100 mIU/mL)、正常应答(100 mIU/mL≤抗-HBs<1000 mIU/mL)和高应答(≥1000 mIU/mL)组,使用非匹配病例对照研究的方法,将抗-HBs<100 mIU/mL作为无/低应答组,≥100 mIU/mL作为正常/高应答组。采用Panel多重PCR技术、重亚硫酸盐转化技术和通过illumina平台进行高通量测序技术,分析研究WTAP基因38个CpG位点DNA甲基化与HepB免疫应答水平的关系。结果经Mann-Whitney U检验比较无/低应答组和正常/高应答组WTAP基因的DNA甲基化水平后发现,无/低应答组WTAP_2基因43位点DNA甲基化水平低于正常/高应答组DNA甲基化水平(P<0.05)。非条件Logistics回归分析结果显示,WTAP_2基因的43位点DNA甲基化水平和HepB应答水平存在关联性(OR=0.73,95%CI:0.538~0.995),43位点DNA低甲基化水平降低了HepB低/无应答的风险。结论WTAP_2基因的43位点的DNA低甲基化水平可能是广西汉族儿童HepB免疫低/无应答水平的保护因素,可为提高HepB低/无应答人群提高疫苗应答水平提供理论性参考依据。