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题名利用正交设计优化黄瓜的SSR-PCR反应体系
被引量:21
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作者
李亚利
陈书霞
孟焕文
程智慧
柴丹丹
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机构
西北农林科技大学园艺学院
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出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期280-284,共5页
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基金
西安市科技攻关项目(GG06091)
西北农林科技大学育种专项项目(05YZ025-1)
国家"十一五"科技支撑计划项目(2006BAD01A7-5-05)
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文摘
以白皮黄瓜B-2-2为试材,采用正交设计L16(45)在4个水平上对影响黄瓜SSR-PCR反应体系的Taq酶浓度、Mg^2+含量、模板DNA用量、dNTP浓度及引物用量等5个因素进行了试验优化,并用单因素完全随机试验筛选各反应因素的最佳水平,建立了黄瓜SSR-PCR反应的最佳体系。结果表明:在20μL反应体系中,Taq酶最适浓度为0.5U,Mg^2+最适浓度为2.0 mmol/L,模板DNA最适用量为5 ng/μL,dNTP最适用量为0.2 mmol/L,引物最适浓度为0.6μmol/L;引物最佳退火温度为50.0℃。利用20个黄瓜材料验证此反应体系,6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果显示,扩增产物在100-300 bp之间多态性高,且反应体系的稳定性和重复性好。
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关键词
白黄瓜
ssr-pcr
体系优化
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Keywords
white skin cucumber,ssr-pcr,reaction system optimization
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分类号
S642.2
[农业科学—蔬菜学]
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