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PIK3CD基因突变致PI3K-δ过度活化综合征1例报告并文献复习 被引量:6
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作者 郑静 肖阳阳 +1 位作者 刘利群 李杏芳 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期301-303,共3页
目的了解PI3K-δ过度活化综合征的临床特征及致病基因。方法回顾分析1例PI3K-δ过度活化综合征患儿的临床资料。结果患儿,男,3岁10个月,反复呼吸道感染,肝脾肿大,发育落后。提取患儿及父母外周血DNA,通过全外显子组测序及Sanger验证,证... 目的了解PI3K-δ过度活化综合征的临床特征及致病基因。方法回顾分析1例PI3K-δ过度活化综合征患儿的临床资料。结果患儿,男,3岁10个月,反复呼吸道感染,肝脾肿大,发育落后。提取患儿及父母外周血DNA,通过全外显子组测序及Sanger验证,证实患儿PIK3CD基因存在错义变异c.3061G>A(E1021K),先证者父母PIK3CD基因均未发现上述变异,为新生变异。该突变使PIK3CD基因发生功能获得性突变,导致编码的p110δ活性增强,PI3K-PIP3-AKT-mTOR信号通路过度激活,诱导细胞分化增殖,致疾病发生,为致病性突变。结论 PI 3 K-δ过度活化综合征为罕见的常染色体显性遗传免疫缺陷病,基因检测可协助诊断。 展开更多
关键词 PI3K-δ过度活化综合征 全外显子组测序法 基因突变
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原发性纤毛运动障碍患者外显子组测序阴性后的遗传诊断思路
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作者 李奕璇 何苗 +1 位作者 郑海霞 刘雅萍 《罕见病研究》 2024年第3期368-374,共7页
原发性纤毛运动障碍(PCD)是一种罕见的单基因遗传病,主要与动纤毛结构和功能障碍有关,多呈常染色体隐性遗传。该疾病会累及多个器官,并且患者的临床表型与遗传异质性为其诊断带来了极大的困难。尽管临床上外显子组测序的使用大大提高了... 原发性纤毛运动障碍(PCD)是一种罕见的单基因遗传病,主要与动纤毛结构和功能障碍有关,多呈常染色体隐性遗传。该疾病会累及多个器官,并且患者的临床表型与遗传异质性为其诊断带来了极大的困难。尽管临床上外显子组测序的使用大大提高了PCD的诊断率,但仍有约30%以上的患者未能得到有效的诊断。本文对PCD的发病机制、诊断方法及外显子组测序阴性后的诊断思路和新兴遗传检测技术进行综述和探讨,以期帮助临床医师进一步选择更多的新兴遗传检测方法,从而提高PCD的阳性诊断率,并提高临床医师对其遗传致病机制的深刻理解,为将来实践基因治疗奠定基础。 展开更多
关键词 原发性纤毛运动障碍 外显子组测序 新兴遗传检测技术 基因诊断率
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系统胎儿超声联合全外显子测序技术诊断胎儿四肢骨骼发育异常的价值 被引量:2
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作者 徐一鸣 付晗 苏丹 《中国计划生育学杂志》 2022年第12期2835-2839,共5页
目的:探究系统胎儿超声检查联合全外显子测序(WES)对染色体微阵列(CMA)分析正常,但四肢骨骼发育异常胎儿产前诊断价值。方法:选择2021年3月-2022年1月本院产前妊娠11^(+1)~13^(+6)周时超声提示胎儿颈项透明层(NT)≥3.5mm,行G显带染色体... 目的:探究系统胎儿超声检查联合全外显子测序(WES)对染色体微阵列(CMA)分析正常,但四肢骨骼发育异常胎儿产前诊断价值。方法:选择2021年3月-2022年1月本院产前妊娠11^(+1)~13^(+6)周时超声提示胎儿颈项透明层(NT)≥3.5mm,行G显带染色体核型分析(KA)、CMA未见明显异常进行WES检测孕妇76例,孕16~18周行系统胎儿超声检查,收集其CMA检测、妊娠结局等资料,分析系统胎儿超声检查联合WES在胎儿四肢体骨骼发育异常中的诊断价值。结果:系统胎儿超声检测结果显示,14例(18.4%)骨骼结构畸形,包括5例多指、3例并趾、3例桡骨短小、2例缺趾、1例足内翻,均终止妊娠且引产证实骨骼系统和肢体异常。WES检出阳性(检出致病性或可能致病性的基因变异)15例(19.7%),以成骨发育不全和软骨发育不全最为常见。以上突变经过Sanger测序予以验证,其中8例胎儿为常染色体显性遗传,突变来源均为新发突变,主要涉及到COL1A1、COL1A2、FGFR3基因;4例胎儿为常染色体隐性遗传,突变来源为父亲或者母亲,3例胎儿突变来源不明。15例胎儿中12例在妊娠16~18周超声发现四肢骨骼异常,3例未发现其他异常,其中13例引产终止妊娠,2例继续妊娠(1例出生后足内翻、1例随访到6月龄发现矮小症);61例WES阴性胎儿中,2例系统超声显示骨骼畸形,59例妊娠16~18周及中晚期超声检测均未发现异常,其中1例终止妊娠,余58例继续妊娠直到分娩,随访至6月龄四肢骨骼生长发育均正常。结论:胎儿系统超声联合胎儿WES技术,可对染色体正常但四肢骨骼发育异常的胎儿进行有效产前诊断,减少孕妇等待时间。 展开更多
关键词 胎儿四肢体骨骼发育异常 系统胎儿超声检查 全外显子测序技术
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3例SUN5基因变异导致无头精子症的遗传学分析和助孕治疗结局
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作者 冯科 倪菁菁 +6 位作者 夏彦清 曲晓伟 张慧娟 万锋 洪锴 张翠莲 郭海彬 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期803-807,共5页
畸形精子症是男性不育的常见原因之一[1],其中无头精子症(acephalic spermatozoa syndrome,ASS)是一种严重导致男性不育的罕见畸形精子症,其特征是精液中含有无头精子尾部和一些松散的精子头部,主要表现为头颈部连接处异常[2-3],精子在... 畸形精子症是男性不育的常见原因之一[1],其中无头精子症(acephalic spermatozoa syndrome,ASS)是一种严重导致男性不育的罕见畸形精子症,其特征是精液中含有无头精子尾部和一些松散的精子头部,主要表现为头颈部连接处异常[2-3],精子在电子显微镜下通常显示精子头部和尾部之间缺少植入窝和基板[4]。ASS有2种亚型:一种类型表现为没有细胞核的小“针头样”精子,另一种类型是头颈部错误连接的精子[3,5]。 展开更多
关键词 无头精子症 SUN5基因 全外显子组测序 基因变异 辅助生殖技术
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染色体核型联合染色体微阵列分析序贯全外显子组测序在胎儿先天性心脏病产前诊断中的应用 被引量:2
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作者 王培 宛杨 +1 位作者 吕嬿 戚庆炜 《发育医学电子杂志》 2023年第5期331-337,F0002,共8页
目的探讨染色体核型分析联合染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)序贯全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)策略在胎儿先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)产前遗传学诊断中的应用。方法纳入阜阳市... 目的探讨染色体核型分析联合染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)序贯全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)策略在胎儿先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)产前遗传学诊断中的应用。方法纳入阜阳市人民医院2019年1月1日至2022年12月31日经产前超声诊断胎儿CHD的患儿64例,分为单一心脏结构畸形组(Ⅰ组)7例;复杂先心组(Ⅱ组)41例;心内合并心外畸形组(Ⅲ组)16例。所有病例均送检染色体核型分析和CMA,当检测结果不能提供有诊断意义的临床信息时,序贯行WES。回顾性分析3组病例的超声表现、产前诊断结果和妊娠结局。结果64例胎儿CHD中,遗传学异常的总检出率为25.0%(16/64)。单一心脏结构畸形组、复杂先心组和心内合并心外畸形组的检出率分别为57.1%(4/7)、12.2%(5/41)和43.8%(7/16)。染色体核型分析、CMA和WES的检出率分别为12.5%(8/64)、7.8%(5/64)和4.7%(3/64)。结论产前超声发现的胎儿CHD,均应进行染色体核型联合CMA的标准产前遗传学诊断,对于结果为阴性的患儿,序贯行WES检测,以全面评估CHD的遗传学病因。 展开更多
关键词 先天性心脏病 产前诊断 染色体微阵列技术 全外显子组测序 染色体核型分析
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Unexpected metastasis of intraductal papillary neoplasm of the bile duct without an invasive component to the brain and lungs:A case report 被引量:6
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作者 Nguyen Hai Nam Kojiro Taura +7 位作者 Masashi Kanai Keita Fukuyama Norimitsu Uza Hirona Maeda Yojiro Yutaka Toyofumi F Chen-Yoshikawa Manabu Muto Shinji Uemoto 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2020年第3期366-374,共9页
BACKGROUND Despite an expanding number of studies on intraductal papillary neoplasm of the bile duct(IPNB),distant metastasis remains unexplained especially in cases of carcinoma in situ.In the present study,we report... BACKGROUND Despite an expanding number of studies on intraductal papillary neoplasm of the bile duct(IPNB),distant metastasis remains unexplained especially in cases of carcinoma in situ.In the present study,we report a rare and interesting case of IPNB without invasive components that later metastasized to lungs and brain.CASE SUMMARY A 69-year-old male was referred to our hospital due to suspected cholangiocarcinoma.Laboratory tests on admission reported a mild elevation of alkaline phosphatase,γ-glutamyl transpeptidase,and total bilirubin in serum.Endoscopic retrograde cholangiography revealed a filling defect in the common bile duct(CBD)extending to the left hepatic duct.Peroral cholangioscopy delineated a tumor in the CBD that had a papillary pattern.Multidetector computed tomography and magnetic resonance cholangiopancreatography detected partial blockage ot interlude in the CBD leading to cholestasis without evidence of metastasis.Therefore,a diagnosis of IPNB cT1N0M0 was established.Left hepatectomy with bile duct reconstruction was performed.Pathological examination confirmed an intraepithelial neoplasia pattern without an invasive component and an R0 resection achievement.The patient was monitored carefully by regular examinations.However,at 32 mo after the operation,a 26 mm tumor in the lungs and a 12 mm lesion in the brain were detected following a suspicious elevated CA 19-9 level.Video-assisted thoracoscopic surgery of left upper lobectomy and stereotactic radiotherapy are indicated.In addition to histopathological results,a genomic profiling analysis using whole exome sequencing subsequently confirmed lung metastasis originating from bile duct cancer.CONCLUSION This case highlights the important role of genomic profiling analysis using whole exome sequencing in identifying the origin of metastasis in patients with IPNB. 展开更多
关键词 Intraductal papillary neoplasm of the bile duct Distant metastasis Invasive component Whole exome sequencing CA 19-9 Case report
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体外受精胚胎移植婴儿先天性聋临床和基因检测分析
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作者 胡民强 谭东辉 +7 位作者 杨曙 朱倩晨 赖若沙 谢华平 邓健航 邓忠 谢鼎华 伍伟景 《中华耳科学杂志》 CSCD 北大核心 2023年第2期205-210,共6页
目的通过对体外受精胚胎移植(in vitro fertilization and embryo transfer,IVF-ET)技术生育的先天性聋婴儿家庭的患儿及其父母进行基因检测和遗传学分析,从遗传学角度探讨其致聋病因,为预防辅助生殖技术生育听觉缺陷婴儿提供借鉴。方... 目的通过对体外受精胚胎移植(in vitro fertilization and embryo transfer,IVF-ET)技术生育的先天性聋婴儿家庭的患儿及其父母进行基因检测和遗传学分析,从遗传学角度探讨其致聋病因,为预防辅助生殖技术生育听觉缺陷婴儿提供借鉴。方法对三组通过IVF-ET技术生育出先天性聋患儿家庭进行病史和遗传学调查,同时对出生婴儿及其父母进行耳科和全身检查,听力学评估,并通过全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)对三组家庭11名成员进行耳聋基因检测和Sanger测序验证所携带耳聋致病基因及突变位点。结果三组家庭通过IVF-ET技术生育5名新生儿,共发生4例先天性感音神经性聋。父母及家族中其他成员均无耳聋表现。WES和Sanger测序结果显示,在三组家庭聋儿及其父母中共发现4种与耳聋相关的基因突变。家庭1突变基因为MYO3A:NM_017433:exon32:c.4462A>G:p.K1488E;MYO15A:NM_016239:exon4:c.3693-2A>G,MYO15A:NM_016239:exon22:c.5638G>A:p.G1880R,该MYO15A基因2个新的突变位点过去未见报道。家庭2突变基因为SLC26A4:NM_000441:exon10:c.1229C>T:p.T410M,SLC26A4:NM_000441:exon19:c.2168A>G:p.H723R。家庭3突变基因为TPO:NM_175721:exon13:c.2404C>T:p.R802W,TPO:NM_175721:exon14:c.2515C>T:p.P839S。结论三组家庭先天性聋患儿均发现已知的耳聋基因突变,其父母携带相同的突变基因,符合遗传规律,其先天性聋与遗传因素有很大相关性。MYO15A基因2个新突变位点的致病性尚待进一步研究。结果提示在应用辅助生育技术时全面耳聋基因筛查的必要性。 展开更多
关键词 先天性聋 感音神经性聋 辅助生殖技术 体外受精胚胎移植 全外显子组测序
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基因解读系统中遗传检测报告自动生成技术 被引量:1
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作者 张少伟 蒋艳凰 《计算机应用与软件》 北大核心 2021年第2期37-42,92,共7页
人工出具遗传检测报告过程繁琐,工作量大。为了提高遗传检测分析的效率,通过对HTML模板进行编辑与格式转换,实现Linux系统下遗传检测报告的自动生成。基于GTX.Digest基因解读系统的分析结果、医生对致病性的判定结果、生物医学领域的权... 人工出具遗传检测报告过程繁琐,工作量大。为了提高遗传检测分析的效率,通过对HTML模板进行编辑与格式转换,实现Linux系统下遗传检测报告的自动生成。基于GTX.Digest基因解读系统的分析结果、医生对致病性的判定结果、生物医学领域的权威数据库,设计基于文献相关性、影响因子可信度的文献排序算法。通过实验验证,该算法的排序结果符合人工排序规则,满足使用需求。该报告自动生成技术提高了GTX.Digest系统的易用性,极大地减轻了医疗工作者的工作量。 展开更多
关键词 全外显子测序 基因解读 文献排序算法 自动生成技术
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锌指基因家族与乳腺癌转移的相关性研究
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作者 袁南贵 罗雪平 《江西中医药大学学报》 2017年第3期47-48,56,共3页
目的:用全外显子测序技术筛选与乳腺癌转移的相关基因;方法:通过外显子测序技术对1例转移性乳腺癌的原发肿瘤组织及转移组织分别进行全外显子测序。结果:发现杂合性缺失涉及的基因最多的是19号染色体,统计发现位于该区域的锌指基因家族... 目的:用全外显子测序技术筛选与乳腺癌转移的相关基因;方法:通过外显子测序技术对1例转移性乳腺癌的原发肿瘤组织及转移组织分别进行全外显子测序。结果:发现杂合性缺失涉及的基因最多的是19号染色体,统计发现位于该区域的锌指基因家族的杂合性缺失发生率最高,涉及基因26个,主要集中在19p13及19q13上。结论:19号染色体上锌指基因家族的的杂合性缺失可能与乳腺癌的转移密切相关。 展开更多
关键词 锌指基因家族 乳腺癌转移基因 杂合性缺失 全外显子测序技术
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眼皮肤白化病Ⅲ型TYRP1基因的新突变
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作者 邢玉莹 郑利雄 +7 位作者 任利成 孙兆军 卢军 张江林 李青 周荣华 阳芳 董文武 《中国皮肤性病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1203-1207,共5页
目的对1例临床疑似白化病的患者进行遗传学分析,明确致病基因。方法收集患者临床资料,提取患者及其父母外周血DNA,使用全外显子组高通量测序技术筛查患者致病基因。对患者及其父母的变异位点进行Sanger测序验证,并对变异位点的致病性进... 目的对1例临床疑似白化病的患者进行遗传学分析,明确致病基因。方法收集患者临床资料,提取患者及其父母外周血DNA,使用全外显子组高通量测序技术筛查患者致病基因。对患者及其父母的变异位点进行Sanger测序验证,并对变异位点的致病性进行分析预测。结果全外显子测序结果发现,患者TYRP1基因存在c.1057_1060del(p.N353Vfs*31)和c.1210C>T(p.H404Y)复合杂合突变,分别遗传自其母亲和父亲,符合眼皮肤白化病Ⅲ型(OCA3)常染色体隐性遗传模式,且生物信息学预测分别为致病和可能致病变异位点。结论患者为TYRP1基因的复合杂合突变引起的OCA3,该复合变异导致的OCA3病例在国内外尚未见文献报道,其中变异位点c.1210C>T(p.H404Y)为全球首报。 展开更多
关键词 眼皮肤白化病Ⅲ型 TYRP1基因 基因突变 全外显子测序技术
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全外显子组测序技术在新生儿遗传病诊断中的应用 被引量:5
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作者 魏豪(综述) 颜景斌(审校) 《国际儿科学杂志》 2021年第1期9-13,共5页
新生儿期的遗传病往往具有临床症状不典型、病情较为严重等特点,从而造成诊断和治疗的困难。随着测序技术的不断发展,第二代测序技术以其高通量、低成本、快速化检测等优势逐渐应用于临床领域。全外显子组测序(whole exome sequencing,W... 新生儿期的遗传病往往具有临床症状不典型、病情较为严重等特点,从而造成诊断和治疗的困难。随着测序技术的不断发展,第二代测序技术以其高通量、低成本、快速化检测等优势逐渐应用于临床领域。全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)技术作为第二代测序技术的一种,仅对基因组外显子区域进行序列捕获、富集并测序,再利用生物信息学手段对WES产生的大量数据进行分析和筛选,从而找到遗传病的变异基因或位点。WES技术因其具有检查结果提示全面和报告周期短的优势,逐渐成为新生儿遗传病分子诊断的重要手段。 展开更多
关键词 全外显子组测序技术 新生儿 遗传病诊断
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PATL2基因复合杂合突变致卵母细胞成熟障碍一例
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作者 雷庆华 李九凤 +1 位作者 周贤琼 张巍 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2022年第7期759-762,共4页
目的探讨1例辅助生殖技术助孕反复失败的原发性不孕症患者的遗传学病因。方法采集患者及其丈夫的外周血样本,提取基因组DNA,应用临床外显子测序技术进行遗传学病因联合分析,Sanger测序方法对变异进行验证。结果患者检测到PATL2基因的复... 目的探讨1例辅助生殖技术助孕反复失败的原发性不孕症患者的遗传学病因。方法采集患者及其丈夫的外周血样本,提取基因组DNA,应用临床外显子测序技术进行遗传学病因联合分析,Sanger测序方法对变异进行验证。结果患者检测到PATL2基因的复合杂合突变c.223-14_223-2del和c.1369G>T(p.G457*),变异分别遗传自其父亲和母亲(均为杂合子),诊断为卵母细胞成熟缺陷4型。结论PATL2基因突变引起卵母细胞成熟障碍可导致原发性不孕症的发生,且c.1369G>T(p.G457*)为新型罕见致病变异,扩大了该基因的致病变异谱。 展开更多
关键词 卵母细胞成熟障碍 PATL2基因 辅助生殖 全外显子测序
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