内江猪与伍隍猪类缘关系的血红素结合蛋白(Hp)、血红蛋白(Hb)多态性研究

采用聚丙烯酰胺凝胶垂直平板电泳法对内江猪、伍隍猪及其对照荣昌猪、杜洛克猪的Hp血清型和Hb进行分型研究,检出了HP^1、HP^2、HP^3三个等位基因控制的6种基因型和4种变异型,根据基因频率计算出四种类群的标准遗传距离并按最短距离法聚类,伍隍猪与内江猪遗传距离最近为0.00203、伍隍猪与荣昌猪为0.00333,伍隍猪与杜洛克最远为0.00850。显示伍隍猪与内江猪有紧密的类缘关系。在HP基因型种类分布上,伍隍猪为4+4种,即存在1—1~F、1—3~F、1~F—3和3—3~F等四种基因型的变异型,而内江猪为5+1种,只有1—3一种变异型存在,揭示两者除同一性外存在一定差异性。卡方检验表明,伍隍猪基因型分布偏离Hardy—Weinberg平衡规律,HP^1—1纯合子频度偏低HP^1—2偏高是失衡的主因,对此进行了讨论,四类群猪Hb均无多态性。

伍隍猪和内江猪拷贝数变异差异与嘴型全基因组关联分析

【目的】探究伍隍猪与内江猪群体之间全基因组拷贝数变异(CNV)差异,并寻找影响伍隍猪嘴型性状的候选基因。【方法】基于50K SNP芯片数据,使用PennCNV和R-Gada检测131头伍隍猪与156头内江猪全基因组拷贝数变异差异,并通过全基因组关联分析(GWAS)筛选伍隍猪嘴型性状候选基因。【结果】伍隍猪的平均嘴长[(11.12±2.78)cm]显著长于内江猪[(5.04±1.26)cm,P<0.05]。伍隍猪相较于内江猪缺失型CNV增加;获得型CNV减少。拷贝数变异区域注释后的差异基因主要富集在破骨细胞分化、能量代谢、神经退行性病变等通路。GWAS分析共得到11个基因与嘴型相关。【结论】通过检测伍隍猪与内江猪群体间拷贝数变异差异,鉴定到GORASP2、CWC22、TMEM64为嘴长表型的候选基因,为后续伍隍猪遗传资源的鉴定提供新证据。

内江猪、伍隍猪生化遗传及细胞遗传的研究:Ⅰ血清乳酸脱氢酶同工酶的分离测定

采用聚丙烯酰胺凝胶盘状电泳法,在完全相同条件下,分别测定了三月龄和六月龄的内江猪、伍隍猪的血清乳酸脱氢酶(LDH)同工酶,并与相应月龄的体尺、体重等进行分析。结果表明:内江猪和伍隍猪血清LDH同工酶表现出五条正常酶带。由正极到负板依次为LDH_1,LDH_2,LDH_3,LDH_4,LDH_5。三月龄时,内江猪和伍隍猪血清LDH同工酶活力均值(％)的顺序是LDH_1>LDH_5>LDH_3>LDH_4>LDH_2,组间差异不显著(P>0.05)。六月龄时,两组LDH同工酶活力均值(％)顺序为LDH_1>LDH_5>LDH_4>LDH_3>LDH_3,组间差异也不显著(P>0.05)。内江猪的LDH同工酶三月龄与六月龄相比无显著差异(P>0.05)。而伍隍猪的LDH_2在三月龄时极显著的高于六月龄(P<0.01),其余差异不显著。血清LDH同工酶与体尺体重等的关系,在内江猪与伍隍猪之间和三月龄与六月龄之间均未发现什么规律性。