目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨黄药子-夏枯草-五味子治疗亚急性甲状腺炎(subacute thyroiditis,SAT)的作用机制。方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and a...目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨黄药子-夏枯草-五味子治疗亚急性甲状腺炎(subacute thyroiditis,SAT)的作用机制。方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选黄药子-夏枯草-五味子的有效成分及作用靶点;利用人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、人类基因数据库(GeneCards)及DrugBank获取SAT相关靶点;运用venny 2.1.0软件取黄药子-夏枯草-五味子有效成分相关靶点与SAT疾病靶点的交集,即为黄药子-夏枯草-五味子治疗SAT的潜在作用靶点;在STRING数据库中获得潜在靶点蛋白相互作用关系,使用Cytoscape 3.7.2进行可视化,并进行拓扑分析筛选黄药子-夏枯草-五味子治疗SAT的关键靶点;通过Metascape数据库对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,并利用Cytoscape 3.7.2构建“关键成分-潜在靶点-通路-疾病”网络;选取度值排名前3位的关键靶点和有效成分作为受体蛋白和配体小分子,使用AutoDockTools 1.5.6对配体和受体进行分子对接,并使用Pymol将分子对接结果可视化。结果:共筛选到28个有效成分及220个有效成分相关靶点;获得SAT相关靶点826个,潜在作用靶点103个;拓扑分析发现19种关键成分和42个潜在关键靶点;GO富集分析筛选出6 448个条目,涉及生物过程5 374个,细胞组成407个,分子功能667个;KEGG通路富集分析得到438条通路;分子对接发现受体与配体之间结合良好。结论:黄药子-夏枯草-五味子可能通过多成分、多靶点调节肿瘤坏死因子信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、甲状腺激素信号通路等发挥治疗亚急性甲状腺炎的作用。展开更多
文摘目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨黄药子-夏枯草-五味子治疗亚急性甲状腺炎(subacute thyroiditis,SAT)的作用机制。方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选黄药子-夏枯草-五味子的有效成分及作用靶点;利用人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、人类基因数据库(GeneCards)及DrugBank获取SAT相关靶点;运用venny 2.1.0软件取黄药子-夏枯草-五味子有效成分相关靶点与SAT疾病靶点的交集,即为黄药子-夏枯草-五味子治疗SAT的潜在作用靶点;在STRING数据库中获得潜在靶点蛋白相互作用关系,使用Cytoscape 3.7.2进行可视化,并进行拓扑分析筛选黄药子-夏枯草-五味子治疗SAT的关键靶点;通过Metascape数据库对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,并利用Cytoscape 3.7.2构建“关键成分-潜在靶点-通路-疾病”网络;选取度值排名前3位的关键靶点和有效成分作为受体蛋白和配体小分子,使用AutoDockTools 1.5.6对配体和受体进行分子对接,并使用Pymol将分子对接结果可视化。结果:共筛选到28个有效成分及220个有效成分相关靶点;获得SAT相关靶点826个,潜在作用靶点103个;拓扑分析发现19种关键成分和42个潜在关键靶点;GO富集分析筛选出6 448个条目,涉及生物过程5 374个,细胞组成407个,分子功能667个;KEGG通路富集分析得到438条通路;分子对接发现受体与配体之间结合良好。结论:黄药子-夏枯草-五味子可能通过多成分、多靶点调节肿瘤坏死因子信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、甲状腺激素信号通路等发挥治疗亚急性甲状腺炎的作用。