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九个X染色体短串联重复基因座复合扩增体系的建立及遗传多态性 被引量:2
1
作者 刘秋玲 吕德坚 赵虎 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期664-669,共6页
目的发掘更多多态性高的X染色体短串联重复(Xehromsommeshorttandemrepeats,X—STR)基因座,以解决法医学实践中的特殊案例。方法建立一组四色荧光复合扩增体系,同时检测DXS7133,DXS981,DXS7424,DX$6789,DXS7132,GATA165812,D... 目的发掘更多多态性高的X染色体短串联重复(Xehromsommeshorttandemrepeats,X—STR)基因座,以解决法医学实践中的特殊案例。方法建立一组四色荧光复合扩增体系,同时检测DXS7133,DXS981,DXS7424,DX$6789,DXS7132,GATA165812,DXS101,GATA31E08和DXS10011共9个X—STR基因座,采用ABIPRISM3100遗传分析仪电泳和GeneMapperID3.1软件进行基因分型。结果用此体系检测华南地区363个无关个体(251名男性,112名女性),9个基因座共检出111个等位基因,女性个体识别率为0.5837~0.9959;三联体非父排除率为0.4072~0.9511;多态性信息含量为0.4481~0.9531。结论本体系中的基因座多态性高,高多态性的XSTR基因座复合扩增体系能为解决特殊的亲权鉴定案提供快速鉴定技术,是常染色体STR、YSTR等鉴定方法的良好补充,在法医学实践和临床产前诊断中将有较好的实用价值。 展开更多
关键词 x染色体短串联重复 荧光复合扩增 亲权鉴定 遗传多态性
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36个X-STR基因座在汉族人群中的遗传多态性荟萃分析
2
作者 张俊涛 杨幸怡 +3 位作者 陈晓晖 徐曲毅 韩晓龙 刘超 《刑事技术》 2024年第3期279-283,共5页
通过对选取的16篇文献中中国汉族群体的X-STR基因座相关参数(汉族群体来源包括广东、上海、云南、河南、北京、贵州、四川、海南、河北,检测试剂盒有Argus X12、Goldeneye 17X、AGCU X19、Microreader X19、Typer X19,等位基因频率大多... 通过对选取的16篇文献中中国汉族群体的X-STR基因座相关参数(汉族群体来源包括广东、上海、云南、河南、北京、贵州、四川、海南、河北,检测试剂盒有Argus X12、Goldeneye 17X、AGCU X19、Microreader X19、Typer X19,等位基因频率大多基于百人份)进行荟萃分析,获取36个X-STR基因座(DXS6807、DXS9895、DXS10148、DXS10135、DXS8378、DXS9902、DXS6795、DXS6810、DXS10159、DXS10162、DXS10164、DXS7132、DXS10079、DXS10074、DXS10075、DXS981、DXS6800、DXS6803、DXS6809、DXS6789、DXS7424、DXS101、DXS7133、GATA172D05、GATA165B12、DXS10103、HPRTB、DXS10101、GATA31E08、DXS8377、DXS10134、DXS7423、DXS9907、DXS10146、DXS6797、DXS6804)在中国汉族人群中基于超1000个无关个体的等位基因频率,为涉及的X-STR亲缘关系鉴定似然率计算提供频率数据。通过荟萃分析发现16篇文献涉及汉族无关个体共8767人,36个X-STR基因座共572个等位基因,其中29个基因座的等位基因数目在基于超1000个无关个体计算后都有不同程度增加,DXS10135、DXS10134、DXS10148、DXS10079的等位基因数目增加均超5个。荟萃分析后获得的中国汉族群体36个X-STR基因座等位基因类型更齐全、等位基因频率更准确,可作为X-STR检验中计算亲缘关系似然率等参数的重要参考。 展开更多
关键词 x染色体短串联重复序列(x-STR) 等位基因频率 中国汉族 荟萃分析
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5个X-STR基因座荧光复合扩增体系的建立及法医学应用 被引量:4
3
作者 刘秋玲 吕德坚 +3 位作者 孙宏钰 陆惠玲 伍祥林 伍新尧 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1459-1462,共4页
为了发掘更多多态性高的X染色体短串联重复(X-STR)基因座,以解决法医学实践中的特殊案例,建立了一组荧光复合扩增体系,同时检测DXS6803、DXS981、DXS6809、DXS6789和DXS7132 5个X-STR基因座,并用ABI PRISM 3100作毛细管电泳和GeneMapper... 为了发掘更多多态性高的X染色体短串联重复(X-STR)基因座,以解决法医学实践中的特殊案例,建立了一组荧光复合扩增体系,同时检测DXS6803、DXS981、DXS6809、DXS6789和DXS7132 5个X-STR基因座,并用ABI PRISM 3100作毛细管电泳和GeneMapper ID 3.1软件进行基因分型,结果清晰,灵敏度高,重复性好。最低检出限为0.25 ng,10~20 ng模板DNA能得到最佳结果,在实际检案中能得到满意结果。实验表明,本体系能为用X-STR基因座解决特殊的亲权鉴定案提供快速鉴定技术,是常染色体STR、Y-STR等鉴定方法的良好补充,在法医学实践中有较好的实用价值。 展开更多
关键词 x染色体短串联重复(x-STR) 荧光复合扩增 亲权鉴定 法医学应用
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4个X-STR基因座复合扩增体系的建立及应用
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作者 白洁 刘华 +5 位作者 李惠芬 陈庆 张庆霞 苏芹 唐晖 刘雅诚 《第四军医大学学报》 北大核心 2009年第20期2053-2056,共4页
目的:建立DXS9902,DXS7130,DXS9898及DXS9895等4个X染色体特异性短串联重复(X-chromosomespecific short tandem repeat,X-STR)基因座的复合扩增体系,调查其多态性并探讨在法医学实践中的应用.方法:复合扩增DXS9902,DXS7130,DXS9898及DX... 目的:建立DXS9902,DXS7130,DXS9898及DXS9895等4个X染色体特异性短串联重复(X-chromosomespecific short tandem repeat,X-STR)基因座的复合扩增体系,调查其多态性并探讨在法医学实践中的应用.方法:复合扩增DXS9902,DXS7130,DXS9898及DXS98954个基因座,ABI PRISM3100进行毛细管电泳检测,Genescan及Genetyper软件进行检测结果分析及等位基因分型.结果:在中国北方汉族200名无关男性个体及200名无关女性个体中,4个基因座分别发现了6,12,8,6个等位基因.结论:这4个基因座的复合扩增系统有较高的多态性信息,在个体识别和亲权鉴定中有较好的实用价值. 展开更多
关键词 x染色体短串联重复 荧光复合扩增 遗传多态性 法医学应用
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19个X-STR基因座在中国3个民族的遗传学调查及法医学应用 被引量:6
5
作者 刘亚举 龙飞 +2 位作者 李瑾 岳俊涛 石美森 《基础医学与临床》 CSCD 2018年第7期913-921,共9页
目的用Microreader^(TM) 19X ID System试剂盒调查19个X染色体短串联重复序列(X-STR)基因座在中国汉族、仡佬族、苗族人群中的遗传学数据,评估其法医学应用价值。方法采集汉(308名)、仡佬(398名)和苗(323名)族无关个体外周血样DNA进行PC... 目的用Microreader^(TM) 19X ID System试剂盒调查19个X染色体短串联重复序列(X-STR)基因座在中国汉族、仡佬族、苗族人群中的遗传学数据,评估其法医学应用价值。方法采集汉(308名)、仡佬(398名)和苗(323名)族无关个体外周血样DNA进行PCR扩增,3500XL遗传分析仪电泳分析,Gene Mapper ID-X分析等位基因片段大小。统计分析19个X-STR基因座的等位基因频率和群体遗传学参数,对3个民族之间的分布差异进行分析,并与其他地区已有人群数据进行比较。结果经Bonferroni修正,19个X-STR基因座基因型分布在3个民族群体中符合Hardy-Weinberg平衡定律;基因座之间不存在连锁不平衡现象。这19个X-STR基因座在女性群体的累积个人识别率均大于0.999 999 999 99,在男性群体的累积个人识别率均大于0.999 999 999 94,在三联体中的累积非父排除率均大于0.999 999 999 36,在二联体中的累积非父排除率均大于0.999 999 52。通过Arlequin v3.5软件计算P值,不同人群间X-STR基因座的频率分布差异呈显著性。结论这19个X-STR基因座在中国汉族、仡佬族和苗族人群中具有较高的多态性,能达到较高的个体识别能力,可以作为现有STR检验体系的补充。 展开更多
关键词 x染色体短串联重复序列 遗传多态现象 汉族 仡佬族 苗族
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19个X-STR基因座在河南汉族人群中的遗传多态性 被引量:1
6
作者 张晓芳 杨幸怡 +4 位作者 陈玲 刘长晖 李双琳 曾滢 刘超 《中国司法鉴定》 2021年第6期62-67,共6页
目的调查河南汉族人群中19个X染色体短串联重复序列(X-chromosome short tandem repeat,X-STR)基因座的遗传多态性,评估其在法医学应用中的价值。方法选取河南汉族人群519名无关个体口腔拭子DNA模板,使用AGCU X19 STR荧光检测体系(DXS7... 目的调查河南汉族人群中19个X染色体短串联重复序列(X-chromosome short tandem repeat,X-STR)基因座的遗传多态性,评估其在法医学应用中的价值。方法选取河南汉族人群519名无关个体口腔拭子DNA模板,使用AGCU X19 STR荧光检测体系(DXS7423、DXS10148、DXS8378、DXS10162、DXS7132、DXS10079、DXS10103、DXS10101、HPTRB、DXS10074和DXS10135、DXS10159、DXS10164、DXS10075、DXS6809、DXS6789、DXS7424、DXS101和DXS10134)进行电泳检测。结果19个X-STR基因座中除了DXS10134外,其余基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(Bonferroni校正P>0.0002=0.05/233),519个河南汉族无关个体共检出219个等位基因,频率为0.0013~0.6130。19个基因座的观察杂合度(Ho)为0.5537~0.9228,理论杂合度(He)为0.5428~0.9252,多态信息含量(PIC)为0.4541~0.9189。结论19个X-STR基因座在河南汉族人群中具有较高的遗传多态性,可满足法医学实际应用,在复杂亲缘关系鉴定和疑难混合检材的法医实践中有特殊的应用价值。 展开更多
关键词 法医遗传学 x染色体短串联重复序列 遗传多态性 遗传关系
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内蒙古地区四个民族九个X短串联重复序列位点的多态性研究
7
作者 李晓钟 通木尔 +5 位作者 欧拉 张冉 荣辽江 侯巧芳 余兵 李生斌 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期89-92,共4页
目的研究内蒙古地区蒙古族、鄂温克族、鄂伦春族、达斡尔族民族x染色体遗传结构及其变化规律,了解9个位点的法医学、群体遗传学应用价值及4个民族间的亲属关系。方法以9个X短串联重复序列(short tandem repeats, X-STR) 位点(DXS67... 目的研究内蒙古地区蒙古族、鄂温克族、鄂伦春族、达斡尔族民族x染色体遗传结构及其变化规律,了解9个位点的法医学、群体遗传学应用价值及4个民族间的亲属关系。方法以9个X短串联重复序列(short tandem repeats, X-STR) 位点(DXS6789, DXS101, DXS8378, DXS7132, DXS7133, DXS7423,DXS6804, DXS6799 和HPRTB)作为遗传标记,通过等位基因频率、杂合度、多态信息量等遗传学指标,以及不同群体之间的差异性比较、遗传距离分析和聚类分析,调查内蒙古地区4个主要少数民族群体遗传结构及其变化规律。结果这9个位点在民族间分布具有不同特点,多数具有中等程度多态性,可作为法医学和人类遗传学分析标记。遗传距离和聚类分析显示蒙古族与西安汉族、鄂伦春族与达斡尔族之间具有较近的遗传关系,该结果接近实际语系关系、文化特点及历史记载。结论研究表明,这9个X—SIR位点不仅可用于法医人类学,同时也可用于群体种系关系的研究。 展开更多
关键词 x染色体短串联重复序列 遗传多态性 遗传距离 聚类分析
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19个X-STR荧光复合扩增体系的法医学应用评估
8
作者 林添春 杨幸怡 +3 位作者 熊晨 李奥成 孙宏钰 刘超 《新医学》 CAS 2021年第11期846-851,共6页
目的评估含有19个X染色体-短串联重复序列(X-STR)的复合扩增体系在法医学中的应用效果。方法参照DNA分析方法科学工作组(SWGDAM)的验证指南,评估了含有19个X-STR的复合扩增体系的种属特异性、灵敏度、抗抑制剂、精确性、可重复性、一致... 目的评估含有19个X染色体-短串联重复序列(X-STR)的复合扩增体系在法医学中的应用效果。方法参照DNA分析方法科学工作组(SWGDAM)的验证指南,评估了含有19个X-STR的复合扩增体系的种属特异性、灵敏度、抗抑制剂、精确性、可重复性、一致性、在混合样本与陈旧样本中的检测效果及Stutter峰和群体多态性。结果 DNA模板量在0.25~1.00ng时,各基因座分型结果清晰准确,均衡性好、特异性强,混合、陈旧样本均能获得正确的分型结果;检测中国南方汉族共196份无关个体血样,19个X-STR遗传标记共检出151个等位基因,基因频率为0.0037~0.8439,其中多态性信息量最为丰富的基因座是DXS10135(多肽性信息含量=0.9173),个体识别能力在男、女性群体中分别为0.9124、0.9894;累积个体识别能力在男性群体中大于0.999 999 999 874,在女性群体中大于0.999 999 999 999;在三联体案件中的累积平均排除概率大于0.999 999 999 298,在二联体中的累积平均排除概率大于0.999 999 500 495。结论含有19个X-STR的复合扩增体系分型准确、稳定,满足法医学实践的要求,获得的基因频率等参数可为X-STR检验提供数据支撑。 展开更多
关键词 x染色体-串联重复序列 荧光复合扩增 法医遗传学 验证
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X-STR体系在特殊亲子鉴定案中的应用1例 被引量:8
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作者 刘秋玲 吕德坚 +5 位作者 张建苗 赖运科 陆惠玲 陈勇 陈维红 赵虎 《中国法医学杂志》 CSCD 北大核心 2011年第2期147-148,共2页
亲权鉴定的法医物证检验,一般的三联体(父亲.母亲一小孩)和二联体(父亲或母亲-小孩)能用常染色STR解决。当常染包STR发生1个或2个基因座违反盂德尔遗传规律,计算PI值〉10000、W值〉0.9999时,提示这些违反孟德尔遗传规律的基因... 亲权鉴定的法医物证检验,一般的三联体(父亲.母亲一小孩)和二联体(父亲或母亲-小孩)能用常染色STR解决。当常染包STR发生1个或2个基因座违反盂德尔遗传规律,计算PI值〉10000、W值〉0.9999时,提示这些违反孟德尔遗传规律的基因座是由于突变造成的。然而,当检测足够多的常染色STR基因座仍仅发现1个或2个基因座违反孟德尔遗传规律但其w值〈0.9999时,此时可能需要检验性染色STR来协助确定。 展开更多
关键词 法医物证学 x染色体短串联重复(x-STR) 荧光复合扩增 亲权鉴定 突变
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Genetic polymorphism analyses of a novel panel of 19 X-STR loci in the Chinese Uygur ethnic minority
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作者 Yu-xin GUO Jian-gang CHEN +11 位作者 Yan WANG Jiang-wei YAN Jing CHEN Tian-hua YAO Li-ping ZHANG Guang YANG Hao-tian MENG Yu-dang ZHANG Ting MEI Yao-shun LIU Qian DONG Bo-feng ZHU 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2016年第5期367-374,共8页
The population genetic data and forensic parameters of 19 X-chromosome short tandem repeat (X-STR) loci in Chinese Uygur ethnic minority are presented. These loci were detected in a sample of 233 (94 males and 139 ... The population genetic data and forensic parameters of 19 X-chromosome short tandem repeat (X-STR) loci in Chinese Uygur ethnic minority are presented. These loci were detected in a sample of 233 (94 males and 139 females) unrelated healthy individuals. We observed 238 alleles at the 19 X-STR loci, with the corresponding gene frequencies spanning the range from 0.0021 to 0.5644. After Bonferroni correction (P〉0.0026), there were no signif- icant deviations from Hardy-Weinberg equilibrium. The cumulative power of discrimination in females and males, and the probability of exclusion of the 19 X-STR loci were 0.999 999 999 999 999 999 998 091,0.999 999 999 999 966, and 0.999 999 986 35, respectively. The cumulative mean exclusion chance was 0.999 999 992 849 in deficiency cases, 0.999 999 999 999 628 in normal trios, and 0.999 999 998 722 in duo cases. The high value of the forensic parameters mentioned above revealed that the novel panel of 19 loci had important values for forensic applications in the LJygur group. 展开更多
关键词 x-CHROMOSOME Short tandem repeat (STR) UYGUR Genetic polymorphism Forensic
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