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我国首次分离的辛德毕斯病毒(XJ-160病毒株)全基因组核苷酸序列测定 被引量:16
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作者 李蕾 梁国栋 +5 位作者 周国林 李富胜 付士红 何海怀 金奇 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期102-105,共4页
对我国首次分离的辛德毕斯病毒XJ 16 0病毒株全基因组核苷酸序列进行测定 ,阐明该病毒基因组与国外株的差异 ,了解其分子致病机理。测序结果显示 ,XJ 16 0病毒全基因组除 5′末端帽子结构和 3′末端多聚腺苷酸尾外共 116 2 6个核苷酸 ,... 对我国首次分离的辛德毕斯病毒XJ 16 0病毒株全基因组核苷酸序列进行测定 ,阐明该病毒基因组与国外株的差异 ,了解其分子致病机理。测序结果显示 ,XJ 16 0病毒全基因组除 5′末端帽子结构和 3′末端多聚腺苷酸尾外共 116 2 6个核苷酸 ,编码 3731个氨基酸。非结构基因的编码区长 746 4核苷酸 (6 0nt~ 75 2 3nt) ,编码 2 486氨基酸 ,翻译成四种非结构蛋白 (nonstructuralprotein ,nsp1 4)。结构基因长 3738核苷酸 (75 6 8~ 1130 6 ) ,编码 12 45个氨基酸 ,翻译成三种结构蛋白和两个小分子肽 (capsid ,E1- 3、6k)。病毒基因组 5′末端和 3′末端及结构基因和非结构基因之间分别有 5 9个核苷酸、45个核苷酸和 32 3个核苷酸的非编码区。核苷酸序列分析表明 ,XJ 16 0病毒具备典型的甲病毒属辛德毕斯病毒基因组特征 ,与标准辛德毕斯病毒AR339病毒株相比 ,核苷酸序列存在 18%差异 ,氨基酸差异为 8%。这是我国完成的第一株辛德毕斯病毒全基因组序列测定 ,序列已输入国际基因库 (GenBankAF10 372 8)。 展开更多
关键词 辛德毕期病毒 甲病毒 基因组 核苷酸序列
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中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160病毒株感染性全基因组cDNA克隆的构建与分析 被引量:10
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作者 杨益良 梁国栋 +6 位作者 付士红 何海怀 李晓宇 邓娟 苏乃伦 王力华 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期173-180,共8页
报告了中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160株的感染性全基因组cDNA克隆的构建与鉴定.利用RT-PCR方法获得覆盖病毒全长基因组的cDNA片段,以低拷贝质粒pBR322作为骨架,将基因组cDNA置于SP6 RNA聚合酶启动子之后,基因组3'末端带有35个... 报告了中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160株的感染性全基因组cDNA克隆的构建与鉴定.利用RT-PCR方法获得覆盖病毒全长基因组的cDNA片段,以低拷贝质粒pBR322作为骨架,将基因组cDNA置于SP6 RNA聚合酶启动子之后,基因组3'末端带有35个连续的A,通过DNA重组技术组装成病毒基因组全长cDNA克隆.该克隆可在大肠杆菌DH5a中稳定扩增.经体外转录,RNA转录体转染BHK-21细胞,细胞发生病变,恢复病毒滴度达到107~108pFU/ml.全基因组cDNA克隆构建过程中引入的沉默突变(8 453位核苷酸由C变为T)产生Xba Ⅰ酶切位点作为遗传标记,在子代恢复病毒的基因组中稳定存在.从细胞病变的特征、BHK-21细胞的空斑形态、病毒的抗原性、病毒在细胞中的生长动力学特征以及对乳鼠的致病性等方面比较,恢复病毒和亲本病毒XJ-160没有显著区别,提示获得了具有感染性的XJ-160病毒全长cDNA克隆.该病毒感染性全基因组cDNA克隆可以作为反向遗传学系统,为进一步研究病毒复制和致病机制,以及开发相应的载体表达系统提供分子生物学工具. 展开更多
关键词 感染性全基因组cDNA克隆 恢复病毒 辛德毕斯病毒 xj-160病毒株 中国 分离
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XJ-160病毒为辛德毕斯病毒新亚型 被引量:13
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作者 李蕾 梁国栋 +5 位作者 李富胜 周国林 付士红 何海怀 金奇 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期106-110,共5页
XJ 16 0病毒是我国首次分离的辛德毕斯病毒 ,在对其全基因组核苷酸序列测定的基础上 ,对病毒基因组序列、病毒同源性和病毒系统进化等进行了较为详细的分析 ,结果表明 :XJ 16 0病毒具有典型的甲病毒属辛德毕斯病毒的序列特征。该病毒nsp... XJ 16 0病毒是我国首次分离的辛德毕斯病毒 ,在对其全基因组核苷酸序列测定的基础上 ,对病毒基因组序列、病毒同源性和病毒系统进化等进行了较为详细的分析 ,结果表明 :XJ 16 0病毒具有典型的甲病毒属辛德毕斯病毒的序列特征。该病毒nsp3蛋白基因中有 11处缺失及两处插入 (45 17~ 5 485 ) ,涉及 90个核苷酸。核苷酸序列的系统进化分析表明 ,XJ 16 0病毒属于辛德毕斯病毒欧洲 /非洲亚组。病毒全基因组核苷酸序列进化分析显示 ,XJ 16 0病毒是一株新的甲病毒或辛德毕斯病毒的新亚型。 展开更多
关键词 xj-160病毒 辛德毕斯病毒 甲病毒 新亚型
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XJ-160病毒复制子型表达载体的构建 被引量:6
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作者 杨益良 梁国栋 +3 位作者 付士红 苏乃伦 邓娟 侯云德 《中国病毒学》 CSCD 2003年第3期221-226,共6页
XJ-160病毒是我国首次分离的辛德毕斯病毒,全基因组测序已经完成。本文利用该病毒全基因序列首先构建了全基因组cDNA克隆质粒,在此基础上,利用基因重组技术将病毒结构基因序列替换为含有多个单酶切位点的序列,得到复制子表达载体质粒pRe... XJ-160病毒是我国首次分离的辛德毕斯病毒,全基因组测序已经完成。本文利用该病毒全基因序列首先构建了全基因组cDNA克隆质粒,在此基础上,利用基因重组技术将病毒结构基因序列替换为含有多个单酶切位点的序列,得到复制子表达载体质粒pRepxj160。为验证载体的功能,将报告基因绿色荧光蛋白(EGFP)和β-半乳糖苷酶基因(lacZ)分别插入到载体的多克隆位点,得到两个表达质粒;经体外转录获得的转录体RNA转染BHK-21细胞后14h,可检测到报告基因的表达。结果表明我们构建的XJ-160病毒复制子型表达载体具有自主复制功能,可以表达异源基因。本研究为进一步开发具有我国自主知识产权的甲病毒载体奠定了基础。 展开更多
关键词 xj-160病毒 复制子型表达载体 构建 辛德毕斯病毒
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我国分离的XJ-160病毒全基因组克隆的构建 被引量:1
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作者 何海怀 杨益良 +4 位作者 付士红 李蕾 周国林 吕新军 梁国栋 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期161-165,共5页
XJ 160 virus was isolated in 1990 from Xinjiang, China. The biological characteristics of XJ 160 virus suggested that it might be a Togavirus. The serological tests showed that XJ 160 virus is a Sindbis like virus. Th... XJ 160 virus was isolated in 1990 from Xinjiang, China. The biological characteristics of XJ 160 virus suggested that it might be a Togavirus. The serological tests showed that XJ 160 virus is a Sindbis like virus. The complete 11626 base nucleotide sequence of XJ 160 has been determined recently. It is necessary to establish a reverse genetic system for rescue of XJ 160 virus from its cDNA clone. We describe here the constructon of full length cDNA clone of XJ 160 virus. The total RNA were extracted from BHK cells infected with XJ 160 virus. Specific primers were used to amplify five fragments covering the whole genome of XJ 160 virus. All of these five fragments have the restriction enzyme sites at both termini to be assembled into the full length cDNA clone. The five PCR fragments were cloned into pGEM T vector. The clones with SP6 inserted direction were selected for subsequent manipulation. After a series of plasmid manipulation, the full length cDNA clone of XJ 160 virus was assembled into pBluescript vector. The restriction enzyme assay and sequencing analysis demonstrated that the whole genome of XJ 160 virus was correctly assembled into pBluescript vector, with added SP6 promoter in 5′ terminus and poly A in its 3′ terminus. 展开更多
关键词 xj-160病毒 辛德毕斯病毒 全基因克隆
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RNAi抑制XJ-160病毒复制的研究 被引量:3
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作者 邓娟 杨益良 +3 位作者 付士红 王力华 金冬雁 梁国栋 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期496-500,共5页
目的通过建立RNA干扰(RNAinterference,RNAi)抑制XJ160病毒复制的模型,在序列特异性、位置效应和量效关系等方面,探讨RNAi对XJ160病毒复制的影响,为进一步研究RNAi的抗病毒作用和机制奠定基础。方法按照siRNA(shortinterferencingRNA)... 目的通过建立RNA干扰(RNAinterference,RNAi)抑制XJ160病毒复制的模型,在序列特异性、位置效应和量效关系等方面,探讨RNAi对XJ160病毒复制的影响,为进一步研究RNAi的抗病毒作用和机制奠定基础。方法按照siRNA(shortinterferencingRNA)的设计要求合成XJ160病毒特异siRNA,脂质体法转染BHK21细胞后感染XJ160病毒,通过测定病毒滴度、蛋白表达量及XJ160病毒RNA合成研究siRNA对XJ160病毒复制的抑制。结果成功建立了RNAi抑制XJ160病毒复制的模型,探讨了RNAi抑制该病毒复制作用的特点。结论外源导入的siRNA能够抑制XJ160病毒的复制,并且这种抑制作用具有明显的序列特异性、位置效应和存在量效关系等特点;siRNA是通过降解病毒RNA实现抑制病毒复制作用的。 展开更多
关键词 病毒复制 RNAi xj-160病毒 siRNA BHK-21细胞 序列特异性 量效关系 位置效应 RNA干扰 抗病毒作用 病毒RNA 设计要求 脂质体法 病毒滴度 合成研究 抑制病毒 步研究 表达量 抑制作 模型
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nsP2-726Pro定点诱变对辛德毕斯病毒XJ-160复制子载体特性的影响
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作者 唐丽 朱武洋 +3 位作者 付士红 何英 王志玉 梁国栋 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期121-127,共7页
为观察nsP2-726Pro定点诱变对辛德毕斯病毒(Sindbis virus,SINV)XJ-160复制子载体特性的影响,以XJ-160病毒复制子载体pBRepXJ为分子基础,利用定点诱变方法分别构建突变载体pBRep-726L、pBRep-726S、pBRep-726V和pBRep-726A。将新霉素抗... 为观察nsP2-726Pro定点诱变对辛德毕斯病毒(Sindbis virus,SINV)XJ-160复制子载体特性的影响,以XJ-160病毒复制子载体pBRepXJ为分子基础,利用定点诱变方法分别构建突变载体pBRep-726L、pBRep-726S、pBRep-726V和pBRep-726A。将新霉素抗性基因(Neomycinr,Neor)克隆到pBRepXJ和各突变载体中,通过细胞培养方法观察nsP2-726Pro定点诱变对载体致细胞病变作用(Cytopathic effect,CPE)的影响;并将增强型绿色荧光蛋白(Enhanced green-fluorescent protein,EGFP)和海肾萤光素酶(Renilla Luciferase,R.luc)报告基因分别插入到各载体中,定性与定量检测定点诱变对复制子载体自主复制能力的影响。实验结果表明,突变载体pBRep-726V和pBRep-726A在BHK-21细胞中的自主复制能力高于pBRepXJ,所诱发的细胞病变进程更快。替换突变nsP2-726Pro→Leu的引入使载体在保持包装能力的同时,完全丧失在细胞上引起CPE的能力。而pBRep-726S则具有中间表型。提示nsP2-726Pro定点诱变在影响XJ-160复制子载体自主复制能力的同时,也改变了CPE的进程。这将为研究辛德毕斯病毒基因组结构与功能的关系及构建非细胞病变的甲病毒载体奠定基础。 展开更多
关键词 xj-160病毒 复制子载体 定点诱变
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