水稻白叶枯病菌无毒新基因的克隆和序列分析

从菲律宾水稻白叶枯病菌9a生理小种的代表菌株PXO339中克隆到一个新的无毒基因,全长2118bp,编码705个氨基酸,分子质量和等电点分别约为74.7ku和6.585.NCBI网站BLAST表明,该基因属于avrBs3基因家族,命名为arp3.与所有avrBs3同源基因的Alignment分析发现,arp3的5’端缺少了两个长度分别是144bp和45bp的片断,但在水稻白叶枯病菌中,arp3基因的5’端的特征很普遍.全长的arp3基因中间区域是一个特异的只有5.5次102bp的重复区,是已克隆的avrBs3基因家族中重复次数最少的一个.C-端有3个核定位信号NLSs和1个酸性转录激活域AAD.

水稻白叶枯病菌luxR同源基因的克隆和表达

luxR基因是革兰氏阴性菌感应反应(QuorumSensing,QS)LuxR/LuxI环路中起重要作用的基因.从水稻白叶枯病菌中分离到一个luxR同源基因,命名为xooR.xooR全长765bp,编码一个由254个氨基酸残基组成的转录因子,分子质量和等电点分别为28.3ku和8.72.XooR蛋白的N-端15AA-171AA是一个Autoind-bind结构域,C-端191AA-245AA是一个HTH(helix-turn-helix)结合DNA结构域.利用原核表达载体pET-24a(+)和gfp基因构建融合蛋白表达系统,Westernblot分析表明XooR-GFP融合蛋白大小为54ku,xooR基因成功地在E.coliBL21中实现了表达.