芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析

根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF／XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌（Xanthomonas campestria pv．mangiferaeindicae）中获得了约1．4kb的DNA片段。经测序和序列同源性分析表明．该基因片段长1422bp含有一个完整的LuxR同源基因，并命名为XcmR。生物信息学分析表明．XcmR基因完整ORF（开放阅读框）全长765bp，编码254个氨基酸，分子质量和等电点分别约为28．2ku和8．9，与GenBank中公布的Xanthomonas属LuxR或AhyR／AsaR氨基酸序列具有86％～99％相似性。系统聚类结果表明，XcmR与来源于柑桔溃疡病菌（X．axonopodis pv．citri）、番茄疮痂病菌（X．c．pv．vesicatoria）、水稻白叶枯菌（X．oryzae pv．oryzae）和甘蓝黑腐病菌（X．c．pv．campest如）的LuxR蛋白聚成一支。NCBI网站蛋白质保守结构域搜索表明，XcmR是LuxR蛋白家族的一员，具有LuxR蛋白相似结构。