“新塔花-丹参-降香”配伍治疗心肌缺血损伤分子机制的网络药理学和分子对接研究

(Abstract):目的通过网络药理学和分子对接技术探讨“新塔花-丹参-降香”改善心肌缺血损伤的药效物质基础和分子作用机制。方法借助TCMSP、UniProt和PubChem数据库及文献补充获得“新塔花-丹参-降香”的主要活性成分,并将与活性成分相联系的靶基因借助UniProt数据库翻译成相应基因。利用GeneCards、OMIM和TTD数据库得到疾病相关靶点,对主要活性成分与疾病靶点取交集后采用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后通过AutoDock Vina软件对关键靶点和主要活性成分进行分子对接验证。结果筛选“新塔花-丹参-降香”针对心肌缺血损伤的101个活性成分和338个潜在作用靶点。蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络拓扑分析筛选得到关键靶点白细胞介素-17(IL-17)、HIF-1、核转录因子-κB(NF-κB)、TNF等。GO功能分析发现“新塔花-丹参-降香”生物过程集中在RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控、基因表达的正向调控、凋亡过程的负调控、对外源刺激的反应等多个方面。KEGG信号富集分析显示涉及血脂与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、细胞凋亡、IL-17信号通路、前列腺癌、HIF-1信号通路、cAMP信号通路、NF-κB信号通路、mTOR信号通路等。分子对接显示活性物质与靶点蛋白之间存在较强的结合力,其中槲皮素与TNF的结合力最强。结论“新塔花-丹参-降香”配伍治疗心肌缺血损伤具有多成分、多靶点、多通路相互协同的特点,可为防治心肌缺血损伤的研究提供参考。