子宫内膜癌化疗反应相关基因的拷贝数变异分析

目的分析与子宫内膜癌化疗反应相关基因的拷贝数变异情况。方法从肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)中,获得子宫内膜癌的全基因组拷贝数变异数据和临床用药数据。分析TCGA数据库中患者的用药信息及药物反应情况,并利用GISTIC2.0软件分析患者肿瘤组织中基因组拷贝数变异情况。利用IGV软件定位拷贝数变异热点区域的关键基因,并分析热点基因的拷贝数变异情况与患者临床治疗反应间的相关性。结果截至2017年5月31日,TCGA数据库中有65例子宫内膜癌患者记录了治疗反应情况,其中49例呈完全缓解,为化疗敏感(CS)患者,2例呈部分缓解、2例呈病情稳定及12例呈病情进展,此3类患者合称化疗抵抗(CR)患者。进一步分析发现,22q12.2和Xp11.23区段特异性在CR患者肿瘤组织中扩增,1q44区段是CR患者肿瘤组织特异性缺失区段。其中22q12.2区段的扩增中心是白血病抑制因子(LIF)的编码基因,Xp11.23区段的扩增中心是果蝇Porcupine基因同源基因(PORCN)和依莫帕米结合蛋白(EBP)编码基因,1q44区段的缺失中心是驱动蛋白家族成员26B(KIF26B)的编码基因。此外,LIF的扩增和PORCN/EBP的扩增与患者发生化疗抵抗相关(P<0.05),但是KIF26B的缺失与化疗抵抗不相关(P>0.05)。结论子宫内膜癌组织中22q12.2区段(LIF)和Xp11.23区段(PORCN/EBP)的扩增及1q44区段(KIF26B)的缺失可能与患者化疗的抵抗相关,可以预判患者的化疗反应情况。