Xpert MTB/RIF Ultra对结核性脑膜炎的早期诊断价值

目的:评价Xpert MTB/RIF Ultra(Ultra)对结核性脑膜炎(TBM)的早期诊断价值。方法:对79例患者的临床资料进行分析,用Ultra、Xpert MTB/RIF(Xpert)、宏基因测序(mNGS)和分枝杆菌培养(MGIT)检测脑脊液(CSF)中的结核分枝杆菌。在临床诊断的基础上,分析各方法的检测性能和利福平药物敏感性。结果:Ultra的敏感度(56.4%)、曲线下面积(AUC值)和Kappa值(0.521)均高于MGIT(20%、0.600、0.236)、Xpert(40%、0.700、0.236)和mNGS(32.7%、0.664、0.352)。在31例Ultra阳性病例中,24例对利福平敏感,7例耐药性不确定。结论:与其他方法相比,Ultra检测脑脊液中结核分枝杆菌具有较高的敏感性。因此,Ultra可用于TBM的早期诊断。

Xpert MTB/RIF联合宏基因组高通量测序对菌阴肺结核的诊断价值分析

目的探讨Xpert MTB/RIF联合宏基因组高通量测序对菌阴肺结核的诊断价值。方法回顾性分析2019年12月至2022年5月诊断为菌阴肺结核的70例患者,分别进行XpertMTB/RIF检测、宏基因组高通量测序及二者联合检测。采用固体培养法和比例法对生化病原菌进行诊断并分析诊断效能。采用预测值绘制受试者操作特征曲线。结果Xpert MTB/RIF诊断阳性率75.57%,阴性率21.43%;宏基因组高通量测序诊断阳性率78.57%,阴性率21.43%;联合诊断阳性率88.57%,阴性率11.43%。Xpert MTB/RIF检测敏感度为77.55%、特异性为59.86%,曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.827;宏基因组高通量测序检测敏感度为77.47%、特异性为61.02%,AUC为0.808;联合检测敏感度为89.75%、特异性为89.57%,AUC为0.925。结果显示Xpert MTB/RIF联合宏基因组高通量测序在菌阴肺结核中诊断的敏感度、特异性均高于单一检测(P<0.05)。结论XpertMTB/RIF联合宏基因组高通量测序在菌阴肺结核诊断中具有较好的应用价值,值得临床推广使用。

支气管肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF检测在肺结核早期诊断中的应用价值

目的分析支气管肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF检测在肺结核早期诊断中的应用价值。方法选取我院2022年3月至2023年3月收治的96例疑似肺结核患者为研究对象,所有研究对象入组后均采集痰液、支气管肺泡灌洗液、浆膜腔积液标本,再分别进行Xpert MTB/RIF检测。以X线胸片、免疫检查(结核菌素皮肤试验或γ干扰素释放试验)等为金标准,比较三种标本Xpert MTB/RIF检测对肺结核的诊断效能。结果96例疑似肺结核患者中,经金标准检出肺结核89例,非肺结核7例。痰液与浆膜腔积液标本Xpert MTB/RIF检测对肺结核的诊断准确度、灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值均无显著差异(P>0.05);支气管肺泡灌洗液标本的Xpert MTB/RIF检测对肺结核的诊断准确度、灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值均显著高于痰液与浆膜腔积液标本,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论在肺结核早期诊断中,开展支气管肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF检测可取得较高诊断效能。

Gene Xpert MTB/RIF技术在结核病诊断中的应用

目的探讨Gene Xpert MTB/RIF技术在结核分枝杆菌(MTB)快速检测中的应用价值。方法收集2020年1月至2022年10月在南昌市第九医院就诊的疑似结核病患者送检的314例痰样本,分别采用Gene XpertMTB/RIF技术、抗酸染色法以及液体培养法进行检测,比较3种检测方法MTB阳性检出率,并以液体培养法检测结果为“金标准”,评估Gene Xpert MTB/RIF技术对MTB的检测效能。结果314例样本经GeneXpertMTB/RIF技术、抗酸染色法和结核分枝杆菌液体培养法检测,其阳性率分别为36.94%、12.10%和36.31%,Gene Xpert MTB/RIF技术和液体培养法MTB的阳性检出率高于抗酸染色法,差异有统计学意义(P<0.05)。以液体培养法为“金标准”,GeneXpertMTB/RIF技术MTB的检测敏感度为95.61%,特异度为96.50%;抗酸染色法的检测敏感度为31.58%,特异度为99.00%;Gene Xpert MTB/RIF技术的敏感度高于抗酸染色法,差异有统计学意义(P<0.05)。经Kappa分析发现Gene Xpert MTB/RIF技术与液体培养法检测MTB的一致性好(Kappa=0.918),而抗酸染色法与液体培养法检测结果的一致性较差(Kappa=0.357)。相比抗酸染色法,Gene XpertMTB/RIF技术有更高的正确检出率,联合使用可有效降低MTB的漏检率。结论GeneXpertMTB/RIF技术在MTB检测中具有敏感度高、特异性好等特点,有较高的临床应用价值。

痰涂片镜检、基因芯片技术及GeneXpert MTB/RIF对疑似肺结核患者的检测效能分析

目的分析痰涂片镜检、基因芯片及多色巢式荧光定量聚合酶链反应(GeneXpert MTB/RIF)对疑似肺结核患者的检测效能。方法选取2017年1月至2022年12月该院收治的疑似肺结核患者97例作为研究对象,均实施痰涂片镜检、基因芯片、GeneXpert MTB/RIF及痰液罗氏培养检查。以痰液罗氏培养结果为金标准,探究不同检测方式及联合检测对疑似肺结核的诊断效能,采用Kappa值检验与金标准诊断结果的一致性。结果痰液罗氏培养检测结果显示,97例疑似肺结核患者阳性55例,阴性42例,阳性检出率为56.70%(55/97)。痰液罗氏培养检出非结核分枝杆菌18株,包括鸟分枝杆菌4株,胞内分枝杆菌9株,偶发分枝杆菌1株,堪萨斯分枝杆菌3株,海分枝杆菌1株。痰涂片镜检检出阳性34例,真阳性29例,阳性检出率为35.05%(34/97),基因芯片检出阳性41例,真阳性37例,阳性检出率为42.27%(41/97);GeneXpert MTB/RIF检出阳性44例,真阳性37例,阳性检出率为45.36%(44/97)。基因芯片、GeneXpert MTB/RIF灵敏度、准确率高于痰涂片镜检,基因芯片与GeneXpert MTB/RIF敏感度一致,但基因芯片特异度高于GeneXpert MTB/RIF。非结核分枝杆菌中,痰涂片镜检检出鸟分枝杆菌1株、胞内分枝杆菌2株,基因芯片检出胞内分枝杆菌1株,GeneXpert MTB/RIF检出鸟分枝杆菌1株。痰涂片镜检、基因芯片、GeneXpert MTB/RIF三项联合检出阳性55例,真阳性53例,三项联合检测灵敏度为96.36%(53/55)、特异度为95.24%(40/42)、准确率为95.88%(93/97),均高于单一方法检测的灵敏度与准确率,差异均有统计学意义(P<0.05)。痰涂片镜检与痰液罗氏培养一致性为68.04%(Kappa=0.59);基因芯片与痰液罗氏培养一致性为77.32%(Kappa=0.70);GeneXpert MTB/RIF与痰液罗氏培养一致性为74.23%(Kappa=0.66);三项联合与痰液罗氏培养一致性为95.88%(Kappa=0.89)。结论较GeneXpert MTB/RIF、痰涂片镜检技术,基因芯片诊断效能及一致性更高,且3种技术联合诊断效能更高,临床可根据需求选择适宜诊断技术。

支气管肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF在菌阴肺结核中应用价值

目的研究支气管肺泡灌洗液结核分枝杆菌/利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(Xpert MTB/RIF)在菌阴肺结核中应用价值。方法选取2023年1月至2023年12月在本院就诊的200例门诊和住院疑似菌阴肺结核患者纳入研究,对所有患者支气管肺泡灌洗液进行收集,分别应用分枝杆菌液体培养和药敏、Xpert MTB/RIF及抗酸染色涂片进行检测,金标准以分枝杆菌液体培养药敏试验和药敏结果为准,比较三种检测方法的特异性、阴性预测价值、敏感性及阳性预测价值,并对检测结果的诊断价值进行分析,评价Xpert MTB/RIF诊断利福平耐药的一致性。结果200例患者中,菌阴肺结核占比为84.00%,非肺结核占比为16.00%;以分枝杆菌液体培养和药敏检测作为金标准,Xpert MTB/RIF检测阳性率与其相当,无统计学意义(P>0.05),且两种检测方法阳性率均明显高于抗酸染色涂片,差异有统计学意义(P<0.05);Xpert MTB/RIF检测特异度、敏感度、准确率、阳性预测值及阴性预测值与其基本一致,差异无统计学意义(P>0.05),且两种检测方法的特异度、准确率、阴性预测值、敏感度及阳性预测值明显高于抗酸染色涂片(P<0.05)。结论支气管肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF与分枝杆菌液体培养和药敏检测具有较高一致性,且能将确定利福平是否耐药的时间控制在较短时间(2 h),为诊疗菌阴肺结核提供了思路,具有重要的临床应用价值。

Xpert MTB/RIF Ultra在儿童结核诊断中的应用价值

目的:探讨Xpert MTB/RIF Ultra在儿童结核诊断中的应用价值。方法:选取2010年1月—2022年12月山东省公共卫生临床中心收治的150例患儿作为研究对象。根据临床综合诊断确诊结果将结核病感染患儿纳入试验组(n=100),将非结核病感染患儿纳入对照组(n=50)。计算不同标本类型的敏感度、特异度、阴性预测值、阳性预测值和准确度,评价Xpert MTB/RIF Ultra检出利福平(RIF)耐药性的效能。结果:Xpert MTB/RIF Ultra的检测所有标本总敏感度为77.00%,特异度为96.00%;合并肺内标本敏感度为92.85%,特异度为96.29%,其中肺内标本中肺泡灌洗液敏感度最高为100.00%;合并肺外标本敏感度为77.55%,特异度为95.65%,其中肺外标本中淋巴结敏感度最高为100.00%。结论:不同标本类型中Xpert MTB/RIF Ultra对儿童结核的检出率差异较大,在诊断肺内结核标本时,检测肺泡灌洗液标本价值最高,在诊断肺外结核标本时,检测淋巴结标本价值最高。

半巢式实时荧光定量PCR体外诊断技术(GeneXpertMTB/RIF)检验在肺结核诊断中的应用效果分析

探讨PCR检测在肺结核诊断中的应用效果。方法 选取2023年1月-2024年1月本院653例疑似肺结核患者,所有患者分别半巢式实时荧光定量PCR体外诊断技术(GeneXpertMTB/RIF)与涂片抗酸染色检查,并与结核杆菌培养试验结果(金标准)对比,分析诊断结果。结果 GeneXpertMTB/RIF系统检查准确度、灵敏度及特异度较涂片抗酸染色检查高,而漏诊率及误诊率比涂片抗酸染色检查低(P<0.05)。结论 GeneXpertMTB/RIF系统检验在肺结核诊断中应用效果明显,不仅具有较高的诊断准确率,且可以为疾病诊断提供参考,值得采纳。

Xpert MTB/RIF技术在肺结核患者结核分枝杆菌鉴定及利福平耐药检测中的应用价值

目的分析Xpert MTB/RIF技术在结核分枝杆菌鉴定及利福平耐药性的检验效能及临床应用价值。方法收集感染科初诊疑似肺结核患者痰液样本,以临床确诊为金标准,评估涂片荧光染色法、Xpert MTB/RIF、液体培养法对结核分枝杆菌检测效能。以比例法药敏试验为金标准,评估Xpert MTB/RIF技术对结核分枝杆菌利福平耐药性检验效能。结果2019年5月至2021年5月初诊疑似肺结核患者593例,确诊肺结核141例,非结核分枝杆菌感染14例,其他肺部感染438例。593例疑似肺结核患者中,三种方法检测阳性率分别为:荧光染色法16.7%,Xpert MTB/RIF法23.4%,液体培养法23.6%。141例确诊肺结核患者中男性占比75.2%,其中涂片法敏感性为58.9%低于Xpert MTB/RIF 98.6%和液体培养法99.3%,涂片法特异性为96.46%、Xpert MTB/RIF和液体培养法特异性均为100%。Xpert MTB/RIF和液体培养法检测MTB一致性Kappa值均>0.99。以140株培养阳性结核杆菌比例法药敏试验结果为金标准,Xpert MTB/RIF法检测利福平耐药敏感性87.5%、特异性100%、准确性99.3%,与比例法药物敏感性试验结果一致性Kappa值0.93,结核杆菌利福平耐药率女性(8.6%)高于男性(4.8%)。结论临床确诊肺结核患者中Xpert MTB/RIF检测结核分枝杆菌一致性高、操作简单、敏感性与特异性好,对利福平耐药性检测与比例法比较结果符合率高。Xpert MTB/RIF可作为快速检测MTB及利福平耐药性的有效方法,并可为临床快速选择治疗方案提供参考。

γ-干扰素释放试验、Xpert MTB/RIF联合检测诊断艾滋病合并肺结核的价值分析

目的:分析γ-干扰素释放试验联合利福平耐药结核分枝杆菌实时荧光定量核酸扩增检测技术(Xpert MTB/RIF)诊断艾滋病合并肺结核的价值。方法:选取2018年1月-2021年12月苏州市第五人民医院收治的126例艾滋病疑似合并肺结核患者作为研究对象,均进行结核分枝杆菌培养、γ-干扰素释放试验与Xpert MTB/RIF检测,以结核分枝杆菌培养结果为“金标准”,比较不同诊断方式的效能。结果:结核分枝杆菌培养结果显示,126例艾滋病患者中,36例(28.57%)诊断为肺结核。联合检测诊断艾滋病合并肺结核的灵敏度、准确度、阴性预测值高于γ-干扰素释放试验、Xpert MTB/RIF单一检测,差异有统计学意义(P<0.05);γ-干扰素释放试验、Xpert MTB/RIF检测单项诊断艾滋病合并肺结核的灵敏度、准确度、阴性预测值以及三种方式诊断艾滋病合并肺结核的特异度、阳性预测值比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:γ-干扰素释放试验联合Xpert MTB/RIF诊断艾滋病合并肺结核的效果较好,可作为辅助诊断艾滋病合并肺结核的方法。

Performance of Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP)-Lateral Flow Detection and Xpert MTB/RIF Ultra for Diagnosis of Pulmonary Tuberculosis

Background: Due to the limitations of diagnosis by Xpert MTB/RIF assay, WHO suggests Loop—Mediated Isothermal Amplification (TB-LAMP) instead of sputum-smear microscopy for pulmonary TB diagnosis in patients. Dr. Thongchai Kaewphinit et al. invented a fast TB detection kit called TB d-tect (LAMP-LFD assay). There was no clinical trial to estimate the performance of TB d-tect. Objective: This study was aimed to find the performance of LFD assay and Xpert MTB/RIF ultra for pulmonary TB. Material and methods: A cross-sectional study was conducted. Suggestive pulmonary TB patients were enrolled from June 2020-28 February 2021. Respiratory specimens were collected from each patient and sent for AFB smear, LAMP-LFD assay, Xpert MTB/RIF ultra and culture TB. Result: 139 patients with suspected pulmonary TB were enrolled. 51% of patients were diagnosed with pulmonary tuberculosis. Based on culture TB as a gold standard, the sensitivity and specificity of LAMP-LFD assay were 85.4% (95% CI: 70.8% - 94.4%) and 87.8% (95% CI: 79.6 - 93.5), respectively. The sensitivity and specificity of Xpert MTB/RIF ultra were 95.1% (95% CI: 83.5% - 99.4%) and 74.5% (95% CI: 64.7 - 82.8), respectively. According to ROC curve, it was found that the areas under the curve of LAMP-LFD assay and Xpert MTB/RIF ultra were 0.866 and 0.848, respectively (p = 0.546). Conclusion: The diagnostic sensitivity and specificity of LAMP-LFD assay appeared to be comparable to those of Xpert MTB/RIF ultra. LAMP-LFD assay could be used in resource limiting laboratory.

Xpert MTB/RIF Ultra快速诊断涂阴肺结核的临床价值

目的评估超敏结核分枝杆菌和利福平耐药基因检测(XpertUltra)方案检测痰液及支气管肺泡灌洗液(BALF)标本在涂阴肺结核患者中早期、快速诊断的价值。方法选择2020年5月-2021年12月在山东省公共卫生临床中心就诊的痰涂片阴性疑似肺结核患者93例,其中临床诊断为涂阴肺结核57例,非肺结核36例。收集所有患者的痰液及BALF标本,分别采用Xpert Ultra、GeneXpert MTB/RIF(Xpert)、BACTEC MGIT 960培养(MGIT 960培养)进行检测。以临床诊断为参考标准,评价3种检测方案及相互联合检测痰液及BALF标本时诊断涂阴肺结核的敏感度、特异度及符合率。结果以临床诊断结果为参考标准,Xpert Ultra检测痰液标本对涂阴肺结核诊断的敏感度明显高于Xpert[56.14%(32/57)vs.36.84%(21/57),P=0.03]和MGIT960培养[56.14%(32/57)vs.33.33%(19/57),P=0.014];Xpert Ultra检测BALF标本对涂阴肺结核诊断的敏感度明显高于Xpert[75.44%(43/57)vs.56.14%(32/57),P=0.030]和MGIT960培养[75.44%(43/57)vs.38.60%(22/57),P<0.01]。3种检测方案及相互联合检测痰液标本诊断涂阴肺结核,受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)依次为:三者联合(0.807)>Xpert Ultra+Xpert(0.798)>Xpert Ultra+MGIT 960培养(0.789)>Xpert Ultra(0.781)>Xpert(0.684)>MGIT 960培养(0.667);检测BALF标本,AUC依次为:三者联合(0.895)=Xpert Ultra+Xpert(0.895)>XpertUltra+MGIT960培养(0.877)=XpertUltra(0.877)>Xpert(0.781)>MGIT960培养(0.693)。3种检测方案均未在入组患者中检测到利福平耐药。结论Xpert Ultra对早期、快速诊断涂阴肺结核具有较高的临床应用价值;其检测BALF的敏感度高于痰液标本,建议优先选择BALF标本。

Xpert MTB/RIF与结核分枝杆菌利福平耐药表型检测一致性分析

目的探讨Xpert MTB/RIF和表型药物敏感性试验(pDST)检测结核分枝杆菌(MTB)利福平(RFP)耐药性结果的一致性,以及产生不一致结果的原因。方法对2020年云南省耐药监测中行Xpert MTB/RIF检测的672株MTB进行比例法pDST,对2种方法结果不一致的菌株进行全基因组测序(WGS)。结果以pDST结果为标准,XpertMTB/RIF检测MTBRFP耐药的敏感性为94.44%,特异性为97.32%,阳性预测值为66.67%,阴性预测值为99.52%。672株MTB中,有19株(2.83%)Xpert MTB/RIF与pDST检测结果不一致。2株Xpert MTB/RIF显示RFP敏感,pDST显示RFP耐药菌株中,未检出耐药突变1株,检出rpoB-Ile491Phe突变1株;17株Xpert MTB/RIF显示RFP耐药,pDST显示RFP敏感菌株均发现RFP耐药相关突变。Xpert MTB/RIF与pDST检测结果不一致的19株MTB均未发现明显的异质性耐药情况。结论Xpert MTB/RIF与pDST检测MTB RFP耐药结果一致性较好。结果不一致的主要原因为pDST结果的不稳定性、部分rpoB基因突变与RFP耐药相关性差,以及少数菌株发生了Xpert MTB/RIF靶点以外的其他罕见突变。

Xpert MTB/RIF Ultra在快速检测结核分枝杆菌和利福平耐药中的应用

目的探讨Xpert MTB/RIF Ultra在快速检测结核分枝杆菌和利福平耐药中的应用价值。方法收集2019年12月至2020年5月就诊于福州肺科医院的447例疑似肺结核患者的痰标本,分别进行MGIT960液体培养及药敏、Xpert MTB/RIF(Xpert)和Xpert Ultra检测,将检出MTB的菌株和痰液进行rpoB基因Sanger测序。以临床诊断结果为参照,比较MGIT960液体培养、Xpert、Xpert Ultra检测MTB的敏感度和特异度;分别以液体药敏和测序结果为金标准,评价Xpert Ultra检测MTB利福平耐药性的效能。结果以临床确诊为参照,Xpert Ultra敏感度高于液体培养和Xpert,差异有统计学意义(χ^(2)=28.97、164.86,P均<0.05),特异度与液体培养和Xpert比较差异无统计学意义(P均>0.05)。分别以利福平液体药敏表型结果和rpoB基因测序结果为金标准,Xpert Ultra的敏感度为88.89%和93.75%。同时经测序分析,35例利福平耐药样本中,rpoB的531位点突变最为常见,占48.57%。结论Xpert Ultra能快速检测痰液中的MTB及其利福平耐药性,对肺结核早期诊疗有良好的临床应用价值,适合在各级实验室推广。

痰结核分枝杆菌培养和Gene Xpert MTB/RIF联合检测在初治涂阴肺结核诊断中的临床价值

目的 探讨痰结核分枝杆菌培养(简称“痰培养”)和Gene Xpert MTB/RIF(简称“Gene Xpert”)联合检测在初治涂阴肺结核诊断中的应用价值。方法 选取2021年2月-2022年7月在广西灵川县居住,在结核病定点医院确诊的167例初治涂阴肺结核患者作为研究对象,采用痰培养和Gene Xpert方法对患者痰标本进行结核分枝杆菌检测,分析痰培养和Gene Xpert对初治涂阴肺结核诊断的效能。结果 167例初治涂阴肺结核患者中,痰培养阳性31例(18.56%),Gene Xpert检测阳性71例(42.51%),痰培养阳性Gene Xpert阴性6例(3.59%),Gene Xpert阳性痰培养阴性46例(27.54%),两种方法均为阳性25例(14.97%)。Gene Xpert检测初治涂阴肺结核患者阳性率高于痰培养,差异有统计学意义(χ^(2)=30.77,P<0.001)。以痰培养作为金标准,Gene Xpert和联合检测的灵敏度、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为80.65%、66.18%、35.21%、94.12%和80.65%、63.38%、48.08%、93.75%。结论 痰培养和Gene Xpert联合检测能够提高初治涂阴肺结核患者的阳性检出率,在一定程度上减少漏诊和误诊的发生。

Xpert MTB/RIF在肺结核诊断中的应用价值

目前常用诊断PTB的检测方式有:细菌学检测技术、生化免疫检测技术、分子生物学检测技术、病理检测技术,其中应用最普遍的有结核菌涂片抗酸染色镜检法、MGIT960液体培养法、结核菌素试验、利福平耐药实时荧光定量核酸扩增技术检测(Xpert MTB/RIF),而基因编辑技术、环介导等温扩增技术、逆转录-环介导等温扩增技术、全基因组测序、基因芯片技术目前临床应用尚未得到广泛的临床推广。

GeneXpert MTB/RIF检出量与结核分枝杆菌培养和利福平表型耐药的关系

目的探讨痰液GeneXpert MTB/RIF(Xpert)检出量与结核分枝杆菌(MTB)培养阳性率和利福平耐药表型的关系。方法选取2016年4月—2019年12月温州市中心医院痰液Xpert检测为利福平耐药的初治肺结核患者183例。比较不同Xpert检出量患者MTB培养阳性率和利福平耐药表型假阳性率的差异。结果183例患者中,痰液Xpert检出量为高、中、低、极低的患者分别有48、46、56、33例。有80.87%(148/183)的患者MTB培养阳性。148例MTB培养阳性患者对一线抗结核药物异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素的耐药率分别为79.05%(117/148)、81.08%(120/148)、27.03%(40/148)、52.70%(78/148);对4种药物全敏感的患者11例,全耐药26例;单种药物耐药24例,以单耐利福平最常见(17例);耐2种药物34例,以耐利福平和异烟肼最常见(25例);耐3种药物53例,以耐利福平、异烟肼、链霉素最常见(40例)。Xpert检出量为极低、低、中、高的患者MTB培养阳性率分别为48.48%、76.79%、93.48%、95.83%,不同Xpert检出量患者MTB培养阳性率差异有统计学意义(P<0.001)。Xpert检出量为极低、低、中、高的患者利福平耐药表型假阳性率分别为43.75%、23.26%、13.95%、10.87%,不同Xpert检出量患者利福平耐药表型假阳性率差异具有统计学意义(P=0.022)。结论痰液Xpert检测可减少肺结核患者的漏诊,但检出量较低时,易出现MTB培养假阴性、利福平耐药假阳性。

Pooled Sputum for Xpert MTB/RIF Testing: A Cost-Saving Strategy in Mwanza, Tanzania

Background: Tuberculosis (TB) diagnostics, such as Xpert MTB/RIF, is still limited by cost. Testing of pooled samples from presumptive TB patients has been thought as a cost-saving strategy to diagnose TB. We assessed the utility and cost-saving of pooled Xpert MTB/RIF testing strategy for the diagnosis of TB in Mwanza, Tanzania. Methods: Sputum samples from Presumptive TB patients were submitted to TB laboratory for routine diagnosis of TB using Xpert MTB/RIF. The TB results from the individual sputum samples were used as the reference standard and were concealed to the investigating laboratory technicians. The remainder of samples were collected serially and were pooled (5 samples per pool) for testing. The agreement of the results between individual sample testing against pooled sample testing and cost-savings was assessed. Results: A total of 250 sputum samples from presumptive TB patients were analyzed and 50 pools were made with each pool containing 5 samples. Of the 50 sputum pools made, Mycobacterium tuberculosis (MTB) was detected in 17 (34.0%) pools. Results from the individual sputum samples MTB/RIF testing were retrieved for all 250 samples and there were 28 (11.2%) samples in which MTB was detected whereas 222 (88.8%) samples had no MTB detected. Following re-analysis of positive pools, all 28 (100%) individual positive MTB samples were detected within the 17 positive pools, with 1 to 3 individual MTB positive samples per pool. The individual sputum samples were correctly identified by pooled sputum on Xpert MTB/RIF testing, with the sensitivity of 100% and specificity of 100%. Using pooling of sputum samples strategy, we saved 46.0% (115/250) of the cartridges. Conclusion: The pooled sputum testing strategy reduced cartridge costs by 46.0% and has the potential to increase the affordability of Xpert MTB/RIF testing in countries with limited resources, such as Tanzania.

The Contribution of the Xpert® MTB/RIF Assay to the Surveillance of Drug-Resistant Tuberculosis in the Central African Republic

Introduction: The Central African Republic is one of the 30 high Tuberculosis burden countries in the world, with an incidence of 540 cases per 100,000 population and a mortality of 91 deaths per 100,000 population. Since 2020, following WHO recommendations, the National Reference Laboratory for Tuberculosis has been using the Xpert® MTB/RIF assay as a first-line diagnostic test for the early detection of Drug Resistance Tuberculosis. The goal of this study was to evaluate the contribution of the Xpert® MTB/RIF assay to the surveillance of rifampicin resistance in new and previously treated tuberculosis cases. Materials and Methods: The data relative to the Xpert® MTB/RIF assay carried out on various categories of tuberculosis patients registered at the National Reference Laboratory for Tuberculosis in 2020 were analyzed retrospectively. The categories of tuberculosis patients were new cases, failed treatment cases, relapse cases, lost-to-follow-up cases and multidrug-resistant tuberculosis contact cases. Results: A total of 1404 tuberculosis patients were registered at the NRL-TB in 2020;the mean age was 39.2 years (2 - 90 years) and the male-to-female sex ratio was 1.16:1. Overall, 32.7% (454/1404) proved infected with tuberculosis, of which 22.5% (102/454) cases showed resistance to rifampicin. The primary resistance rate was 9.1% (27/298) and the secondary resistance rate was 46.6% (75/161). Treatment failures and relapsed cases were significantly associated with rifampicin resistance (p 0.005). Conclusion: Large-scale use of Xpert® MTB/RIF, especially in the provinces of the Central African Republic, will help the Ministry of Health to better control Drug Resistance Tuberculosis in the country.

宏基因组二代测序技术和Gene Xpert MTB/RIF对肺结核的诊断价值

目的:对比抗酸涂片、结核分枝杆菌培养、结核分枝杆菌及利福平耐药基因检测(Gene Xpert MTB/RIF)和宏基因组二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)对肺结核诊断的临床价值。方法:回顾分析2021年3月至2023年4月在山东省公共卫生临床中心就诊的175名疑似肺结核患者的临床资料,所有纳入病例均进行痰抗酸涂片、肺泡灌洗液抗酸涂片、痰培养、肺泡灌洗液培养、肺泡灌洗液Gene Xpert MTB/RIF和mNGS检查。比较抗酸涂片、结核杆菌培养、Gene Xpert MTB/RIF和mNGS诊断肺结核的阳性率。结果:175名疑似结核患者共确诊结核126例,灌洗液Gene Xpert MTB/RI敏感度为77.8%,灌洗液mNGS检查阳性率为85.7%高于痰培养法(46.0%)、灌洗液培养法(57.1%),对于涂片阴性的结核患者Gene Xpert MTB/RIF和mNGS检查阳性率高于培养法(P < 0.05)。结论:mNGS及Gene Xpert MTB/RIF在诊断肺结核方面具有重要意义,极大提高了涂片阴性检出率。