目的探讨薛氏五叶芦根汤防控新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的网络作用机制及可行性。方法在中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)检索下载薛氏五叶芦根汤...目的探讨薛氏五叶芦根汤防控新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的网络作用机制及可行性。方法在中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)检索下载薛氏五叶芦根汤所有中药的活性成分、作用靶标及分子结构;利用Cytoscape软件构建成分-靶标网络;将作用靶标导入STRING平台进行蛋白互作分析;借助R软件对靶标进行基因本体(Gene Ontology,GO)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路分析;在RCSB PDB(RCSBProtein Data Bank)数据库中检索获取COVID-19相关靶标的晶体结构,借助AutoDockTool、Vina软件,将受体与配体进行预处理及分子对接。结果筛选获得中药活性成分57种,作用靶标286个;通过构建成分-靶标网络获得4个核心网络;通过GO富集获得P≤0.05的生物学过程189条,主要涉及肾上腺素能受体活性、G蛋白偶联胺受体活性、核受体活性等;通过KEGG富集获得P≤0.05的信号通路100条,主要涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、乙型肝炎、白介素-17(Interleukin,IL-17)信号通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、人巨细胞病毒感染、流体剪切应力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号途径等;分子对接结果显示所含活性成分与COVID-19相关靶标的结合能均P<-5kcaL/mol(20.9kj/mol)。结论薛氏五叶芦根汤代茶饮的多种活性成分可通过与COVID-19的相关靶标结合,通过多种生物学途径对COVID-19发挥调控作用。展开更多
文摘目的探讨薛氏五叶芦根汤防控新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的网络作用机制及可行性。方法在中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)检索下载薛氏五叶芦根汤所有中药的活性成分、作用靶标及分子结构;利用Cytoscape软件构建成分-靶标网络;将作用靶标导入STRING平台进行蛋白互作分析;借助R软件对靶标进行基因本体(Gene Ontology,GO)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路分析;在RCSB PDB(RCSBProtein Data Bank)数据库中检索获取COVID-19相关靶标的晶体结构,借助AutoDockTool、Vina软件,将受体与配体进行预处理及分子对接。结果筛选获得中药活性成分57种,作用靶标286个;通过构建成分-靶标网络获得4个核心网络;通过GO富集获得P≤0.05的生物学过程189条,主要涉及肾上腺素能受体活性、G蛋白偶联胺受体活性、核受体活性等;通过KEGG富集获得P≤0.05的信号通路100条,主要涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、乙型肝炎、白介素-17(Interleukin,IL-17)信号通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、人巨细胞病毒感染、流体剪切应力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号途径等;分子对接结果显示所含活性成分与COVID-19相关靶标的结合能均P<-5kcaL/mol(20.9kj/mol)。结论薛氏五叶芦根汤代茶饮的多种活性成分可通过与COVID-19的相关靶标结合,通过多种生物学途径对COVID-19发挥调控作用。