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聚合酶链式反应及限制性片段长度多态性技术检测乙型肝炎病毒P基因区YMDD基因序列变异 被引量:11
1
作者 周智勇 孙剑 +2 位作者 陈金军 侯金林 骆抗先 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2001年第12期885-887,共3页
目的建立检测基因变异的聚合酶链反应(PCR)限制性片段长度多态性(Restrictionfragmentlengthpolymophism,RFLP)法。方法从服用拉米夫定1年以上的慢性乙肝病例中选取10例抽取血清,分别采用错配套式PCR-RFLP技术、PCR产物直接测序和重组... 目的建立检测基因变异的聚合酶链反应(PCR)限制性片段长度多态性(Restrictionfragmentlengthpolymophism,RFLP)法。方法从服用拉米夫定1年以上的慢性乙肝病例中选取10例抽取血清,分别采用错配套式PCR-RFLP技术、PCR产物直接测序和重组克隆测序,检测P基因YMDD变异。结果在10个病例中,PCR-RFLP检测到7例为野毒株、1例为混合株感染、2例为变异株;PCR产物直接测序,9例为野株、1例为变异株;对2份用PCR-RFLP法检测为非野株,而PCR测序为阴性的标本采用克隆后测序,发现均为混合株感染。结论通过对几种检测方法的对比,认为克隆后测序的结果最精确;而从实用性和经济角度来看,采用PCR-RFLP进行初步筛检的方法具有更大的意义,值得推广。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 拉米夫定 耐药性 限制性片段长度多态型 PCR ymdd基因 RFLP
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荧光PCR法检测乙型肝炎病毒YMDD基因变异的研究 被引量:1
2
作者 黄毅 蔡立勉 +1 位作者 陈发林 朱敏 《江西医学检验》 2005年第5期413-416,共4页
目的探讨荧光PCR法在检测酪氨酸-蛋氨酸-天门冬氨酸-天门冬氨酸(YMDD)基因变异上的临床应用价值及其拉米夫定治疗一年慢性乙型肝炎(CHB)患者发生YMDD基因变异的情况。方法61例HBsAg(+)HBeAg(+)HBcAb(+)HBVDNA(+)CHB患者接受拉米夫定治... 目的探讨荧光PCR法在检测酪氨酸-蛋氨酸-天门冬氨酸-天门冬氨酸(YMDD)基因变异上的临床应用价值及其拉米夫定治疗一年慢性乙型肝炎(CHB)患者发生YMDD基因变异的情况。方法61例HBsAg(+)HBeAg(+)HBcAb(+)HBVDNA(+)CHB患者接受拉米夫定治疗一年,采用荧光定量PCR法检测其血清HBVDNA含量,ELISA法检测血清乙肝五项标志物,动力学法检测血清谷丙转氨酶(ALT)含量。HBVYMDD基因变异采用荧光PCR法进行检测。结果61例CHB患者经拉米夫定治疗一年后HBV-DNA阳性率降至34.4%(21/61),YMDD基因变异发生率18.0%(11/61),分析YMDD基因变异类型:4例为混合变异,其中3例为YMDD+YIDD,1例为YMDD+YVDD;7例为完全变异,其中5例为YIDD,2例为YVDD。变异患者组无1例出现HBeAb血清学转换,血清HBVDNA含量106.6±0.8(copies/ml),明显高于HBVDNA(+)无变异组(P<0.05),ALT含量123.8±53.8(U/L),明显高于HBVDNA(-)无变异组(P<0.01)。结论YMDD基因变异CHB患者HBVDNA均反跳,伴有ALT升高,及时了解CHB患者有无YMDD基因变异对避免造成患者不必要的经济负担、指导临床合理用药具有重要意义。荧光PCR法用于检测YMDD基因变异,具有经济实用、自动化程度高、简便快捷的优点。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 拉米夫定治疗 ymdd基因变异 荧光PCR法
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包含YMDD基因序列的乙型肝炎病毒P区基因变异的研究 被引量:17
3
作者 封波 魏来 +1 位作者 陈明 李秀华 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 2004年第1期29-31,共3页
目的 研究包含YMDD基因序列的乙型肝炎病毒(HBV)P区基因的一级结构及其变异特点。 方法 从4例未经任何抗病毒治疗的HBV感染患者外周血血清中扩增HBV P基因区序列(长度为1057 bp),双酶切后克隆入pUC19载体中,每份标本随机取20个经限制性... 目的 研究包含YMDD基因序列的乙型肝炎病毒(HBV)P区基因的一级结构及其变异特点。 方法 从4例未经任何抗病毒治疗的HBV感染患者外周血血清中扩增HBV P基因区序列(长度为1057 bp),双酶切后克隆入pUC19载体中,每份标本随机取20个经限制性片段长度多态性分析(RFLP)法鉴定为阳性的克隆,采取错配聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR—RFLP)法检测YMDD基序变异,最后取其中两个标本共10个阳性克隆进行双向测序。 结果 标本1和2克隆间核苷酸变异率分别为0.3%~1.1%,0.4%~1.7%。80个阳性克隆中,有2个克隆YMDD基序变异为YMGD。 结论 包含YMDD基序的HBV P区存在准种分布特征,在未经抗病毒治疗的患者血清中,存在一种新的YMDD变异形式,即YMGD变异。 展开更多
关键词 ymdd基因 基因序列 乙型肝炎病毒 HBV 基因变异 肝脏损伤
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乙型肝炎病毒YMDD变异与基因型相关性的研究 被引量:4
4
作者 李迪 穆锦江 +3 位作者 徐维祯 李桂秋 房勇 谷鸿喜 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1216-1218,共3页
目的探讨乙型肝炎病毒(HBV)发生YMDD基因变异与HBV基因型的关系。方法首先HBV 6个主要基因型(A^F)特异性多引物用巢式PCR法对175例接受拉米夫定抗病毒治疗患者的血清HBV DNA进行基因分型和分析,再采用实时荧光PCR法对标本进行YMDD变异... 目的探讨乙型肝炎病毒(HBV)发生YMDD基因变异与HBV基因型的关系。方法首先HBV 6个主要基因型(A^F)特异性多引物用巢式PCR法对175例接受拉米夫定抗病毒治疗患者的血清HBV DNA进行基因分型和分析,再采用实时荧光PCR法对标本进行YMDD变异检测。结果在175例标本中B、C、D基因型阳性率分别为9.1%、88.6%、2.3%;103例标本发生YMDD变异,YMDD总变异率、B、C基因型标本YMDD变异率分别为58.9%、62.5%5、8.1%;HBV B、C两基因型间的YMDD的变异率差异无统计学意义(P>0.05);在10例B基因型YMDD变异的标本中,有2例发生YIDD变异;其余8例发生YVDD(YMDD+YVDD)变异;68例C基因型YMDD变异的标本中,有44例发生YIDD(YMDD+YIDD)变异、24例发生YVDD(YMDD+YVDD)变异;HBV B、C两基因型间的YMDD不同变异类型发生率差异有统计学意义。结论在拉米夫定抗病毒治疗2~4年,HBV YMDD变异率为58.9%;HBV B、C基因型标本间发生YMDD变异率差异无统计学意义;HBV B、C基因型标本基因变异类型差异均有统计学意义(χ2=5.5,P<0.05)。 展开更多
关键词 乙型肝炎 基因 拉米夫定 ymdd基因变异
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乙型肝炎病毒多聚酶基因YMDD变异与临床治疗反应 被引量:4
5
作者 王召钦 马为民 +3 位作者 周伯平 陈心春 王火生 徐六妹 《广东医学》 CAS CSCD 2002年第6期584-585,共2页
目的 了解深圳地区慢性乙型肝炎患者在长期拉米夫定治疗中HBV多聚酶基因YMDD变异的情况及其对治疗反应的影响。方法 对 10 0例拉米夫定治疗中 2 8例出现血清病毒核酸 (HBVDNA)阳性的患者 ,采用限制性片段长度多态性分析法 (PCR -RFLP... 目的 了解深圳地区慢性乙型肝炎患者在长期拉米夫定治疗中HBV多聚酶基因YMDD变异的情况及其对治疗反应的影响。方法 对 10 0例拉米夫定治疗中 2 8例出现血清病毒核酸 (HBVDNA)阳性的患者 ,采用限制性片段长度多态性分析法 (PCR -RFLP)检测YMDD变异 ,并观察其血清HBVDNA及丙氨酸转氨酶 (ALT)水平。结果  10 0例中有 17例YMDD变异阳性 ,其中以YVDD(M5 5 0V)变异为主 ,占 64 7% (11/17) ,YIDD(M5 5 0I)变异为 3 5 3 % (6/17)。发生YMDD变异的患者均伴有HBVDNA及ALT水平反跳 ,1例住院患者停用拉米夫定后出现病情加重。结论 深圳地区慢性乙型肝炎患者在长期拉米夫定治疗中 (疗程 1年 ,10 0mg/d)HBV多聚酶基因YMDD变异率为 17 0 % (17/10 0 ) ,发生变异者较无变异者疗效降低 ,检测YMDD变异有助于监测疗效。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 多聚酶基因ymdd变异 拉米夫定
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应用拉米夫定治疗时间与HBV YMDD基因变异情况的分析 被引量:1
6
作者 邓林 苏婷 +1 位作者 石铭 张凡 《中国冶金工业医学杂志》 2014年第6期627-628,共2页
目的探讨慢性乙型肝炎(CHB)患者应用拉米夫定治疗时间长短与HBV YMDD基因变异情况的关系。方法将254例CHB患者按应用拉米夫定治疗时间不同分为〈24周、24-48周、49-96周和〉96周共4组,采用PCR荧光法检测血清HBV DNA水平和HBV YMDD基... 目的探讨慢性乙型肝炎(CHB)患者应用拉米夫定治疗时间长短与HBV YMDD基因变异情况的关系。方法将254例CHB患者按应用拉米夫定治疗时间不同分为〈24周、24-48周、49-96周和〉96周共4组,采用PCR荧光法检测血清HBV DNA水平和HBV YMDD基因变异情况。结果拉米夫定治疗时间长短与血清HBV DNA阳性率有相关性,随着拉米夫定治疗时间的延长,血清HBV DNA的阳性率逐渐上升。拉米夫定治疗时间长短与HBV DNA阳性患者的HBV YMDD基因变异率有关,随着拉米夫定治疗时间的延长,HBV DNA阳性患者的HBV YMDD基因变异率呈升高趋势,且拉米夫定治疗时间〉24周后HBV YMDD基因变异率显著升高。结论长时间应用拉米夫定治疗CHB可引起HBV YMDD基因变异,致使患者产生耐药。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 拉米夫定 ymdd基因 变异
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拉米夫定治疗引起HBVYMDD变异的检测及临床意义 被引量:1
7
作者 蒋孝华 蔡亚平 +2 位作者 刘映霞 李红梅 唐武成 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期321-323,共3页
目的探讨拉米夫定治疗慢性乙型肝炎引起的HBVYMDD变异与HBVDNA病毒载量与血清谷丙转氨酶(ALT)之间的关系。方法140例拉米夫定治疗48 ̄96周的慢性乙型肝炎患者为研究对象。用荧光定量PCR法检测HBVDNA,基因序列分析检测HBVYMDD变异,全自... 目的探讨拉米夫定治疗慢性乙型肝炎引起的HBVYMDD变异与HBVDNA病毒载量与血清谷丙转氨酶(ALT)之间的关系。方法140例拉米夫定治疗48 ̄96周的慢性乙型肝炎患者为研究对象。用荧光定量PCR法检测HBVDNA,基因序列分析检测HBVYMDD变异,全自动生化分析仪检测ALT水平。结果140例检测标本46例存在YMDD变异,变异率为32.86%,其中29例(20.71%)为rtM204V/rtL180M变异,16例(11.43%)为rtM204I变异,1例(0.72%)为rtM204I/rtL180M变异。HBVDNA>105拷贝/mL的发生率变异株组(40/46,86.96%)明显高于野生株组(6/94,6.38%)(χ2=90.889,P<0.01)。血清ALT水平变异株组(143.96±192.97)u/L明显高于野生株组(41.29±31.54)u/L(F=25.409,P<0.01)。结论慢性乙型肝炎患者应用拉米夫定48 ̄96周YMDD变异率为32.86%,变异类型以rtM204V/rtL180M为主,其次为rtM204I。变异时HBV-DNA病毒载量及ALT水平升高。 展开更多
关键词 拉米夫定 肝炎病毒 乙型 基因变异 ymdd
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健肝3号胶囊联合拉米夫定对慢性乙型肝炎患者基因突变的影响
8
作者 涂燕云 李中华 +5 位作者 张红星 陈枝俏 刘旭东 王岚 林海 戸玉轩 《江西中医药》 2011年第9期28-29,共2页
目的:观察拉米夫定联合健肝3号胶囊(原称疗肝3号胶囊)对慢性乙型肝炎患者T淋巴细胞亚群的影响。方法:120例CHB患者随机分为治疗组和对照组,治疗组40例为拉米夫定联合健肝3号胶囊治疗;西药对照组40例单用拉米夫定治疗,中药对照组单用健肝... 目的:观察拉米夫定联合健肝3号胶囊(原称疗肝3号胶囊)对慢性乙型肝炎患者T淋巴细胞亚群的影响。方法:120例CHB患者随机分为治疗组和对照组,治疗组40例为拉米夫定联合健肝3号胶囊治疗;西药对照组40例单用拉米夫定治疗,中药对照组单用健肝3号胶囊,疗程均为12个月。治疗第3、6、9、12个月各检测1次YMDD变异株。治疗前后各检测CD4+T细胞、CD8+T细胞、CD4+/CD8+值。结果治疗12个月时,治疗组CD4+T细胞与两组对照组无显著差异,治疗组CD8+T细胞较西药对照组下降,CD4+/CD8+值较西药对照组升高,均有显著差异(P<0.05)。治疗12月时,共检测出10例YMDD变异,治疗组2例,对照组8例,有显著性差异(P<0.05)治疗组YMDD(-)CD8+T细胞较对照组YMDD(+)明显下降(P<0.01),CD4+/CD8+值较对照组YMDD(+)明显升高,有显著性差异(P<0.01);结论:拉米夫定联合健肝3号胶囊,可使慢性乙型肝炎患者CD8+T细胞较对照组下降,CD4+/CD8+值较对照组升高;健肝3号胶囊可能有效降低乙型肝炎患者CD8+T细胞,从而可能有效降低乙型肝炎患者YMDD变异率。健肝3号胶囊是对慢性乙型肝炎治疗有效的纯中药制剂。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 T淋巴细胞亚群 拉米夫定 健肝3号 基因变异 ymdd
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Clinical features of chronic hepatitis B patients with YMDD mutation after lamivudine therapy 被引量:13
9
作者 LIU Ke-zhou(刘克洲) +5 位作者 HOU Wei(侯伟) ZUMBIKA Edward, NI Qin(倪勤) 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2005年第12期1182-1187,共6页
Objective: To study the clinical features of chronic hepatitis B (CHB) patients with tyrosine-methionine-aspartateaspartate (YMDD) mutation after lamivudine therapy. Methods: This investigation was a retrospective stu... Objective: To study the clinical features of chronic hepatitis B (CHB) patients with tyrosine-methionine-aspartateaspartate (YMDD) mutation after lamivudine therapy. Methods: This investigation was a retrospective study of 63 CHB patients with YMDD mutation during lamivudine therapy. Clinical data, including period and types of YMDD mutation; hepatitis B virus (HBV) DNA levels and alanine aminotransferase (ALT) levels before and after YMDD mutation were measured. YMDD mutation in the HBV DNA polymerase gene was determined using polymerase chain reaction (PCR) and direct sequencing. HBV DNA quantification was determined using real-time PCR. Relevant serum markers of HBV were measured. The follow-up period was 12 months after YMDD mutation. Results: YMDD mutation occurred 7~44 months (median, 21.5 months) after the start of lamivudine therapy. The majority of the cases (42/63, 66.6%) had YMDD mutants detected between 12 and 24 months. Four types of YMDD mutation were observed in this study, rtL180M/M204V mutation was the predominant type (26/63, 41.3%). A proportion of patients (16/63, 25.4%; 12/63, 19.1%) had higher HBV DNA levels and ALT levels (after mutation vs before mutation),respectively. Conclusion: The majority of patients with YMDD mutants had similar or lower HBV DNA levels and ALT levels compared with baseline values. This subset of patients might have benefited from the continued lamivudine therapy. The patients with increased ALT and HBV DNA levels (breakthrough hepatitis) should benefit from the addition of a newer nucleotide analogue (e.g. adefovir). 展开更多
关键词 Chronic hepatitis B (CHB) Tyrosine-methionine-aspartate-aspartate ymdd mutation LAMIVUDINE
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YMDD variants of HBV DNA polymerase gene: Rapid detection and clinicopathoiogical analysis with long-term Iamivudine therapy after liver transplantation 被引量:1
10
作者 FeiPei Jun-YuNing Jiang-FengYou Jing-PinYang JieZheng 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第18期2714-2719,共6页
AIM: To look for a rapid low-cost technique for the detection of HBV variants.METHODS: Two patients who underwent orthotopic liver transplantation (OLT) for HBV infection were treated with lamivudine (100 mg daily) an... AIM: To look for a rapid low-cost technique for the detection of HBV variants.METHODS: Two patients who underwent orthotopic liver transplantation (OLT) for HBV infection were treated with lamivudine (100 mg daily) and HBV infection recurred in the grafted livers. The patients were monitored intensively for liver enzymes, hepatitis B surface antigen (HBsAg) and HBV DNA in serum. Liver biopsy was performed regularly. HBV DNA in a conserved polymerase domain (the YMDD locus) was amplified from serum of each patient by PCR and sequenced. HBV genotypes were analyzed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the PCR products generated from a fragment of the polymerase gene.RESULTS: YMDD wild-type HBV was detected in one patient by PCR-RFLP and DNA sequencing 19 mo after OLT, and YIDD mutant-type HBV in the other patient, 16 mo after OLT.CONCLUSION: PCR-RFLP assay is an accurate and simple method for genotyping lamivudine-resistant HBV variants. 展开更多
关键词 Liver transplantation HBV DNA Polymerase gene ymdd variants PCR-RFLP
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慢性乙型肝炎患者治疗前YMDD变异基因的检测及分析 被引量:6
11
作者 叶晓光 王若伦 郭海波 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期248-248,共1页
关键词 微板核酸杂交-核酸定量检测 慢性乙型肝炎 治疗前 ymdd变异基因 检测
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Hepatitis B virus genotypes and lamivudine resistance mutations in Jordan 被引量:10
12
作者 Hani A Masaadeh Wail A Hayajneh Enayat A Alqudah 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2008年第47期7231-7234,共4页
AIM:To investigate and identify prevalent hepatitis B virus(HBV) genotypes and to explore lamivudine-resistant mutations among treated and untreated patients in Jordan.METHODS:A total of 107 cases with chronic hepatit... AIM:To investigate and identify prevalent hepatitis B virus(HBV) genotypes and to explore lamivudine-resistant mutations among treated and untreated patients in Jordan.METHODS:A total of 107 cases with chronic hepatitis B were recruited from different medical centers in Jordan.Serological tests were preformed for all cases using a microparticle enzyme immunoassay.HBV Genotyping was performed for 70 cases using Line probe genotyping assay.The YMDD mutations were explored for 20 cases(4 were lamivudine naive) using the INNO-LiPA HBV DR assay.RESULTS:Genotype D was the only detected genotype.A total of 6 YMDD mutations were detected in 5 treated patients(31%) while one mutation was detected in the naive patients.Seventeen percent of cases were positive for HBeAg and had statistically significant higher levels of serum aminotransferases.CONCLUSION:HBV genotype D appears to be the only circulating type in Jordanian patients.The YMDD mutations were detected in 31% of lamivudine-treated cases with similar patterns to those found in the literature.We also found a relatively low prevalence of HBeAg expression among examined cases(17%).Awareness of these serologic,genotypic and resistance patterns might help in the formulation of management plans and for predicting clinical outcomes.Further larger scale studies are needed to confirm our results and to examine possible associations among clinical,serologic,and genetic patterns of HBV infections in Jordan. 展开更多
关键词 Hepatitis B virus GENOTYPES LAMIVUDINE ymdd mutation JORDAN
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阿德福韦酯联合拉米夫定治疗拉米夫定耐药慢性乙型肝炎的临床观察 被引量:3
13
作者 金红 金水忠 +2 位作者 徐红 沈国辉 陆耀忠 《中国临床新医学》 2011年第9期823-826,共4页
目的观察阿德福韦酯联合拉米夫定治疗拉米夫定耐药慢性乙型肝炎临床疗效。方法首先在充分告知符合研究对象的患者(80例)病情后根据患者的意愿选择分为:(1)对照组(单药治疗组,n=38例),在拉米夫定应用基础上重叠阿德福韦酯治疗12周后,停... 目的观察阿德福韦酯联合拉米夫定治疗拉米夫定耐药慢性乙型肝炎临床疗效。方法首先在充分告知符合研究对象的患者(80例)病情后根据患者的意愿选择分为:(1)对照组(单药治疗组,n=38例),在拉米夫定应用基础上重叠阿德福韦酯治疗12周后,停用拉米夫定,单独使用阿德福韦酯治疗132周;(2)观察组(联合治疗组,n=42例),出现拉米夫定耐药后联合应用阿德福韦酯144周。每3个月检测患者的HBV-DNA、HBV-M、肝功能、肾功能及血常规等。结果 144周疗程结束后联合治疗组患者HBV-DNA转阴率明显优于对照组,疗效差异有统计学意义(P<0.01),HbeAg在两组间未见明显差异(P>0.05),联合治疗组治疗后肝功能复常率较单药治疗组高(P<0.05)。结论阿德福韦酯联合拉米夫定治疗拉米夫定耐药慢性乙型肝炎有较好的疗效。 展开更多
关键词 阿德福韦酯 拉米夫定 乙肝病毒基因(ymdd)变异 慢性乙型肝炎
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锁核酸捕获TaqMan探针实时PCR和PCR-RFLP检测乙型肝炎病毒基因变异的研究 被引量:9
14
作者 余文辉 周小梅 +3 位作者 周大桥 李顺民 贺劲松 李爱娣 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期977-982,共6页
目的评价锁核酸捕获TaqMan探针实时聚合酶链反应(PCR)和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测乙型肝炎病毒(HBV)基因变异的特点。方法分别用直接测序法、锁核酸(LNA)捕获TaqMan探针实时PCR和PCR-RFLP检测77例接受... 目的评价锁核酸捕获TaqMan探针实时聚合酶链反应(PCR)和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测乙型肝炎病毒(HBV)基因变异的特点。方法分别用直接测序法、锁核酸(LNA)捕获TaqMan探针实时PCR和PCR-RFLP检测77例接受拉米夫定(LAU)治疗6个月以上的慢性乙型肝炎患者的血清样本。结果锁核酸捕获TaqMan探针实时PCR和PCR-RFLP都能检测HBV野生型YMDD及其变异型YIDD和YVDD。此外,两种方法尚能鉴定HBV野生型和变异型混合种群。更为重要的是,在检测HBV野生型和变异型共生变异方面,锁核酸捕获TaqMan探针实时PCR比PCR-RFLP更敏感、更省时。结论锁核酸捕获TaqMan探针实时PCR是一种检测HBV YMDD变异的灵敏度和特异性都高的快速法,在监测HBV患者LAM抗病毒治疗的疗效及发现新耐药病毒基因型等方面具有广泛的应用前景。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 ymdd基因 乙型肝炎病毒 变异 限制性片段长度多态性 锁核酸
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