YTHDF基因DNA甲基化与乙肝疫苗低/无免疫应答水平关系研究

目的:从表观遗传角度探究N6-甲基腺苷(m 6 A)修饰相关的YTHDF基因DNA甲基化与乙肝疫苗接种者免疫低/无免疫应答水平的关系。方法:收集263例汉族儿童为研究对象。对儿童的外周血进行乙肝血清标志物检测,将乙型肝炎表面抗体(anti-HBs)浓度<100 mIU/ml者纳入病例组,将anti-HBs≥100 mIU/ml者纳入对照组。使用Methyl Target技术检测YTHDF基因位点的DNA甲基化水平,分析YTHDF基因81个位点CpG DNA甲基化水平与乙肝疫苗免疫应答水平的关系。结果:病例组纳入104例,对照组纳入159例,两组年龄和性别分布比较差异无统计学意义(均P>0.05)。病例组YTHDF1_1基因23位点、YTHDF1_2基因69位点与YTHDF1_2基因140位点甲基化水平均高于对照组(均P<0.05)。多因素非条件Logistic回归分析表明,YTHDF1_1基因23位点和YTHDF1_2基因140位点甲基化水平可能是乙肝疫苗低/无免疫应答的危险因素,而YTHDF1_2基因69位点和YTHDF2_1基因28位点甲基化水平可能是乙肝疫苗低/无免疫应答的保护因素(均P<0.05)。结论:YTHDF1_1基因23位点和YTHDF1_2基因140位点甲基化水平可能是乙肝疫苗低/无免疫应答的危险因素,YTHDF1_2基因69位点和YTHDF2_1基因28位点甲基化水平可能是乙肝疫苗低/无免疫应答的保护因素。

乳腺癌组织中整体m6A修饰水平与YTHDF3基因的表达

目的探讨乳腺癌组织中mRNA整体N6-甲基腺苷(m6A)修饰水平和甲基化阅读蛋白关键基因YTHDF3基因在乳腺癌组织和癌旁组织中的表达。方法通过生物信息学对YTHDF3基因在乳腺癌组织与癌旁组织中的表达差异及乳腺癌患者生存率进行分析;收集乳腺外科手术切除的25例乳腺癌组织和20例癌旁组织(作为对照),利用液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)方法分析乳腺癌组织与癌旁组织组中mRNA的整体甲基化水平,通过实时荧光定量PCR(qPCR)和Western blot实验检测YTHDF3基因在乳腺癌组织和癌旁组织中的相对表达量。结果生物信息数据库结果显示,YTHDF3基因在乳腺癌组织中的表达明显高于癌旁组织(P<0.001),与癌旁组织比较,YTHDF3基因只有在和81~100岁年龄段表达差异具有统计学意义(P<0.05),乳腺癌旁组织中YTHDF3基因的表达量明显低于Luminal分型的乳腺癌(P<0.01),利用受试者工作特征(ROC)曲线验证乳腺癌5年生存率和10年生存率曲线下面积(AUC)>0.56、0.60,高表达YTHDF3基因的乳腺癌患者比低表达的患者存活率低((P<0.05);LC-MS/MS结果显示,乳腺癌分子分型中Luminal型的mRNA的整体甲基化水平高于癌旁组织、差异有统计学意义(P<0.05),HER-2过表达型(HER-2 positive)与癌旁组织的整体甲基化水平差异无统计学意义(P>0.05);qPCR检测结果显示,YTHDF3基因的表达量在乳腺癌分子Luminal亚型、HER-2 positive亚型中均高于癌旁组织(P<0.05);Western blot结果显示,乳腺癌中YTHDF3蛋白水平高于癌旁组织(P<0.05)。结论乳腺癌组织中mRNA的甲基化水平高于癌旁组织,并且甲基化阅读蛋白关键基因YTHDF3基因在乳腺癌组织中表达上调。