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Genetic Polymorphism of Milk Protein and Their Relationships with Milking Performances in Chinese Yak 被引量:2
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作者 MAOYong-jiang ZHONGGuang-hui +4 位作者 ZHENGYu-cai PENGXian-wen YANGZhang-ping WANGYong JIANGMing-feng 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2004年第4期310-315,共6页
The milk protein polymorphisms were typed by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE)from 109 Maiwa and 100 Jiulong yaks, and the relationships among milk protein polymorphisms,milking traits and milk protein composi... The milk protein polymorphisms were typed by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE)from 109 Maiwa and 100 Jiulong yaks, and the relationships among milk protein polymorphisms,milking traits and milk protein compositions were studied. The results showed thatβ-CN,κ-CN andα-La were monomorphic,αs1-CN andβ-Lg were polymorphic, the dominantgenes were αs1-CN D and β-Lg E,respectively. The frequencies of αs1-CN D were 0.8073and 0.6000 and β-Lg E were 0.9770 and 0.9700 in two populations respectively.The meanheterozygosities were 0.1021 and 0.1867 in two populations. No significant effects onmilking traits and milk protein compositions were observed except for αs1-CN locus onfat percentage in Jiulong yak. 展开更多
关键词 Milk protein Genetic polymorphisms Milking traits yak
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Novel SNP of EPAS1 gene associated with higher hemoglobin concentration revealed the hypoxia adaptation of yak(Bos grunniens) 被引量:8
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作者 WU Xiao-yun DING Xue-zhi +4 位作者 CHU Min GUO Xian BAO Peng-jia LIANG Chun-nian YAN Ping 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2015年第4期741-748,共8页
Endothelial PAS domain protein 1 gene (EPAS1) is a key transcription factor that activates the expression of oxygen-regu- lated genes. In this study, in order to better understand the effects of EPAS1 gene on hemato... Endothelial PAS domain protein 1 gene (EPAS1) is a key transcription factor that activates the expression of oxygen-regu- lated genes. In this study, in order to better understand the effects of EPAS1 gene on hematologic parameters in yak, we firstly quantified the tissue expression patterns for EPASl mRNA of yak, identified polymorphism in this gene and evaluated its association with hematologic parameters. Expression of EPAS1 mRNA was detected in all eight tissues (heart, liver, lung, spleen, pancreas, kidney, muscles and ovary). The expressions of EPAS1 in lung and pancreas were extremely higher than other tissues examined. Three novel single nucleotide polymorphisms (SNPs) (g.83052 C〉T, g.83065 G〉A and g.83067 C〉A) within the EPAS1 were identified and genotyped in Pali (PL), Gannan (GN) and Tianzhu White (TZW) yak breeds. Significant higher frequencies of the AA and GA genotypes and A allele of the g.83065 G〉A were observed in the PL and GN breeds than that in the TZW breed (P〈0.01). Association analysis of the PL breed indicated that the g.83065 G〉A polymorphism was significantly associated with hemoglobin (HGB) concentration in yaks (P〈0.05). Individuals with genotype AA had significantly higher HGB concentration (P〈0.05) than those with genotype GA and GG. All these results will help our further understanding of biological functional of yak EPAS1 gene in responding to hypoxia and also indicate EPAS1 might contribute to the hypoxia adaptation of the yak. 展开更多
关键词 EPAS1 gene m RNA expression polymorphism hypoxia adaptation yak
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Transferrin gene polymorphisms and population genetic studies of Atlantic cod(Gadus morhua)
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作者 Berhan Asmamaw 《Journal of Coastal Life Medicine》 2016年第1期1-7,共7页
Objective:To detect single nucleotide polymorphisms(SNPs)in the cod transferrin gene by comparing the sequences from Norwegian(North East Atlantic Ocean)and Canadian(North West Atlantic Ocean)specimen,and to quantify ... Objective:To detect single nucleotide polymorphisms(SNPs)in the cod transferrin gene by comparing the sequences from Norwegian(North East Atlantic Ocean)and Canadian(North West Atlantic Ocean)specimen,and to quantify the genetic variation and differentiation in East and West Atlantic cod populations.Methods:cDNA sequences between individuals of Canadian(North West Atlantic Ocean)and Norwegian(North East Atlantic Ocean)origin were aligned.Allele frequencies of the SNPs were used to discriminate the different Atlantic cod populations in West/East Atlantic Ocean,and the Baltic Sea.Results:The sequence alignment detected 19 SNPs,of which 18 of them resulted in amino acid changes in the transferrin protein.Nonsynonymous to synonymous site substitution ratio(dn/ds)was by far greater than 1 providing an evidence for the existence of positive selection.The West Atlantic cod populations showed high values of heterozygosity and the Baltic populations were found to be inbred.Conclusions:This study identified and indicated transferrin gene polymorphisms that can be used for population differentiations. 展开更多
关键词 transferrin polymorphismS Atlantic cod Gadus morhua
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Transferrin in fishes:A review article
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作者 Berhan Asmamaw 《Journal of Coastal Life Medicine》 2016年第3期176-180,共5页
Transferrin is a single monomeric glycoprotein of molecular weight of 80 kDa that transports iron involved in many metabolic processes amongst the sites of absorption,storage and utilization,hence considered as the ma... Transferrin is a single monomeric glycoprotein of molecular weight of 80 kDa that transports iron involved in many metabolic processes amongst the sites of absorption,storage and utilization,hence considered as the major iron binding protein in the plasma of vertebrate species.In this study,transferrin structure,synthesis,receptor and the mechanism of cellular uptake of iron from transferrin have been reviewed.Besides,the major biological functions of transferrin and the different forms of it(polymorphisms)have been indicated. 展开更多
关键词 transferrin Iron Ferric polymorphismS
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青海高原型牦牛GHR基因多态性与生长发育的关联性
5
作者 丁维芹 祁增源 +3 位作者 刘亚倩 韩银仓 李文浩 孙永刚 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2024年第1期9-15,35,共8页
【目的】探索青海高原型牦牛(Bos grunniens)生长激素受体(growth hormone receptor)基因GHR多态性及其与生长性状的关联性。【方法】以440头同等放牧条件下的30~36月龄健康牦牛为试验群体,PCR扩增其GHR基因,测序后用DNASTAR 7.1软件分... 【目的】探索青海高原型牦牛(Bos grunniens)生长激素受体(growth hormone receptor)基因GHR多态性及其与生长性状的关联性。【方法】以440头同等放牧条件下的30~36月龄健康牦牛为试验群体,PCR扩增其GHR基因,测序后用DNASTAR 7.1软件分析单核苷酸多态性(SNP)位点,研究不同基因型及其合并基因型与生长发育指标(体质量、体高、体斜长、胸围和管围)的关联性。【结果】青海高原型牦牛GHR基因上存在g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A 3个SNP位点,其中g.732195A>G上存在2种基因型(AA,AG),g.732091C>G和g.732373G>A上各存在3种基因型(分别为CC、CG、GG和GA、AA、GG);卡方检验表明,g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A均处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态,且g.732195A>G为低度多态(PIC<0.25),g.732091C>G和g.732373G>A为中度多态(0.25<PIC<0.50)。与生长性状的关联性分析发现,g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A能够显著或极显著影响高原型牦牛的体质量和胸围,优势基因型分别为g.732091C>G和g.732373G>A的GG以及g.732195A>G的AA。对合并基因型分析发现,合并基因型GG-AA-GG个体的生长发育尤其是体斜长表现最佳。【结论】青海高原型牦牛GHR基因有3个SNP位点,因其与青海高原型牦牛的部分生长性状相关,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因。 展开更多
关键词 高原型牦牛 GHR基因 SNP位点 基因多态性 合并基因型
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牦牛乳蛋白多态性对奶酪凝乳特性的影响
6
作者 谈婷 罗毅皓 +1 位作者 孙万成 孙祥祥 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期40-49,共10页
为了检测青海部分地区7家不同牧场牦牛乳κ-酪蛋白和αs1-酪蛋白基因多态性,作者分析了基因多态性对奶酪凝乳特性的影响。通过提取牦牛乳体细胞,采用限制性片段长度多态性聚合酶链式反应(polymerase chain reaction-restrition fragment... 为了检测青海部分地区7家不同牧场牦牛乳κ-酪蛋白和αs1-酪蛋白基因多态性,作者分析了基因多态性对奶酪凝乳特性的影响。通过提取牦牛乳体细胞,采用限制性片段长度多态性聚合酶链式反应(polymerase chain reaction-restrition fragment length polymophism,PCR-RFLP)分析技术,对提取的DNA进行PCR扩增及酶切,对电泳条带进行基因分型;提取牦牛乳蛋白,采用高效液相色谱法(high performance liquid chromatography,HPLC)分析各样品与标准品色谱图,对出峰时间和出峰形状进行基因分型。利用流变仪测定不同基因型牦牛乳凝乳过程中流变特性,记录奶酪凝乳时间,计算奶酪得率。牦牛乳κ-酪蛋白基因有AA型、AB型和BB型3种基因型,3种基因型与凝乳特性的分析表明,在凝乳时间方面A等位基因为有利等位基因。牦牛乳αs1-酪蛋白存在AA型、AB型和BB型3种类型,3种基因型与凝乳特性的分析表明,在凝乳时间、奶酪得率、最大动力黏度和最大剪切速率方面B等位基因为有利等位基因。以上结果表明,青海7家牧场牦牛乳κ-酪蛋白和αs1-酪蛋白均存在基因多态性,κ-酪蛋白A等位基因和αs1-酪蛋白B等位基因是影响牦牛乳凝乳特性的主效基因。 展开更多
关键词 牦牛乳 蛋白质多态性 高效液相色谱法 限制性片段长度多态性聚合酶链式反应 凝乳特性
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西藏中部地区散养牦牛和绵羊细粒棘球绦虫cox1和nad1的多态性
7
作者 陈欣怡 梁宏 +4 位作者 赤列旺姆 扎西旺杰 德吉玉珍 唐文强 赵海龙 《中国高原医学与生物学杂志》 CAS 2024年第2期107-114,共8页
目的分析西藏中部地区散养牦牛和绵羊细粒棘球绦虫cox1、nad1的基因多态性。方法采集西藏中部地区45份散养牦牛和绵羊细粒棘球蚴包囊,提取包囊生发层DNA,根据细粒棘球蚴线粒体cox1、nad1基因序列设计扩增的引物序列,用PCR技术扩增线粒体... 目的分析西藏中部地区散养牦牛和绵羊细粒棘球绦虫cox1、nad1的基因多态性。方法采集西藏中部地区45份散养牦牛和绵羊细粒棘球蚴包囊,提取包囊生发层DNA,根据细粒棘球蚴线粒体cox1、nad1基因序列设计扩增的引物序列,用PCR技术扩增线粒体cox1、nad1基因片段,将扩增产物做琼脂糖凝胶电泳并测序;利用MEGA11.0软件做cox1、nad1序列特征与同源性比对,并构建系统进化树;运用DnaSP 5.0软件计算序列单倍型数量(H),分析核苷酸多样性(Pi)、单倍体型多样性(Hd)特性;利用Network软件为cox1、nad1基因的所有单倍体构建单倍体网络图,判断西藏中部地区散养牦牛和绵羊的主要单倍型。结果(1)cox1、nad1序列长度分别为925、839bp。(2)在cox1序列中,A、T、G、C碱基的平均含量分别为32.6%、33.1%、17.4%、16.9%;而nad1序列中,A、T、G、C碱基的平均含量为19.5%、47.6%、25.5%、7.4%;同源性分析结果显示,cox1序列之间的同源性为99.6%~100.0%,nad1序列之间的同源性为98.1%~100.0%;西藏中部地区散养牦牛和绵羊细粒棘球绦虫基因型为G1、G3、G6。(3)cox1、nad1单倍型个数分别为19个、7个,Hd、Pi分别为0.89600、0.56000和0.36500、0.00060。(4)单倍型网络图显示,Hc-2、Hc-12、Hn-1为西藏中部地区散养牦牛和绵羊的主要单倍型。结论西藏中部地区散养牦牛和绵羊细粒棘球绦虫基因型为G1、G3、G6,G1是主要基因型。上述结论为探明西藏中部地区细粒棘球蚴的分型和病原体遗传演化的情况提供了参考依据。 展开更多
关键词 西藏 散养 牦牛 绵羊 细粒棘球绦虫 cox1 nad1 基因 多态性
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吉拉牦牛重要经济性状分子选育潜力研究
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作者 张强 鲜莉莉 +7 位作者 彭阳洋 平措占堆 陈晓英 洛桑顿珠 达瓦琼达 崔建钊 俄广鑫 巴桑旺堆 《中国饲料》 北大核心 2023年第15期24-32,共9页
牦牛是我国青藏高原特有的宝贵生物资源,具有极强的生态适应性、独特的生物学效应和巨大的经济潜力,在青藏高原生态、社会、经济和文化中的意义不可替代。吉拉牦牛作为西藏日喀则地区特有地方品种资源,对当地牧业发展具有重要意义。本... 牦牛是我国青藏高原特有的宝贵生物资源,具有极强的生态适应性、独特的生物学效应和巨大的经济潜力,在青藏高原生态、社会、经济和文化中的意义不可替代。吉拉牦牛作为西藏日喀则地区特有地方品种资源,对当地牧业发展具有重要意义。本研究利用SNaPshot技术鉴定吉拉牦牛种群(111个体样本量)内14个已证实与牦牛生长、泌乳等经济性状显著相关SNP的基因型分布,进一步明确它们在吉拉牦牛群体分子选育潜力。结果显示:14个SNP标记在吉拉牦牛群体基因多样性丰富,且大部分标记座位上携带与经济性状相关的优势基因型,特别是ACSL1_A2079T、GHSR_T1387C、MyOD1_C1710T和TMEM18_C4447T等座位携带优势基因型比例较高。另外,全部位点在吉拉牦牛群体内未发现偏离哈代温伯格平衡,表明该群体作为地方资源品种,尚没有经过针对经济性状强力的人工选择。本研究通过对吉拉牦牛种群内经济性状候选标记的基因型频率分布鉴定,可为今后该牦牛品种分子育种提供数据参考。 展开更多
关键词 吉拉牦牛 单核苷酸多态性 经济性状 基因型频率
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四川牦牛PRSS2基因遗传多态性及其与肉品质性状的关联性分析 被引量:1
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作者 单晓雨 陆惠娴 +5 位作者 王君瑜 颜黎东 田孟鑫 孔品晴 姜平 赵志辉 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2023年第7期119-124,138-140,共9页
为了探讨丝氨酸蛋白酶2 (serine protease 2,PRSS2)基因的遗传多态性及其与四川牦牛肉品质性状的相关性,试验采用DNA直接测序法对93头四川牦牛PRSS2基因的遗传多态性进行研究,并使用Haploview 4.2软件对PRSS2基因的多态性位点进行连锁... 为了探讨丝氨酸蛋白酶2 (serine protease 2,PRSS2)基因的遗传多态性及其与四川牦牛肉品质性状的相关性,试验采用DNA直接测序法对93头四川牦牛PRSS2基因的遗传多态性进行研究,并使用Haploview 4.2软件对PRSS2基因的多态性位点进行连锁不平衡分析,探讨PRSS2基因单倍型组合个体与肉品质性状的相关性。结果表明:在四川牦牛PRSS2基因中一共发现了6个SNPs位点,分别为I3-151 G>A、I3-328 C>T、E4-53 C>T、E4-110 C>T、I4-87 A>T、I4-127 C>T,其中I3-328 C>T、E4-110 C>T位点与剪切力相关、I4-87 A>T位点与蒸煮损失和pH24 h值相关;I4-127 C>T位点与pH45 min值相关;H4H4单倍型组合个体的红度(a*)显著高于H1H4单倍型组合个体(P<0.05);H1H3和H2H3单倍型组合个体的蒸煮损失显著低于H2H4和H3H3单倍型组合个体(P<0.05);H2H4、H1H2、H1H4和H3H3单倍型组合个体的剪切力显著高于H1H1和H1H3单倍型组合个体(P<0.05)。说明四川牦牛PRSS2基因中存在6个SNPs位点,H4H4、H1H3、H2H3和H1H1单倍型组合可作为筛选牦牛肉肉色、系水力和嫩度的最优单倍型组合。 展开更多
关键词 PRSS2基因 单核苷酸多态性 四川牦牛 肉品质 分子标记
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中国部分牦牛品种线粒体DNA遗传多态性研究 被引量:59
10
作者 赖松家 王玲 +1 位作者 刘益平 李学伟 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第5期463-470,共8页
采用DNA测序技术首次测定了中国5个牦牛品种(类群)35个个体线粒体DNA控制区(D loop)全序列,结果表明:牦牛线粒体DNA控制区全序列长度为891~895bp,T、C、A、G4种核苷酸的含量分别为28.5%、25.3%、32.5%、13.7%。检测到55个变异位点,约... 采用DNA测序技术首次测定了中国5个牦牛品种(类群)35个个体线粒体DNA控制区(D loop)全序列,结果表明:牦牛线粒体DNA控制区全序列长度为891~895bp,T、C、A、G4种核苷酸的含量分别为28.5%、25.3%、32.5%、13.7%。检测到55个变异位点,约占分析位点总数的6.16%,核甘酸变异类型有转换、颠换、插入/缺失4种。确定了24种单倍型,单倍型H4和H6为中国牦牛的主体单倍型,各单倍型在品种间分布不平衡,所测定的5个牦牛品种(类群)单倍型多样度平均为0.9697±0.0180,说明我国牦牛D loop单倍型类型丰富。牦牛品种内各序列平均核苷酸差异数为10.936,核苷酸多样度为1.231%;牦牛品种间核苷酸分歧度(Dxy)约为0.760%~2.155%,品种间双参数距离范围为0.000~0.029,表明我国牦牛遗传多态性丰富。对D环序列变异的分子方差分析和单倍型网络关系图的结果表明:我国牦牛品种间出现显著的遗传分化,牦牛单倍型网络关系图聚为2个聚类簇,表明我国牦牛有2个母系来源,或者有2个主要的驯化地点。 展开更多
关键词 牦牛 多态性 D-LOOP 单倍型
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牦牛乳中上皮粘蛋白MUC1的遗传多态性研究 被引量:9
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作者 郑玉才 彭先文 +4 位作者 钟光辉 毛永江 王永 邹思湘 陈杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期235-238,共4页
采用SDS PAGE研究了 10 8头麦洼牦牛和 98头九龙牦牛乳MUC1的生化遗传特性 ,结果表明 :牦牛乳MUC1呈现出多态性 ,表现为一条或两条迁移率不同的区带。SDS PAGE分析发现 4种分子量的MUC1区带 ,依次为A :2 0 8kd ,B :2 0 0kd ,C :196kd ,D... 采用SDS PAGE研究了 10 8头麦洼牦牛和 98头九龙牦牛乳MUC1的生化遗传特性 ,结果表明 :牦牛乳MUC1呈现出多态性 ,表现为一条或两条迁移率不同的区带。SDS PAGE分析发现 4种分子量的MUC1区带 ,依次为A :2 0 8kd ,B :2 0 0kd ,C :196kd ,D :185kd ,分子量大于荷斯坦牛。麦洼牦牛乳MUC1基因座受A、B、C、D 4个复等位基因支配 ,有 9种基因型 ;九龙牦牛乳MUC1基因座受A、C、D 3个复等位基因支配 ,显示 5种基因型。两品种牦牛乳MUC1基因型分布差异极显著 (P <0 0 1) ,并且均偏离哈代—温伯格定律 (P <0 0 1) 。 展开更多
关键词 牦牛乳 上皮粘蛋白 MUC1 遗传多态性
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中国牦牛乳蛋白遗传多态性及其与泌乳性能相关性研究 被引量:17
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作者 毛永江 钟光辉 +4 位作者 郑玉才 彭先文 杨章平 王永 江明峰 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期291-295,共5页
利用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对109头麦洼牦牛和100头九龙牦牛乳蛋白多态性进行分型,并采用最小二乘法分析乳蛋白多态性与泌乳性能及乳蛋白组分之间的相关性。结果表明,β-CN、κ-CN和α-La呈单态,基因型分别为AA、BB和BB型;而αs1-CN... 利用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对109头麦洼牦牛和100头九龙牦牛乳蛋白多态性进行分型,并采用最小二乘法分析乳蛋白多态性与泌乳性能及乳蛋白组分之间的相关性。结果表明,β-CN、κ-CN和α-La呈单态,基因型分别为AA、BB和BB型;而αs1-CN和β-Lg呈多态,αs1-CN 的D基因为优势基因,在麦洼牦牛和九龙牦牛中的频率分别为0.8073和0.6000, β-Lg座位优势基因为β-Lg E,在麦洼牦牛和九龙牦牛中的频率分别为0.9770和0.9700;麦洼牦牛和九龙牦牛群体平均杂合度分别为0.1021和0.1867;在2品种牦牛群体中,除αs1-CN基因座对九龙牦牛乳脂率有显著影响外(P<0.05),其余乳蛋白基因座对泌乳性能及乳蛋白相对含量均无显著影响(P>0.05)。 展开更多
关键词 中国牦牛 乳蛋白 遗传多态性 泌乳性能 相关性
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牦牛MSTN基因内含子2多态性及与生长性状的相关性 被引量:21
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作者 梁春年 阎萍 +6 位作者 刑成峰 裴杰 郭宪 包鹏甲 丁学智 褚敏 朱新书 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期285-289,共5页
采用PCR-SSCP技术对大通牦牛、甘南牦牛和天祝白牦牛(共277头)肌肉抑制素基因(MSTN)内含子2的部分序列进行了多态性研究,分析该基因与牦牛生长性状的相关性。结果表明,牦牛MSTN基因内含子2存在2个等位基因和3种基因型。在该基因座上,甘... 采用PCR-SSCP技术对大通牦牛、甘南牦牛和天祝白牦牛(共277头)肌肉抑制素基因(MSTN)内含子2的部分序列进行了多态性研究,分析该基因与牦牛生长性状的相关性。结果表明,牦牛MSTN基因内含子2存在2个等位基因和3种基因型。在该基因座上,甘南牦牛、天祝白牦牛呈Hardy-Weinberg平衡状态,大通牦牛呈不平衡状态。3种基因型与牦牛部分生长性状的最小二乘法分析表明,MSTN基因内含子2对成年牦牛胸围、体质量、胸围指数、体长指数和肉用指数均显著相关(P<0.05),而不同基因型的牦牛体高、管围、体长和管围指数差异不显著。初步推断牦牛MSTN基因内含子2可作为牦牛标记辅助选择的遗传标记之一。 展开更多
关键词 牦牛 MSTN基因 多态性 遗传标记 PCR-SSCP
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麦洼牦牛H-FABP、HSL基因多态性及与生长性状的相关分析 被引量:17
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作者 柴志欣 王永 +3 位作者 罗晓林 武志娟 刘仲娜 钟金城 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第14期3022-3031,共10页
【目的】探讨心脏脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid-binding protein,H-FABP)、激素敏感脂肪酶(hormone-sensitive lipase,HSL)基因在牦牛中的遗传多态性,进一步揭示牦牛各品系间的遗传分化以及候选基因与牦牛生长性状间的关联性,同时为... 【目的】探讨心脏脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid-binding protein,H-FABP)、激素敏感脂肪酶(hormone-sensitive lipase,HSL)基因在牦牛中的遗传多态性,进一步揭示牦牛各品系间的遗传分化以及候选基因与牦牛生长性状间的关联性,同时为2个候选基因在牦牛中的表达调控等研究提供理论依据,寻找可用于辅助选择的分子标记。【方法】采用PCR-SSCP技术和DNA测序技术对共100头麦洼牦牛个体的H-FABP、HSL基因的外显子部分进行遗传多态性分析,统计基因和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算纯合度、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传多态指标,分析候选基因不同基因型与体高、体重、体斜长、胸围、管围等生长性状的关联性。【结果】①麦洼牦牛H-FABP、HSL基因外显子部分均存在多态性,多态性检验均存在3种基因型;②适合性检验表明仅HSL基因外显子8上多态位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,其余多态位点均偏离;③测序分析表明,H-FABP基因外显子4第7 339位(与原序列相比)发生单碱基突变(T→C),该突变属同义突变;HSL基因外显子7第6 883位发生G→C转换,以及第6816处发生碱基A→G突变,并导致编码氨基酸由天冬氨酸(D)转变为甘氨酸(G);外显子8第10 183 bp处发生A→G碱基突变,编码氨基酸由半胱氨酸(C)变为甘氨酸(G);④对各标记基因型生长发育指标(体高、体斜长、胸围、管围、体重)进行差异显著性检验,仅HSL基因外显子7上A6816G基因座差异极显著(P﹤0.01)。【结论】麦洼牦牛H-FABP、HSL基因存在遗传多态性,且HSL基因外显子7上A6816G基因座表现的多态有可能作为一种遗传标记。 展开更多
关键词 麦洼牦牛 H-FABP基因 HSL基因 多态性
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牦牛LPL基因外显子7多态性与生长性状相关性的研究 被引量:14
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作者 梁春年 邢成峰 +6 位作者 阎萍 丁学智 裴杰 郭宪 包鹏甲 褚敏 朱新书 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2010年第5期16-19,共4页
采用PCR-SSCP技术对5个牦牛品种共398头牦牛脂蛋白脂肪酶基因(LPL)外显子7进行了多态性研究,分析了该基因与牦牛生长性状的相关性。结果表明,牦牛LPL基因外显子7存在2个等位基因3种基因型。各群体在该基因座上呈Hardy-Weinberg平衡状态... 采用PCR-SSCP技术对5个牦牛品种共398头牦牛脂蛋白脂肪酶基因(LPL)外显子7进行了多态性研究,分析了该基因与牦牛生长性状的相关性。结果表明,牦牛LPL基因外显子7存在2个等位基因3种基因型。各群体在该基因座上呈Hardy-Weinberg平衡状态。三种基因型与牦牛部分生长性状的最小二乘法分析表明,该位点多态与牦牛的体重、体高、胸围存在显著相关(P<0.05),BB型个体体重、体高、胸围显著高于AA和AB型个体。初步推断牦牛LPL基因第7外显子可作为牦牛标记辅助选择的遗传标记之一。 展开更多
关键词 牦牛 LPL基因 多态性 性状标记 PCR-SSCP
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牦牛MSTN基因内含子Ⅱ遗传多样性研究 被引量:9
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作者 梁春年 阎萍 +6 位作者 刑成峰 王丁克 裴杰 郭宪 曾玉峰 包鹏甲 褚敏 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2009年第5期16-19,共4页
利用PCR-SSCP技术研究了5个牦牛群体共计401头个体的MSTN基因第2内含子的多态性。结果表明:牦牛MSTN基因第2内含子存在多态性,测序发现该片段第192 bp处有一个A到G的单碱基突变。所检测的5个牦牛群体中,除新疆巴州牦牛群体未检测到AA基... 利用PCR-SSCP技术研究了5个牦牛群体共计401头个体的MSTN基因第2内含子的多态性。结果表明:牦牛MSTN基因第2内含子存在多态性,测序发现该片段第192 bp处有一个A到G的单碱基突变。所检测的5个牦牛群体中,除新疆巴州牦牛群体未检测到AA基因型,其他4个群体中均发现AA、AB和BB 3种基因型,大通牦牛、甘南牦牛、青海高原牦牛群体中均以BB型为优势基因型,而天祝白牦牛和新疆巴州牦牛则以AB为优势基因型。不同牦牛群体中均检测到A,B两个等位基因,并且B基因频率均高于A基因频率,B等位基因为各牦牛群体中的优势等位基因。各群体经过χ2检验,在该基因座上,甘南牦牛、天祝白牦牛、青海高原牦牛3个群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),大通牦牛、新疆巴州牦牛两个群体处于不平衡状态(P<0.05)。分析了5个牦牛群体的遗传结构,发现大通牦牛的基因杂合度、有效等位基因数、多态信息含量等均最低,分别为:0.171,1.207,0.157;而天祝白牦牛的基因杂合度,有效等位基因数、多态信息含量等均最高,分别为:0.490,1.961,0.370;新疆巴州牦牛的基因杂合度、有效等位基因数、多态信息含量等均略低于天祝白牦牛。 展开更多
关键词 牦牛 MSTN基因 内含子Ⅱ PCR-SSCP 多态性
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转铁蛋白受体基因多态性与IgA肾病易感性及临床病理表型的相关性 被引量:9
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作者 冯现竹 侯平 +2 位作者 朱厉 于磊 张宏 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期369-373,共5页
目的:探讨转铁蛋白受体基因(TFRC)多态性与中国汉族人群IgA肾病遗传易感性及临床病理表型的相关性。方法:采用聚合酶链反应-限制片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymor-phism,PCR-RFLP)分析转... 目的:探讨转铁蛋白受体基因(TFRC)多态性与中国汉族人群IgA肾病遗传易感性及临床病理表型的相关性。方法:采用聚合酶链反应-限制片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymor-phism,PCR-RFLP)分析转铁蛋白受体基因TFRC多态性并鉴定基因型,采用病例-对照研究比较正常人与IgA肾病患者基因型的分布频率,并比较不同基因型与患者临床病理表型之间的相关性。结果:(1)380例IgA肾病患者TFRC基因的424G/A及-5184C/T多态性与250例正常对照相比,基因型分布频率差异无统计学意义(P>0.05);(2)临床资料显示,年龄、性别、血压、血尿、血肌酐水平、内生肌酐清除率及血清IgA水平等临床指标与TFRC424G/A及-5184C/T基因型不具有相关性。(3)病理资料显示,TFRC基因424G/A和-5184C/T基因型分布与肾活检标本中肾小球系膜区IgA沉积的荧光强度相关,424GG或-5184CC基因型患者系膜区IgA沉积的荧光强度较低,差异有统计学意义(P<0.05),但与肾病理损害程度(Haas分级)无明显相关性。结论:TFRC的424G/A及-5184C/T多态性与IgA肾病遗传易感性无关,但与系膜区IgA沉积的荧光强度相关。基因其他部位的多态位点与IgA肾病的发病,以及该基因的多态位点与其他基因的多态位点间的交互作用还需要进一步研究。 展开更多
关键词 受体 转铁蛋白 肾小球肾炎 IGA 多态性 单核苷酸
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甘南牦牛H-FABP基因CDS区多态性及生物信息学分析 被引量:14
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作者 曹健 罗玉柱 +3 位作者 胡江 刘秀 李少斌 吴应童 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期14-20,共7页
应用PCR产物混合样本DNA池法检测甘南牦牛心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因CDS区多态性,并应用生物信息学方法分析甘南牦牛H-FABP蛋白质特性.结果表明:甘南牦牛H-FABP基因CDS区序列与九龙牦牛相同,而与普通牛对比在第3外显子存在*76G&g... 应用PCR产物混合样本DNA池法检测甘南牦牛心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因CDS区多态性,并应用生物信息学方法分析甘南牦牛H-FABP蛋白质特性.结果表明:甘南牦牛H-FABP基因CDS区序列与九龙牦牛相同,而与普通牛对比在第3外显子存在*76G>A的同义突变;甘南牦牛H-FABP氨基酸序列没有明显的疏水性区域,也未形成跨膜螺旋区及信号肽,推测其主要在细胞质中发挥生物学作用;甘南牦牛H-FABP基因编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主的mixed型;氨基酸序列与普通牛、山羊、马、人、小鼠、大鼠、鸡、草雀及绿鸭9个物种间同源性较高,与其实际亲缘关系远近一致. 展开更多
关键词 甘南牦牛 H-FABP基因 多态性 生物信息学
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牦牛FSHR基因部分序列多态性及其与繁殖性状的关联分析 被引量:8
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作者 王明亮 高旭东 +3 位作者 陈鹏 郝明超 刘犇 余四九 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期239-247,共9页
本研究旨在分析牦牛FSHR基因5’端及第一外显子的多态性,并分析其与繁殖性状的关联性,为从遗传角度上解决牦牛产犊间隔过长的问题提供参考。以4个种群的667头牦牛为研究对象,应用PCR-SSCP方法检测FSHR基因的多态性,并用最小二乘法分析... 本研究旨在分析牦牛FSHR基因5’端及第一外显子的多态性,并分析其与繁殖性状的关联性,为从遗传角度上解决牦牛产犊间隔过长的问题提供参考。以4个种群的667头牦牛为研究对象,应用PCR-SSCP方法检测FSHR基因的多态性,并用最小二乘法分析雌性个体该基因多态性与产犊间隔的关系。结果表明,三个扩增片段共获得牦牛FSHR基因940 bp的序列,由5’端和第一外显子组成,与其它哺乳动物的对应序列有较高的同源性。共发现9处突变位点,其中一处位于开放阅读框内,但属于同义突变。不同种群间的产犊间隔差异显著(P<0.05);FSHR基因不同基因型对产犊间隔影响差异不显著(P>0.05),但AB、LL、LM、LN及RT基因型均有缩短牦牛产犊间隔的趋势。 展开更多
关键词 牦牛 FSHR基因 多态性 繁殖性状 关联分析
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牦牛GH基因多态性的PCR-SSCP分析 被引量:10
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作者 白晶晶 胡江 +2 位作者 成述儒 王继卿 罗玉柱 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期1-5,共5页
采用PCR-SSCP技术对天祝白牦牛和青海高原牦牛的生长激素基因(GH基因)5个外显子及部分内含子序列进行遗传变异分析,以探讨牦牛GH基因的遗传特性.结果表明:2个牦牛群体GH基因第1、第2和第4外显子无多态性,第3内含子1694bp处均发生T→C转... 采用PCR-SSCP技术对天祝白牦牛和青海高原牦牛的生长激素基因(GH基因)5个外显子及部分内含子序列进行遗传变异分析,以探讨牦牛GH基因的遗传特性.结果表明:2个牦牛群体GH基因第1、第2和第4外显子无多态性,第3内含子1694bp处均发生T→C转换,形成A、B2个等位基因,并检测到AA、AB和BB共3种基因型;天祝白牦牛第5外显子2373bp处发生G→T碱基颠换,形成C、D2个等位基因,检测到CC和CD2种基因型,但碱基改变并未引起氨基酸变化,因此这种碱基转换为沉默突变;天祝白牦牛和青海高原牦牛均为低度多态,经Hardy-Weinberg平衡检验2个牦牛群体均处于非平衡状态. 展开更多
关键词 牦牛 GH基因 PCR-SSCP 多态性
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