2007年深圳市Yamagata系B型流感病毒基因特性的分析

目的分析2007年深圳市Yamagata系B型流感病毒血凝素(HA)基因的特性。方法将2007年深圳市分离到的Yamagata系B型流感毒株进行血凝素HA片段核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,用SIMMONIC软件和Mega软件对其进行分析。结果2007年在深圳市流行的Yamagata系B型流感病毒根据197-199位氨基酸的差异可以划分为A、B、C3个分支。分支C在197位上有糖基化位点的增加,而分支A、B则未在该区域呈现出糖基化位点的特征性结构。此外与今年的国内代表株B/Fujianxinluo/54/06相比,除了40号位点上的氨基酸变异为共同存在外,其余大多数的氨基酸点变异是散发存在的。部分的变异位点处在HA1区的抗原表位,可能会导致病毒的抗原性改变。结论2007年在深圳市流行的Yamagata系B型流感病毒与B/Fujianxinluo/54/06相比基因特性已发生变化,并呈现出多样性的变化趋势。

Yamagata系乙型流感病毒血凝素蛋白单克隆抗体制备及双抗体夹心ELISA检测方法的建立

目的制备Yamagata系乙型流感病毒血凝素蛋白(hemagglutinin,HA)的特异性单克隆抗体,建立检测Yamagata系乙型流感病毒的双抗体夹心ELISA方法。方法用Yamagata系乙型流感病毒(B/Phuket/3073/2013)抗原免疫BALB/c小鼠,取免疫小鼠脾细胞与骨髓瘤SP2/0细胞进行融合,通过4次有限稀释获得阳性杂交瘤细胞并建株。将单克隆抗体1F7和2H6分别作为捕获抗体和检测抗体,建立一种检测Yamagata系乙型流感病毒的双抗体夹心ELISA法。结果该方法中捕获抗体1F7在96孔板的包被量为40 ng/孔,检测抗体2H6工作浓度为100 ng/孔;该方法仅能与Yamagata系乙型流感病毒发生反应,具有较强特异性。灵敏度分析显示,该方法对病毒尿囊液和病毒纯化HA蛋白最低检测值分别为2-1 HAU/100μL和1.22 ng/mL,具有较高灵敏度。重复性试验表明,该方法批内和批间重复性变异系数均小于5%。结论本研究建立的ELISA方法特异性强、灵敏度高、重复性好,为Yamagata系乙型流感病毒快速诊断及定量检测提供技术支持。

2017年深圳市学校乙型/Yamagata系流感传播动力学研究及防控措施评价

目的探讨2017年深圳市乙型Yamagata系(B/Y)流感在学校暴发疫情中的传播能力,评价疫苗接种和隔离措施的防控效果。方法运用SEIAR动力学模型对暴发现场调查数据进行模拟,计算疫情的基本再生数(R0)评价B/Y的传播能力;设计SEIARV疫苗接种模型和SEIARQ隔离模型,计算累计罹患率(TAR)和暴发持续时间(DO),评价疫苗接种与隔离措施的防控效果。结果 2017年深圳市B/Y流感暴发疫情的R0为5.97(95%CI:3.66~8.28);无干预措施下模拟疫情将持续52 d,TAR为99.57%。模拟单独采取在疫情发生前接种流感灭活疫苗(IIV),当接种比例为30%、50%和70%时,接种三价流感灭活疫苗(IIV3)或四价流感灭活疫苗(IIV4)的TAR分别为80.51%/76.81%、65.07%/58.48%和44.06%/33.77%;模拟单独采取疫情发生后应急接种,当接种比例为30%、50%和70%时,接种IIV3/IIV4的TAR分别为85.94%/82.46%、73.55%/67.03%和57.90%/47.54%;当接种比例≥50%,如采取疫情发生前疫苗接种+隔离的联合干预措施,TAR均<1%;如采取疫情发生后应急接种+隔离,TAR均<5%。结论 2017-2018年流感季B/Y在学校暴发疫情中传播能力较强;无论接种IIV3或IIV4,高覆盖率的疫苗接种结合隔离措施是有效的流感防控措施。

2012年邯郸市乙型Yamagata系流感病毒HA1基因变异分析

目的研究邯郸市2012年流感监测中分离的Yamagata系乙型流感毒株HA1的抗原性和基因特性，阐明HA1基因的变异与流感流行的关系。方法用MDCK细胞分离培养流感病毒，提取病毒核酸，采用RT—PCR方法特异性扩增病毒HA1基因，进行核苷酸序列测定，用DNAStar中Megalign软件进行分析。结果2012年分离的Yamagata系乙型流感病毒与2008-2009年代表株B／Florida／4／2。06相比亲缘关系较远，核苷酸同源性为96．2％～96．8％，氨基酸同源性为96．5％～97．4％，HA1区9个位点氨基酸发生替换，其中6个参与抗原表位构成；与WHO推荐的2012～2013年疫苗株B／Wisconsin／01／2010相比亲缘关系近，核苷酸同源性为98．8％～99．4％，氨基酸同源性为97．4％～98．5％，有5个位点发生氨基酸替换，其中3个参与抗原表位的构成；与国家流感中心提供的标准抗血清的血凝抑制滴度≥1：640。结论邯郸市2012年分离的Yamagata系乙型流感病毒血凝素蛋白HA1与B／Florida／4／2006相比已形成新的变种，与B／Wisconsin／01／2010相比也发生了新的变异，但尚不能确定是否形成Yamagata系有代表性的新变种。

新余市2013年-2014年B型Yamagata系流感病毒HA1基因特性分析

目的了解2013年-2014年新余市Yamagata系乙型流感病毒的序列特性和变异特点,分析WHO推荐流感疫苗株对人体的保护情况。方法选取新余市2013年-2014年通过狗肾传代细胞（MDCK）培养分离到的Yamagata系乙型流感毒株9株,提取病毒RNA,反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）扩增HA1基因片段,对序列进行处理和特性分析。结果 2013年-2014年的乙型流感病毒均为B型Yamagata系。9株流感毒株HA1区与疫苗推荐株B/Wisconsin/01/2010的核苷酸同源性为97.8%～99.4%,氨基酸替换数为3个～4个,其中8株均在3个相同的氨基酸位点发生变异;与代表株B/Yamagata/16/1988的核苷酸同源性为94.4%～96.2%。B/Jiangxi Yushui/1221/2014与疫苗株B/Massachusetts/02/2012的核苷酸同源性为99.3%,氨基酸替换数为3个。结论新余市2013年-2014年B型Yamagata系流感病毒都发生了抗原性变化,WHO推荐的2011年-2012年疫苗对88.89%的B型Yamagata系流感仍有预防效果,当年度的疫苗株能很好地预防另外11.11%流感的流行。

莆田市2013—2018年流感病毒B/Yamagata系HA1基因特征分析

目的分析莆田市乙型流感病毒B/Yamagata系毒株血凝素HA1区基因变异特征和种系进化关系,为流感防控提供数据支持。方法选取2013—2018年的26株B/Yamagata系原始标本,对HA1区进行测序,运用DNAstar 7.1进行同源性分析,用Mega 7.0构建进化树。结果与相应年份WHO推荐的疫苗株相比,2013年和2015年莆田市B/Yamagata系毒株HA1区同源性分别为94.6%~95.0%和95.8%~95.9%,普遍存在150、165、202抗原决定簇氨基酸位点变异。2016—2018年B/Yamagata系毒株基因变异较小,同源性为98.1%~99.2%,均出现D196N位点的变异。结论莆田市2013年和2015年B/Yamagata系毒株与疫苗株匹配程度不高,且抗原特性改变较大。2016—2018年B/Yamagata系毒株HA1区基因同源性较高,WHO推荐疫苗株B/Phuket/3073/2013对人群仍有良好的免疫保护作用。

流感季来临,如何预防流感的发生

流感是怎么传播的流行性感冒简称流感,是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病。流感病毒分为甲、乙、丙、丁四型,目前引起流感季节性流行的病毒是甲型病毒中的H1N1、H3N2亚型及乙型病毒中的Victoria和Yamagata系。

珠海市2007-2008年乙型流感病毒基因特性分析

目的了解珠海市近两年乙型流感病毒的基因变异情况。方法采集珠海市流感样病例样本进行流感病毒的分离和鉴定,并对分离到的乙型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定,用Mega、DNA Star、GeneDoc软件对测序结果进行分析处理,并与WHO推荐的疫苗株基因序列进行比对。结果 2007-2008年分离的乙型流感毒株分属于Yamagata系和Victoria系两个谱系,谱系内毒株间距离很近。Yamagata系毒株与B/Brisbane/3/2007的核苷酸同源性极高,在99.4%~99.7%之间;Victoria系乙型流感病毒株与B/Malasia/2506/2004的核苷酸同源性亦很高,在98.6%~99.1%之间。与疫苗株和其它流行株相比,本次分离的两个谱系毒株均未发现核苷酸的丢失和插入,但均增加一个潜在的糖基化位点。结论珠海市人群交替流行着Yamagata系和Victoria系两个抗原性不同的进化系的乙型流感病毒,病毒的基因发生了变异。2007-2008两年WHO推荐的乙型流感疫苗株与我地区当年流行株为不同谱系毒株,预防保护效果不好。

浙江省乙型流感病毒HA_1基因分析

目的：了解浙江省近几年乙型流感病毒的基因变异情况和WHO推荐流感疫苗株对浙江省人体的保护情况。方法：采集浙江省类流感样本进行流感病毒的分离和鉴定，并对分离到的乙型流感病毒进行核酸的提取，采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定，用DNAMAN和BioEdit生物软件对测序结果进行分析处理，并与WHO推荐疫苗株基因进行比对。结果：分离到Yamagata系和Victoria系两个进化系的乙型流感病毒，两系毒株均未发现核苷酸的丢失和插入，糖基化位点没有太大改变。毒株之间核苷酸的同源性为95.25%，氨基酸的同源性为95.28%。Yamagata系毒株HA1区域核苷酸序列长度为1038 bp，推导的氨基酸序列长度为346个，氨基酸变异替换数在6-8之间；Victoria系毒株HA1区域的核苷酸序列长度为1041 bp，推导的氨基酸序列长度为347个，氨基酸变异替换数在2-8之间，相比Yamagata系毒株在163位上都多1个天冬酰胺（N）。基因进化树上可见明显的Yamagata系和Victoria系两个分支。结论：浙江省人群交替流行着Yamagata系和Victoria系两个抗原性不同的进化系的乙型流感病毒，病毒的基因发生了变异，抗原已发生漂移。2001、2006两年WHO推荐乙型流感疫苗株与我省当年流行株为不同谱系毒株，预防保护效果不够理想，其余年份为同一谱系毒株，预防保护效果较好。

新冠疫情下话流感

流行性感冒(简称流感)是流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病。全国流感监测结果显示,每年10月我国各地陆续进入流感流行季节。流感病毒分为甲、乙、丙、丁四型。目前感染人的主要是甲型流感病毒中的H1N1、H3N2亚型及乙型流感病毒中的Victoria和Yamagata系。

80例流感病例的临床特点分析

目的探讨甲型流感病毒中的H1N1、非H1N1(H3N2亚型及乙型流感病毒Yamagata系)流感患者的临床特点。方法回顾性分析80流感患者的临床资料,根据流感病例咽拭子病毒株分离为甲乙型3种流感组,根据病情严重程度分为轻症流感组与重症组,并对每例病患的发病年龄、呼吸道症状、影像学资料、治疗和预后进行分析。结果 H1N1组与非H1N1组发病年龄相近(P>0.05);两组外周血白细胞、中性粒细胞比例及淋巴细胞比例均无明显升高或降低(P>0.05);17例患者诊断为重症流感,轻症及重症患者实验室检查相比较外周血白细胞升高、降钙素原升高、淋巴细胞比例显著下降(P均<0.05),最低淋巴细胞比例组间比较差异有统计学意义(P<0.05)。有5例患者并发ARDS及多器官功能障碍,治疗无效死亡。结论甲型H1N1流感与其他类型流感很难从症状、外周血象与其他流感区分,轻症患者预后良好,重症患者外周血实验室结果及影像学检查有一定特点,可早期诊断和治疗,减少病死率。

打了疫苗,就一定不得流感了吗

每年,世界卫生组织(WHO)都会根据前一年的全球流感疫情,来分析预测当年将会有哪些流感毒株流行。然后各国会根据WHO的建议,制作相应的疫苗。大家会发现,今年的流感疫苗从三价升级为四价。这就是国家根据去年流感病毒流行的情况,在原有的三种型别病毒成分基础上,新添加了乙型Yamagata系的流感病毒成分。新的四价疫苗所覆盖的四种亚型是最常见的流感病毒,90%以上的流感都是由这四种病毒引起的。可以说,接种四价流感疫苗后可预防90%的流感。

流感来袭,我们该怎样科学应对

流感是流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病,甲型和乙型流感病毒每年呈季节性流行,其中甲型流感病毒可引起世界范围内的大流行,乙型流感引起的季节性流行也可在世界范围内传播。目前引起流感季节性流行的是甲型中的H1N1、H3N2亚型及乙型病毒的Victoria和Yamagata系。

2015-2017年盐城市乙型流感病毒HA1、NA基因分子特征

目的对盐城市2015-2017年流行的乙型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因进行分子进化特征研究。方法将盐城市2015-2017年流感监测哨点医院以及流感暴发点采集的流感样病例咽拭子标本进行核酸、病毒分离检测定型,对选取的18株乙型流感病毒分离株采用一步法RT-PCR方法扩增其HA1基因和NA基因,扩增产物经纯化测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸以及分子进化层面对毒株进行分子特征分析。结果盐城市2015-2017年分离的乙型流感病毒HA1基因和NA基因聚类的分支关系基本一致,2015年Yamagata系毒株位于Yamagata Clade 3分支,属Phuket/3073类毒株;2016-2017年Victoria系毒株分布于Victoria Clade 1A分支,属Brisbane/60类毒株。Yamagata系所有毒株在190-helix抗原表位均发生了D196N位点的变异;Victoria系毒株共涉及2个抗原表位,120-loop抗原表位的117、129位点,190-helix抗原表位的197、199位点。盐城株未发生系内、系间重配。18株分离株未发生NA蛋白酶活性位点以及耐药位点的变化。结论 2015年Yamagata系毒株与疫苗株B/Phuket/3073/2013匹配性较好。2016-2017年Victoria系毒株HA1和NA抗原基因变异位点在积累,这些变异位点的积累很可能会导致流感病毒发生实质性的抗原性的漂移,降低与流感疫苗株的匹配度,减弱流感疫苗的保护作用。

2019年不同类型流感病毒在佛山地区流行特征分析

2017-2018年间,流感病毒在我国流行态势严重,为探讨佛山地区流感病毒的流行特征,为佛山市流感的防控提供科学依据,本研究搜集2019年佛山市流感监测哨点医院采集的流感样病例标本,采用实时荧光RT-PCR检测流感病毒核酸,分析佛山市流感流行病学数据库病人详细信息,分析流行趋势及病毒流行的类型,为制定流感的防控提供科学依据。结果显示:2019年共检测流感样病例咽拭子标本1356例,流感病毒核酸检测阳性率为25.52%,甲型流感病毒阳性率为19.17%,乙型流感病毒阳性率为6.34%。不同职业人群共18个,小学生(7.67%),幼托儿童(3.17%)流感病毒核酸检测阳性率较高。把年龄分成5个年龄段进行分析,流感阳性率最高的是25~59岁组与5~14岁组。2019年佛山地区主要检出新甲H1型、季H3型、BV型三种型别,1月份,12月份为流感活跃的两个高峰,各型别在不同的时间交替或共同流行。不同性别的人群流感阳性率差异无统计学意义。不同型别病毒株在不同性别人群间阳性率差异无统计学意义。本研究结果提示佛山地区主要以甲型流感流行为主,优势亚型为新甲H1型,季H3型,部分乙型流感患者,以BV型为主。流感病毒感染的重点人群是小学生与幼托儿童,不同类型的流感病毒,在不同性别人群间感染无差异。通过对2019年佛山市流感流行特征的分析可以为佛山市流感的防控提供科学依据。

2011年-2016年唐山地区B型流感病毒血凝素基因特性分析

目的分析2011年-2016年唐山地区B型流感血凝素基因特征。方法对唐山市哨点医院流感样病例咽拭子标本进行核酸检测,阳性标本采用MDCK细胞分离培养,选取10株B型流感病毒进行HA1基因测序,分析其核苷酸序列特征及氨基酸变异情况。结果进化分析显示,唐山地区B型流感病毒分为B/Victoria系和B/Yamagata系,其中4株B/Vic系毒株为1B分支(2011年-2012年)和1A分支(2015年-2016年),6株B/Yam系毒株均属于3分支。与疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,B/Vic系毒株氨基酸替换发生在N129S和I146V(1B分支)、I117V和N129D(1A分支)。与疫苗株B/Wisconsin/1/2010(B/Yam 3分支)相比,B/Yam毒株共有7个位点发生氨基酸替换;与疫苗株B/Massachusetts/2/2012(B/Yam 2分支)相比,有14个位点发生氨基酸替换,其中N116K、S150I、N165Y和D196N位于抗原表位上。结论 2011年-2016年唐山地区B型流感毒株发生明显变异,连续分子学监测对该地区的疫苗接种政策有重要意义。

台州市乙型流感病毒分离、鉴定及HA1基因特性研究

目的:了解台州市Yamagata系乙型流感病毒的基因特性、变异情况和WHO推荐流感疫苗株对人体的保护情况。方法:用狗肾传代细胞(MDCK)分离流感病毒,用标准血清及荧光定量RT-PCR方法鉴定。选2011年分离株进行HA1基因序列测定,用DNAman和DNAstar生物学软件进行序列分析。结果:2011年分离株HA1基因与参考毒株核苷酸同源性为88.6%～96.9%,氨基酸同源性为89.2%～98.0%,存在8个潜在的糖基化位点,比同谱系疫苗株在197位增加了一个糖基化位点"NKT"。与Yamagata系代表株在进化树的同一支上,与Victoria系代表株比,氨基酸162位缺失K。结论:本地2011年分离株与近年来WHO推荐的流感疫苗株在HA1片段有明显的氨基酸变异。2010年-2011年台州市主要分离到Yamagata系乙型流感病毒,而WHO推荐使用的2010年-2011年乙型流感疫苗株B/Brisbane/60/2008属于Victoria系,因此本年度流感疫苗对我市乙型流感不能提供最佳的保护性。

中国流感疫苗接种所面临的挑战和应对策略

本期流感专栏刊出有关流感疫苗研究、生产和应用的4篇文章，其中涉及世界卫生组织推荐的北半球疫苗组分与我国流感流行病毒是否匹配的问题。根据对2014--2015监测年度中国H3N2亚型流感病毒和B型流感病毒病原学特征分析，比较了疫苗株与流行病毒的匹配性。结果显示，世界卫生组织推荐的疫苗株与我国H3N2亚型流行株匹配性不好；在B型流感病毒方面，我国流行的B型Yamagata系病毒与疫苗株匹配较好，但Victoria系病毒与四价疫苗的匹配性不佳。提示应结合我国流行病毒的抗原性和基因特性，选择与我国流行病毒匹配更好的疫苗株用于流感的预防。

2008-2009年珠海市乙型流感病毒HA1基因特性分析

目的了解珠海市2008-2009年乙型流感病毒HA1基因变异情况。方法按照采样时间,选取珠海市2008-2009年每月用狗肾传代细胞(MDCK)培养分离到的第1、2株乙型流感毒株共25株,没分离到毒株的月份不选,提取病毒RNA,RT-PCR扩增HA1基因片段,产物纯化测序,推导氨基酸序列,进行基因进化特性分析。结果 2008年珠海市乙型流感毒株在8月达到分离高峰,晚于A型流感毒株分离高峰时间7月,2009年其在4月达分离高峰,早于A型流感毒株分离高峰时间5月。2008-2009年珠海市流行的乙型流感病毒优势株为Victoria系病毒。与北半球国际疫苗株B/Florida/4/2006 like-virus(GenBank序列号CY033876.1)相比,2008-2009年珠海市流行的Yamagata系乙型流感病毒HA1片段有7个氨基酸位点发生替换:分别是103 K→R,212D→N,其中08-1267、09-0233和09-0240毒株的218N→S,08-190毒株的123P→A、245S→G、270P→S,除08-190外另5株毒株的181N→Y、245S→D,氨基酸同源性高于97%。其中有2个参与构成抗原决定簇的氨基酸位点发生替换,没有发生病毒抗原漂移。Victoria系毒株与疫苗代表株的同源性低于89%。结论 2008-2009年珠海市流行的Yamagata系乙型流感病毒与疫苗代表株同源性极高,本年度的流感疫苗株对珠海市乙型流感病毒流行的防治起了一定作用。2008-2009年珠海市流行的乙型流感病毒优势株属Victoria系,故本年度的流感疫苗株不能对珠海地区流行的乙型流感提供最佳保护。珠海市2008年乙型流感病毒流行时间较长,2009年流行高峰提前可能与此有关。

南京某小学一起流感样暴发疫情实验室检测及流感病毒HA1基因特性分析

目的了解2015年1月南京市某小学一起流感暴发疫情致病流感病毒HA1基因的序列特征和变异特点,分析现有的流感疫苗株对人体的保护情况。方法对此次疫情采集的咽拭子标本采用荧光定量PCR对所提核酸进行甲型/乙型流感病毒的检测,阳性核酸进一步分型检测。阳性咽拭子使用MDCK细胞进行病毒分离,阳性病毒培养液提取核酸,RT-PCR扩增HA1基因片段并测序。序列分析使用MEGA 5.2软件邻接法构建系统进化树。结果经荧光定量PCR鉴定,采集的10例病例咽拭子中,5例为B型Yamagata系流感病毒阳性。所分离的毒株间HA1的核苷酸同源性为100%;与2015年度国内外疫苗推荐株高度同源,序列相似性达99.5%以上。与国内外疫苗株相比多个位点发生了氨基酸突变,其中,D196N和R141G位于抗原决定簇;196位增加了一个糖基化位点。结论此次疫情流行的B型Yamagata系流感流行株与同年度国内外疫苗株HA1基因同源性高,疫苗有很好的保护作用,建议在校学生主动接种预防;HA1区域的氨基酸变异涉及抗原决定簇,需加强监测。